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Chromosome characteristics of enh27428[chr1:203774413-203778643]
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Tissue distribution of enh27428
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Transcription factor that possibly regulate enh27428[chr1:203774413-203778643]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 203774429 203774444 MEF2A JASPAR yes 34660265
chr1 203774430 203774445 MEF2C JASPAR yes 34660266
chr1 203774431 203774443 MEF2A JASPAR yes 34660267
chr1 203774431 203774443 MEF2B JASPAR yes 34660268
chr1 203774431 203774443 MEF2D JASPAR yes 34660269
chr1 203774433 203774437 YY1 TRANSFAC yes 34660270
chr1 203774448 203774461 NFKB1 JASPAR yes 34660271
chr1 203774448 203774461 NFKB2 JASPAR yes 34660272
chr1 203774451 203774462 CEBPB JASPAR yes 34660273
chr1 203774454 203774466 YY1 JASPAR yes 34660274
chr1 203774476 203774494 RARA JASPAR yes 34660275
chr1 203774483 203774496 NR2F1 JASPAR yes 34660276
chr1 203774485 203774496 ESRRA JASPAR yes 34660277
chr1 203774485 203774496 ESRRB JASPAR yes 34660278
chr1 203774486 203774494 NR4A2 JASPAR yes 34660279
chr1 203774487 203774497 RORA JASPAR yes 34660280
chr1 203774515 203774521 TCF1 TRANSFAC yes 34660281
chr1 203774523 203774542 PITX2 TRANSFAC yes 34660282
chr1 203774529 203774542 ZBTB18 JASPAR yes 34660283
chr1 203774530 203774542 PKNOX1 JASPAR yes 34660284
chr1 203774530 203774542 TGIF1 JASPAR yes 34660285
chr1 203774531 203774540 SNAI2 JASPAR yes 34660286
chr1 203774531 203774541 FIGLA JASPAR yes 34660287
chr1 203774531 203774541 ID4 JASPAR yes 34660288
chr1 203774531 203774541 TCF3 JASPAR yes 34660289
chr1 203774531 203774541 TCF4 JASPAR yes 34660290
chr1 203774533 203774542 ZEB1 JASPAR yes 34660291
chr1 203774533 203774543 TBX21 JASPAR yes 34660292
chr1 203774534 203774542 MGA JASPAR yes 34660293
chr1 203774534 203774542 TBX15 JASPAR yes 34660294
chr1 203774534 203774542 TBX1 JASPAR yes 34660295
chr1 203774534 203774542 TBX4 JASPAR yes 34660296
chr1 203774534 203774542 TBX5 JASPAR yes 34660297
chr1 203774534 203774544 TBR1 JASPAR yes 34660298
chr1 203774534 203774547 SMAD2 JASPAR yes 34660299
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chr1 203774574 203774580 SOX10 JASPAR yes 34660302
chr1 203774584 203774588 YY1 TRANSFAC yes 34660303
chr1 203774605 203774620 FOXP1 JASPAR yes 34660304
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chr1 203774625 203774638 DUXA JASPAR yes 34660306
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chr1 203774626 203774637 PROP1 JASPAR yes 34660308
chr1 203774627 203774638 FOXB1 JASPAR yes 34660309
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chr1 203774629 203774639 GSX1 JASPAR yes 34660311
chr1 203774629 203774639 GSX2 JASPAR yes 34660312
chr1 203774629 203774639 HOXB2 JASPAR yes 34660313
