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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of enh64016[chr1:33490805-33496760]
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Tissue distribution of enh64016
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Transcription factor that possibly regulate enh64016[chr1:33490805-33496760]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 33490806 33490827 IRF1 JASPAR yes 28022353
chr1 33490812 33490827 MEF2C JASPAR yes 28022354
chr1 33490813 33490828 MEF2A JASPAR yes 28022355
chr1 33490814 33490826 MEF2A JASPAR yes 28022356
chr1 33490814 33490826 MEF2B JASPAR yes 28022357
chr1 33490814 33490826 MEF2D JASPAR yes 28022358
chr1 33490815 33490825 MEF2A JASPAR yes 28022359
chr1 33490829 33490845 SOX8 JASPAR yes 28022360
chr1 33490855 33490870 JUND JASPAR yes 28022361
chr1 33490858 33490873 JUND JASPAR yes 28022362
chr1 33490859 33490872 JUN JASPAR yes 28022363
chr1 33490872 33490876 TEAD2 TRANSFAC yes 28022364
chr1 33490872 33490888 SOX4 JASPAR yes 28022365
chr1 33490888 33490901 ZBTB18 JASPAR yes 28022366
chr1 33490889 33490899 FIGLA JASPAR yes 28022367
chr1 33490889 33490899 ID4 JASPAR yes 28022368
chr1 33490889 33490899 TCF3 JASPAR yes 28022369
chr1 33490889 33490899 TCF4 JASPAR yes 28022370
chr1 33490891 33490896 USF2 TRANSFAC yes 28022371
chr1 33490902 33490905 MYB TRANSFAC yes 28022372
chr1 33490903 33490913 CLOCK JASPAR yes 28022373
chr1 33490903 33490921 MAFF JASPAR yes 28022374
chr1 33490905 33490926 MAFG JASPAR yes 28022375
chr1 33490910 33490924 FOXF2 JASPAR yes 28022376
chr1 33490911 33490922 FOXA1 JASPAR yes 28022377
chr1 33490911 33490922 FOXH1 JASPAR yes 28022378
chr1 33490911 33490926 FOXA1 JASPAR yes 28022379
chr1 33490912 33490923 FOXB1 JASPAR yes 28022380
chr1 33490912 33490923 FOXC1 JASPAR yes 28022381
chr1 33490912 33490924 FOXC2 JASPAR yes 28022382
chr1 33490915 33490923 FOXG1 JASPAR yes 28022383
chr1 33490920 33490924 YY1 TRANSFAC yes 28022384
chr1 33490924 33490930 NFIC JASPAR yes 28022385
chr1 33490963 33490973 RORA JASPAR yes 28022386
chr1 33490966 33490972 ESR1 TRANSFAC yes 28022387
chr1 33490968 33490972 ESR1 TRANSFAC yes 28022388
chr1 33490992 33491007 TFAP2C JASPAR yes 28022389
chr1 33490994 33491006 INSM1 JASPAR yes 28022390
chr1 33490994 33491006 TFAP2A JASPAR yes 28022391
chr1 33490994 33491006 TFAP2B JASPAR yes 28022392
chr1 33490994 33491006 TFAP2C JASPAR yes 28022393
chr1 33490994 33491009 TFAP2A JASPAR yes 28022394
chr1 33490996 33491005 TFAP2A JASPAR yes 28022395
chr1 33491010 33491020 RELA JASPAR yes 28022396
chr1 33491010 33491020 REL JASPAR yes 28022397
chr1 33491010 33491021 NFKB1 JASPAR yes 28022398
chr1 33491026 33491034 MEIS3 JASPAR yes 28022399
chr1 33491027 33491031 NFE TRANSFAC yes 28022400
chr1 33491059 33491080 IRF1 JASPAR yes 28022401
chr1 33491063 33491075 IRF1 JASPAR yes 28022402
