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  3. vista153[chr1:5957166-5957512]
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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista153[chr1:5957166-5957512]
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Tissue distribution of vista153
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Transcription factor that possibly regulate vista153[chr1:5957166-5957512]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 5957152 5957166 RORA JASPAR yes 26372380
chr1 5957152 5957166 RORA JASPAR yes 118220472
chr1 5957173 5957188 PRDM1 JASPAR yes 26372381
chr1 5957173 5957188 PRDM1 JASPAR yes 118220473
chr1 5957193 5957196 MYB TRANSFAC yes 26372382
chr1 5957193 5957196 MYB TRANSFAC yes 118220474
chr1 5957195 5957201 SOX10 JASPAR yes 26372383
chr1 5957195 5957201 SOX10 JASPAR yes 118220475
chr1 5957197 5957207 TEAD1 JASPAR yes 26372384
chr1 5957197 5957207 TEAD4 JASPAR yes 26372385
chr1 5957197 5957207 TEAD1 JASPAR yes 118220476
chr1 5957197 5957207 TEAD4 JASPAR yes 118220477
chr1 5957246 5957260 POU1F1 JASPAR yes 26372386
chr1 5957246 5957260 POU1F1 JASPAR yes 118220478
chr1 5957247 5957259 POU3F1 JASPAR yes 26372387
chr1 5957247 5957259 POU3F2 JASPAR yes 26372388
chr1 5957247 5957259 POU3F1 JASPAR yes 118220479
chr1 5957247 5957259 POU3F2 JASPAR yes 118220480
chr1 5957247 5957260 POU3F3 JASPAR yes 26372389
chr1 5957247 5957260 POU3F3 JASPAR yes 118220481
chr1 5957254 5957258 YY1 TRANSFAC yes 26372390
chr1 5957254 5957258 YY1 TRANSFAC yes 118220482
chr1 5957266 5957275 VENTX JASPAR yes 26372391
chr1 5957266 5957275 VENTX JASPAR yes 118220483
chr1 5957266 5957276 ALX3 JASPAR yes 26372392
chr1 5957266 5957276 ESX1 JASPAR yes 26372393
chr1 5957266 5957276 GBX2 JASPAR yes 26372394
chr1 5957266 5957276 GSX1 JASPAR yes 26372395
chr1 5957266 5957276 GSX2 JASPAR yes 26372396
chr1 5957266 5957276 HESX1 JASPAR yes 26372397
chr1 5957266 5957276 HOXB3 JASPAR yes 26372398
chr1 5957266 5957276 LBX2 JASPAR yes 26372399
chr1 5957266 5957276 LHX2 JASPAR yes 26372400
chr1 5957266 5957276 MIXL1 JASPAR yes 26372401
chr1 5957266 5957276 MNX1 JASPAR yes 26372402
chr1 5957266 5957276 RAX JASPAR yes 26372403
chr1 5957266 5957276 ALX3 JASPAR yes 118220484
chr1 5957266 5957276 ESX1 JASPAR yes 118220485
chr1 5957266 5957276 GBX2 JASPAR yes 118220486
chr1 5957266 5957276 GSX1 JASPAR yes 118220487
chr1 5957266 5957276 GSX2 JASPAR yes 118220488
chr1 5957266 5957276 HESX1 JASPAR yes 118220489
chr1 5957266 5957276 HOXB3 JASPAR yes 118220490
chr1 5957266 5957276 LBX2 JASPAR yes 118220491
chr1 5957266 5957276 LHX2 JASPAR yes 118220492
chr1 5957266 5957276 MIXL1 JASPAR yes 118220493
chr1 5957266 5957276 MNX1 JASPAR yes 118220494
chr1 5957266 5957276 RAX JASPAR yes 118220495
chr1 5957267 5957271 H1TF2 TRANSFAC yes 26372404
chr1 5957267 5957271 NFE TRANSFAC yes 26372405
chr1 5957267 5957271 SRF TRANSFAC yes 26372406
chr1 5957267 5957271 H1TF2 TRANSFAC yes 118220496
chr1 5957267 5957271 NFE TRANSFAC yes 118220497
chr1 5957267 5957271 SRF TRANSFAC yes 118220498
chr1 5957267 5957275 BARX1 JASPAR yes 26372407
chr1 5957267 5957275 BSX JASPAR yes 26372408
chr1 5957267 5957275 DLX6 JASPAR yes 26372409
chr1 5957267 5957275 ISX JASPAR yes 26372410
