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Chromosome characteristics of enh88816[chr4:6031665-6036875]
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Tissue distribution of enh88816
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Transcription factor that possibly regulate enh88816[chr4:6031665-6036875]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr4 6031695 6031711 ZNF143 JASPAR yes 88021629
chr4 6031696 6031707 EBF1 JASPAR yes 88021630
chr4 6031703 6031723 ESR1 JASPAR yes 88021631
chr4 6031710 6031714 H4TF2 TRANSFAC yes 88021632
chr4 6031734 6031740 TCF4 TRANSFAC yes 88021633
chr4 6031737 6031755 NR3C1 JASPAR yes 88021634
chr4 6031738 6031743 ETS2 TRANSFAC yes 88021635
chr4 6031752 6031764 PKNOX1 JASPAR yes 88021636
chr4 6031758 6031762 NFE TRANSFAC yes 88021637
chr4 6031760 6031776 POU4F2 JASPAR yes 88021638
chr4 6031762 6031776 POU4F1 JASPAR yes 88021639
chr4 6031763 6031775 MEF2B JASPAR yes 88021640
chr4 6031763 6031775 MEF2D JASPAR yes 88021641
chr4 6031779 6031792 HSF2 JASPAR yes 88021642
chr4 6031783 6031798 HSF1 JASPAR yes 88021643
chr4 6031784 6031797 HSF1 JASPAR yes 88021644
chr4 6031784 6031797 HSF2 JASPAR yes 88021645
chr4 6031784 6031797 HSF4 JASPAR yes 88021646
chr4 6031788 6031803 HSF1 JASPAR yes 88021647
chr4 6031789 6031802 HSF1 JASPAR yes 88021648
chr4 6031789 6031802 HSF2 JASPAR yes 88021649
chr4 6031789 6031802 HSF4 JASPAR yes 88021650
chr4 6031790 6031805 STAT1 JASPAR yes 88021651
chr4 6031793 6031804 STAT3 JASPAR yes 88021652
chr4 6031793 6031808 MEF2C JASPAR yes 88021653
chr4 6031794 6031809 MEF2A JASPAR yes 88021654
chr4 6031800 6031811 PROP1 JASPAR yes 88021655
chr4 6031818 6031828 TEAD1 JASPAR yes 88021656
chr4 6031818 6031830 TEAD1 JASPAR yes 88021657
chr4 6031837 6031852 FOXP1 JASPAR yes 88021658
chr4 6031842 6031854 IRF1 JASPAR yes 88021659
chr4 6031874 6031895 REST JASPAR yes 88021660
chr4 6031894 6031904 RORA JASPAR yes 88021661
chr4 6031895 6031906 ESRRA JASPAR yes 88021662
chr4 6031895 6031906 ESRRB JASPAR yes 88021663
chr4 6031895 6031908 NR2F1 JASPAR yes 88021664
chr4 6031897 6031911 RXRB JASPAR yes 88021665
chr4 6031897 6031911 RXRG JASPAR yes 88021666
chr4 6031899 6031903 ESR1 TRANSFAC yes 88021667
chr4 6031906 6031911 SP1 TRANSFAC yes 88021668
chr4 6031924 6031934 MLX JASPAR yes 88021669
chr4 6031943 6031952 SRY JASPAR yes 88021670
chr4 6031949 6031952 MYB TRANSFAC yes 88021671
chr4 6031955 6031970 TFAP2C JASPAR yes 88021672
chr4 6031956 6031967 TFAP2A JASPAR yes 88021673
chr4 6031956 6031967 TFAP2B JASPAR yes 88021674
chr4 6031957 6031966 TFAP2A JASPAR yes 88021675
chr4 6031961 6031971 SP1 JASPAR yes 88021676
chr4 6031961 6031982 ZNF263 JASPAR yes 88021677
chr4 6031962 6031972 SP1 JASPAR yes 88021678
chr4 6031962 6031983 ZNF263 JASPAR yes 88021679
chr4 6031964 6031985 ZNF263 JASPAR yes 88021680
chr4 6031965 6031986 ZNF263 JASPAR yes 88021681
chr4 6031966 6031976 ZNF740 JASPAR yes 88021682
chr4 6031968 6031978 SP1 JASPAR yes 88021683
chr4 6031968 6031989 ZNF263 JASPAR yes 88021684
chr4 6031969 6031979 SP1 JASPAR yes 88021685
chr4 6031969 6031990 ZNF263 JASPAR yes 88021686
chr4 6031971 6031977 MAZ TRANSFAC yes 88021687
chr4 6031971 6031982 E2F6 JASPAR yes 88021688
