EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista17035[chr13:110950675-110951614]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista17035[chr13:110950675-110951614]
Back to top
Tissue distribution of vista17035
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista17035[chr13:110950675-110951614]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr13 110950661 110950681 TP53 JASPAR yes 19342251
chr13 110950661 110950681 TP53 JASPAR yes 60335021
chr13 110950665 110950677 FOXI1 JASPAR yes 19342252
chr13 110950665 110950677 FOXI1 JASPAR yes 60335023
chr13 110950678 110950686 GATA3 JASPAR yes 19342253
chr13 110950678 110950686 GATA3 JASPAR yes 60335024
chr13 110950700 110950711 STAT3 JASPAR yes 19342254
chr13 110950700 110950711 STAT3 JASPAR yes 60335025
chr13 110950724 110950729 GATA2 JASPAR yes 19342255
chr13 110950724 110950729 GATA2 JASPAR yes 60335026
chr13 110950725 110950736 NFIL3 JASPAR yes 19342256
chr13 110950725 110950736 NFIL3 JASPAR yes 60335027
chr13 110950728 110950736 GMEB2 JASPAR yes 19342257
chr13 110950728 110950736 GMEB2 JASPAR yes 60335028
chr13 110950731 110950742 HOXA10 JASPAR yes 19342258
chr13 110950731 110950742 HOXA10 JASPAR yes 60335029
chr13 110950732 110950741 CDX1 JASPAR yes 19342259
chr13 110950732 110950741 CDX1 JASPAR yes 60335030
chr13 110950732 110950742 HOXA13 JASPAR yes 19342260
chr13 110950732 110950742 HOXB13 JASPAR yes 19342261
chr13 110950732 110950742 HOXC10 JASPAR yes 19342262
chr13 110950732 110950742 HOXD13 JASPAR yes 19342263
chr13 110950732 110950742 HOXA13 JASPAR yes 60335031
chr13 110950732 110950742 HOXB13 JASPAR yes 60335032
chr13 110950732 110950742 HOXC10 JASPAR yes 60335033
chr13 110950732 110950742 HOXD13 JASPAR yes 60335034
chr13 110950746 110950760 SPIC JASPAR yes 19342264
chr13 110950746 110950760 SPIC JASPAR yes 60335035
chr13 110950755 110950762 NFATC2 JASPAR yes 19342265
chr13 110950755 110950762 NFATC2 JASPAR yes 60335036
chr13 110950768 110950782 ONECUT1 JASPAR yes 19342266
chr13 110950768 110950782 ONECUT2 JASPAR yes 19342267
chr13 110950768 110950782 ONECUT3 JASPAR yes 19342268
chr13 110950768 110950782 ONECUT1 JASPAR yes 60335037
chr13 110950768 110950782 ONECUT2 JASPAR yes 60335038
chr13 110950768 110950782 ONECUT3 JASPAR yes 60335039
chr13 110950769 110950779 CUX2 JASPAR yes 19342269
chr13 110950769 110950779 CUX2 JASPAR yes 60335040
chr13 110950830 110950833 MYB TRANSFAC yes 19342270
chr13 110950830 110950833 MYB TRANSFAC yes 60335041
chr13 110950840 110950846 ZNF354C JASPAR yes 19342271
chr13 110950840 110950846 ZNF354C JASPAR yes 60335042
chr13 110950846 110950857 NFKB1 JASPAR yes 19342272
chr13 110950846 110950857 NFKB1 JASPAR yes 60335043
chr13 110950848 110950852 YY1 TRANSFAC yes 19342273
chr13 110950848 110950852 YY1 TRANSFAC yes 60335044
chr13 110950863 110950877 RORA JASPAR yes 19342274
chr13 110950863 110950877 RORA JASPAR yes 60335045
chr13 110950864 110950874 RORA JASPAR yes 19342275
chr13 110950864 110950874 RORA JASPAR yes 60335046
chr13 110950869 110950873 YY1 TRANSFAC yes 19342276
chr13 110950869 110950873 YY1 TRANSFAC yes 60335047
chr13 110950873 110950892 PAX5 JASPAR yes 19342277
chr13 110950873 110950892 PAX5 JASPAR yes 60335048
chr13 110950888 110950896 GATA3 JASPAR yes 19342278
chr13 110950888 110950896 GATA3 JASPAR yes 60335049
chr13 110950908 110950919 ELK4 JASPAR yes 19342279
chr13 110950908 110950919 ELK4 JASPAR yes 60335050
chr13 110950909 110950913 YY1 TRANSFAC yes 19342280