chr1 203774629 203774639 HOXB3 JASPAR yes 34660314
chr1 203774629 203774639 MEOX2 JASPAR yes 34660315
chr1 203774629 203774639 MIXL1 JASPAR yes 34660316
chr1 203774629 203774639 MNX1 JASPAR yes 34660317
chr1 203774629 203774640 HOXA10 JASPAR yes 34660318
chr1 203774630 203774638 LMX1A JASPAR yes 34660319
chr1 203774630 203774638 LMX1B JASPAR yes 34660320
chr1 203774630 203774638 NKX6-1 JASPAR yes 34660321
chr1 203774630 203774638 NKX6-2 JASPAR yes 34660322
chr1 203774630 203774638 PDX1 JASPAR yes 34660323
chr1 203774630 203774638 VAX1 JASPAR yes 34660324
chr1 203774630 203774638 VAX2 JASPAR yes 34660325
chr1 203774630 203774638 VSX1 JASPAR yes 34660326
chr1 203774630 203774640 HOXD13 JASPAR yes 34660327
chr1 203774641 203774646 ETS2 TRANSFAC yes 34660328
chr1 203774645 203774651 TCF1 TRANSFAC yes 34660329
chr1 203774665 203774670 GATA1 TRANSFAC yes 34660330
chr1 203774688 203774706 RARA JASPAR yes 34660331
chr1 203774696 203774700 YY1 TRANSFAC yes 34660332
chr1 203774718 203774735 NR3C1 JASPAR yes 34660333
chr1 203774718 203774735 NR3C2 JASPAR yes 34660334
chr1 203774720 203774735 AR JASPAR yes 34660335
chr1 203774729 203774736 NKX3-1 JASPAR yes 34660336
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chr1 203774734 203774748 POU1F1 JASPAR yes 34660339
chr1 203774735 203774747 POU3F1 JASPAR yes 34660340
chr1 203774735 203774747 POU3F2 JASPAR yes 34660341
chr1 203774735 203774748 POU2F2 JASPAR yes 34660342
chr1 203774736 203774745 POU3F4 JASPAR yes 34660343
chr1 203774736 203774745 POU5F1B JASPAR yes 34660344
chr1 203774737 203774744 POU2F1 TRANSFAC yes 34660345
chr1 203774737 203774744 POU2F2 TRANSFAC yes 34660346
chr1 203774778 203774784 ZNF354C JASPAR yes 34660347
chr1 203774787 203774802 SOX21 JASPAR yes 34660348
chr1 203774817 203774830 HSF2 JASPAR yes 34660349
chr1 203774831 203774840 SNAI2 JASPAR yes 34660350
chr1 203774831 203774841 ID4 JASPAR yes 34660351
chr1 203774831 203774841 TCF3 JASPAR yes 34660352
chr1 203774831 203774841 TCF4 JASPAR yes 34660353
chr1 203774835 203774848 ZBTB18 JASPAR yes 34660354
chr1 203774839 203774860 MAFG JASPAR yes 34660355
chr1 203774843 203774854 NFE2L2 JASPAR yes 34660356
chr1 203774869 203774873 ESR1 TRANSFAC yes 34660357
chr1 203774892 203774903 DMRT3 JASPAR yes 34660358
chr1 203774896 203774901 GATA2 JASPAR yes 34660359
chr1 203774935 203774946 YY2 JASPAR yes 34660360
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chr1 203774966 203774971 H4TF1 TRANSFAC yes 34660362
chr1 203774969 203774982 POU2F2 JASPAR yes 34660363
chr1 203774969 203774983 POU1F1 JASPAR yes 34660364
chr1 203774970 203774982 POU3F1 JASPAR yes 34660365
chr1 203774970 203774982 POU3F2 JASPAR yes 34660366
chr1 203774970 203774983 POU3F3 JASPAR yes 34660367
chr1 203774971 203774975 YY1 TRANSFAC yes 34660368
chr1 203774971 203774983 POU2F1 JASPAR yes 34660369
chr1 203774972 203774979 POU2F1 TRANSFAC yes 34660370
