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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista17009[chr13:110401088-110401398]
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Tissue distribution of vista17009
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Transcription factor that possibly regulate vista17009[chr13:110401088-110401398]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr13 110401088 110401102 FOXF2 JASPAR yes 19340863
chr13 110401088 110401102 FOXF2 JASPAR yes 60291210
chr13 110401090 110401101 FOXB1 JASPAR yes 19340864
chr13 110401090 110401101 FOXC1 JASPAR yes 19340865
chr13 110401090 110401101 FOXB1 JASPAR yes 60291211
chr13 110401090 110401101 FOXC1 JASPAR yes 60291212
chr13 110401090 110401102 FOXC2 JASPAR yes 19340866
chr13 110401090 110401102 FOXC2 JASPAR yes 60291213
chr13 110401091 110401099 GATA3 JASPAR yes 19340867
chr13 110401091 110401099 GATA3 JASPAR yes 60291214
chr13 110401093 110401101 FOXG1 JASPAR yes 19340868
chr13 110401093 110401101 FOXG1 JASPAR yes 60291215
chr13 110401096 110401106 MYF6 JASPAR yes 19340869
chr13 110401096 110401106 NEUROG2 JASPAR yes 19340870
chr13 110401096 110401106 MYF6 JASPAR yes 60291216
chr13 110401096 110401106 NEUROG2 JASPAR yes 60291217
chr13 110401098 110401102 YY1 TRANSFAC yes 19340871
chr13 110401098 110401102 YY1 TRANSFAC yes 60291218
chr13 110401099 110401114 FOXP1 JASPAR yes 19340872
chr13 110401099 110401114 MEF2C JASPAR yes 19340873
chr13 110401099 110401114 FOXP1 JASPAR yes 60291219
chr13 110401099 110401114 MEF2C JASPAR yes 60291220
chr13 110401107 110401125 MAFF JASPAR yes 19340874
chr13 110401107 110401125 MAFF JASPAR yes 60291221
chr13 110401108 110401123 MAFK JASPAR yes 19340875
chr13 110401108 110401123 MAFK JASPAR yes 60291222
chr13 110401122 110401128 SOX10 JASPAR yes 19340876
chr13 110401122 110401128 SOX10 JASPAR yes 60291223
chr13 110401124 110401139 FOXP1 JASPAR yes 19340877
chr13 110401124 110401139 FOXP1 JASPAR yes 60291224
chr13 110401124 110401145 IRF1 JASPAR yes 19340878
chr13 110401124 110401145 IRF1 JASPAR yes 60291225
chr13 110401128 110401142 IRF7 JASPAR yes 19340879
chr13 110401128 110401142 IRF7 JASPAR yes 60291226
chr13 110401133 110401137 YY1 TRANSFAC yes 19340880
chr13 110401133 110401137 YY1 TRANSFAC yes 60291227
chr13 110401166 110401181 AR JASPAR yes 19340881
chr13 110401166 110401181 AR JASPAR yes 60291228
chr13 110401181 110401189 EHF JASPAR yes 19340882
chr13 110401181 110401189 EHF JASPAR yes 60291229
chr13 110401205 110401211 MAZ TRANSFAC yes 19340883
chr13 110401205 110401211 MAZ TRANSFAC yes 60291230
chr13 110401208 110401229 ZNF263 JASPAR yes 19340884
chr13 110401208 110401229 ZNF263 JASPAR yes 60291231
chr13 110401214 110401225 E2F1 JASPAR yes 19340885
chr13 110401214 110401225 E2F1 JASPAR yes 60291232
chr13 110401215 110401226 E2F4 JASPAR yes 19340886
chr13 110401215 110401226 E2F6 JASPAR yes 19340887
chr13 110401215 110401226 E2F4 JASPAR yes 60291233
chr13 110401215 110401226 E2F6 JASPAR yes 60291234
chr13 110401219 110401225 MAZ TRANSFAC yes 19340888
chr13 110401219 110401225 MAZ TRANSFAC yes 60291235
chr13 110401247 110401252 TFAP2A TRANSFAC yes 19340889
chr13 110401247 110401252 TFAP2A TRANSFAC yes 60291236
chr13 110401247 110401253 MZF1 JASPAR yes 19340890
chr13 110401247 110401253 MZF1 JASPAR yes 60291237
chr13 110401306 110401321 HNF4A JASPAR yes 19340891
chr13 110401306 110401321 HNF4A JASPAR yes 60291238
chr13 110401307 110401321 NR2F1 JASPAR yes 19340892
chr13 110401307 110401321 RXRB JASPAR yes 19340893
chr13 110401307 110401321 RXRG JASPAR yes 19340894
chr13 110401307 110401321 NR2F1 JASPAR yes 60291239
chr13 110401307 110401321 RXRB JASPAR yes 60291240
chr13 110401307 110401321 RXRG JASPAR yes 60291241