chr13 110950909 110950913 YY1 TRANSFAC yes 60335051
chr13 110950909 110950919 ELK1 JASPAR yes 19342281
chr13 110950909 110950919 ELK3 JASPAR yes 19342282
chr13 110950909 110950919 ERG JASPAR yes 19342283
chr13 110950909 110950919 ETS1 JASPAR yes 19342284
chr13 110950909 110950919 ETV1 JASPAR yes 19342285
chr13 110950909 110950919 ETV3 JASPAR yes 19342286
chr13 110950909 110950919 ETV4 JASPAR yes 19342287
chr13 110950909 110950919 FEV JASPAR yes 19342288
chr13 110950909 110950919 FLI1 JASPAR yes 19342289
chr13 110950909 110950919 ELK1 JASPAR yes 60335052
chr13 110950909 110950919 ELK3 JASPAR yes 60335053
chr13 110950909 110950919 ERG JASPAR yes 60335054
chr13 110950909 110950919 ETS1 JASPAR yes 60335055
chr13 110950909 110950919 ETV1 JASPAR yes 60335056
chr13 110950909 110950919 ETV3 JASPAR yes 60335057
chr13 110950909 110950919 ETV4 JASPAR yes 60335058
chr13 110950909 110950919 FEV JASPAR yes 60335059
chr13 110950909 110950919 FLI1 JASPAR yes 60335060
chr13 110950910 110950918 FEV JASPAR yes 19342290
chr13 110950910 110950918 FEV JASPAR yes 60335061
chr13 110950910 110950919 ELK4 JASPAR yes 19342291
chr13 110950910 110950919 ELK4 JASPAR yes 60335062
chr13 110950911 110950917 ETS1 JASPAR yes 19342292
chr13 110950911 110950917 ETS1 JASPAR yes 60335063
chr13 110950911 110950921 ELK1 JASPAR yes 19342293
chr13 110950911 110950921 ELK1 JASPAR yes 60335064
chr13 110950930 110950945 MEF2A JASPAR yes 19342294
chr13 110950930 110950945 MEF2A JASPAR yes 60335065
chr13 110950931 110950946 MEF2C JASPAR yes 19342295
chr13 110950931 110950946 MEF2C JASPAR yes 60335066
chr13 110950934 110950938 YY1 TRANSFAC yes 19342296
chr13 110950934 110950938 YY1 TRANSFAC yes 60335067
chr13 110950947 110950950 MYB TRANSFAC yes 19342297
chr13 110950947 110950950 MYB TRANSFAC yes 60335068
chr13 110950957 110950972 LEF1 JASPAR yes 19342298
chr13 110950957 110950972 LEF1 JASPAR yes 60335069
chr13 110950958 110950972 GATA2 JASPAR yes 19342299
chr13 110950958 110950972 TCF7L2 JASPAR yes 19342300
chr13 110950958 110950972 GATA2 JASPAR yes 60335070
chr13 110950958 110950972 TCF7L2 JASPAR yes 60335071
chr13 110950962 110950970 GATA3 JASPAR yes 19342301
chr13 110950962 110950970 GATA3 JASPAR yes 60335072
chr13 110950973 110950985 GRHL1 JASPAR yes 19342302
chr13 110950973 110950985 GRHL1 JASPAR yes 60335073
chr13 110950974 110950984 TFCP2 JASPAR yes 19342303
chr13 110950974 110950984 TFCP2 JASPAR yes 60335074
chr13 110950975 110950986 SPDEF JASPAR yes 19342304
chr13 110950975 110950986 SPDEF JASPAR yes 60335075
chr13 110950982 110950990 E2F1 JASPAR yes 19342305
chr13 110950982 110950990 E2F1 JASPAR yes 60335076
chr13 110950988 110950999 HOXC11 JASPAR yes 19342306
chr13 110950988 110950999 HOXC12 JASPAR yes 19342307
chr13 110950988 110950999 HOXD12 JASPAR yes 19342308
chr13 110950988 110950999 HOXC11 JASPAR yes 60335077
chr13 110950988 110950999 HOXC12 JASPAR yes 60335078
chr13 110950988 110950999 HOXD12 JASPAR yes 60335079
chr13 110950989 110950999 HOXC10 JASPAR yes 19342309
chr13 110950989 110950999 HOXD11 JASPAR yes 19342310
chr13 110950989 110950999 HOXC10 JASPAR yes 60335080
chr13 110950989 110950999 HOXD11 JASPAR yes 60335081
chr13 110951004 110951017 ELF1 JASPAR yes 19342311
chr13 110951004 110951017 ELF1 JASPAR yes 60335082
chr13 110951005 110951017 ELF1 JASPAR yes 19342312
chr13 110951005 110951017 ELF1 JASPAR yes 60335083
chr13 110951006 110951017 ELF5 JASPAR yes 19342313
chr13 110951006 110951017 ELF5 JASPAR yes 60335084
