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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista1131[chr1:33446816-33447482]
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Tissue distribution of vista1131
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Transcription factor that possibly regulate vista1131[chr1:33446816-33447482]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 33446820 33446830 TEAD1 JASPAR yes 28018722
chr1 33446820 33446830 TEAD4 JASPAR yes 28018723
chr1 33446820 33446830 TEAD1 JASPAR yes 118269005
chr1 33446820 33446830 TEAD4 JASPAR yes 118269006
chr1 33446821 33446829 TEAD3 JASPAR yes 28018724
chr1 33446821 33446829 TEAD3 JASPAR yes 118269007
chr1 33446824 33446829 ETS2 TRANSFAC yes 28018725
chr1 33446824 33446829 ETS2 TRANSFAC yes 118269008
chr1 33446864 33446872 EHF JASPAR yes 28018726
chr1 33446864 33446872 EHF JASPAR yes 118269009
chr1 33446871 33446879 EHF JASPAR yes 28018727
chr1 33446871 33446879 EHF JASPAR yes 118269010
chr1 33446886 33446892 NFIC JASPAR yes 28018728
chr1 33446886 33446892 NFIC JASPAR yes 118269011
chr1 33446887 33446905 MAFF JASPAR yes 28018729
chr1 33446887 33446905 MAFF JASPAR yes 118269012
chr1 33446901 33446907 ETS1 JASPAR yes 28018730
chr1 33446901 33446907 SPI1 JASPAR yes 28018731
chr1 33446901 33446907 ETS1 JASPAR yes 118269013
chr1 33446901 33446907 SPI1 JASPAR yes 118269014
chr1 33446901 33446911 ELK1 JASPAR yes 28018732
chr1 33446901 33446911 ELK1 JASPAR yes 118269015
chr1 33446913 33446927 JUN JASPAR yes 28018733
chr1 33446913 33446927 JUN JASPAR yes 118269016
chr1 33446915 33446926 BATF JASPAR yes 28018734
chr1 33446915 33446926 BATF JASPAR yes 118269017
chr1 33446916 33446927 JUNB JASPAR yes 28018735
chr1 33446916 33446927 JUNB JASPAR yes 118269018
chr1 33446918 33446927 JDP2 JASPAR yes 28018736
chr1 33446918 33446927 JDP2 JASPAR yes 118269019
chr1 33446923 33446931 SF1 TRANSFAC yes 28018737
chr1 33446923 33446931 SF1 TRANSFAC yes 118269020
chr1 33446923 33446934 ESRRB JASPAR yes 28018738
chr1 33446923 33446934 ESRRB JASPAR yes 118269021
chr1 33446940 33446961 IRF1 JASPAR yes 28018739
chr1 33446940 33446961 IRF1 JASPAR yes 118269022
chr1 33446941 33446951 RELA JASPAR yes 28018740
chr1 33446941 33446951 RELA JASPAR yes 118269023
chr1 33446941 33446952 NFKB1 JASPAR yes 28018741
chr1 33446941 33446952 NFKB1 JASPAR yes 118269024
chr1 33446943 33446957 SPI1 JASPAR yes 28018742
chr1 33446943 33446957 SPIC JASPAR yes 28018743
chr1 33446943 33446957 SPI1 JASPAR yes 118269025
chr1 33446943 33446957 SPIC JASPAR yes 118269026
chr1 33446952 33446967 MEF2C JASPAR yes 28018744
chr1 33446952 33446967 MEF2C JASPAR yes 118269027
chr1 33446959 33446973 SPI1 JASPAR yes 28018745
chr1 33446959 33446973 SPIC JASPAR yes 28018746
chr1 33446959 33446973 SPI1 JASPAR yes 118269028
chr1 33446959 33446973 SPIC JASPAR yes 118269029
chr1 33446960 33446973 ELF1 JASPAR yes 28018747
chr1 33446960 33446973 ELF1 JASPAR yes 118269030
chr1 33446961 33446973 ELF1 JASPAR yes 28018748
chr1 33446961 33446973 ELF4 JASPAR yes 28018749
chr1 33446961 33446973 ELF1 JASPAR yes 118269031
chr1 33446961 33446973 ELF4 JASPAR yes 118269032
chr1 33446962 33446973 ETV2 JASPAR yes 28018750