chr1 5957267 5957275 LBX1 JASPAR yes 26372411
chr1 5957267 5957275 LHX9 JASPAR yes 26372412
chr1 5957267 5957275 MSX1 JASPAR yes 26372413
chr1 5957267 5957275 MSX2 JASPAR yes 26372414
chr1 5957267 5957275 NKX6-2 JASPAR yes 26372415
chr1 5957267 5957275 PRRX1 JASPAR yes 26372416
chr1 5957267 5957275 RAX2 JASPAR yes 26372417
chr1 5957267 5957275 SHOX JASPAR yes 26372418
chr1 5957267 5957275 UNCX JASPAR yes 26372419
chr1 5957267 5957275 BARX1 JASPAR yes 118220499
chr1 5957267 5957275 BSX JASPAR yes 118220500
chr1 5957267 5957275 DLX6 JASPAR yes 118220501
chr1 5957267 5957275 ISX JASPAR yes 118220502
chr1 5957267 5957275 LBX1 JASPAR yes 118220503
chr1 5957267 5957275 LHX9 JASPAR yes 118220504
chr1 5957267 5957275 MSX1 JASPAR yes 118220505
chr1 5957267 5957275 MSX2 JASPAR yes 118220506
chr1 5957267 5957275 NKX6-2 JASPAR yes 118220507
chr1 5957267 5957275 PRRX1 JASPAR yes 118220508
chr1 5957267 5957275 RAX2 JASPAR yes 118220509
chr1 5957267 5957275 SHOX JASPAR yes 118220510
chr1 5957267 5957275 UNCX JASPAR yes 118220511
chr1 5957267 5957277 HOXB13 JASPAR yes 26372420
chr1 5957267 5957277 HOXD13 JASPAR yes 26372421
chr1 5957267 5957277 HOXB13 JASPAR yes 118220512
chr1 5957267 5957277 HOXD13 JASPAR yes 118220513
chr1 5957276 5957279 MYB TRANSFAC yes 26372422
chr1 5957276 5957279 MYB TRANSFAC yes 118220514
chr1 5957277 5957290 ATF4 JASPAR yes 26372423
chr1 5957277 5957290 ATF4 JASPAR yes 118220515
chr1 5957292 5957313 REST JASPAR yes 26372424
chr1 5957292 5957313 REST JASPAR yes 118220516
chr1 5957302 5957312 TBX21 JASPAR yes 26372425
chr1 5957302 5957312 TBX21 JASPAR yes 118220517
chr1 5957302 5957313 TBX20 JASPAR yes 26372426
chr1 5957302 5957313 TBX2 JASPAR yes 26372427
chr1 5957302 5957313 TBX20 JASPAR yes 118220518
chr1 5957302 5957313 TBX2 JASPAR yes 118220519
chr1 5957302 5957315 EOMES JASPAR yes 26372428
chr1 5957302 5957315 EOMES JASPAR yes 118220520
chr1 5957303 5957313 TBR1 JASPAR yes 26372429
chr1 5957303 5957313 TBR1 JASPAR yes 118220521
chr1 5957316 5957331 NR2C2 JASPAR yes 26372430
chr1 5957316 5957331 NR2C2 JASPAR yes 118220522
chr1 5957317 5957331 RXRB JASPAR yes 26372431
chr1 5957317 5957331 RXRG JASPAR yes 26372432
chr1 5957317 5957331 RXRB JASPAR yes 118220523
chr1 5957317 5957331 RXRG JASPAR yes 118220524
chr1 5957324 5957339 RFX5 JASPAR yes 26372433
chr1 5957324 5957339 RFX5 JASPAR yes 118220525
chr1 5957332 5957337 TFAP2A TRANSFAC yes 26372434
chr1 5957332 5957337 TFAP2A TRANSFAC yes 118220526
chr1 5957332 5957338 MZF1 JASPAR yes 26372435
chr1 5957332 5957338 MZF1 JASPAR yes 118220527
chr1 5957341 5957354 POU2F2 JASPAR yes 26372436
chr1 5957341 5957354 POU2F2 JASPAR yes 118220528
chr1 5957342 5957354 POU3F1 JASPAR yes 26372437
chr1 5957342 5957354 POU3F2 JASPAR yes 26372438
chr1 5957342 5957354 POU3F1 JASPAR yes 118220529
chr1 5957342 5957354 POU3F2 JASPAR yes 118220530
chr1 5957342 5957355 POU3F3 JASPAR yes 26372439
chr1 5957342 5957355 POU3F3 JASPAR yes 118220531
chr1 5957343 5957347 YY1 TRANSFAC yes 26372440
chr1 5957343 5957347 YY1 TRANSFAC yes 118220532
chr1 5957343 5957355 POU2F1 JASPAR yes 26372441
chr1 5957343 5957355 POU2F1 JASPAR yes 118220533
chr1 5957344 5957351 POU2F1 TRANSFAC yes 26372442
chr1 5957344 5957351 POU2F2C TRANSFAC yes 26372443