chr1 33491063 33491077 IRF7 JASPAR yes 28022403
chr1 33491063 33491077 IRF8 JASPAR yes 28022404
chr1 33491063 33491078 IRF9 JASPAR yes 28022405
chr1 33491065 33491086 IRF1 JASPAR yes 28022406
chr1 33491067 33491082 STAT2 JASPAR yes 28022407
chr1 33491068 33491082 STAT1 JASPAR yes 28022408
chr1 33491070 33491084 GATA2 JASPAR yes 28022409
chr1 33491071 33491089 SRF JASPAR yes 28022410
chr1 33491072 33491077 ETS2 TRANSFAC yes 28022411
chr1 33491074 33491082 GATA3 JASPAR yes 28022412
chr1 33491074 33491082 GATA5 JASPAR yes 28022413
chr1 33491127 33491137 GSC2 JASPAR yes 28022414
chr1 33491127 33491137 GSC JASPAR yes 28022415
chr1 33491128 33491136 OTX2 JASPAR yes 28022416
chr1 33491128 33491137 PITX3 JASPAR yes 28022417
chr1 33491128 33491146 MAFF JASPAR yes 28022418
chr1 33491130 33491145 MAFK JASPAR yes 28022419
chr1 33491147 33491153 SOX10 JASPAR yes 28022420
chr1 33491156 33491166 NFIA JASPAR yes 28022421
chr1 33491158 33491164 NFIC JASPAR yes 28022422
chr1 33491182 33491194 MEF2A JASPAR yes 28022423
chr1 33491194 33491209 SOX21 JASPAR yes 28022424
chr1 33491197 33491201 YY1 TRANSFAC yes 28022425
chr1 33491211 33491215 ESR1 TRANSFAC yes 28022426
chr1 33491229 33491244 MYBL2 JASPAR yes 28022427
chr1 33491259 33491263 H4TF2 TRANSFAC yes 28022428
chr1 33491266 33491269 MYB TRANSFAC yes 28022429
chr1 33491269 33491280 NFIL3 JASPAR yes 28022430
chr1 33491270 33491274 YY1 TRANSFAC yes 28022431
chr1 33491270 33491282 DBP JASPAR yes 28022432
chr1 33491270 33491282 HLF JASPAR yes 28022433
chr1 33491271 33491283 POU2F1 JASPAR yes 28022434
chr1 33491271 33491284 POU3F3 JASPAR yes 28022435
chr1 33491271 33491285 POU1F1 JASPAR yes 28022436
chr1 33491272 33491284 POU3F1 JASPAR yes 28022437
chr1 33491272 33491284 POU3F2 JASPAR yes 28022438
chr1 33491272 33491285 POU2F2 JASPAR yes 28022439
chr1 33491273 33491281 FOXL1 JASPAR yes 28022440
chr1 33491273 33491282 POU5F1B JASPAR yes 28022441
chr1 33491296 33491310 SPI1 JASPAR yes 28022442
chr1 33491309 33491324 STAT2 JASPAR yes 28022443
chr1 33491319 33491327 FEV JASPAR yes 28022444
chr1 33491321 33491328 SPIB JASPAR yes 28022445
chr1 33491327 33491334 NKX3-1 JASPAR yes 28022446
chr1 33491349 33491363 IRF8 JASPAR yes 28022447
chr1 33491350 33491355 GATA1 TRANSFAC yes 28022448
chr1 33491395 33491415 TP53 JASPAR yes 28022449
chr1 33491397 33491417 TP63 JASPAR yes 28022450
chr1 33491398 33491416 TP53 JASPAR yes 28022451
chr1 33491399 33491414 TP53 JASPAR yes 28022452
chr1 33491426 33491435 HIC2 JASPAR yes 28022453
chr1 33491429 33491433 LFA1 TRANSFAC yes 28022454
chr1 33491447 33491450 MYB TRANSFAC yes 28022455
chr1 33491453 33491457 NFE TRANSFAC yes 28022456
chr1 33491457 33491466 PITX3 JASPAR yes 28022457
chr1 33491457 33491467 GSC2 JASPAR yes 28022458
chr1 33491457 33491467 GSC JASPAR yes 28022459
chr1 33491458 33491466 OTX2 JASPAR yes 28022460