chr1 203774972 203774979 POU2F2C TRANSFAC yes 34660371
chr1 203774972 203774979 POU2F2 TRANSFAC yes 34660372
chr1 203774972 203774981 POU5F1B JASPAR yes 34660373
chr1 203775003 203775014 HOXC13 JASPAR yes 34660374
chr1 203775022 203775026 ESR1 TRANSFAC yes 34660375
chr1 203775027 203775041 IRF7 JASPAR yes 34660376
chr1 203775049 203775060 FLI1 JASPAR yes 34660377
chr1 203775050 203775054 YY1 TRANSFAC yes 34660378
chr1 203775051 203775059 FEV JASPAR yes 34660379
chr1 203775053 203775058 ETS2 TRANSFAC yes 34660380
chr1 203775056 203775062 TCF4 TRANSFAC yes 34660381
chr1 203775056 203775077 IRF1 JASPAR yes 34660382
chr1 203775094 203775099 GATA2 JASPAR yes 34660383
chr1 203775110 203775121 CEBPA JASPAR yes 34660384
chr1 203775111 203775122 CEBPB JASPAR yes 34660385
chr1 203775115 203775125 ALX3 JASPAR yes 34660386
chr1 203775115 203775125 EMX1 JASPAR yes 34660387
chr1 203775115 203775125 GSX2 JASPAR yes 34660388
chr1 203775115 203775125 HOXA2 JASPAR yes 34660389
chr1 203775115 203775125 HOXB2 JASPAR yes 34660390
chr1 203775115 203775125 HOXB3 JASPAR yes 34660391
chr1 203775115 203775125 MEOX1 JASPAR yes 34660392
chr1 203775115 203775125 MEOX2 JASPAR yes 34660393
chr1 203775115 203775125 MIXL1 JASPAR yes 34660394
chr1 203775115 203775125 MNX1 JASPAR yes 34660395
chr1 203775116 203775124 LMX1A JASPAR yes 34660396
chr1 203775116 203775124 LMX1B JASPAR yes 34660397
chr1 203775116 203775124 NKX6-1 JASPAR yes 34660398
chr1 203775116 203775124 NKX6-2 JASPAR yes 34660399
chr1 203775116 203775124 PDX1 JASPAR yes 34660400
chr1 203775116 203775124 VAX1 JASPAR yes 34660401
chr1 203775116 203775124 VAX2 JASPAR yes 34660402
chr1 203775116 203775124 VSX1 JASPAR yes 34660403
chr1 203775121 203775124 MYB TRANSFAC yes 34660404
chr1 203775138 203775149 NFE2 JASPAR yes 34660405
chr1 203775139 203775148 JDP2 JASPAR yes 34660406
chr1 203775171 203775192 IRF1 JASPAR yes 34660407
chr1 203775174 203775184 ETV1 JASPAR yes 34660408
chr1 203775174 203775184 ETV4 JASPAR yes 34660409
chr1 203775174 203775184 ETV5 JASPAR yes 34660410
chr1 203775174 203775185 ETV2 JASPAR yes 34660411
chr1 203775174 203775185 SPDEF JASPAR yes 34660412
chr1 203775174 203775188 SPI1 JASPAR yes 34660413
chr1 203775174 203775188 SPIC JASPAR yes 34660414
chr1 203775183 203775189 TCF4 TRANSFAC yes 34660415
chr1 203775222 203775239 BCL6B JASPAR yes 34660416
chr1 203775224 203775230 LEF1 TRANSFAC yes 34660417
chr1 203775224 203775230 SOX10 JASPAR yes 34660418
chr1 203775253 203775257 H4TF2 TRANSFAC yes 34660419
chr1 203775280 203775284 H1TF2 TRANSFAC yes 34660420
chr1 203775280 203775284 NFE TRANSFAC yes 34660421
chr1 203775280 203775284 SRF TRANSFAC yes 34660422
chr1 203775299 203775310 FOXH1 JASPAR yes 34660423
chr1 203775300 203775306 ZNF354C JASPAR yes 34660424
chr1 203775315 203775319 NFE TRANSFAC yes 34660425
