EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista11498[chr11:109947189-109947580]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista11498[chr11:109947189-109947580]
Back to top
Tissue distribution of vista11498
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista11498[chr11:109947189-109947580]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr11 109947178 109947199 IRF1 JASPAR yes 41328727
chr11 109947178 109947199 ZNF263 JASPAR yes 41328728
chr11 109947178 109947199 IRF1 JASPAR yes 114127186
chr11 109947178 109947199 ZNF263 JASPAR yes 114127187
chr11 109947182 109947197 PRDM1 JASPAR yes 41328729
chr11 109947182 109947197 PRDM1 JASPAR yes 114127188
chr11 109947183 109947204 ZNF263 JASPAR yes 41328730
chr11 109947183 109947204 ZNF263 JASPAR yes 114127189
chr11 109947193 109947203 ZNF740 JASPAR yes 41328731
chr11 109947193 109947203 ZNF740 JASPAR yes 114127190
chr11 109947279 109947285 ZNF354C JASPAR yes 41328732
chr11 109947279 109947285 ZNF354C JASPAR yes 114127191
chr11 109947281 109947292 GCM1 JASPAR yes 41328733
chr11 109947281 109947292 GCM1 JASPAR yes 114127192
chr11 109947282 109947292 GCM2 JASPAR yes 41328734
chr11 109947282 109947292 GCM2 JASPAR yes 114127193
chr11 109947283 109947294 USF2 JASPAR yes 41328735
chr11 109947283 109947294 USF2 JASPAR yes 114127194
chr11 109947284 109947294 TFE3 JASPAR yes 41328736
chr11 109947284 109947294 TFEB JASPAR yes 41328737
chr11 109947284 109947294 TFE3 JASPAR yes 114127195
chr11 109947284 109947294 TFEB JASPAR yes 114127196
chr11 109947284 109947295 USF1 JASPAR yes 41328738
chr11 109947284 109947295 USF1 JASPAR yes 114127197
chr11 109947288 109947299 FOS JASPAR yes 41328739
chr11 109947288 109947299 FOSL1 JASPAR yes 41328740
chr11 109947288 109947299 FOS JASPAR yes 114127198
chr11 109947288 109947299 FOSL1 JASPAR yes 114127199
chr11 109947289 109947298 JDP2 JASPAR yes 41328741
chr11 109947289 109947298 JDP2 JASPAR yes 114127200
chr11 109947290 109947301 BATF JASPAR yes 41328742
chr11 109947290 109947301 BATF JASPAR yes 114127201
chr11 109947300 109947311 E2F6 JASPAR yes 41328743
chr11 109947300 109947311 E2F6 JASPAR yes 114127202
chr11 109947301 109947316 TFAP2C JASPAR yes 41328744
chr11 109947301 109947316 TFAP2C JASPAR yes 114127203
chr11 109947302 109947323 ZNF263 JASPAR yes 41328745
chr11 109947302 109947323 ZNF263 JASPAR yes 114127204
chr11 109947303 109947315 TFAP2A JASPAR yes 41328746
chr11 109947303 109947315 TFAP2A JASPAR yes 114127205
chr11 109947313 109947323 SP1 JASPAR yes 41328747
chr11 109947313 109947323 SP1 JASPAR yes 114127206
chr11 109947337 109947341 YY1 TRANSFAC yes 41328748
chr11 109947337 109947341 YY1 TRANSFAC yes 114127207
chr11 109947342 109947345 MYB TRANSFAC yes 41328749
chr11 109947342 109947345 MYB TRANSFAC yes 114127208
chr11 109947351 109947365 E2F7 JASPAR yes 41328750
chr11 109947351 109947365 E2F7 JASPAR yes 114127209
chr11 109947355 109947360 SP1 TRANSFAC yes 41328751