chr1 33491458 33491474 POU4F2 JASPAR yes 28022461
chr1 33491458 33491474 POU4F3 JASPAR yes 28022462
chr1 33491481 33491492 FOXA1 JASPAR yes 28022463
chr1 33491482 33491493 FOXC1 JASPAR yes 28022464
chr1 33491482 33491494 FOXC2 JASPAR yes 28022465
chr1 33491490 33491494 YY1 TRANSFAC yes 28022466
chr1 33491517 33491521 NFE TRANSFAC yes 28022467
chr1 33491552 33491567 AR JASPAR yes 28022468
chr1 33491561 33491568 NKX3-1 JASPAR yes 28022469
chr1 33491577 33491581 YY1 TRANSFAC yes 28022470
chr1 33491583 33491597 POU4F1 JASPAR yes 28022471
chr1 33491583 33491599 POU4F2 JASPAR yes 28022472
chr1 33491583 33491599 POU4F3 JASPAR yes 28022473
chr1 33491610 33491623 ELF1 JASPAR yes 28022474
chr1 33491612 33491623 ELF5 JASPAR yes 28022475
chr1 33491613 33491623 GABPA JASPAR yes 28022476
chr1 33491613 33491624 FLI1 JASPAR yes 28022477
chr1 33491637 33491652 SOX21 JASPAR yes 28022478
chr1 33491672 33491683 HOXC13 JASPAR yes 28022479
chr1 33491679 33491684 ETS2 TRANSFAC yes 28022480
chr1 33491685 33491689 TEAD2 TRANSFAC yes 28022481
chr1 33491715 33491725 NFATC3 JASPAR yes 28022482
chr1 33491717 33491723 ETS1 JASPAR yes 28022483
chr1 33491725 33491734 SOX9 JASPAR yes 28022484
chr1 33491727 33491736 SRY JASPAR yes 28022485
chr1 33491734 33491738 TEAD2 TRANSFAC yes 28022486
chr1 33491734 33491739 TBP TRANSFAC yes 28022487
chr1 33491773 33491790 RXRA JASPAR yes 28022488
chr1 33491780 33491801 IRF1 JASPAR yes 28022489
chr1 33491781 33491792 NFKB1 JASPAR yes 28022490
chr1 33491782 33491797 STAT2 JASPAR yes 28022491
chr1 33491783 33491797 STAT1 JASPAR yes 28022492
chr1 33491786 33491801 FOXP1 JASPAR yes 28022493
chr1 33491786 33491807 IRF1 JASPAR yes 28022494
chr1 33491786 33491807 ZNF263 JASPAR yes 28022495
chr1 33491790 33491811 IRF1 JASPAR yes 28022496
chr1 33491790 33491811 ZNF263 JASPAR yes 28022497
chr1 33491792 33491813 IRF1 JASPAR yes 28022498
chr1 33491794 33491815 IRF1 JASPAR yes 28022499
chr1 33491798 33491819 IRF1 JASPAR yes 28022500
chr1 33491800 33491815 PRDM1 JASPAR yes 28022501
chr1 33491800 33491815 STAT2 JASPAR yes 28022502
chr1 33491801 33491815 SPIC JASPAR yes 28022503
chr1 33491801 33491815 STAT1 JASPAR yes 28022504
chr1 33491803 33491818 FOXP1 JASPAR yes 28022505
chr1 33491833 33491837 NFE TRANSFAC yes 28022506
chr1 33491862 33491879 PAX1 JASPAR yes 28022507
chr1 33491896 33491906 SREBF2 JASPAR yes 28022508
chr1 33491899 33491912 NFKB1 JASPAR yes 28022509
chr1 33491899 33491912 NFKB2 JASPAR yes 28022510
chr1 33491947 33491957 MAX JASPAR yes 28022511
chr1 33491947 33491958 USF1 JASPAR yes 28022512
chr1 33491947 33491958 USF2 JASPAR yes 28022513
chr1 33491947 33491959 HES5 JASPAR yes 28022514
chr1 33491947 33491959 HES7 JASPAR yes 28022515
chr1 33491948 33491958 BHLHE40 JASPAR yes 28022516
chr1 33491948 33491958 HEY1 JASPAR yes 28022517
chr1 33491948 33491958 HEY2 JASPAR yes 28022518