chr1 203775325 203775331 NFIC JASPAR yes 34660426
chr1 203775327 203775331 H1TF2 TRANSFAC yes 34660427
chr1 203775327 203775331 NFE TRANSFAC yes 34660428
chr1 203775327 203775331 SRF TRANSFAC yes 34660429
chr1 203775347 203775351 LFA1 TRANSFAC yes 34660430
chr1 203775357 203775375 IRF2 JASPAR yes 34660431
chr1 203775358 203775379 IRF1 JASPAR yes 34660432
chr1 203775360 203775375 PRDM1 JASPAR yes 34660433
chr1 203775360 203775375 STAT2 JASPAR yes 34660434
chr1 203775361 203775375 STAT1 JASPAR yes 34660435
chr1 203775362 203775376 IRF7 JASPAR yes 34660436
chr1 203775362 203775376 IRF8 JASPAR yes 34660437
chr1 203775362 203775377 IRF9 JASPAR yes 34660438
chr1 203775385 203775393 GATA3 JASPAR yes 34660439
chr1 203775405 203775410 ETS2 TRANSFAC yes 34660440
chr1 203775417 203775438 IRF1 JASPAR yes 34660441
chr1 203775418 203775439 ZNF263 JASPAR yes 34660442
chr1 203775419 203775434 FOXP1 JASPAR yes 34660443
chr1 203775419 203775440 IRF1 JASPAR yes 34660444
chr1 203775421 203775436 STAT2 JASPAR yes 34660445
chr1 203775422 203775436 STAT1 JASPAR yes 34660446
chr1 203775423 203775437 IRF7 JASPAR yes 34660447
chr1 203775424 203775439 FOXP1 JASPAR yes 34660448
chr1 203775424 203775445 IRF1 JASPAR yes 34660449
chr1 203775425 203775446 IRF1 JASPAR yes 34660450
chr1 203775426 203775447 IRF1 JASPAR yes 34660451
chr1 203775429 203775443 SPIC JASPAR yes 34660452
chr1 203775432 203775437 ETS2 TRANSFAC yes 34660453
chr1 203775435 203775450 FOXP1 JASPAR yes 34660454
chr1 203775459 203775470 NFE2L2 JASPAR yes 34660455
chr1 203775462 203775477 RFX5 JASPAR yes 34660456
chr1 203775463 203775467 NFE TRANSFAC yes 34660457
chr1 203775477 203775491 RXRB JASPAR yes 34660458
chr1 203775480 203775489 NKX2-8 JASPAR yes 34660459
chr1 203775480 203775490 NKX2-3 JASPAR yes 34660460
chr1 203775514 203775527 ELF3 JASPAR yes 34660461
chr1 203775515 203775525 GABPA JASPAR yes 34660462
chr1 203775515 203775526 ELF5 JASPAR yes 34660463
chr1 203775515 203775527 EHF JASPAR yes 34660464
chr1 203775515 203775527 ELF4 JASPAR yes 34660465
chr1 203775517 203775523 ETS1 JASPAR yes 34660466
chr1 203775517 203775523 SPI1 JASPAR yes 34660467
chr1 203775517 203775527 ELK1 JASPAR yes 34660468
chr1 203775562 203775570 RHOXF1 JASPAR yes 34660469
chr1 203775570 203775582 PKNOX2 JASPAR yes 34660470
chr1 203775576 203775585 THAP1 JASPAR yes 34660471
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chr1 203775584 203775593 HIC2 JASPAR yes 34660475
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chr1 203778198 203778207 SNAI2 JASPAR yes 34660881
chr1 203778199 203778204 USF2 TRANSFAC yes 34660882
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chr1 203778629 203778633 YY1 TRANSFAC yes 34660949
SNP sites on enh27428[chr1:203774413-203778643]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 203774466 rs146624078 G A
YY1
871444
chr1 203774650 rs577376490 A G