chr4 6031973 6031981 SP1 TRANSFAC yes 88021689
chr4 6031975 6031981 MAZ TRANSFAC yes 88021690
chr4 6031975 6031986 E2F6 JASPAR yes 88021691
chr4 6031976 6031991 NR2C2 JASPAR yes 88021692
chr4 6031976 6031997 ZNF263 JASPAR yes 88021693
chr4 6031977 6031998 ZNF263 JASPAR yes 88021694
chr4 6031980 6032001 ZNF263 JASPAR yes 88021695
chr4 6031986 6031990 LFA1 TRANSFAC yes 88021696
chr4 6031996 6032000 ESR1 TRANSFAC yes 88021697
chr4 6032000 6032011 GCM1 JASPAR yes 88021698
chr4 6032005 6032018 SMAD2 JASPAR yes 88021699
chr4 6032006 6032011 SP1 TRANSFAC yes 88021700
chr4 6032019 6032030 GCM1 JASPAR yes 88021701
chr4 6032029 6032034 SP1 TRANSFAC yes 88021702
chr4 6032055 6032067 HES5 JASPAR yes 88021703
chr4 6032056 6032066 CLOCK JASPAR yes 88021704
chr4 6032056 6032066 MAX JASPAR yes 88021705
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chr4 6032056 6032066 MNT JASPAR yes 88021708
chr4 6032056 6032066 TFE3 JASPAR yes 88021709
chr4 6032056 6032066 TFEB JASPAR yes 88021710
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chr4 6032057 6032067 MAX JASPAR yes 88021712
chr4 6032058 6032063 MYC TRANSFAC yes 88021713
chr4 6032058 6032063 USF1 TRANSFAC yes 88021714
chr4 6032058 6032063 USF2 TRANSFAC yes 88021715
chr4 6032058 6032065 USF1 JASPAR yes 88021716
chr4 6032063 6032082 RFX2 JASPAR yes 88021717
chr4 6032096 6032107 NFKB1 JASPAR yes 88021718
chr4 6032106 6032114 MGA JASPAR yes 88021719
chr4 6032119 6032130 NFKB1 JASPAR yes 88021720
chr4 6032137 6032141 LFA1 TRANSFAC yes 88021721
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chr4 6032165 6032174 NFIX JASPAR yes 88021724
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chr4 6032173 6032183 ID4 JASPAR yes 88021727
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chr4 6032173 6032183 TCF3 JASPAR yes 88021729
chr4 6032173 6032183 TCF4 JASPAR yes 88021730
chr4 6032174 6032183 SNAI2 JASPAR yes 88021731
chr4 6032175 6032180 USF2 TRANSFAC yes 88021732
chr4 6032178 6032192 POU4F1 JASPAR yes 88021733
chr4 6032178 6032194 POU4F3 JASPAR yes 88021734
chr4 6032213 6032218 ETS2 TRANSFAC yes 88021735
chr4 6032219 6032229 SP1 JASPAR yes 88021736
chr4 6032252 6032265 NFKB1 JASPAR yes 88021737
chr4 6032252 6032265 NFKB2 JASPAR yes 88021738
chr4 6032273 6032288 AR JASPAR yes 88021739
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chr4 6032294 6032300 ETS1 JASPAR yes 88021741
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chr4 6032328 6032340 TFAP2C JASPAR yes 88021748
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chr4 6032328 6032343 TFAP2C JASPAR yes 88021750
chr4 6032329 6032340 EBF1 JASPAR yes 88021751
chr4 6032329 6032340 TFAP2A JASPAR yes 88021752
chr4 6032330 6032339 TFAP2A JASPAR yes 88021753
chr4 6032335 6032339 LFA1 TRANSFAC yes 88021754
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chr4 6032344 6032357 TFAP2B JASPAR yes 88021756
chr4 6032344 6032357 TFAP2C JASPAR yes 88021757
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chr4 6032415 6032420 SP1 TRANSFAC yes 88021766
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chr4 6032418 6032424 ETS1 JASPAR yes 88021768
chr4 6032418 6032424 SPI1 JASPAR yes 88021769