chr1 33446962 33446973 ETV2 JASPAR yes 118269033
chr1 33446963 33446973 ERF JASPAR yes 28018751
chr1 33446963 33446973 ERG JASPAR yes 28018752
chr1 33446963 33446973 ETS1 JASPAR yes 28018753
chr1 33446963 33446973 ETV3 JASPAR yes 28018754
chr1 33446963 33446973 FEV JASPAR yes 28018755
chr1 33446963 33446973 FLI1 JASPAR yes 28018756
chr1 33446963 33446973 GABPA JASPAR yes 28018757
chr1 33446963 33446973 ERF JASPAR yes 118269034
chr1 33446963 33446973 ERG JASPAR yes 118269035
chr1 33446963 33446973 ETS1 JASPAR yes 118269036
chr1 33446963 33446973 ETV3 JASPAR yes 118269037
chr1 33446963 33446973 FEV JASPAR yes 118269038
chr1 33446963 33446973 FLI1 JASPAR yes 118269039
chr1 33446963 33446973 GABPA JASPAR yes 118269040
chr1 33446963 33446974 FLI1 JASPAR yes 28018758
chr1 33446963 33446974 FLI1 JASPAR yes 118269041
chr1 33446964 33446972 EHF JASPAR yes 28018759
chr1 33446964 33446972 FEV JASPAR yes 28018760
chr1 33446964 33446972 EHF JASPAR yes 118269042
chr1 33446964 33446972 FEV JASPAR yes 118269043
chr1 33446965 33446972 SPI1 JASPAR yes 28018761
chr1 33446965 33446972 SPI1 JASPAR yes 118269044
chr1 33446978 33446989 FOXA1 JASPAR yes 28018762
chr1 33446978 33446989 FOXA1 JASPAR yes 118269045
chr1 33447047 33447051 H4TF2 TRANSFAC yes 28018763
chr1 33447047 33447051 H4TF2 TRANSFAC yes 118269046
chr1 33447056 33447066 SP1 JASPAR yes 28018764
chr1 33447056 33447066 SP1 JASPAR yes 118269047
chr1 33447057 33447061 LFA1 TRANSFAC yes 28018765
chr1 33447057 33447061 LFA1 TRANSFAC yes 118269048
chr1 33447093 33447097 YY1 TRANSFAC yes 28018766
chr1 33447093 33447097 YY1 TRANSFAC yes 118269049
chr1 33447098 33447103 ETS2 TRANSFAC yes 28018767
chr1 33447098 33447103 ETS2 TRANSFAC yes 118269050
chr1 33447100 33447108 EHF JASPAR yes 28018768
chr1 33447100 33447108 EHF JASPAR yes 118269051
chr1 33447107 33447116 JDP2 JASPAR yes 28018769
chr1 33447107 33447116 JDP2 JASPAR yes 118269052
chr1 33447125 33447133 MEIS2 JASPAR yes 28018770
chr1 33447125 33447133 MEIS2 JASPAR yes 118269053
chr1 33447126 33447130 NFE TRANSFAC yes 28018771
chr1 33447126 33447130 NFE TRANSFAC yes 118269054
chr1 33447126 33447133 MEIS1 JASPAR yes 28018772
chr1 33447126 33447133 MEIS1 JASPAR yes 118269055
chr1 33447129 33447146 PAX1 JASPAR yes 28018773
chr1 33447129 33447146 PAX1 JASPAR yes 118269056
chr1 33447131 33447145 PAX6 JASPAR yes 28018774
chr1 33447131 33447145 PAX6 JASPAR yes 118269057
chr1 33447139 33447151 PROX1 JASPAR yes 28018775
chr1 33447139 33447151 PROX1 JASPAR yes 118269058
chr1 33447141 33447146 ATF1 TRANSFAC yes 28018776
chr1 33447141 33447146 ATF1 TRANSFAC yes 118269059
chr1 33447141 33447149 CREB1 JASPAR yes 28018777
chr1 33447141 33447149 CREB1 JASPAR yes 118269060
chr1 33447171 33447182 CEBPA JASPAR yes 28018778
chr1 33447171 33447182 CEBPA JASPAR yes 118269061
chr1 33447172 33447183 CEBPB JASPAR yes 28018779
chr1 33447172 33447183 CEBPB JASPAR yes 118269062
chr1 33447198 33447209 E2F6 JASPAR yes 28018780
chr1 33447198 33447209 E2F6 JASPAR yes 118269063
chr1 33447200 33447208 SP1 TRANSFAC yes 28018781
chr1 33447200 33447208 SP1 TRANSFAC yes 118269064
chr1 33447200 33447210 SP1 JASPAR yes 28018782
