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  3. enh49648[chr1:8838039-8844635]
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Chromosome characteristics of enh49648[chr1:8838039-8844635]
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Tissue distribution of enh49648
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Transcription factor that possibly regulate enh49648[chr1:8838039-8844635]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 8838048 8838052 YY1 TRANSFAC yes 26597336
chr1 8838048 8838061 ELF1 JASPAR yes 26597337
chr1 8838049 8838057 FEV JASPAR yes 26597338
chr1 8838049 8838062 JUN JASPAR yes 26597339
chr1 8838050 8838068 SRF JASPAR yes 26597340
chr1 8838053 8838066 ZBTB18 JASPAR yes 26597341
chr1 8838061 8838074 HNF1B JASPAR yes 26597342
chr1 8838121 8838133 PBX1 JASPAR yes 26597343
chr1 8838131 8838136 ETS2 TRANSFAC yes 26597344
chr1 8838146 8838150 YY1 TRANSFAC yes 26597345
chr1 8838166 8838177 FOXA1 JASPAR yes 26597346
chr1 8838166 8838181 FOXA1 JASPAR yes 26597347
chr1 8838179 8838193 JUN JASPAR yes 26597348
chr1 8838181 8838192 BATF JASPAR yes 26597349
chr1 8838183 8838194 FOS JASPAR yes 26597350
chr1 8838183 8838194 FOSL1 JASPAR yes 26597351
chr1 8838183 8838194 JUND JASPAR yes 26597352
chr1 8838183 8838194 NFE2 JASPAR yes 26597353
chr1 8838184 8838195 FOSL2 JASPAR yes 26597354
chr1 8838184 8838195 JUNB JASPAR yes 26597355
chr1 8838184 8838198 JUN JASPAR yes 26597356
chr1 8838198 8838215 ZNF410 JASPAR yes 26597357
chr1 8838199 8838210 NFIL3 JASPAR yes 26597358
chr1 8838200 8838204 YY1 TRANSFAC yes 26597359
chr1 8838200 8838212 DBP JASPAR yes 26597360
chr1 8838200 8838212 HLF JASPAR yes 26597361
chr1 8838234 8838245 DMRT3 JASPAR yes 26597362
chr1 8838255 8838270 JUND JASPAR yes 26597363
chr1 8838261 8838275 GLIS2 JASPAR yes 26597364
chr1 8838261 8838275 GLIS3 JASPAR yes 26597365
chr1 8838360 8838380 TP53 JASPAR yes 26597366
chr1 8838371 8838381 NFIA JASPAR yes 26597367
chr1 8838373 8838379 NFIC JASPAR yes 26597368
chr1 8838388 8838403 MEF2A JASPAR yes 26597369
chr1 8838389 8838401 FOXI1 JASPAR yes 26597370
chr1 8838389 8838404 MEF2C JASPAR yes 26597371
chr1 8838390 8838402 FOXC2 JASPAR yes 26597372
chr1 8838390 8838402 MEF2A JASPAR yes 26597373
chr1 8838390 8838402 MEF2B JASPAR yes 26597374
chr1 8838390 8838402 MEF2D JASPAR yes 26597375
chr1 8838391 8838401 MEF2A JASPAR yes 26597376
chr1 8838391 8838402 FOXB1 JASPAR yes 26597377
chr1 8838391 8838402 FOXC1 JASPAR yes 26597378
chr1 8838392 8838396 YY1 TRANSFAC yes 26597379
chr1 8838400 8838404 YY1 TRANSFAC yes 26597380