chr4 6032431 6032436 H4TF1 TRANSFAC yes 88021770
chr4 6032448 6032460 HNF1B JASPAR yes 88021771
chr4 6032454 6032469 JUND JASPAR yes 88021772
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chr4 6032500 6032508 TEAD3 JASPAR yes 88021778
chr4 6032510 6032514 LFA1 TRANSFAC yes 88021779
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chr4 6032528 6032548 PPARG JASPAR yes 88021784
chr4 6032530 6032545 ESR2 JASPAR yes 88021785
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chr4 6032673 6032678 SP1 TRANSFAC yes 88021792
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chr4 6032717 6032732 FOXA1 JASPAR yes 88021798
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chr4 6032732 6032742 NEUROD2 JASPAR yes 88021800
chr4 6032734 6032752 TP53 JASPAR yes 88021801
chr4 6032735 6032755 TP53 JASPAR yes 88021802
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chr4 6032765 6032780 HNF4G JASPAR yes 88021804
chr4 6032766 6032781 HNF4A JASPAR yes 88021805
chr4 6032770 6032776 SOX10 JASPAR yes 88021806
chr4 6032789 6032806 RARA JASPAR yes 88021807
chr4 6032789 6032806 RXRA JASPAR yes 88021808
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chr4 6032822 6032832 MEF2A JASPAR yes 88021812
chr4 6032822 6032834 FOXI1 JASPAR yes 88021813
chr4 6032835 6032839 LFA1 TRANSFAC yes 88021814
chr4 6032848 6032860 FOXI1 JASPAR yes 88021815
chr4 6032878 6032887 HIC2 JASPAR yes 88021816
chr4 6032881 6032885 LFA1 TRANSFAC yes 88021817
chr4 6032927 6032936 SNAI2 JASPAR yes 88021818
chr4 6032927 6032937 ID4 JASPAR yes 88021819
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chr4 6032932 6032938 ZNF354C JASPAR yes 88021821
chr4 6032941 6032954 NR2F1 JASPAR yes 88021822
chr4 6032943 6032961 RARA JASPAR yes 88021823
chr4 6032945 6032949 ESR1 TRANSFAC yes 88021824
chr4 6032953 6032973 ESR1 JASPAR yes 88021825
chr4 6032956 6032976 PPARG JASPAR yes 88021826
chr4 6032971 6032983 YY1 JASPAR yes 88021827
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chr4 6032975 6032986 CEBPB JASPAR yes 88021829
chr4 6032989 6033004 MEF2C JASPAR yes 88021830
chr4 6032990 6033005 MEF2A JASPAR yes 88021831
chr4 6032991 6033003 MEF2A JASPAR yes 88021832
chr4 6032991 6033003 MEF2B JASPAR yes 88021833
chr4 6032991 6033003 MEF2D JASPAR yes 88021834
chr4 6033034 6033055 ZNF263 JASPAR yes 88021835
chr4 6033067 6033087 RREB1 JASPAR yes 88021836
chr4 6033069 6033090 ZNF263 JASPAR yes 88021837
chr4 6033076 6033093 ESR1 JASPAR yes 88021838
chr4 6033076 6033094 ESR1 JASPAR yes 88021839
chr4 6033080 6033089 RUNX2 JASPAR yes 88021840
chr4 6033085 6033095 SREBF1 JASPAR yes 88021841
chr4 6033141 6033153 FOXC2 JASPAR yes 88021842
chr4 6033141 6033153 MEF2D JASPAR yes 88021843
chr4 6033142 6033154 FOXI1 JASPAR yes 88021844
chr4 6033143 6033157 ONECUT2 JASPAR yes 88021845
chr4 6033143 6033157 ONECUT3 JASPAR yes 88021846
chr4 6033143 6033158 FOXP1 JASPAR yes 88021847
chr4 6033143 6033158 HNF1A JASPAR yes 88021848
chr4 6033144 6033158 POU4F1 JASPAR yes 88021849
chr4 6033144 6033159 FOXA1 JASPAR yes 88021850
chr4 6033144 6033160 POU4F2 JASPAR yes 88021851
chr4 6033144 6033160 POU4F3 JASPAR yes 88021852
