EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista12135[chr11:129282439-129282677]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista12135[chr11:129282439-129282677]
Back to top
Tissue distribution of vista12135
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista12135[chr11:129282439-129282677]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr11 129282440 129282458 ESR2 JASPAR yes 42373015
chr11 129282440 129282458 ESR2 JASPAR yes 114157393
chr11 129282472 129282483 HOXA10 JASPAR yes 42373016
chr11 129282472 129282483 HOXA10 JASPAR yes 114157394
chr11 129282473 129282483 ALX3 JASPAR yes 42373017
chr11 129282473 129282483 GSX2 JASPAR yes 42373018
chr11 129282473 129282483 MNX1 JASPAR yes 42373019
chr11 129282473 129282483 ALX3 JASPAR yes 114157395
chr11 129282473 129282483 GSX2 JASPAR yes 114157396
chr11 129282473 129282483 MNX1 JASPAR yes 114157397
chr11 129282474 129282482 LMX1A JASPAR yes 42373020
chr11 129282474 129282482 LMX1B JASPAR yes 42373021
chr11 129282474 129282482 NKX6-1 JASPAR yes 42373022
chr11 129282474 129282482 NKX6-2 JASPAR yes 42373023
chr11 129282474 129282482 VAX1 JASPAR yes 42373024
chr11 129282474 129282482 VAX2 JASPAR yes 42373025
chr11 129282474 129282482 VSX1 JASPAR yes 42373026
chr11 129282474 129282482 VSX2 JASPAR yes 42373027
chr11 129282474 129282482 LMX1A JASPAR yes 114157398
chr11 129282474 129282482 LMX1B JASPAR yes 114157399
chr11 129282474 129282482 NKX6-1 JASPAR yes 114157400
chr11 129282474 129282482 NKX6-2 JASPAR yes 114157401
chr11 129282474 129282482 VAX1 JASPAR yes 114157402
chr11 129282474 129282482 VAX2 JASPAR yes 114157403
chr11 129282474 129282482 VSX1 JASPAR yes 114157404
chr11 129282474 129282482 VSX2 JASPAR yes 114157405
chr11 129282479 129282491 POU2F1 JASPAR yes 42373028
chr11 129282479 129282491 POU2F1 JASPAR yes 114157406
chr11 129282479 129282492 POU3F3 JASPAR yes 42373029
chr11 129282479 129282492 POU3F3 JASPAR yes 114157407
chr11 129282479 129282493 POU1F1 JASPAR yes 42373030
chr11 129282479 129282493 POU1F1 JASPAR yes 114157408
chr11 129282480 129282492 POU3F1 JASPAR yes 42373031
chr11 129282480 129282492 POU3F2 JASPAR yes 42373032
chr11 129282480 129282492 POU3F1 JASPAR yes 114157409
chr11 129282480 129282492 POU3F2 JASPAR yes 114157410
chr11 129282480 129282493 POU2F2 JASPAR yes 42373033
chr11 129282480 129282493 POU2F2 JASPAR yes 114157411
chr11 129282481 129282489 POU2F1 TRANSFAC yes 42373034
chr11 129282481 129282489 POU2F1 TRANSFAC yes 114157412
chr11 129282481 129282490 POU3F4 JASPAR yes 42373035
chr11 129282481 129282490 POU5F1B JASPAR yes 42373036
chr11 129282481 129282490 POU3F4 JASPAR yes 114157413
chr11 129282481 129282490 POU5F1B JASPAR yes 114157414
chr11 129282482 129282489 POU2F1 TRANSFAC yes 42373037
chr11 129282482 129282489 POU2F2 TRANSFAC yes 42373038
chr11 129282482 129282489 POU2F1 TRANSFAC yes 114157415
chr11 129282482 129282489 POU2F2 TRANSFAC yes 114157416
chr11 129282484 129282494 NOTO JASPAR yes 42373039
chr11 129282484 129282494 NOTO JASPAR yes 114157417
chr11 129282487 129282505 E2F3 JASPAR yes 42373040
chr11 129282487 129282505 E2F3 JASPAR yes 114157418
chr11 129282494 129282498 LFA1 TRANSFAC yes 42373041
chr11 129282494 129282498 LFA1 TRANSFAC yes 114157419
chr11 129282507 129282522 HSF1 JASPAR yes 42373042
chr11 129282507 129282522 HSF1 JASPAR yes 114157420
chr11 129282508 129282521 HSF1 JASPAR yes 42373043
chr11 129282508 129282521 HSF4 JASPAR yes 42373044
chr11 129282508 129282521 HSF1 JASPAR yes 114157421
chr11 129282508 129282521 HSF4 JASPAR yes 114157422
chr11 129282510 129282525 STAT1 JASPAR yes 42373045
chr11 129282510 129282525 STAT1 JASPAR yes 114157423
chr11 129282512 129282523 STAT1 JASPAR yes 42373046
chr11 129282512 129282523 STAT3 JASPAR yes 42373047
chr11 129282512 129282523 STAT1 JASPAR yes 114157424
chr11 129282512 129282523 STAT3 JASPAR yes 114157425
chr11 129282523 129282529 SP1 TRANSFAC yes 42373048
chr11 129282523 129282529 SP1 TRANSFAC yes 114157426
chr11 129282524 129282529 SP1 TRANSFAC yes 42373049
chr11 129282524 129282529 SP1 TRANSFAC yes 114157427
chr11 129282530 129282533 MYB TRANSFAC yes 42373050
chr11 129282530 129282533 MYB TRANSFAC yes 114157428
chr11 129282530 129282543 ELF3 JASPAR yes 42373051
chr11 129282530 129282543 ELF3 JASPAR yes 114157429
chr11 129282534 129282544 RORA JASPAR yes 42373052
