EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista17201[chr13:114890433-114890784]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista17201[chr13:114890433-114890784]
Back to top
Tissue distribution of vista17201
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista17201[chr13:114890433-114890784]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr13 114890518 114890809 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108092104
chr13 114890432 114890436 NFE TRANSFAC yes 19350058
chr13 114890432 114890436 NFE TRANSFAC yes 60498409
chr13 114890460 114890466 YY1 JASPAR yes 19350059
chr13 114890460 114890466 YY1 JASPAR yes 60498410
chr13 114890472 114890485 DUXA JASPAR yes 19350060
chr13 114890472 114890485 DUXA JASPAR yes 60498411
chr13 114890473 114890484 DUX4 JASPAR yes 19350061
chr13 114890473 114890484 PHOX2A JASPAR yes 19350062
chr13 114890473 114890484 PROP1 JASPAR yes 19350063
chr13 114890473 114890484 DUX4 JASPAR yes 60498412
chr13 114890473 114890484 PHOX2A JASPAR yes 60498413
chr13 114890473 114890484 PROP1 JASPAR yes 60498414
chr13 114890473 114890491 NFYA JASPAR yes 19350064
chr13 114890473 114890491 NFYA JASPAR yes 60498415
chr13 114890476 114890486 ALX3 JASPAR yes 19350065
chr13 114890476 114890486 EN2 JASPAR yes 19350066
chr13 114890476 114890486 ESX1 JASPAR yes 19350067
chr13 114890476 114890486 GBX1 JASPAR yes 19350068
chr13 114890476 114890486 GBX2 JASPAR yes 19350069
chr13 114890476 114890486 HESX1 JASPAR yes 19350070
chr13 114890476 114890486 LBX2 JASPAR yes 19350071
chr13 114890476 114890486 MIXL1 JASPAR yes 19350072
chr13 114890476 114890486 RAX JASPAR yes 19350073
chr13 114890476 114890486 ALX3 JASPAR yes 60498416
chr13 114890476 114890486 EN2 JASPAR yes 60498417
chr13 114890476 114890486 ESX1 JASPAR yes 60498418
chr13 114890476 114890486 GBX1 JASPAR yes 60498419
chr13 114890476 114890486 GBX2 JASPAR yes 60498420
chr13 114890476 114890486 HESX1 JASPAR yes 60498421
chr13 114890476 114890486 LBX2 JASPAR yes 60498422
chr13 114890476 114890486 MIXL1 JASPAR yes 60498423
chr13 114890476 114890486 RAX JASPAR yes 60498424
chr13 114890477 114890481 H1TF2 TRANSFAC yes 19350074
chr13 114890477 114890481 NFE TRANSFAC yes 19350075
chr13 114890477 114890481 SRF TRANSFAC yes 19350076
chr13 114890477 114890481 H1TF2 TRANSFAC yes 60498425
chr13 114890477 114890481 NFE TRANSFAC yes 60498426
chr13 114890477 114890481 SRF TRANSFAC yes 60498427
chr13 114890477 114890485 BARX1 JASPAR yes 19350077
chr13 114890477 114890485 BSX JASPAR yes 19350078
chr13 114890477 114890485 EN1 JASPAR yes 19350079
chr13 114890477 114890485 ISX JASPAR yes 19350080
chr13 114890477 114890485 LHX9 JASPAR yes 19350081
chr13 114890477 114890485 MSX1 JASPAR yes 19350082
chr13 114890477 114890485 MSX2 JASPAR yes 19350083
chr13 114890477 114890485 PRRX1 JASPAR yes 19350084
chr13 114890477 114890485 RAX2 JASPAR yes 19350085
chr13 114890477 114890485 SHOX JASPAR yes 19350086
chr13 114890477 114890485 BARX1 JASPAR yes 60498428
chr13 114890477 114890485 BSX JASPAR yes 60498429
chr13 114890477 114890485 EN1 JASPAR yes 60498430
chr13 114890477 114890485 ISX JASPAR yes 60498431
chr13 114890477 114890485 LHX9 JASPAR yes 60498432
chr13 114890477 114890485 MSX1 JASPAR yes 60498433
chr13 114890477 114890485 MSX2 JASPAR yes 60498434
chr13 114890477 114890485 PRRX1 JASPAR yes 60498435
chr13 114890477 114890485 RAX2 JASPAR yes 60498436
chr13 114890477 114890485 SHOX JASPAR yes 60498437
chr13 114890501 114890506 GATA2 JASPAR yes 19350087
