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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of enh43116[chr1:204889009-204897135]
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Tissue distribution of enh43116
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Transcription factor that possibly regulate enh43116[chr1:204889009-204897135]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 204893439 204893634 TEAD4 UCSC Txn Factor no Conserved 107860759
chr1 204893494 204894064 ZNF217 ENCODE Uniform TFBS no MCF-7 21371135
chr1 204893494 204894064 ZNF217 ENCODE Uniform TFBS no MCF-7 107860764
chr1 204893548 204894044 GATA3 UCSC Txn Factor no Conserved 107860765
chr1 204891055 204891065 NFKB1 JASPAR yes 34737083
chr1 204891055 204891065 RELA JASPAR yes 34737084
chr1 204891055 204891065 REL JASPAR yes 34737085
chr1 204891055 204891066 NFKB1 JASPAR yes 34737086
chr1 204891061 204891068 SPIB JASPAR yes 34737087
chr1 204891063 204891076 NR2F1 JASPAR yes 34737088
chr1 204891066 204891074 NR4A2 JASPAR yes 34737089
chr1 204891067 204891081 NR2F1 JASPAR yes 34737090
chr1 204891072 204891092 PPARG JASPAR yes 34737091
chr1 204891073 204891091 ESR1 JASPAR yes 34737092
chr1 204891084 204891099 SOX21 JASPAR yes 34737093
chr1 204891084 204891100 SOX4 JASPAR yes 34737094
chr1 204891087 204891095 MEIS2 JASPAR yes 34737095
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chr1 204891106 204891117 ESRRB JASPAR yes 34737100
chr1 204891141 204891147 NFIC JASPAR yes 34737101
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chr1 204891157 204891169 INSM1 JASPAR yes 34737103
chr1 204891185 204891195 CLOCK JASPAR yes 34737104
chr1 204891187 204891192 MYC TRANSFAC yes 34737105
chr1 204891187 204891192 USF1 TRANSFAC yes 34737106
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chr1 204891187 204891194 USF1 JASPAR yes 34737108
chr1 204891203 204891214 CEBPA JASPAR yes 34737109
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chr1 204891226 204891230 YY1 TRANSFAC yes 34737111
chr1 204891261 204891266 TFAP2A TRANSFAC yes 34737112
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chr1 204891293 204891308 ESR2 JASPAR yes 34737115
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chr1 204891314 204891328 TLX1 JASPAR yes 34737120
chr1 204891329 204891343 PLAG1 JASPAR yes 34737121
chr1 204891331 204891341 SP1 JASPAR yes 34737122
chr1 204891342 204891363 ZNF263 JASPAR yes 34737123
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chr1 204891350 204891354 NFE TRANSFAC yes 34737126
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chr1 204891437 204891445 MEIS3 JASPAR yes 34737134
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chr1 204891452 204891456 NFE TRANSFAC yes 34737136
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chr1 204891583 204891593 GSC2 JASPAR yes 34737142
chr1 204891583 204891593 GSC JASPAR yes 34737143
chr1 204891584 204891592 OTX1 JASPAR yes 34737144
chr1 204891584 204891592 OTX2 JASPAR yes 34737145
chr1 204891589 204891601 MEF2B JASPAR yes 34737146
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chr1 204891660 204891674 BATF3 JASPAR yes 34737165
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chr1 204891664 204891672 MEIS3 JASPAR yes 34737167
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chr1 204892337 204892347 TBR1 JASPAR yes 34737282
chr1 204892362 204892368 PEA3 TRANSFAC yes 34737283
chr1 204892373 204892383 BARHL2 JASPAR yes 34737284
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chr1 204892395 204892401 SOX10 JASPAR yes 34737287
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chr1 204892412 204892422 OLIG2 JASPAR yes 34737289
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chr1 204894802 204894823 ZNF263 JASPAR yes 34737635
chr1 204894849 204894870 REST JASPAR yes 34737636
chr1 204894851 204894868 ZNF410 JASPAR yes 34737637
chr1 204894883 204894889 ZNF354C JASPAR yes 34737638
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chr1 204895074 204895085 EBF1 JASPAR yes 34737665
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chr1 204895148 204895152 TEAD2 TRANSFAC yes 34737671
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chr1 204895225 204895240 FOXP1 JASPAR yes 34737678
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chr1 204895487 204895498 NFIL3 JASPAR yes 34737765
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SNP sites on enh43116[chr1:204889009-204897135]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
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chr1 204889131 rs73079687 A T no 880072
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chr1 204889909 rs76242821 G A no 880079
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chr1 204891735 rs546685128 G A
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chr1 204891777 rs118080276 G A,C no 880108
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SP1
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ETS2 GLIS3
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chr1 204892646 rs74992847 T A
PAX7
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chr1 204892731 rs537120158 C A no 880122
chr1 204892803 rs185210528 A G
NFE
880123
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H4TF1
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chr1 204892837 rs572685091 TCAGGCCCCTGAGG T
H4TF1
880125
chr1 204892841 rs146824409 G A
TFAP2A TFAP2B TFAP2C
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chr1 204892843 rs140489093 C A
TFAP2A TFAP2B TFAP2C
880127
chr1 204893005 rs370946905 G A
SMAD3
880128
chr1 204893056 rs145169715 C A,T no 880129
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chr1 204893549 rs180916030 T G
GATA3 TEAD4 ZNF217
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chr1 204893652 rs77547905 G C
GATA3 SP1 ZNF217
880133
chr1 204893885 rs11579941 A C
GATA3 ZNF217
880134
chr1 204894184 rs143261727 A G
HOXA13 MEF2A MEF2C MEF2D POU4F1
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chr1 204894312 rs7532428 G A
T
880137
chr1 204894399 rs75676354 A G
CDX1 HOXA10
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chr1 204894499 rs190413876 C T
RELA TBX5 ZEB1
880139
chr1 204894516 rs11240313 A C
MAX USF1 USF2
880140
chr1 204894570 rs78844664 C T no 880141
chr1 204894628 rs138026873 T C no 880142
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ATF7 BATF3 JDP2 JUN JUND
880143
chr1 204895062 rs545544201 A C no 880144
chr1 204895066 rs150510179 G A no 880145
chr1 204895216 rs2802851 G A no 880146
chr1 204895504 rs191328074 T C
POU2F2
880147
chr1 204895644 rs149241758 T G no 880148
chr1 204895673 rs534368951 C G no 880149
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YY1
880150
chr1 204895896 rs111354167 T G
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HIC2
880152
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GATA3
880159
chr1 204896319 rs151039791 C T
SP1
880160
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SP1
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SP1
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MAFF MAFG MAFK YY1
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880166
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880167
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REST
880168
chr1 204897129 rs147093588 G C,T
EBF1 TFAP2A
880169
Genes possibly regulated by enh43116[chr1:204889009-204897135]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 204797779 204991950 + NFASC ENSG00000163531.11 204797779 0.82 1.0 1756 8770
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by enh43116[chr1:204889009-204897135]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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