chr11 129282534 129282544 RORA JASPAR yes 114157430
chr11 129282536 129282554 ESR2 JASPAR yes 42373053
chr11 129282536 129282554 ESR2 JASPAR yes 114157431
chr11 129282537 129282543 ESR1 TRANSFAC yes 42373054
chr11 129282537 129282543 ESR1 TRANSFAC yes 114157432
chr11 129282539 129282543 ESR1 TRANSFAC yes 42373055
chr11 129282539 129282543 ESR1 TRANSFAC yes 114157433
chr11 129282546 129282565 RFX2 JASPAR yes 42373056
chr11 129282546 129282565 RFX2 JASPAR yes 114157434
chr11 129282547 129282551 ESR1 TRANSFAC yes 42373057
chr11 129282547 129282551 ESR1 TRANSFAC yes 114157435
chr11 129282571 129282574 MYB TRANSFAC yes 42373058
chr11 129282571 129282574 MYB TRANSFAC yes 114157436
chr11 129282578 129282597 RFX2 JASPAR yes 42373059
chr11 129282578 129282597 RFX2 JASPAR yes 114157437
chr11 129282580 129282595 RFX5 JASPAR yes 42373060
chr11 129282580 129282595 RFX5 JASPAR yes 114157438
chr11 129282582 129282598 RFX2 JASPAR yes 42373061
chr11 129282582 129282598 RFX3 JASPAR yes 42373062
chr11 129282582 129282598 RFX4 JASPAR yes 42373063
chr11 129282582 129282598 RFX5 JASPAR yes 42373064
chr11 129282582 129282598 RFX2 JASPAR yes 114157439
chr11 129282582 129282598 RFX3 JASPAR yes 114157440
chr11 129282582 129282598 RFX4 JASPAR yes 114157441
chr11 129282582 129282598 RFX5 JASPAR yes 114157442
chr11 129282583 129282602 RFX2 JASPAR yes 42373065
chr11 129282583 129282602 RFX2 JASPAR yes 114157443
chr11 129282594 129282604 NFATC3 JASPAR yes 42373066
chr11 129282594 129282604 NFATC3 JASPAR yes 114157444
chr11 129282596 129282603 NFATC2 JASPAR yes 42373067
chr11 129282596 129282603 NFATC2 JASPAR yes 114157445
chr11 129282597 129282605 FOXO3 JASPAR yes 42373068
chr11 129282597 129282605 FOXO3 JASPAR yes 114157446
chr11 129282599 129282613 CREB3L1 JASPAR yes 42373069
chr11 129282599 129282613 CREB3L1 JASPAR yes 114157447
chr11 129282600 129282610 MAX JASPAR yes 42373070
chr11 129282600 129282610 MAX JASPAR yes 114157448
chr11 129282600 129282612 HES5 JASPAR yes 42373071
chr11 129282600 129282612 HES5 JASPAR yes 114157449
chr11 129282601 129282611 CLOCK JASPAR yes 42373072
chr11 129282601 129282611 HEY1 JASPAR yes 42373073
chr11 129282601 129282611 HEY2 JASPAR yes 42373074
chr11 129282601 129282611 MAX JASPAR yes 42373075
chr11 129282601 129282611 MLXIPL JASPAR yes 42373076
chr11 129282601 129282611 MNT JASPAR yes 42373077
chr11 129282601 129282611 TFE3 JASPAR yes 42373078
chr11 129282601 129282611 TFEC JASPAR yes 42373079
chr11 129282601 129282611 CLOCK JASPAR yes 114157450
chr11 129282601 129282611 HEY1 JASPAR yes 114157451
chr11 129282601 129282611 HEY2 JASPAR yes 114157452
chr11 129282601 129282611 MAX JASPAR yes 114157453
chr11 129282601 129282611 MLXIPL JASPAR yes 114157454
chr11 129282601 129282611 MNT JASPAR yes 114157455
chr11 129282601 129282611 TFE3 JASPAR yes 114157456
chr11 129282601 129282611 TFEC JASPAR yes 114157457
chr11 129282602 129282612 MAX JASPAR yes 42373080
chr11 129282602 129282612 MAX JASPAR yes 114157458
chr11 129282603 129282608 MYC TRANSFAC yes 42373081
chr11 129282603 129282608 USF1 TRANSFAC yes 42373082
chr11 129282603 129282608 USF2 TRANSFAC yes 42373083
chr11 129282603 129282608 MYC TRANSFAC yes 114157459
chr11 129282603 129282608 USF1 TRANSFAC yes 114157460
chr11 129282603 129282608 USF2 TRANSFAC yes 114157461
chr11 129282603 129282610 USF1 JASPAR yes 42373084
chr11 129282603 129282610 USF1 JASPAR yes 114157462
chr11 129282618 129282623 SP1 TRANSFAC yes 42373085
chr11 129282618 129282623 SP1 TRANSFAC yes 114157463
chr11 129282646 129282650 NFE TRANSFAC yes 42373086
chr11 129282646 129282650 NFE TRANSFAC yes 114157464
chr11 129282668 129282689 REST JASPAR yes 42373087
chr11 129282668 129282689 REST JASPAR yes 114157465
SNP sites on vista12135[chr11:129282439-129282677]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr11 129282441 rs77842531 C T
ESR2
2363561
chr11 129282528 rs186166975 C T
SP1
2363562
chr11 129282654 rs116509844 G A no 2363563
Genes possibly regulated by vista12135[chr11:129282439-129282677]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr11 129245835 129322171 + BARX2 ENSG00000043039.5 129245835 0.97 0.97 11632 63396
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista12135[chr11:129282439-129282677]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results