chr1 8838417 8838435 NR3C1 JASPAR yes 26597381
chr1 8838422 8838437 FOXP1 JASPAR yes 26597382
chr1 8838428 8838435 NKX3-1 JASPAR yes 26597383
chr1 8838448 8838455 NKX3-1 JASPAR yes 26597384
chr1 8838456 8838463 SPI1 JASPAR yes 26597385
chr1 8838456 8838464 FEV JASPAR yes 26597386
chr1 8838458 8838463 ETS2 TRANSFAC yes 26597387
chr1 8838461 8838476 HSF1 JASPAR yes 26597388
chr1 8838485 8838493 HOXA5 JASPAR yes 26597389
chr1 8838492 8838512 TBX19 JASPAR yes 26597390
chr1 8838494 8838510 T JASPAR yes 26597391
chr1 8838495 8838505 NKX2-3 JASPAR yes 26597392
chr1 8838506 8838517 NFE2L2 JASPAR yes 26597393
chr1 8838510 8838521 FOXA1 JASPAR yes 26597394
chr1 8838517 8838533 SOX8 JASPAR yes 26597395
chr1 8838526 8838530 YY1 TRANSFAC yes 26597396
chr1 8838560 8838564 YY1 TRANSFAC yes 26597397
chr1 8838570 8838585 LEF1 JASPAR yes 26597398
chr1 8838574 8838585 STAT1 JASPAR yes 26597399
chr1 8838578 8838583 ETS2 TRANSFAC yes 26597400
chr1 8838622 8838633 FOSL2 JASPAR yes 26597401
chr1 8838632 8838635 MYB TRANSFAC yes 26597402
chr1 8838653 8838658 ETS2 TRANSFAC yes 26597403
chr1 8838704 8838708 LFA1 TRANSFAC yes 26597404
chr1 8838707 8838719 YY1 JASPAR yes 26597405
chr1 8838712 8838726 TLX1 JASPAR yes 26597406
chr1 8838750 8838755 MYC TRANSFAC yes 26597407
chr1 8838759 8838771 HES5 JASPAR yes 26597408
chr1 8838759 8838771 HES7 JASPAR yes 26597409
chr1 8838760 8838771 USF2 JASPAR yes 26597410
chr1 8838761 8838771 MAX JASPAR yes 26597411
chr1 8838788 8838809 ZNF263 JASPAR yes 26597412
chr1 8838795 8838802 CEBPA TRANSFAC yes 26597413
chr1 8838796 8838807 E2F6 JASPAR yes 26597414
chr1 8838834 8838845 JUNB JASPAR yes 26597415
chr1 8838835 8838846 FOSL1 JASPAR yes 26597416
chr1 8838844 8838864 ESR1 JASPAR yes 26597417
chr1 8838847 8838865 ESR2 JASPAR yes 26597418
chr1 8838848 8838865 ESR1 JASPAR yes 26597419
chr1 8838848 8838866 ESR1 JASPAR yes 26597420
chr1 8838848 8838866 ESR2 JASPAR yes 26597421
chr1 8838849 8838864 ESR2 JASPAR yes 26597422
chr1 8838849 8838869 ESR1 JASPAR yes 26597423
chr1 8838856 8838867 ESRRA JASPAR yes 26597424
chr1 8838856 8838867 ESRRB JASPAR yes 26597425
chr1 8838857 8838865 NR4A2 JASPAR yes 26597426
chr1 8838858 8838868 RORA JASPAR yes 26597427
chr1 8838870 8838885 FOXP1 JASPAR yes 26597428
chr1 8838872 8838887 FOXP1 JASPAR yes 26597429
chr1 8838873 8838894 IRF1 JASPAR yes 26597430
chr1 8838874 8838889 FOXP1 JASPAR yes 26597431
chr1 8838874 8838895 IRF1 JASPAR yes 26597432
chr1 8838875 8838896 IRF1 JASPAR yes 26597433
chr1 8838879 8838894 PRDM1 JASPAR yes 26597434
chr1 8838879 8838900 IRF1 JASPAR yes 26597435
chr1 8838880 8838895 FOXP1 JASPAR yes 26597436