chr1 33447200 33447210 SP1 JASPAR yes 118269065
chr1 33447202 33447208 MAZ TRANSFAC yes 28018783
chr1 33447202 33447208 MAZ TRANSFAC yes 118269066
chr1 33447206 33447211 SP1 TRANSFAC yes 28018784
chr1 33447206 33447211 SP1 TRANSFAC yes 118269067
chr1 33447211 33447219 MEIS2 JASPAR yes 28018785
chr1 33447211 33447219 MEIS3 JASPAR yes 28018786
chr1 33447211 33447219 MEIS2 JASPAR yes 118269068
chr1 33447211 33447219 MEIS3 JASPAR yes 118269069
chr1 33447211 33447227 POU4F3 JASPAR yes 28018787
chr1 33447211 33447227 POU4F3 JASPAR yes 118269070
chr1 33447212 33447216 NFE TRANSFAC yes 28018788
chr1 33447212 33447216 NFE TRANSFAC yes 118269071
chr1 33447212 33447219 MEIS1 JASPAR yes 28018789
chr1 33447212 33447219 MEIS1 JASPAR yes 118269072
chr1 33447213 33447227 POU4F1 JASPAR yes 28018790
chr1 33447213 33447227 POU4F1 JASPAR yes 118269073
chr1 33447213 33447228 HNF1A JASPAR yes 28018791
chr1 33447213 33447228 HNF1A JASPAR yes 118269074
chr1 33447214 33447226 HNF1B JASPAR yes 28018792
chr1 33447214 33447226 HNF1B JASPAR yes 118269075
chr1 33447214 33447227 HNF1B JASPAR yes 28018793
chr1 33447214 33447227 HNF1B JASPAR yes 118269076
chr1 33447214 33447228 POU4F1 JASPAR yes 28018794
chr1 33447214 33447228 POU4F1 JASPAR yes 118269077
chr1 33447214 33447230 POU4F2 JASPAR yes 28018795
chr1 33447214 33447230 POU4F3 JASPAR yes 28018796
chr1 33447214 33447230 POU4F2 JASPAR yes 118269078
chr1 33447214 33447230 POU4F3 JASPAR yes 118269079
chr1 33447215 33447227 HNF1B JASPAR yes 28018797
chr1 33447215 33447227 HNF1B JASPAR yes 118269080
chr1 33447216 33447230 ONECUT2 JASPAR yes 28018798
chr1 33447216 33447230 ONECUT3 JASPAR yes 28018799
chr1 33447216 33447230 ONECUT2 JASPAR yes 118269081
chr1 33447216 33447230 ONECUT3 JASPAR yes 118269082
chr1 33447217 33447227 LHX6 JASPAR yes 28018800
chr1 33447217 33447227 MNX1 JASPAR yes 28018801
chr1 33447217 33447227 POU6F1 JASPAR yes 28018802
chr1 33447217 33447227 LHX6 JASPAR yes 118269083
chr1 33447217 33447227 MNX1 JASPAR yes 118269084
chr1 33447217 33447227 POU6F1 JASPAR yes 118269085
chr1 33447218 33447226 LMX1A JASPAR yes 28018803
chr1 33447218 33447226 LMX1B JASPAR yes 28018804
chr1 33447218 33447226 NKX6-1 JASPAR yes 28018805
chr1 33447218 33447226 NKX6-2 JASPAR yes 28018806
chr1 33447218 33447226 VAX1 JASPAR yes 28018807
chr1 33447218 33447226 VAX2 JASPAR yes 28018808
chr1 33447218 33447226 VSX1 JASPAR yes 28018809
chr1 33447218 33447226 VSX2 JASPAR yes 28018810
chr1 33447218 33447226 LMX1A JASPAR yes 118269086
chr1 33447218 33447226 LMX1B JASPAR yes 118269087
chr1 33447218 33447226 NKX6-1 JASPAR yes 118269088
chr1 33447218 33447226 NKX6-2 JASPAR yes 118269089
chr1 33447218 33447226 VAX1 JASPAR yes 118269090
chr1 33447218 33447226 VAX2 JASPAR yes 118269091
chr1 33447218 33447226 VSX1 JASPAR yes 118269092
chr1 33447218 33447226 VSX2 JASPAR yes 118269093
chr1 33447219 33447229 PAX3 JASPAR yes 28018811
chr1 33447219 33447229 PAX7 JASPAR yes 28018812
chr1 33447219 33447229 PAX3 JASPAR yes 118269094
chr1 33447219 33447229 PAX7 JASPAR yes 118269095
chr1 33447221 33447233 MEF2A JASPAR yes 28018813
chr1 33447221 33447233 MEF2B JASPAR yes 28018814
chr1 33447221 33447233 MEF2D JASPAR yes 28018815