chr1 33491948 33491958 MAX JASPAR yes 28022519
chr1 33491948 33491958 MLX JASPAR yes 28022520
chr1 33491948 33491958 MNT JASPAR yes 28022521
chr1 33491948 33491958 TFE3 JASPAR yes 28022522
chr1 33491948 33491958 TFEB JASPAR yes 28022523
chr1 33491948 33491959 USF2 JASPAR yes 28022524
chr1 33491949 33491956 USF1 JASPAR yes 28022525
chr1 33491949 33491959 MAX JASPAR yes 28022526
chr1 33491950 33491955 MYC TRANSFAC yes 28022527
chr1 33491950 33491955 USF1 TRANSFAC yes 28022528
chr1 33491950 33491955 USF2 TRANSFAC yes 28022529
chr1 33491966 33491978 DBP JASPAR yes 28022530
chr1 33491966 33491978 HLF JASPAR yes 28022531
chr1 33491968 33491979 NFIL3 JASPAR yes 28022532
chr1 33491971 33491981 ALX3 JASPAR yes 28022533
chr1 33491971 33491981 GSX1 JASPAR yes 28022534
chr1 33491972 33491980 BSX JASPAR yes 28022535
chr1 33491972 33491980 DLX6 JASPAR yes 28022536
chr1 33491972 33491980 MSX1 JASPAR yes 28022537
chr1 33491972 33491980 MSX2 JASPAR yes 28022538
chr1 33491978 33491989 NFKB1 JASPAR yes 28022539
chr1 33492010 33492019 CDX1 JASPAR yes 28022540
chr1 33492010 33492020 HOXA13 JASPAR yes 28022541
chr1 33492026 33492032 GATA3 JASPAR yes 28022542
chr1 33492036 33492050 JUN JASPAR yes 28022543
chr1 33492039 33492050 JUNB JASPAR yes 28022544
chr1 33492040 33492051 FOS JASPAR yes 28022545
chr1 33492040 33492051 JUND JASPAR yes 28022546
chr1 33492045 33492059 PAX6 JASPAR yes 28022547
chr1 33492053 33492057 H1TF2 TRANSFAC yes 28022548
chr1 33492053 33492057 NFE TRANSFAC yes 28022549
chr1 33492053 33492057 SRF TRANSFAC yes 28022550
chr1 33492071 33492077 HiNF-A TRANSFAC yes 28022551
chr1 33492073 33492087 ATF7 JASPAR yes 28022552
chr1 33492073 33492087 BATF3 JASPAR yes 28022553
chr1 33492087 33492099 YY1 JASPAR yes 28022554
chr1 33492089 33492100 DUX4 JASPAR yes 28022555
chr1 33492109 33492119 HOXA13 JASPAR yes 28022556
chr1 33492110 33492114 YY1 TRANSFAC yes 28022557
chr1 33492126 33492140 MTF1 JASPAR yes 28022558
chr1 33492152 33492173 LUN1 TRANSFAC yes 28022559
chr1 33492169 33492183 PLAG1 JASPAR yes 28022560
chr1 33492176 33492181 SP1 TRANSFAC yes 28022561
chr1 33492177 33492182 SP1 TRANSFAC yes 28022562
chr1 33492181 33492198 RARA JASPAR yes 28022563
chr1 33492181 33492198 RXRA JASPAR yes 28022564
chr1 33492182 33492188 ZNF354C JASPAR yes 28022565
chr1 33492188 33492198 RORA JASPAR yes 28022566
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chr1 33492189 33492200 ESRRB JASPAR yes 28022568
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chr1 33493394 33493405 ELF5 JASPAR yes 28022790
chr1 33493394 33493407 ELF1 JASPAR yes 28022791
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chr1 33493723 33493734 PROP1 JASPAR yes 28022824
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chr1 33495175 33495185 HESX1 JASPAR yes 28023007
chr1 33495175 33495185 HOXA2 JASPAR yes 28023008