chr13 114890501 114890506 GATA2 JASPAR yes 60498438
chr13 114890530 114890545 FOXP1 JASPAR yes 19350088
chr13 114890530 114890545 FOXP1 JASPAR yes 60498439
chr13 114890531 114890542 FOXP2 JASPAR yes 19350089
chr13 114890531 114890542 FOXP2 JASPAR yes 60498440
chr13 114890531 114890545 FOXF2 JASPAR yes 19350090
chr13 114890531 114890545 FOXF2 JASPAR yes 60498441
chr13 114890532 114890540 FOXG1 JASPAR yes 19350091
chr13 114890532 114890540 FOXG1 JASPAR yes 60498442
chr13 114890545 114890557 INSM1 JASPAR yes 19350092
chr13 114890545 114890557 INSM1 JASPAR yes 60498443
chr13 114890545 114890565 RREB1 JASPAR yes 19350093
chr13 114890545 114890565 RREB1 JASPAR yes 60498444
chr13 114890546 114890566 RREB1 JASPAR yes 19350094
chr13 114890546 114890566 RREB1 JASPAR yes 60498445
chr13 114890571 114890575 YY1 TRANSFAC yes 19350095
chr13 114890571 114890575 YY1 TRANSFAC yes 60498446
chr13 114890601 114890612 ELK4 JASPAR yes 19350096
chr13 114890601 114890612 FLI1 JASPAR yes 19350097
chr13 114890601 114890612 ELK4 JASPAR yes 60498447
chr13 114890601 114890612 FLI1 JASPAR yes 60498448
chr13 114890603 114890610 SPI1 JASPAR yes 19350098
chr13 114890603 114890610 SPI1 JASPAR yes 60498449
chr13 114890603 114890611 EHF JASPAR yes 19350099
chr13 114890603 114890611 FEV JASPAR yes 19350100
chr13 114890603 114890611 EHF JASPAR yes 60498450
chr13 114890603 114890611 FEV JASPAR yes 60498451
chr13 114890612 114890627 RUNX2 JASPAR yes 19350101
chr13 114890612 114890627 RUNX2 JASPAR yes 60498452
chr13 114890613 114890624 USF1 JASPAR yes 19350102
chr13 114890613 114890624 USF1 JASPAR yes 60498453
chr13 114890614 114890624 TFE3 JASPAR yes 19350103
chr13 114890614 114890624 TFEB JASPAR yes 19350104
chr13 114890614 114890624 TFEC JASPAR yes 19350105
chr13 114890614 114890624 TFE3 JASPAR yes 60498454
chr13 114890614 114890624 TFEB JASPAR yes 60498455
chr13 114890614 114890624 TFEC JASPAR yes 60498456
chr13 114890614 114890625 USF2 JASPAR yes 19350106
chr13 114890614 114890625 USF2 JASPAR yes 60498457
chr13 114890615 114890625 MAX JASPAR yes 19350107
chr13 114890615 114890625 MAX JASPAR yes 60498458
chr13 114890642 114890653 STAT1 JASPAR yes 19350108
chr13 114890642 114890653 STAT1 JASPAR yes 60498459
chr13 114890643 114890648 ETS2 TRANSFAC yes 19350109
chr13 114890643 114890648 ETS2 TRANSFAC yes 60498460
chr13 114890650 114890665 RUNX2 JASPAR yes 19350110
chr13 114890650 114890665 RUNX2 JASPAR yes 60498461
chr13 114890666 114890679 ZBTB18 JASPAR yes 19350111
chr13 114890666 114890679 ZBTB18 JASPAR yes 60498462
chr13 114890668 114890678 MAX JASPAR yes 19350112
chr13 114890668 114890678 MAX JASPAR yes 60498463
chr13 114890672 114890678 ZNF354C JASPAR yes 19350113
chr13 114890672 114890678 ZNF354C JASPAR yes 60498464
chr13 114890678 114890693 JUND JASPAR yes 19350114
chr13 114890678 114890693 JUND JASPAR yes 60498465
chr13 114890679 114890696 ZNF410 JASPAR yes 19350115
chr13 114890679 114890696 ZNF410 JASPAR yes 60498466
chr13 114890680 114890694 ATF7 JASPAR yes 19350116
chr13 114890680 114890694 BATF3 JASPAR yes 19350117
chr13 114890680 114890694 ATF7 JASPAR yes 60498467
chr13 114890680 114890694 BATF3 JASPAR yes 60498468
chr13 114890680 114890698 RARA JASPAR yes 19350118
chr13 114890680 114890698 RARA JASPAR yes 60498469
chr13 114890681 114890693 DBP JASPAR yes 19350119
chr13 114890681 114890693 HLF JASPAR yes 19350120
chr13 114890681 114890693 JDP2 JASPAR yes 19350121
chr13 114890681 114890693 TEF JASPAR yes 19350122