chr13 110401307 110401322 HNF4G JASPAR yes 19340895
chr13 110401307 110401322 HNF4G JASPAR yes 60291242
chr13 110401310 110401322 IRF1 JASPAR yes 19340896
chr13 110401310 110401322 IRF1 JASPAR yes 60291243
chr13 110401317 110401332 STAT1 JASPAR yes 19340897
chr13 110401317 110401332 STAT1 JASPAR yes 60291244
chr13 110401319 110401330 STAT3 JASPAR yes 19340898
chr13 110401319 110401330 STAT3 JASPAR yes 60291245
chr13 110401335 110401356 ZNF263 JASPAR yes 19340899
chr13 110401335 110401356 ZNF263 JASPAR yes 60291246
chr13 110401342 110401347 TFAP2A TRANSFAC yes 19340900
chr13 110401342 110401347 TFAP2A TRANSFAC yes 60291247
chr13 110401342 110401348 MZF1 JASPAR yes 19340901
chr13 110401342 110401348 MZF1 JASPAR yes 60291248
chr13 110401342 110401363 ZNF263 JASPAR yes 19340902
chr13 110401342 110401363 ZNF263 JASPAR yes 60291249
chr13 110401345 110401351 PEA3 TRANSFAC yes 19340903
chr13 110401345 110401351 PEA3 TRANSFAC yes 60291250
chr13 110401346 110401354 EHF JASPAR yes 19340904
chr13 110401346 110401354 EHF JASPAR yes 60291251
chr13 110401354 110401368 POU1F1 JASPAR yes 19340905
chr13 110401354 110401368 POU1F1 JASPAR yes 60291252
chr13 110401355 110401367 POU3F1 JASPAR yes 19340906
chr13 110401355 110401367 POU3F1 JASPAR yes 60291253
chr13 110401355 110401368 POU3F3 JASPAR yes 19340907
chr13 110401355 110401368 POU3F3 JASPAR yes 60291254
chr13 110401356 110401368 POU2F1 JASPAR yes 19340908
chr13 110401356 110401368 POU2F1 JASPAR yes 60291255
chr13 110401359 110401373 POU4F1 JASPAR yes 19340909
chr13 110401359 110401373 POU4F1 JASPAR yes 60291256
chr13 110401359 110401375 POU4F2 JASPAR yes 19340910
chr13 110401359 110401375 POU4F3 JASPAR yes 19340911
chr13 110401359 110401375 POU4F2 JASPAR yes 60291257
chr13 110401359 110401375 POU4F3 JASPAR yes 60291258
chr13 110401360 110401376 POU4F2 JASPAR yes 19340912
chr13 110401360 110401376 POU4F2 JASPAR yes 60291259
chr13 110401362 110401376 POU4F1 JASPAR yes 19340913
chr13 110401362 110401376 POU4F1 JASPAR yes 60291260
chr13 110401368 110401389 IRF1 JASPAR yes 19340914
chr13 110401368 110401389 IRF1 JASPAR yes 60291261
chr13 110401373 110401377 YY1 TRANSFAC yes 19340915
chr13 110401373 110401377 YY1 TRANSFAC yes 60291262
chr13 110401373 110401394 IRF1 JASPAR yes 19340916
chr13 110401373 110401394 IRF1 JASPAR yes 60291263
chr13 110401374 110401389 FOXP1 JASPAR yes 19340917
chr13 110401374 110401389 FOXP1 JASPAR yes 60291264
chr13 110401374 110401395 IRF1 JASPAR yes 19340918
chr13 110401374 110401395 IRF1 JASPAR yes 60291265
chr13 110401375 110401387 FOXC2 JASPAR yes 19340919
chr13 110401375 110401387 FOXC2 JASPAR yes 60291266
chr13 110401377 110401381 YY1 TRANSFAC yes 19340920
chr13 110401377 110401381 YY1 TRANSFAC yes 60291267
chr13 110401379 110401394 FOXP1 JASPAR yes 19340921
chr13 110401379 110401394 FOXP1 JASPAR yes 60291268
chr13 110401380 110401395 FOXP1 JASPAR yes 19340922
chr13 110401380 110401395 FOXP1 JASPAR yes 60291269
chr13 110401387 110401402 MEF2C JASPAR yes 19340923
chr13 110401387 110401402 MEF2C JASPAR yes 60291270
SNP sites on vista17009[chr13:110401088-110401398]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr13 110401176 rs7321293 G A
AR
3387570
chr13 110401220 rs142867535 G A
E2F1 E2F4 E2F6 MAZ ZNF263
3387571
chr13 110401276 rs551521453 T C no 3387572
chr13 110401303 rs35135742 G A no 3387573
chr13 110401304 rs76944188 T C no 3387574
Genes possibly regulated by vista17009[chr13:110401088-110401398]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr13 110406184 110438915 - IRS2 ENSG00000185950.7 110438915 0.77 1.0 13018 62483
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista17009[chr13:110401088-110401398]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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