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chr4 6036747 6036758 TFAP2B JASPAR yes 88022318
chr4 6036747 6036758 TFAP2C JASPAR yes 88022319
chr4 6036748 6036757 TFAP2A JASPAR yes 88022320
chr4 6036791 6036799 GATA3 JASPAR yes 88022321
chr4 6036800 6036805 MYC TRANSFAC yes 88022322
chr4 6036816 6036821 ETS2 TRANSFAC yes 88022323
chr4 6036820 6036834 RORA JASPAR yes 88022324
chr4 6036832 6036853 IRF1 JASPAR yes 88022325
chr4 6036833 6036854 ZNF263 JASPAR yes 88022326
chr4 6036834 6036849 PRDM1 JASPAR yes 88022327
chr4 6036835 6036856 ZNF263 JASPAR yes 88022328
chr4 6036836 6036857 IRF1 JASPAR yes 88022329
chr4 6036838 6036859 IRF1 JASPAR yes 88022330
chr4 6036839 6036860 ZNF263 JASPAR yes 88022331
chr4 6036840 6036855 PRDM1 JASPAR yes 88022332
chr4 6036842 6036857 PRDM1 JASPAR yes 88022333
chr4 6036842 6036863 ZNF263 JASPAR yes 88022334
chr4 6036844 6036865 IRF1 JASPAR yes 88022335
chr4 6036845 6036866 ZNF263 JASPAR yes 88022336
chr4 6036846 6036861 PRDM1 JASPAR yes 88022337
chr4 6036848 6036869 ZNF263 JASPAR yes 88022338
chr4 6036850 6036871 IRF1 JASPAR yes 88022339
chr4 6036851 6036872 ZNF263 JASPAR yes 88022340
chr4 6036852 6036867 PRDM1 JASPAR yes 88022341
chr4 6036852 6036867 STAT2 JASPAR yes 88022342
chr4 6036853 6036867 STAT1 JASPAR yes 88022343
chr4 6036854 6036868 IRF7 JASPAR yes 88022344
chr4 6036854 6036868 IRF8 JASPAR yes 88022345
chr4 6036854 6036869 IRF9 JASPAR yes 88022346
chr4 6036858 6036873 PRDM1 JASPAR yes 88022347
SNP sites on enh88816[chr4:6031665-6036875]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr4 6031668 rs76615966 G A,T no 7374461
chr4 6031683 rs114484695 G A,C no 7374462
chr4 6031741 rs371332120 G A
ETS2 NR3C1
7374463
chr4 6031759 rs528220991 CT C
NFE PKNOX1
7374464
chr4 6031777 rs540522056 C T no 7374465
chr4 6031847 rs11944030 A C
FOXP1 IRF1
7374466
chr4 6032118 rs62284774 T C no 7374467
chr4 6032174 rs572378403 C T
ID4 NFIA NFIX NHLH1 SNAI2 TCF3 TCF4 ZEB1
7374468
chr4 6032178 rs13105242 C T
ID4 NHLH1 POU4F1 POU4F3 SNAI2 TCF3 TCF4 USF2 ZEB1
7374469
chr4 6032205 rs117292266 T C no 7374470
chr4 6032226 rs144899728 C T
SP1
7374471
chr4 6032235 rs17765384 G A no 7374472
chr4 6032411 rs149021278 C A no 7374473
chr4 6032420 rs34363250 G A
ETS1 GABPA MZF1 PLAG1 SP1 SPI1
7374474
chr4 6032456 rs10026454 A C,G
HNF1B JUND
7374475
chr4 6032589 rs75441809 G A no 7374476
chr4 6032643 rs10014474 T A no 7374477
chr4 6032680 rs577725401 C T no 7374478
chr4 6032801 rs6813726 C A,T
ALX3 RARA RXRA
7374479
chr4 6032824 rs6813743 C A
FOXI1 MEF2A MEF2C
7374480
chr4 6032904 rs138564935 A G no 7374481
chr4 6032909 rs140359463 C T no 7374482
chr4 6032929 rs545480357 G A
ID4 SNAI2
7374483
chr4 6032938 rs10014782 T A
NFKB1 ZNF354C
7374484
chr4 6032943 rs181589554 G A
NFKB1 NR2F1 RARA
7374485
chr4 6033054 rs186561794 G C
ZNF263
7374486
chr4 6033078 rs190965612 A T
ESR1 RREB1 ZNF263
7374487
chr4 6033100 rs141782093 C T no 7374488
chr4 6033183 rs182390306 G A
TFAP2B
7374489
chr4 6033187 rs557066494 C T
TFAP2B
7374490
chr4 6033198 rs35403494 G A
CREB3 CREB3L1
7374491
chr4 6033218 rs34703972 G A no 7374492
chr4 6033269 rs573061340 C T
HES7 NR3C2
7374493
chr4 6033318 rs185952465 G C
HNF4A
7374494
chr4 6033385 rs147276214 C A
RFX2 RFX3 RFX5