chr1 8838881 8838896 IRF9 JASPAR yes 26597437
chr1 8838882 8838896 IRF7 JASPAR yes 26597438
chr1 8838883 8838897 STAT1 JASPAR yes 26597439
chr1 8838883 8838898 PRDM1 JASPAR yes 26597440
chr1 8838883 8838898 STAT2 JASPAR yes 26597441
chr1 8838885 8838900 FOXP1 JASPAR yes 26597442
chr1 8838904 8838922 IRF2 JASPAR yes 26597443
chr1 8838905 8838926 IRF1 JASPAR yes 26597444
chr1 8838907 8838922 STAT2 JASPAR yes 26597445
chr1 8838908 8838922 STAT1 JASPAR yes 26597446
chr1 8838909 8838921 IRF1 JASPAR yes 26597447
chr1 8838909 8838923 IRF7 JASPAR yes 26597448
chr1 8838909 8838924 IRF9 JASPAR yes 26597449
chr1 8838911 8838917 TCF4 TRANSFAC yes 26597450
chr1 8838911 8838926 FOXP1 JASPAR yes 26597451
chr1 8838915 8838927 IRF1 JASPAR yes 26597452
chr1 8838917 8838923 TCF4 TRANSFAC yes 26597453
chr1 8838932 8838942 GABPA JASPAR yes 26597454
chr1 8838932 8838946 SPIC JASPAR yes 26597455
chr1 8838935 8838942 SPIB JASPAR yes 26597456
chr1 8838940 8838944 NFE TRANSFAC yes 26597457
chr1 8838969 8838986 PAX9 JASPAR yes 26597458
chr1 8838973 8838987 TLX1 JASPAR yes 26597459
chr1 8838973 8838991 ESR2 JASPAR yes 26597460
chr1 8838974 8838991 ESR1 JASPAR yes 26597461
chr1 8839010 8839031 MAFG JASPAR yes 26597462
chr1 8839015 8839026 FOS JASPAR yes 26597463
chr1 8839015 8839026 FOSL1 JASPAR yes 26597464
chr1 8839015 8839026 JUND JASPAR yes 26597465
chr1 8839016 8839027 JUNB JASPAR yes 26597466
chr1 8839016 8839027 NFE2L2 JASPAR yes 26597467
chr1 8839016 8839030 JUN JASPAR yes 26597468
chr1 8839017 8839028 BATF JASPAR yes 26597469
chr1 8839046 8839066 TP63 JASPAR yes 26597470
chr1 8839047 8839065 TP53 JASPAR yes 26597471
chr1 8839047 8839065 TP63 JASPAR yes 26597472
chr1 8839047 8839065 TP73 JASPAR yes 26597473
chr1 8839048 8839068 TP53 JASPAR yes 26597474
chr1 8839052 8839068 ZNF143 JASPAR yes 26597475
chr1 8839057 8839076 PAX5 JASPAR yes 26597476
chr1 8839074 8839089 MEF2A JASPAR yes 26597477
chr1 8839075 8839090 MEF2C JASPAR yes 26597478
chr1 8839076 8839088 MEF2A JASPAR yes 26597479
chr1 8839076 8839088 MEF2B JASPAR yes 26597480
chr1 8839076 8839088 MEF2D JASPAR yes 26597481
chr1 8839078 8839082 YY1 TRANSFAC yes 26597482
chr1 8839099 8839111 YY1 JASPAR yes 26597483
chr1 8839121 8839139 RARA JASPAR yes 26597484
chr1 8839128 8839141 NR2F1 JASPAR yes 26597485
chr1 8839132 8839140 CREB1 JASPAR yes 26597486
chr1 8839184 8839195 NFE2 JASPAR yes 26597487
chr1 8839185 8839196 FOSL2 JASPAR yes 26597488
chr1 8839192 8839202 SP1 JASPAR yes 26597489
chr1 8839195 8839200 SP1 TRANSFAC yes 26597490
chr1 8839228 8839231 MYB TRANSFAC yes 26597491