chr1 33495175 33495185 HOXB2 JASPAR yes 28023009
chr1 33495175 33495185 HOXB3 JASPAR yes 28023010
chr1 33495175 33495185 LHX2 JASPAR yes 28023011
chr1 33495175 33495185 LHX6 JASPAR yes 28023012
chr1 33495175 33495185 MEOX1 JASPAR yes 28023013
chr1 33495175 33495185 MEOX2 JASPAR yes 28023014
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chr1 33495176 33495184 VAX2 JASPAR yes 28023020
chr1 33495176 33495184 VSX1 JASPAR yes 28023021
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chr1 33495397 33495406 ELK4 JASPAR yes 28023045
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chr1 33495398 33495408 ELK1 JASPAR yes 28023048
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chr1 33495466 33495472 SOX10 JASPAR yes 28023051
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chr1 33496026 33496033 NKX3-1 JASPAR yes 28023153
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chr1 33496057 33496062 SP1 TRANSFAC yes 28023156
chr1 33496068 33496072 YY1 TRANSFAC yes 28023157
chr1 33496092 33496109 PAX1 JASPAR yes 28023158
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chr1 33496206 33496209 MYB TRANSFAC yes 28023173
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chr1 33496659 33496665 MYC TRANSFAC yes 28023224
chr1 33496664 33496667 MYB TRANSFAC yes 28023225
chr1 33496673 33496681 FEV JASPAR yes 28023226
chr1 33496674 33496689 HNF1A JASPAR yes 28023227
chr1 33496675 33496688 HNF1B JASPAR yes 28023228
chr1 33496681 33496685 YY1 TRANSFAC yes 28023229
chr1 33496721 33496736 MAFK JASPAR yes 28023230
chr1 33496725 33496736 NRL JASPAR yes 28023231
chr1 33496748 33496752 NFE TRANSFAC yes 28023232
chr1 33496749 33496754 GATA2 JASPAR yes 28023233
SNP sites on enh64016[chr1:33490805-33496760]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 33490927 rs77832916 C A
NFIC
221572
chr1 33491625 rs112345739 C T no 221573
chr1 33491647 rs150583182 T C
SOX21
221574
chr1 33491759 rs376489452 C T no 221575
chr1 33491797 rs75040699 T C
FOXP1 IRF1 STAT1 STAT2 ZNF263
221576
chr1 33491863 rs139607382 G A
PAX1
221577
chr1 33491897 rs114108402 C T
SREBF2
221578
chr1 33491914 rs147393571 C T no 221579
chr1 33491965 rs139979574 A G no 221580
chr1 33492071 rs147255655 A G
HiNF-A
221581
chr1 33492136 rs550222003 G A
MTF1
221582
chr1 33492277 rs189266480 C T
TP53 TP63 TP73
221583
chr1 33492304 rs556187896 G C no 221584
chr1 33492326 rs577697959 T C no 221585
chr1 33492405 rs371510482 C T no 221586
chr1 33492509 rs111376301 C T
ELF1 ELF4 ELK1 ELK3 ELK4 ERF ERG ETS1 ETV1 ETV2 ETV3 ETV4 ETV5 ETV6 FEV FLI1 GABPA NFKB1 SPI1
221587
chr1 33492510 rs186474736 G A,C
ELF1 ELF4 ELK1 ELK3 ELK4 ERF ERG ETS1 ETV1 ETV2 ETV3 ETV4 ETV5 ETV6 FEV FLI1 GABPA NFKB1 SPI1
221588
chr1 33492554 rs542900717 C T
NFKB1 NFKB2
221589
chr1 33492688 rs140587289 G A no 221590
chr1 33492760 rs10798924 T C no 221591