chr11 109947355 109947360 SP1 TRANSFAC yes 114127210
chr11 109947357 109947362 TFAP2A TRANSFAC yes 41328752
chr11 109947357 109947362 TFAP2A TRANSFAC yes 114127211
chr11 109947357 109947363 MZF1 JASPAR yes 41328753
chr11 109947357 109947363 MZF1 JASPAR yes 114127212
chr11 109947376 109947389 EOMES JASPAR yes 41328754
chr11 109947376 109947389 EOMES JASPAR yes 114127213
chr11 109947378 109947398 TBX19 JASPAR yes 41328755
chr11 109947378 109947398 TBX19 JASPAR yes 114127214
chr11 109947380 109947396 T JASPAR yes 41328756
chr11 109947380 109947396 T JASPAR yes 114127215
chr11 109947389 109947404 RFX5 JASPAR yes 41328757
chr11 109947389 109947404 RFX5 JASPAR yes 114127216
chr11 109947420 109947435 TFAP2A JASPAR yes 41328758
chr11 109947420 109947435 TFAP2A JASPAR yes 114127217
chr11 109947423 109947434 TFAP2A JASPAR yes 41328759
chr11 109947423 109947434 TFAP2B JASPAR yes 41328760
chr11 109947423 109947434 TFAP2C JASPAR yes 41328761
chr11 109947423 109947434 TFAP2A JASPAR yes 114127218
chr11 109947423 109947434 TFAP2B JASPAR yes 114127219
chr11 109947423 109947434 TFAP2C JASPAR yes 114127220
chr11 109947446 109947449 MYB TRANSFAC yes 41328762
chr11 109947446 109947449 MYB TRANSFAC yes 114127221
chr11 109947448 109947455 SPI1 JASPAR yes 41328763
chr11 109947448 109947455 SPI1 JASPAR yes 114127222
chr11 109947448 109947456 FEV JASPAR yes 41328764
chr11 109947448 109947456 FEV JASPAR yes 114127223
chr11 109947450 109947455 ETS2 TRANSFAC yes 41328765
chr11 109947450 109947455 ETS2 TRANSFAC yes 114127224
chr11 109947460 109947464 YY1 TRANSFAC yes 41328766
chr11 109947460 109947464 YY1 TRANSFAC yes 114127225
chr11 109947465 109947477 EHF JASPAR yes 41328767
chr11 109947465 109947477 ELF4 JASPAR yes 41328768
chr11 109947465 109947477 EHF JASPAR yes 114127226
chr11 109947465 109947477 ELF4 JASPAR yes 114127227
chr11 109947465 109947478 ELF3 JASPAR yes 41328769
chr11 109947465 109947478 ELF3 JASPAR yes 114127228
chr11 109947466 109947477 ELF5 JASPAR yes 41328770
chr11 109947466 109947477 ELF5 JASPAR yes 114127229
chr11 109947469 109947475 ETS1 JASPAR yes 41328771
chr11 109947469 109947475 SPI1 JASPAR yes 41328772
chr11 109947469 109947475 ETS1 JASPAR yes 114127230
chr11 109947469 109947475 SPI1 JASPAR yes 114127231
chr11 109947474 109947479 GATA2 JASPAR yes 41328773
chr11 109947474 109947479 GATA2 JASPAR yes 114127232
chr11 109947477 109947482 GATA2 JASPAR yes 41328774
chr11 109947477 109947482 GATA2 JASPAR yes 114127233
chr11 109947505 109947516 FOXA1 JASPAR yes 41328775
chr11 109947505 109947516 FOXA1 JASPAR yes 114127234
chr11 109947505 109947520 FOXA1 JASPAR yes 41328776
chr11 109947505 109947520 FOXA1 JASPAR yes 114127235
chr11 109947516 109947527 HOXC11 JASPAR yes 41328777
chr11 109947516 109947527 HOXC12 JASPAR yes 41328778
chr11 109947516 109947527 HOXC11 JASPAR yes 114127236
chr11 109947516 109947527 HOXC12 JASPAR yes 114127237