chr1 8839244 8839248 NFE TRANSFAC yes 26597492
chr1 8839245 8839250 GATA2 JASPAR yes 26597493
chr1 8839251 8839256 ETS2 TRANSFAC yes 26597494
chr1 8839251 8839259 FEV JASPAR yes 26597495
chr1 8839259 8839274 FOXA1 JASPAR yes 26597496
chr1 8839260 8839271 FOXB1 JASPAR yes 26597497
chr1 8839260 8839271 FOXC1 JASPAR yes 26597498
chr1 8839273 8839293 TBX19 JASPAR yes 26597499
chr1 8839275 8839291 T JASPAR yes 26597500
chr1 8839278 8839282 YY1 TRANSFAC yes 26597501
chr1 8839294 8839298 TEAD2 TRANSFAC yes 26597502
chr1 8839315 8839328 SMAD2 JASPAR yes 26597503
chr1 8839318 8839328 TBR1 JASPAR yes 26597504
chr1 8839319 8839329 TBX21 JASPAR yes 26597505
chr1 8839320 8839328 MGA JASPAR yes 26597506
chr1 8839320 8839328 TBX15 JASPAR yes 26597507
chr1 8839320 8839328 TBX1 JASPAR yes 26597508
chr1 8839320 8839328 TBX4 JASPAR yes 26597509
chr1 8839320 8839328 TBX5 JASPAR yes 26597510
chr1 8839320 8839329 ZEB1 JASPAR yes 26597511
chr1 8839320 8839332 PKNOX1 JASPAR yes 26597512
chr1 8839320 8839332 TGIF1 JASPAR yes 26597513
chr1 8839320 8839333 ZBTB18 JASPAR yes 26597514
chr1 8839321 8839331 FIGLA JASPAR yes 26597515
chr1 8839321 8839331 ID4 JASPAR yes 26597516
chr1 8839321 8839331 TCF3 JASPAR yes 26597517
chr1 8839321 8839331 TCF4 JASPAR yes 26597518
chr1 8839322 8839331 SNAI2 JASPAR yes 26597519
chr1 8839323 8839328 USF2 TRANSFAC yes 26597520
chr1 8839346 8839360 PLAG1 JASPAR yes 26597521
chr1 8839354 8839359 SP1 TRANSFAC yes 26597522
chr1 8839357 8839361 LFA1 TRANSFAC yes 26597523
chr1 8839366 8839379 NR2F1 JASPAR yes 26597524
chr1 8839368 8839386 RARA JASPAR yes 26597525
chr1 8839370 8839374 ESR1 TRANSFAC yes 26597526
chr1 8839396 8839408 YY1 JASPAR yes 26597527
chr1 8839400 8839411 CEBPB JASPAR yes 26597528
chr1 8839401 8839414 NFKB1 JASPAR yes 26597529
chr1 8839401 8839414 NFKB2 JASPAR yes 26597530
chr1 8839418 8839433 MEF2C JASPAR yes 26597531
chr1 8839419 8839434 MEF2A JASPAR yes 26597532
chr1 8839420 8839432 MEF2A JASPAR yes 26597533
chr1 8839420 8839432 MEF2B JASPAR yes 26597534
chr1 8839420 8839432 MEF2D JASPAR yes 26597535
chr1 8839440 8839449 HIC2 JASPAR yes 26597536
chr1 8839443 8839447 LFA1 TRANSFAC yes 26597537
chr1 8839448 8839459 FOSL2 JASPAR yes 26597538
chr1 8839450 8839463 SMAD2 JASPAR yes 26597539
chr1 8839453 8839463 TBR1 JASPAR yes 26597540
chr1 8839454 8839464 TBX21 JASPAR yes 26597541
chr1 8839455 8839463 MGA JASPAR yes 26597542
chr1 8839455 8839463 TBX15 JASPAR yes 26597543
chr1 8839455 8839463 TBX1 JASPAR yes 26597544
chr1 8839455 8839463 TBX4 JASPAR yes 26597545
chr1 8839455 8839463 TBX5 JASPAR yes 26597546