chr13 114890681 114890693 DBP JASPAR yes 60498470
chr13 114890681 114890693 HLF JASPAR yes 60498471
chr13 114890681 114890693 JDP2 JASPAR yes 60498472
chr13 114890681 114890693 TEF JASPAR yes 60498473
chr13 114890681 114890696 JUND JASPAR yes 19350123
chr13 114890681 114890696 JUND JASPAR yes 60498474
chr13 114890682 114890695 JUN JASPAR yes 19350124
chr13 114890682 114890695 JUN JASPAR yes 60498475
chr13 114890692 114890697 MYC TRANSFAC yes 19350125
chr13 114890692 114890697 MYC TRANSFAC yes 60498476
chr13 114890700 114890705 MYC TRANSFAC yes 19350126
chr13 114890700 114890705 MYC TRANSFAC yes 60498477
chr13 114890708 114890719 FOS JASPAR yes 19350127
chr13 114890708 114890719 FOSL1 JASPAR yes 19350128
chr13 114890708 114890719 JUND JASPAR yes 19350129
chr13 114890708 114890719 FOS JASPAR yes 60498478
chr13 114890708 114890719 FOSL1 JASPAR yes 60498479
chr13 114890708 114890719 JUND JASPAR yes 60498480
chr13 114890709 114890718 JDP2 JASPAR yes 19350130
chr13 114890709 114890718 JDP2 JASPAR yes 60498481
chr13 114890709 114890720 JUNB JASPAR yes 19350131
chr13 114890709 114890720 JUNB JASPAR yes 60498482
chr13 114890709 114890721 HNF1B JASPAR yes 19350132
chr13 114890709 114890721 HNF1B JASPAR yes 60498483
chr13 114890713 114890728 NFYB JASPAR yes 19350133
chr13 114890713 114890728 NFYB JASPAR yes 60498484
chr13 114890729 114890746 BCL6B JASPAR yes 19350134
chr13 114890729 114890746 BCL6B JASPAR yes 60498485
chr13 114890736 114890746 MEF2A JASPAR yes 19350135
chr13 114890736 114890746 MEF2A JASPAR yes 60498486
chr13 114890737 114890741 TEAD2 TRANSFAC yes 19350136
chr13 114890737 114890741 TEAD2 TRANSFAC yes 60498487
chr13 114890737 114890742 TBP TRANSFAC yes 19350137
chr13 114890737 114890742 TBP TRANSFAC yes 60498488
chr13 114890747 114890752 USF2 TRANSFAC yes 19350138
chr13 114890747 114890752 USF2 TRANSFAC yes 60498489
chr13 114890761 114890776 MEF2C JASPAR yes 19350139
chr13 114890761 114890776 MEF2C JASPAR yes 60498490
chr13 114890773 114890789 SOX8 JASPAR yes 19350140
chr13 114890773 114890789 SOX8 JASPAR yes 60498491
chr13 114890778 114890788 HOXA13 JASPAR yes 19350141
chr13 114890778 114890788 HOXB13 JASPAR yes 19350142
chr13 114890778 114890788 HOXD13 JASPAR yes 19350143
chr13 114890778 114890788 HOXA13 JASPAR yes 60498492
chr13 114890778 114890788 HOXB13 JASPAR yes 60498493
chr13 114890778 114890788 HOXD13 JASPAR yes 60498494
chr13 114890780 114890795 NFYB JASPAR yes 19350144
chr13 114890780 114890795 NFYB JASPAR yes 60498495
chr13 114890780 114890801 REST JASPAR yes 19350145
chr13 114890780 114890801 REST JASPAR yes 60498496
chr13 114890782 114890802 PPARG JASPAR yes 19350146
chr13 114890782 114890802 PPARG JASPAR yes 60498497
SNP sites on vista17201[chr13:114890433-114890784]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr13 114890451 rs192143073 C T no 3416012
chr13 114890515 rs9525276 C T no 3416013
chr13 114890592 rs138833878 T C
RUNX3
3416014
chr13 114890598 rs116224245 C T
RUNX3
3416015
chr13 114890682 rs115560495 C T
ATF7 BATF3 DBP HLF JDP2 JUN JUND RARA RUNX3 TEF ZNF410
3416016
chr13 114890720 rs140466932 G A
HNF1B JUNB NFYB RUNX3
3416017
Genes possibly regulated by vista17201[chr13:114890433-114890784]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr13 114747194 114898086 - RASA3 ENSG00000185989.9 114898086 0.76 1.0 13052 92698
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista17201[chr13:114890433-114890784]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results