chr1 5957344 5957351 POU2F2 TRANSFAC yes 26372444
chr1 5957344 5957351 POU2F1 TRANSFAC yes 118220534
chr1 5957344 5957351 POU2F2C TRANSFAC yes 118220535
chr1 5957344 5957351 POU2F2 TRANSFAC yes 118220536
chr1 5957344 5957353 POU3F4 JASPAR yes 26372445
chr1 5957344 5957353 POU5F1B JASPAR yes 26372446
chr1 5957344 5957353 POU3F4 JASPAR yes 118220537
chr1 5957344 5957353 POU5F1B JASPAR yes 118220538
chr1 5957345 5957359 TLX1 JASPAR yes 26372447
chr1 5957345 5957359 TLX1 JASPAR yes 118220539
chr1 5957346 5957360 TLX1 JASPAR yes 26372448
chr1 5957346 5957360 TLX1 JASPAR yes 118220540
chr1 5957370 5957382 PROX1 JASPAR yes 26372449
chr1 5957370 5957382 PROX1 JASPAR yes 118220541
chr1 5957380 5957391 BATF JASPAR yes 26372450
chr1 5957380 5957391 BATF JASPAR yes 118220542
chr1 5957384 5957398 TCF7L2 JASPAR yes 26372451
chr1 5957384 5957398 TCF7L2 JASPAR yes 118220543
chr1 5957384 5957399 LEF1 JASPAR yes 26372452
chr1 5957384 5957399 NR2C2 JASPAR yes 26372453
chr1 5957384 5957399 LEF1 JASPAR yes 118220544
chr1 5957384 5957399 NR2C2 JASPAR yes 118220545
chr1 5957385 5957399 RXRB JASPAR yes 26372454
chr1 5957385 5957399 RXRG JASPAR yes 26372455
chr1 5957385 5957399 RXRB JASPAR yes 118220546
chr1 5957385 5957399 RXRG JASPAR yes 118220547
chr1 5957388 5957394 TCF1 TRANSFAC yes 26372456
chr1 5957388 5957394 TCF1 TRANSFAC yes 118220548
chr1 5957429 5957434 SP1 TRANSFAC yes 26372457
chr1 5957429 5957434 SP1 TRANSFAC yes 118220549
chr1 5957429 5957438 HIC2 JASPAR yes 26372458
chr1 5957429 5957438 HIC2 JASPAR yes 118220550
chr1 5957432 5957436 LFA1 TRANSFAC yes 26372459
chr1 5957432 5957436 LFA1 TRANSFAC yes 118220551
chr1 5957438 5957448 HMBOX1 JASPAR yes 26372460
chr1 5957438 5957448 HMBOX1 JASPAR yes 118220552
chr1 5957440 5957443 MYB TRANSFAC yes 26372461
chr1 5957440 5957443 MYB TRANSFAC yes 118220553
chr1 5957447 5957460 DUXA JASPAR yes 26372462
chr1 5957447 5957460 DUXA JASPAR yes 118220554
chr1 5957448 5957459 DUX4 JASPAR yes 26372463
chr1 5957448 5957459 DUX4 JASPAR yes 118220555
chr1 5957465 5957468 MYB TRANSFAC yes 26372464
chr1 5957465 5957468 MYB TRANSFAC yes 118220556
chr1 5957466 5957481 SOX21 JASPAR yes 26372465
chr1 5957466 5957481 SOX21 JASPAR yes 118220557
chr1 5957473 5957479 GATA3 JASPAR yes 26372466
chr1 5957473 5957479 GATA3 JASPAR yes 118220558
chr1 5957491 5957502 EBF1 JASPAR yes 26372467
chr1 5957491 5957502 EBF1 JASPAR yes 118220559
chr1 5957495 5957515 RREB1 JASPAR yes 26372468
chr1 5957495 5957515 RREB1 JASPAR yes 118220560
chr1 5957503 5957508 SP1 TRANSFAC yes 26372469
chr1 5957503 5957508 SP1 TRANSFAC yes 118220561
SNP sites on vista153[chr1:5957166-5957512]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 5957342 rs12139627 G A
POU2F2 POU3F1 POU3F2 POU3F3
35340
chr1 5957465 rs527683507 G A,T
MYB
35341
Genes possibly regulated by vista153[chr1:5957166-5957512]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 5922871 6052533 - NPHP4 ENSG00000131697.13 6052533 0.78 1.0 87 4979
chr1 6051526 6161253 + KCNAB2 ENSG00000069424.10 6051526 0.83 1.0 88 5986
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista153[chr1:5957166-5957512]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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No results