chr1 8839455 8839464 ZEB1 JASPAR yes 26597547
chr1 8839455 8839467 PKNOX1 JASPAR yes 26597548
chr1 8839455 8839467 TGIF1 JASPAR yes 26597549
chr1 8839455 8839468 ZBTB18 JASPAR yes 26597550
chr1 8839456 8839466 FIGLA JASPAR yes 26597551
chr1 8839456 8839466 ID4 JASPAR yes 26597552
chr1 8839456 8839466 TCF3 JASPAR yes 26597553
chr1 8839456 8839466 TCF4 JASPAR yes 26597554
chr1 8839457 8839466 SNAI2 JASPAR yes 26597555
chr1 8839458 8839463 USF2 TRANSFAC yes 26597556
chr1 8839464 8839485 LUN1 TRANSFAC yes 26597557
chr1 8839480 8839496 ZNF143 JASPAR yes 26597558
chr1 8839488 8839493 SP1 TRANSFAC yes 26597559
chr1 8839491 8839504 NFKB1 JASPAR yes 26597560
chr1 8839493 8839499 ZNF354C JASPAR yes 26597561
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chr1 8839496 8839507 USF2 JASPAR yes 26597563
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chr1 8843932 8843942 GSC JASPAR yes 26598161
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chr1 8844397 8844411 ONECUT3 JASPAR yes 26598222
chr1 8844398 8844403 GATA1 TRANSFAC yes 26598223
chr1 8844403 8844407 YY1 TRANSFAC yes 26598224
chr1 8844407 8844417 NFATC3 JASPAR yes 26598225
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chr1 8844589 8844604 FOXP1 JASPAR yes 26598254
chr1 8844590 8844601 FOXH1 JASPAR yes 26598255
chr1 8844592 8844603 FOXP2 JASPAR yes 26598256
chr1 8844592 8844604 FOXI1 JASPAR yes 26598257
chr1 8844594 8844602 FOXG1 JASPAR yes 26598258
chr1 8844596 8844602 HiNF-A TRANSFAC yes 26598259
SNP sites on enh49648[chr1:8838039-8844635]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 8838074 rs143002751 T C
HNF1B
58902
chr1 8838165 rs192651782 C A no 58903
chr1 8838200 rs567658312 C T
DBP HLF NFIL3 YY1 ZNF410
58904
chr1 8838400 rs540506741 A G
FOXB1 FOXC1 FOXC2 FOXI1 MEF2A MEF2B MEF2C MEF2D YY1
58905
chr1 8838466 rs550654892 C T
HSF1
58906
chr1 8838528 rs12123076 A G
SOX8 YY1
58907
chr1 8838731 rs7556144 G A no 58908
chr1 8838732 rs74628510 C T no 58909
chr1 8838958 rs146251498 T C no 58910
chr1 8839040 rs111300666 G A no 58911
chr1 8839193 rs184736983 A T
FOSL2 NFE2 SP1
58912
chr1 8839279 rs71641062 C T
T TBX19 YY1
58913
chr1 8839300 rs7513880 G A no 58914
chr1 8839313 rs116029613 G A no 58915
chr1 8839390 rs189724418 G A,C no 58916
chr1 8839579 rs180812686 G A
HIC2 LFA1 PAX5 ZNF143
58917
chr1 8839700 rs146037963 C T
PAX5
58918
chr1 8839703 rs139598732 C G
PAX5 SOX10
58919
chr1 8839719 rs149986356 C T
FOXP1 IRF1
58920
chr1 8839766 rs201260531 T G no 58921
chr1 8840064 rs543012982 A G no 58922
chr1 8840125 rs185502099 C A
ID4 SNAI2 TCF3 TCF4 USF2
58923
chr1 8840139 rs551467066 T A no 58924