chr13 110951007 110951014 ETS1 TRANSFAC yes 19342314
chr13 110951007 110951014 ETS1 TRANSFAC yes 60335085
chr13 110951025 110951040 TFAP2C JASPAR yes 19342315
chr13 110951025 110951040 TFAP2C JASPAR yes 60335086
chr13 110951031 110951052 ZNF263 JASPAR yes 19342316
chr13 110951031 110951052 ZNF263 JASPAR yes 60335087
chr13 110951036 110951044 TBX15 JASPAR yes 19342317
chr13 110951036 110951044 TBX15 JASPAR yes 60335088
chr13 110951036 110951047 E2F6 JASPAR yes 19342318
chr13 110951036 110951047 E2F6 JASPAR yes 60335089
chr13 110951037 110951042 SP1 TRANSFAC yes 19342319
chr13 110951037 110951042 SP1 TRANSFAC yes 60335090
chr13 110951040 110951046 MAZ TRANSFAC yes 19342320
chr13 110951040 110951046 MAZ TRANSFAC yes 60335091
chr13 110951040 110951051 E2F6 JASPAR yes 19342321
chr13 110951040 110951051 E2F6 JASPAR yes 60335092
chr13 110951059 110951074 HNF4G JASPAR yes 19342322
chr13 110951059 110951074 HNF4G JASPAR yes 60335093
chr13 110951060 110951075 HNF4A JASPAR yes 19342323
chr13 110951060 110951075 HNF4A JASPAR yes 60335094
chr13 110951083 110951095 INSM1 JASPAR yes 19342324
chr13 110951083 110951095 INSM1 JASPAR yes 60335095
chr13 110951083 110951101 NFYA JASPAR yes 19342325
chr13 110951083 110951101 NFYA JASPAR yes 60335096
chr13 110951177 110951183 YY1 JASPAR yes 19342326
chr13 110951177 110951183 YY1 JASPAR yes 60335097
chr13 110951184 110951205 IRF1 JASPAR yes 19342327
chr13 110951184 110951205 IRF1 JASPAR yes 60335098
chr13 110951253 110951268 NR2C2 JASPAR yes 19342328
chr13 110951253 110951268 NR2C2 JASPAR yes 60335099
chr13 110951256 110951260 LFA1 TRANSFAC yes 19342329
chr13 110951256 110951260 LFA1 TRANSFAC yes 60335100
chr13 110951263 110951278 TFAP2C JASPAR yes 19342330
chr13 110951263 110951278 TFAP2C JASPAR yes 60335101
chr13 110951287 110951291 YY1 TRANSFAC yes 19342331
chr13 110951287 110951291 YY1 TRANSFAC yes 60335102
chr13 110951295 110951305 SREBF1 JASPAR yes 19342332
chr13 110951295 110951305 SREBF2 JASPAR yes 19342333
chr13 110951295 110951305 SREBF1 JASPAR yes 60335103
chr13 110951295 110951305 SREBF2 JASPAR yes 60335104
chr13 110951315 110951321 ZNF354C JASPAR yes 19342334
chr13 110951315 110951321 ZNF354C JASPAR yes 60335105
chr13 110951331 110951342 ELK4 JASPAR yes 19342335
chr13 110951331 110951342 FLI1 JASPAR yes 19342336
chr13 110951331 110951342 ELK4 JASPAR yes 60335106
chr13 110951331 110951342 FLI1 JASPAR yes 60335107
chr13 110951332 110951342 ETV6 JASPAR yes 19342337
chr13 110951332 110951342 ETV6 JASPAR yes 60335108
chr13 110951332 110951345 ELF1 JASPAR yes 19342338
chr13 110951332 110951345 ELF1 JASPAR yes 60335109
chr13 110951333 110951340 SPI1 JASPAR yes 19342339
chr13 110951333 110951340 SPI1 JASPAR yes 60335110
chr13 110951333 110951341 EHF JASPAR yes 19342340
chr13 110951333 110951341 FEV JASPAR yes 19342341
chr13 110951333 110951341 EHF JASPAR yes 60335111
chr13 110951333 110951341 FEV JASPAR yes 60335112
chr13 110951357 110951372 HSF1 JASPAR yes 19342342
chr13 110951357 110951372 HSF1 JASPAR yes 60335113
chr13 110951358 110951371 HSF1 JASPAR yes 19342343
chr13 110951358 110951371 HSF2 JASPAR yes 19342344
chr13 110951358 110951371 HSF4 JASPAR yes 19342345
chr13 110951358 110951371 HSF1 JASPAR yes 60335114
chr13 110951358 110951371 HSF2 JASPAR yes 60335115
chr13 110951358 110951371 HSF4 JASPAR yes 60335116
chr13 110951366 110951374 EHF JASPAR yes 19342346
chr13 110951366 110951374 EHF JASPAR yes 60335117