chr1 33447221 33447233 MEF2A JASPAR yes 118269096
chr1 33447221 33447233 MEF2B JASPAR yes 118269097
chr1 33447221 33447233 MEF2D JASPAR yes 118269098
chr1 33447222 33447232 MEF2A JASPAR yes 28018816
chr1 33447222 33447232 MEF2A JASPAR yes 118269099
chr1 33447229 33447232 MYB TRANSFAC yes 28018817
chr1 33447229 33447232 MYB TRANSFAC yes 118269100
chr1 33447239 33447243 YY1 TRANSFAC yes 28018818
chr1 33447239 33447243 YY1 TRANSFAC yes 118269101
chr1 33447243 33447255 FOXI1 JASPAR yes 28018819
chr1 33447243 33447255 FOXI1 JASPAR yes 118269102
chr1 33447244 33447258 FOXF2 JASPAR yes 28018820
chr1 33447244 33447258 FOXF2 JASPAR yes 118269103
chr1 33447245 33447253 FOXG1 JASPAR yes 28018821
chr1 33447245 33447253 FOXG1 JASPAR yes 118269104
chr1 33447246 33447257 HOXA10 JASPAR yes 28018822
chr1 33447246 33447257 HOXA10 JASPAR yes 118269105
chr1 33447247 33447256 CDX1 JASPAR yes 28018823
chr1 33447247 33447256 CDX1 JASPAR yes 118269106
chr1 33447247 33447258 CDX2 JASPAR yes 28018824
chr1 33447247 33447258 CDX2 JASPAR yes 118269107
chr1 33447249 33447267 ESR2 JASPAR yes 28018825
chr1 33447249 33447267 ESR2 JASPAR yes 118269108
chr1 33447250 33447267 ESR1 JASPAR yes 28018826
chr1 33447250 33447267 ESR1 JASPAR yes 118269109
chr1 33447251 33447266 ESR2 JASPAR yes 28018827
chr1 33447251 33447266 ESR2 JASPAR yes 118269110
chr1 33447257 33447261 YY1 TRANSFAC yes 28018828
chr1 33447257 33447261 YY1 TRANSFAC yes 118269111
chr1 33447260 33447263 MYB TRANSFAC yes 28018829
chr1 33447260 33447263 MYB TRANSFAC yes 118269112
chr1 33447263 33447271 EHF JASPAR yes 28018830
chr1 33447263 33447271 EHF JASPAR yes 118269113
chr1 33447283 33447292 NKX3-2 JASPAR yes 28018831
chr1 33447283 33447292 NKX3-2 JASPAR yes 118269114
chr1 33447287 33447300 SMAD2 JASPAR yes 28018832
chr1 33447287 33447300 SMAD2 JASPAR yes 118269115
chr1 33447291 33447305 CREB3L1 JASPAR yes 28018833
chr1 33447291 33447305 CREB3L1 JASPAR yes 118269116
chr1 33447292 33447302 MAX JASPAR yes 28018834
chr1 33447292 33447302 MAX JASPAR yes 118269117
chr1 33447292 33447306 RXRB JASPAR yes 28018835
chr1 33447292 33447306 RXRB JASPAR yes 118269118
chr1 33447293 33447303 BHLHE40 JASPAR yes 28018836
chr1 33447293 33447303 HEY1 JASPAR yes 28018837
chr1 33447293 33447303 MLXIPL JASPAR yes 28018838
chr1 33447293 33447303 MLX JASPAR yes 28018839
chr1 33447293 33447303 BHLHE40 JASPAR yes 118269119
chr1 33447293 33447303 HEY1 JASPAR yes 118269120
chr1 33447293 33447303 MLXIPL JASPAR yes 118269121
chr1 33447293 33447303 MLX JASPAR yes 118269122
chr1 33447295 33447300 MYC TRANSFAC yes 28018840
chr1 33447295 33447300 USF1 TRANSFAC yes 28018841
chr1 33447295 33447300 USF2 TRANSFAC yes 28018842
chr1 33447295 33447300 MYC TRANSFAC yes 118269123
chr1 33447295 33447300 USF1 TRANSFAC yes 118269124
chr1 33447295 33447300 USF2 TRANSFAC yes 118269125
chr1 33447303 33447317 PLAG1 JASPAR yes 28018843
chr1 33447303 33447317 PLAG1 JASPAR yes 118269126
chr1 33447305 33447309 YY1 TRANSFAC yes 28018844
chr1 33447305 33447309 YY1 TRANSFAC yes 118269127
chr1 33447318 33447321 MYB TRANSFAC yes 28018845
chr1 33447318 33447321 MYB TRANSFAC yes 118269128
chr1 33447359 33447362 MYB TRANSFAC yes 28018846