chr1 8840949 rs144695915 C T
NFE2
58925
chr1 8841145 rs147939236 G A,T
FOSL2 SMAD2
58926
chr1 8841267 rs539557446 TAGCTGGGCATGGTGGCACACACCTGTTGTCCC T no 58927
chr1 8841429 rs11586759 C A
FOXP1
58928
chr1 8841548 rs78002477 A G
TEAD1 TEAD3 TEAD4
58929
chr1 8841567 rs531773815 G GGT
PAX5
58930
chr1 8841613 rs79608829 A G
IRF1 IRF7 STAT2
58931
chr1 8841700 rs567800889 C T no 58932
chr1 8841754 rs115286749 G A
FOXF2 TEAD1
58933
chr1 8841812 rs536432322 G A no 58934
chr1 8841971 rs549473848 T C no 58935
chr1 8842145 rs112470424 C G no 58936
chr1 8842175 rs78411328 A C
NFYA
58937
chr1 8842639 rs191284879 T C
GATA1
58938
chr1 8842691 rs141093762 G A
FOSL2
58939
chr1 8842751 rs547202538 G A
CREB1 ESR1
58940
chr1 8842763 rs543432993 G A no 58941
chr1 8842770 rs138732751 GCCTGGCCAAAATGGTGAAAT G no 58942
chr1 8842770 rs146567691 GCCTGGCCAAAATGGTGAAAT G no 58943
chr1 8842798 rs564722405 C T
FOXP1
58944
chr1 8842949 rs201591644 A AGT no 58945
chr1 8843056 rs537129539 G T no 58946
chr1 8843129 rs570764698 A G
TP63
58947
chr1 8843135 rs75462377 A G
TEAD2
58948
chr1 8843203 rs76611792 G A
LFA1
58949
chr1 8843266 rs138369723 T C
HES5 HES7 PKNOX2 TP53 TP63 TP73
58950
chr1 8843324 rs183142118 G A
ESR1
58951
chr1 8843402 rs72857219 T A,G
MAFF
58952
chr1 8843457 rs532016190 T C no 58953
chr1 8843555 rs371622510 C A,T
MEF2A
58954
chr1 8843579 rs145367276 C A
PROX1 SOX10
58955
chr1 8843667 rs137923027 C A no 58956
chr1 8843675 rs187816799 G C
LFA1
58957
chr1 8843721 rs546570396 A T
IRF1 MEF2C TBP
58958
chr1 8843724 rs76992094 A T
IRF1 MEF2C TBP
58959
chr1 8843938 rs193075688 T C
GSC GSC2 MZF1 OTX1 PITX3
58960
chr1 8844124 rs113299720 A G
MAX TP53 TP63
58961
chr1 8844134 rs572439930 A G
TP63
58962
chr1 8844316 rs564453834 A C no 58963
chr1 8844444 rs114567024 A G
MYB NFIL3 TEF
58964
chr1 8844463 rs79464202 C T
CDX1 CDX2 FOXF2 HNF1B HOXA10 HOXA13
58965
chr1 8844476 rs145987949 A G no 58966
chr1 8844525 rs6697719 T A
FOXP1 IRF1 IRF7 IRF9 STAT2
58967
chr1 8844573 rs143388780 CCTGGCAGA C no 58968
chr1 8844600 rs4908514 C T
FOXG1 FOXH1 FOXI1 FOXP1 FOXP2 HiNF-A
58969
chr1 8844604 rs74050288 C T
FOXI1 FOXP1
58970
Genes possibly regulated by enh49648[chr1:8838039-8844635]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 8412457 8877702 - RERE ENSG00000142599.13 8877702 0.76 0.99 116 66933
chr1 8921061 8939308 - ENO1 ENSG00000074800.9 8939308 0.77 1.0 117 5327
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by enh49648[chr1:8838039-8844635]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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