chr1 33493081 rs146593481 G A no 221592
chr1 33493092 rs553911878 C G no 221593
chr1 33493209 rs145338054 C T
PAX5
221594
chr1 33493296 rs12409924 G A,T
ESR1
221595
chr1 33493489 rs143008602 A G
BCL6B
221596
chr1 33493500 rs148275145 T C no 221597
chr1 33493586 rs552726158 G T no 221598
chr1 33493822 rs114996335 C T no 221599
chr1 33493842 rs141296653 C T
FOSL2
221600
chr1 33493993 rs114348643 G A
RFX2 RFX5 ZNF263
221601
chr1 33494018 rs2284806 A C no 221602
chr1 33494060 rs147416774 C G no 221603
chr1 33494199 rs565780994 C G no 221604
chr1 33494276 rs370853949 T C
RFX5
221605
chr1 33494388 rs555942397 G A
SREBF1
221606
chr1 33494442 rs116229427 C T no 221607
chr1 33494458 rs2268693 T C
PAX6 PBX1
221608
chr1 33494566 rs75126482 C G,T no 221609
chr1 33494568 rs541914166 G A no 221610
chr1 33494699 rs147267416 G A
NFIL3 POU2F2 POU3F4 POU5F1B
221611
chr1 33494703 rs79574666 G A
POU2F2 POU3F4 POU5F1B TCF4
221612
chr1 33494809 rs564750375 A G no 221613
chr1 33494812 rs558756029 ATCT A no 221614
chr1 33494903 rs72884314 C T no 221615
chr1 33494943 rs72884318 C T no 221616
chr1 33494978 rs149776646 T C
EBF1 GLIS3
221617
chr1 33495421 rs77609412 G A no 221618
chr1 33495427 rs79142149 A T no 221619
chr1 33495449 rs115748984 T G
EN2
221620
chr1 33495566 rs144657161 C T
TEAD1 TEAD3 TEAD4
221621
chr1 33495721 rs558225795 C A
PAX5
221622
chr1 33495722 rs573287538 A C no 221623
chr1 33495735 rs76444375 G A no 221624
chr1 33495766 rs78947685 T C
REST
221625
chr1 33495838 rs530676147 T C no 221626
chr1 33495964 rs528075730 C T
LFA1 THAP1
221627
chr1 33496004 rs546459583 T A,C
ALX3 BSX DLX6 EMX1 EMX2 EN1 ESX1 GBX2 GSX1 GSX2 HESX1 HOXA10 HOXB13 HOXB2 HOXB3 HOXD13 IRF1 ISX LBX1 LBX2 LHX2 LHX6 LHX9 LMX1A LMX1B MEOX1 MEOX2 MIXL1 MNX1 NKX6-1 NKX6-2 NOTO PAX4 PDX1 POU6F2 PRRX1 RAX RAX2 SHOX UNCX VAX1 VAX2 VSX1 VSX2
221628
chr1 33496297 rs10914648 C G,T
POU4F1 POU4F3 ZNF410
221629
chr1 33496391 rs563136898 C T
ESR1 TLX1
221630
chr1 33496632 rs79284554 A G no 221631
chr1 33496639 rs10753271 C T
FOXA1 FOXP1
221632
chr1 33496664 rs146618847 T G
MYB MYC
221633
chr1 33496702 rs141337840 G A no 221634
chr1 33496725 rs568988997 C T
MAFK NRL
221635
chr1 33496733 rs117020421 A C
MAFK NRL
221636
Genes possibly regulated by enh64016[chr1:33490805-33496760]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 33402046 33430286 - RNF19B ENSG00000116514.12 33430286 0.66 1.0 471 39481
chr1 33439268 33439642 + FKSG48 ENSG00000267885.1 33439268 0.84 1.0 472 48463
chr1 33473585 33546597 - AK2 ENSG00000004455.12 33546597 0.77 1.0 473 50163
chr1 33546705 33586131 + ADC ENSG00000142920.12 33546705 0.69 1.0 474 50055
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by enh64016[chr1:33490805-33496760]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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