chr1 33447359 33447362 MYB TRANSFAC yes 118269129
chr1 33447379 33447385 HiNF-A TRANSFAC yes 28018847
chr1 33447379 33447385 HiNF-A TRANSFAC yes 118269130
chr1 33447390 33447403 ZBTB18 JASPAR yes 28018848
chr1 33447390 33447403 ZBTB18 JASPAR yes 118269131
chr1 33447400 33447412 JDP2 JASPAR yes 28018849
chr1 33447400 33447412 JDP2 JASPAR yes 118269132
chr1 33447402 33447409 JUN TRANSFAC yes 28018850
chr1 33447402 33447409 JUN TRANSFAC yes 118269133
chr1 33447409 33447427 NR3C1 JASPAR yes 28018851
chr1 33447409 33447427 NR3C1 JASPAR yes 118269134
chr1 33447413 33447428 FOXA1 JASPAR yes 28018852
chr1 33447413 33447428 FOXA1 JASPAR yes 118269135
chr1 33447414 33447418 YY1 TRANSFAC yes 28018853
chr1 33447414 33447418 YY1 TRANSFAC yes 118269136
chr1 33447415 33447427 FOXC2 JASPAR yes 28018854
chr1 33447415 33447427 FOXC2 JASPAR yes 118269137
chr1 33447415 33447428 POU2F2 JASPAR yes 28018855
chr1 33447415 33447428 POU2F2 JASPAR yes 118269138
chr1 33447416 33447427 FOXB1 JASPAR yes 28018856
chr1 33447416 33447427 FOXC1 JASPAR yes 28018857
chr1 33447416 33447427 FOXB1 JASPAR yes 118269139
chr1 33447416 33447427 FOXC1 JASPAR yes 118269140
chr1 33447416 33447428 POU3F1 JASPAR yes 28018858
chr1 33447416 33447428 POU3F1 JASPAR yes 118269141
chr1 33447417 33447421 YY1 TRANSFAC yes 28018859
chr1 33447417 33447421 YY1 TRANSFAC yes 118269142
chr1 33447417 33447428 FOXA1 JASPAR yes 28018860
chr1 33447417 33447428 FOXA1 JASPAR yes 118269143
chr1 33447418 33447427 POU3F4 JASPAR yes 28018861
chr1 33447418 33447427 POU5F1B JASPAR yes 28018862
chr1 33447418 33447427 POU3F4 JASPAR yes 118269144
chr1 33447418 33447427 POU5F1B JASPAR yes 118269145
chr1 33447464 33447468 YY1 TRANSFAC yes 28018863
chr1 33447464 33447468 YY1 TRANSFAC yes 118269146
chr1 33447480 33447486 SOX10 JASPAR yes 28018864
chr1 33447480 33447486 SOX10 JASPAR yes 118269147
SNP sites on vista1131[chr1:33446816-33447482]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 33446878 rs10798922 T G
EHF
221277
chr1 33446879 rs10914634 A C
EHF
221278
chr1 33446885 rs572931386 T C no 221279
chr1 33447075 rs372955588 A C no 221280
chr1 33447090 rs116531127 G A no 221281
chr1 33447146 rs186294463 G A
ATF1 CREB1 PAX1 PROX1
221282
chr1 33447177 rs145772999 T C
CEBPA CEBPB
221283
chr1 33447178 rs190826921 G A
CEBPA CEBPB
221284
chr1 33447314 rs183013532 C T
PLAG1
221285
chr1 33447318 rs112319153 G A
MYB
221286
chr1 33447343 rs143661607 A G no 221287
Genes possibly regulated by vista1131[chr1:33446816-33447482]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 33351595 33364042 + HPCA ENSG00000121905.5 33351595 0.81 1.0 469 4779
chr1 33360195 33367039 - TMEM54 ENSG00000121900.14 33367039 0.81 1.0 470 20223
chr1 33402046 33430286 - RNF19B ENSG00000116514.12 33430286 0.66 1.0 471 83470
chr1 33439268 33439642 + FKSG48 ENSG00000267885.1 33439268 0.84 1.0 472 92452
chr1 33473585 33546597 - AK2 ENSG00000004455.12 33546597 0.77 1.0 473 885
chr1 33546705 33586131 + ADC ENSG00000142920.12 33546705 0.69 1.0 474 777
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista1131[chr1:33446816-33447482]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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