chr11 109947517 109947527 HOXD11 JASPAR yes 41328779
chr11 109947517 109947527 HOXD11 JASPAR yes 114127238
chr11 109947524 109947535 CDX2 JASPAR yes 41328780
chr11 109947524 109947535 RUNX1 JASPAR yes 41328781
chr11 109947524 109947535 CDX2 JASPAR yes 114127239
chr11 109947524 109947535 RUNX1 JASPAR yes 114127240
chr11 109947525 109947536 HOXA10 JASPAR yes 41328782
chr11 109947525 109947536 HOXA10 JASPAR yes 114127241
chr11 109947526 109947535 CDX1 JASPAR yes 41328783
chr11 109947526 109947535 CDX1 JASPAR yes 114127242
chr11 109947526 109947536 HOXA13 JASPAR yes 41328784
chr11 109947526 109947536 HOXB13 JASPAR yes 41328785
chr11 109947526 109947536 HOXA13 JASPAR yes 114127243
chr11 109947526 109947536 HOXB13 JASPAR yes 114127244
chr11 109947532 109947547 TFAP2A JASPAR yes 41328786
chr11 109947532 109947547 TFAP2A JASPAR yes 114127245
chr11 109947534 109947549 TFAP2A JASPAR yes 41328787
chr11 109947534 109947549 TFAP2C JASPAR yes 41328788
chr11 109947534 109947549 TFAP2A JASPAR yes 114127246
chr11 109947534 109947549 TFAP2C JASPAR yes 114127247
chr11 109947535 109947546 TFAP2A JASPAR yes 41328789
chr11 109947535 109947546 TFAP2B JASPAR yes 41328790
chr11 109947535 109947546 TFAP2C JASPAR yes 41328791
chr11 109947535 109947546 TFAP2A JASPAR yes 114127248
chr11 109947535 109947546 TFAP2B JASPAR yes 114127249
chr11 109947535 109947546 TFAP2C JASPAR yes 114127250
chr11 109947535 109947547 INSM1 JASPAR yes 41328792
chr11 109947535 109947547 TFAP2A JASPAR yes 41328793
chr11 109947535 109947547 TFAP2B JASPAR yes 41328794
chr11 109947535 109947547 TFAP2C JASPAR yes 41328795
chr11 109947535 109947547 INSM1 JASPAR yes 114127251
chr11 109947535 109947547 TFAP2A JASPAR yes 114127252
chr11 109947535 109947547 TFAP2B JASPAR yes 114127253
chr11 109947535 109947547 TFAP2C JASPAR yes 114127254
chr11 109947536 109947545 TFAP2A JASPAR yes 41328796
chr11 109947536 109947545 TFAP2A JASPAR yes 114127255
chr11 109947540 109947545 SP1 TRANSFAC yes 41328797
chr11 109947540 109947545 SP1 TRANSFAC yes 114127256
chr11 109947550 109947553 MYB TRANSFAC yes 41328798
chr11 109947550 109947553 MYB TRANSFAC yes 114127257
SNP sites on vista11498[chr11:109947189-109947580]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr11 109947319 rs114044206 C A,T
SP1 ZNF263
2254052
chr11 109947326 rs142521274 C T no 2254053
chr11 109947346 rs76459304 CAGG C no 2254054
chr11 109947346 rs79603706 CAGG C no 2254055
chr11 109947435 rs139347190 C A
TFAP2A
2254056
chr11 109947509 rs12270706 A G
FOXA1
2254057
chr11 109947516 rs543239483 AG A
FOXA1 HOXC11 HOXC12
2254058
Genes possibly regulated by vista11498[chr11:109947189-109947580]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr11 109964087 110042566 + ZC3H12C ENSG00000149289.6 109964087 0.75 0.99 11412 83493
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista11498[chr11:109947189-109947580]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results