7374495
chr4 6033522 rs368959622 C T no 7374496
chr4 6033546 rs115810824 T A
GATA3 GATA5
7374497
chr4 6033657 rs765831 A G no 7374498
chr4 6033667 rs575610140 A G no 7374499
chr4 6033695 rs544230831 G T
AR CREB1 ESR2 JUN NR2F1 NR4A2
7374500
chr4 6033720 rs560900251 T C,G
NFKB1 RFX2 RFX5 STAT1 STAT3
7374501
chr4 6033749 rs559968783 G A
SP1
7374502
chr4 6033752 rs144848445 C T
MAFF
7374503
chr4 6033753 rs539767487 G A
MAFF
7374504
chr4 6033803 rs544364758 G A no 7374505
chr4 6033859 rs148550190 C T no 7374506
chr4 6033903 rs191224677 G A
ESR2
7374507
chr4 6033913 rs142977809 T A no 7374508
chr4 6033917 rs114403980 A G no 7374509
chr4 6034039 rs6819485 G A no 7374510
chr4 6034081 rs6819647 G C no 7374511
chr4 6034084 rs116838519 T C no 7374512
chr4 6034278 rs183076572 A G
H1TF2 NFE SRF
7374513
chr4 6034285 rs79258309 C T no 7374514
chr4 6034309 rs115081267 C G
SMAD2
7374515
chr4 6034387 rs72430030 CACAAAACAAA C
FOXP1 IRF1 RREB1
7374516
chr4 6034387 rs753154262 CACAAAACAAA C
FOXP1 IRF1 RREB1
7374517
chr4 6034481 rs28688973 A T
NHLH1 ZBTB18
7374518
chr4 6034497 rs143151038 T A,C
MYC
7374519
chr4 6034506 rs532611986 C T
PLAG1
7374520
chr4 6034584 rs28510368 C G,T
E2F4 ZIC1 ZIC3 ZIC4
7374521
chr4 6034585 rs35263128 G A
E2F4 SP1 ZIC1 ZIC3 ZIC4
7374522
chr4 6034615 rs73071571 T G
RREB1
7374523
chr4 6034750 rs140287725 G A
RARA RXRA SOX10
7374524
chr4 6034764 rs79877737 A C no 7374525
chr4 6034814 rs62284775 G C
NFE2L2
7374526
chr4 6034920 rs28735576 T C
LFA1 RFX5
7374527
chr4 6035026 rs115815664 G A no 7374528
chr4 6035209 rs6853245 A G no 7374529
chr4 6035263 rs6826769 G A
RUNX2 RUNX3
7374530
chr4 6035326 rs182844583 G A
PLAG1
7374531
chr4 6035440 rs73071578 T A
MEF2A NR2F1 RXRG SRF TBP TEAD2
7374532
chr4 6035453 rs6827217 G A
NR2F1 RXRG
7374533
chr4 6035484 rs73071580 A G no 7374534
chr4 6035519 rs114455725 G A no 7374535
chr4 6035532 rs73798433 T C no 7374536
chr4 6035696 rs143867946 T C
ESR1 RUNX2
7374537
chr4 6035701 rs75158537 T C
ESR2 RUNX2 SOX10
7374538
chr4 6035721 rs147238909 T A
ESR1 FIGLA MSC RORA TAL1 TFAP4 ZBTB18
7374539
chr4 6035798 rs77561685 C G
FIGLA FOXP2 ID4 MSC MYF6 PTF SNAI2 TAL1 TCF3 TCF4 TFAP4 USF2
7374540
chr4 6035861 rs77066532 T C no 7374541
chr4 6036010 rs118030660 C T
PLAG1
7374542
chr4 6036074 rs73798434 C T no 7374543
chr4 6036258 rs4358336 G A
FOSL2
7374544
chr4 6036303 rs4342146 T C
ZNF354C
7374545
chr4 6036305 rs187706015 G T
ZNF354C
7374546
chr4 6036357 rs112868229 C T no 7374547
chr4 6036362 rs28711039 C T no 7374548
chr4 6036482 rs68081371 C T no 7374549
chr4 6036500 rs139371269 C G no 7374550
chr4 6036574 rs67700466 C T no 7374551
chr4 6036691 rs28624123 C T no 7374552
chr4 6036716 rs192706060 G A,C
ESRRB TAL1 YY1
7374553
chr4 6036761 rs66944062 A G
TFAP2A TFAP2C
7374554
chr4 6036789 rs572457624 G A no 7374555
Genes possibly regulated by enh88816[chr4:6031665-6036875]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr4 5958845 5991545 - C4orf50 ENSG00000181215.8 5991545 0.98 0.86 4503 59880
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by enh88816[chr4:6031665-6036875]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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