chr13 110951371 110951382 E2F4 JASPAR yes 19342347
chr13 110951371 110951382 E2F4 JASPAR yes 60335118
chr13 110951372 110951393 ZNF263 JASPAR yes 19342348
chr13 110951372 110951393 ZNF263 JASPAR yes 60335119
chr13 110951374 110951380 SP1 TRANSFAC yes 19342349
chr13 110951374 110951380 SP1 TRANSFAC yes 60335120
chr13 110951374 110951384 SP1 JASPAR yes 19342350
chr13 110951374 110951384 SP1 JASPAR yes 60335121
chr13 110951376 110951381 SP1 TRANSFAC yes 19342351
chr13 110951376 110951381 SP1 TRANSFAC yes 60335122
chr13 110951379 110951390 USF1 JASPAR yes 19342352
chr13 110951379 110951390 USF1 JASPAR yes 60335123
chr13 110951381 110951394 NR2F1 JASPAR yes 19342353
chr13 110951381 110951394 NR2F1 JASPAR yes 60335124
chr13 110951384 110951392 NR4A2 JASPAR yes 19342354
chr13 110951384 110951392 NR4A2 JASPAR yes 60335125
chr13 110951404 110951417 ZBTB18 JASPAR yes 19342355
chr13 110951404 110951417 ZBTB18 JASPAR yes 60335126
chr13 110951423 110951432 THAP1 JASPAR yes 19342356
chr13 110951423 110951432 THAP1 JASPAR yes 60335127
chr13 110951426 110951430 LFA1 TRANSFAC yes 19342357
chr13 110951426 110951430 LFA1 TRANSFAC yes 60335128
chr13 110951443 110951453 NFATC3 JASPAR yes 19342358
chr13 110951443 110951453 NFATC3 JASPAR yes 60335129
chr13 110951445 110951451 ETS1 JASPAR yes 19342359
chr13 110951445 110951451 ETS1 JASPAR yes 60335130
chr13 110951457 110951463 SOX10 JASPAR yes 19342360
chr13 110951457 110951463 SOX10 JASPAR yes 60335131
chr13 110951469 110951475 MAZ TRANSFAC yes 19342361
chr13 110951469 110951475 MAZ TRANSFAC yes 60335132
chr13 110951518 110951521 MYB TRANSFAC yes 19342362
chr13 110951518 110951521 MYB TRANSFAC yes 60335133
chr13 110951586 110951590 NFE TRANSFAC yes 19342363
chr13 110951586 110951590 NFE TRANSFAC yes 60335134
chr13 110951597 110951612 NR2C2 JASPAR yes 19342364
chr13 110951597 110951612 NR2C2 JASPAR yes 60335135
chr13 110951602 110951611 ZEB1 JASPAR yes 19342365
chr13 110951602 110951611 ZEB1 JASPAR yes 60335136
chr13 110951605 110951610 USF2 TRANSFAC yes 19342366
chr13 110951605 110951610 USF2 TRANSFAC yes 60335137
chr13 110951613 110951619 HiNF-A TRANSFAC yes 19342367
chr13 110951613 110951619 HiNF-A TRANSFAC yes 60335138
SNP sites on vista17035[chr13:110950675-110951614]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr13 110950702 rs35340437 T A
STAT3
3392696
chr13 110950730 rs150792489 T C
GMEB2 NFIL3
3392697
chr13 110950782 rs138072305 G C
ONECUT1 ONECUT2 ONECUT3
3392698
chr13 110950875 rs73619243 T G
PAX5 RORA
3392699
chr13 110951010 rs371706343 A G
ELF1 ELF5 ETS1
3392700
chr13 110951239 rs149355543 A C no 3392701
chr13 110951288 rs9559765 C T
YY1
3392702
chr13 110951315 rs12874003 G A
ZNF354C
3392703
chr13 110951376 rs147447357 C T
E2F4 SP1 ZNF263
3392704
chr13 110951469 rs76494909 G C,T
MAZ
3392705
chr13 110951479 rs9555684 A G no 3392706
chr13 110951487 rs9301445 C T no 3392707
chr13 110951529 rs2029767 A G no 3392708
chr13 110951562 rs2029766 G A no 3392709
chr13 110951608 rs139983681 C A
NR2C2 USF2 ZEB1
3392710
Genes possibly regulated by vista17035[chr13:110950675-110951614]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr13 110801318 110959496 - COL4A1 ENSG00000187498.10 110959496 0.85 0.93 13019 92118
chr13 110958159 111165374 + COL4A2 ENSG00000134871.13 110958159 0.78 0.91 13020 93455
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista17035[chr13:110950675-110951614]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results