TCF1
871445
chr1 203774666 rs141433299 G A
GATA1
871446
chr1 203774729 rs374791970 T A
AR NKX3-1 NR3C1 NR3C2
871447
chr1 203774774 rs11810904 A G no 871448
chr1 203774793 rs7532505 C T
SOX21
871449
chr1 203774839 rs79310402 G A
ID4 MAFG SNAI2 TCF3 TCF4 ZBTB18
871450
chr1 203775062 rs192672142 C T
IRF1 TCF4
871451
chr1 203775153 rs12088595 G A no 871452
chr1 203775174 rs140182696 A G
ETV1 ETV2 ETV4 ETV5 IRF1 SPDEF SPI1 SPIC
871453
chr1 203775216 rs78535301 A G no 871454
chr1 203775234 rs547767421 A AC
BCL6B
871455
chr1 203775473 rs150330488 G A
RFX5
871456
chr1 203775515 rs11240542 T C
EHF ELF3 ELF4 ELF5 GABPA
871457
chr1 203775522 rs34027291 C T
EHF ELF3 ELF4 ELF5 ELK1 ETS1 GABPA SPI1
871458
chr1 203775876 rs75040727 T C
H4TF1
871459
chr1 203776007 rs561473495 A T no 871460
chr1 203776067 rs11402411 A AT
NR3C1
871461
chr1 203776067 rs398103607 A AT
NR3C1
871462
chr1 203776304 rs552175959 T C no 871463
chr1 203776625 rs2365868 A G
NR3C1
871464
chr1 203776697 rs148464263 C T
PAX5 TFAP2B TFAP2C
871465
chr1 203776873 rs184948696 A G
FOXA1 FOXB1 FOXC1 FOXC2 FOXI1 FOXP1 HNF1A ONECUT2 ONECUT3 POU4F1 PROP1 YY1
871466
chr1 203776874 rs189729623 T C
FOXA1 FOXB1 FOXC1 FOXC2 FOXI1 FOXP1 HNF1A ONECUT2 ONECUT3 POU4F1 PROP1 YY1
871467
chr1 203776938 rs567588962 C T
PAX1 PAX5 PAX9
871468
chr1 203776990 rs74954151 G A no 871469
chr1 203777049 rs6593960 G T no 871470
chr1 203777070 rs77803457 A G
POU6F2
871471
chr1 203777309 rs6685918 C G no 871472
chr1 203777370 rs35762392 CTT C
ESR2 NR3C1 PPARG
871473
chr1 203777532 rs189303556 A G no 871474
chr1 203777741 rs12145049 C T
PRDM1
871475
chr1 203777799 rs7546400 A T no 871476
chr1 203777907 rs78922731 G A no 871477
chr1 203777921 rs534669523 C T
IRF1 SPI1 YY1 YY2
871478
chr1 203777931 rs150862432 T C
FOXP1 IRF1 SPI1 ZNF263
871479
chr1 203777950 rs567924712 T C
YY1
871480
chr1 203777968 rs199629782 ATTTTC A
FOXA1 FOXB1 FOXC1 FOXC2 FOXI1 IRF7 ONECUT2 ONECUT3 YY1
871481
chr1 203777991 rs12729443 T C no 871482
chr1 203778051 rs577100849 C T no 871483
chr1 203778177 rs7542453 C G,T
RARA
871484
chr1 203778338 rs6699480 T C
PAX5 SOX10
871485
chr1 203778485 rs565850281 A G
MEF2A MEF2B MEF2C MEF2D
871486
chr1 203778609 rs556683369 CTT C
FOXP1
871487
Genes possibly regulated by enh27428[chr1:203774413-203778643]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 203734304 203745361 + LAX1 ENSG00000122188.8 203734304 0.94 1.0 1742 59891
chr1 203764782 203823252 + ZC3H11A ENSG00000058673.11 203764782 0.66 0.99 1743 90369
chr1 203765437 203769686 + ZBED6 ENSG00000257315.1 203765437 0.76 0.98 1744 91024
chr1 203830731 203839678 + SNRPE ENSG00000182004.8 203830731 0.92 0.99 1745 47912
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by enh27428[chr1:203774413-203778643]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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