EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista20416[chr15:67393197-67393867]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista20416[chr15:67393197-67393867]
Back to top
Tissue distribution of vista20416
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista20416[chr15:67393197-67393867]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr15 67393344 67393950 NFIC UCSC Txn Factor no Conserved 108149351
chr15 67393454 67393893 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108149362
chr15 67393460 67393842 ATF2 UCSC Txn Factor no Conserved 108149364
chr15 67393466 67393675 BATF UCSC Txn Factor no Conserved 108149369
chr15 67393203 67393218 HNF4A JASPAR yes 24207567
chr15 67393203 67393218 HNF4A JASPAR yes 70545913
chr15 67393204 67393219 HNF4G JASPAR yes 24207568
chr15 67393204 67393219 HNF4G JASPAR yes 70545914
chr15 67393207 67393219 IRF1 JASPAR yes 24207569
chr15 67393207 67393219 IRF1 JASPAR yes 70545915
chr15 67393210 67393224 TLX1 JASPAR yes 24207570
chr15 67393210 67393224 TLX1 JASPAR yes 70545916
chr15 67393233 67393247 SPI1 JASPAR yes 24207571
chr15 67393233 67393247 SPI1 JASPAR yes 70545917
chr15 67393237 67393242 TFAP2A TRANSFAC yes 24207572
chr15 67393237 67393242 TFAP2A TRANSFAC yes 70545918
chr15 67393237 67393243 MZF1 JASPAR yes 24207573
chr15 67393237 67393243 MZF1 JASPAR yes 70545919
chr15 67393239 67393244 ETS2 TRANSFAC yes 24207574
chr15 67393239 67393244 ETS2 TRANSFAC yes 70545920
chr15 67393251 67393258 NFATC2 JASPAR yes 24207575
chr15 67393251 67393258 NFATC2 JASPAR yes 70545921
chr15 67393262 67393278 E2F2 JASPAR yes 24207576
chr15 67393262 67393278 E2F2 JASPAR yes 70545922
chr15 67393279 67393299 RREB1 JASPAR yes 24207577
chr15 67393279 67393299 RREB1 JASPAR yes 70545923
chr15 67393291 67393301 RORA JASPAR yes 24207578
chr15 67393291 67393301 RORA JASPAR yes 70545924
chr15 67393294 67393300 ESR1 TRANSFAC yes 24207579
chr15 67393294 67393300 ESR1 TRANSFAC yes 70545925
chr15 67393296 67393300 ESR1 TRANSFAC yes 24207580
chr15 67393296 67393300 ESR1 TRANSFAC yes 70545926
chr15 67393318 67393328 FIGLA JASPAR yes 24207581
chr15 67393318 67393328 FIGLA JASPAR yes 70545927
chr15 67393320 67393325 USF2 TRANSFAC yes 24207582
chr15 67393320 67393325 USF2 TRANSFAC yes 70545928
chr15 67393327 67393331 YY1 TRANSFAC yes 24207583
chr15 67393327 67393331 YY1 TRANSFAC yes 70545929
chr15 67393358 67393362 NFE TRANSFAC yes 24207584
chr15 67393358 67393362 NFE TRANSFAC yes 70545930
chr15 67393358 67393371 SMAD2 JASPAR yes 24207585
chr15 67393358 67393371 SMAD2 JASPAR yes 70545931
chr15 67393362 67393366 NFE TRANSFAC yes 24207586
chr15 67393362 67393366 NFE TRANSFAC yes 70545932
chr15 67393372 67393382 SREBF1 JASPAR yes 24207587
chr15 67393372 67393382 SREBF1 JASPAR yes 70545933
chr15 67393400 67393406 LEF1 TRANSFAC yes 24207588
chr15 67393400 67393406 SOX10 JASPAR yes 24207589
chr15 67393400 67393406 LEF1 TRANSFAC yes 70545934
chr15 67393400 67393406 SOX10 JASPAR yes 70545935
chr15 67393404 67393419 MEF2C JASPAR yes 24207590
chr15 67393404 67393419 MEF2C JASPAR yes 70545936
chr15 67393405 67393420 MEF2A JASPAR yes 24207591
chr15 67393405 67393420 MEF2A JASPAR yes 70545937
chr15 67393420 67393425 GATA2 JASPAR yes 24207592
chr15 67393420 67393425 GATA2 JASPAR yes 70545938
chr15 67393437 67393448 ESRRA JASPAR yes 24207593
chr15 67393437 67393448 ESRRA JASPAR yes 70545939
chr15 67393446 67393452 ZNF354C JASPAR yes 24207594
chr15 67393446 67393452 ZNF354C JASPAR yes 70545940
chr15 67393448 67393463 HSF1 JASPAR yes 24207595
chr15 67393448 67393463 HSF1 JASPAR yes 70545941
chr15 67393449 67393462 HSF4 JASPAR yes 24207596
chr15 67393449 67393462 HSF4 JASPAR yes 70545942
chr15 67393454 67393467 HSF2 JASPAR yes 24207597
chr15 67393454 67393467 HSF2 JASPAR yes 70545943
chr15 67393487 67393491 LFA1 TRANSFAC yes 24207598
chr15 67393487 67393491 LFA1 TRANSFAC yes 70545944
chr15 67393506 67393514 BARX1 JASPAR yes 24207599
chr15 67393506 67393514 BARX1 JASPAR yes 70545945
chr15 67393519 67393527 FOXL1 JASPAR yes 24207600
chr15 67393519 67393527 FOXL1 JASPAR yes 70545946
chr15 67393524 67393544 RREB1 JASPAR yes 24207601
chr15 67393524 67393544 RREB1 JASPAR yes 70545947
chr15 67393527 67393547 RREB1 JASPAR yes 24207602
chr15 67393527 67393547 RREB1 JASPAR yes 70545948
chr15 67393531 67393543 FOXI1 JASPAR yes 24207603
chr15 67393531 67393543 FOXI1 JASPAR yes 70545949
chr15 67393550 67393562 PKNOX2 JASPAR yes 24207604
chr15 67393550 67393562 PKNOX2 JASPAR yes 70545950
chr15 67393551 67393561 TFEB JASPAR yes 24207605
chr15 67393551 67393561 TFEC JASPAR yes 24207606
chr15 67393551 67393561 TFEB JASPAR yes 70545951
chr15 67393551 67393561 TFEC JASPAR yes 70545952
chr15 67393551 67393562 USF1 JASPAR yes 24207607
chr15 67393551 67393562 USF2 JASPAR yes 24207608
chr15 67393551 67393562 USF1 JASPAR yes 70545953
chr15 67393551 67393562 USF2 JASPAR yes 70545954
chr15 67393552 67393562 MAX JASPAR yes 24207609
chr15 67393552 67393562 MAX JASPAR yes 70545955
chr15 67393556 67393567 NFE2L2 JASPAR yes 24207610
chr15 67393556 67393567 NFE2L2 JASPAR yes 70545956
chr15 67393558 67393574 SOX8 JASPAR yes 24207611
chr15 67393558 67393574 SOX8 JASPAR yes 70545957
chr15 67393560 67393581 IRF1 JASPAR yes 24207612
chr15 67393560 67393581 IRF1 JASPAR yes 70545958
chr15 67393563 67393577 SPI1 JASPAR yes 24207613
chr15 67393563 67393577 SPI1 JASPAR yes 70545959
chr15 67393566 67393587 IRF1 JASPAR yes 24207614
chr15 67393566 67393587 IRF1 JASPAR yes 70545960
chr15 67393594 67393604 SREBF2 JASPAR yes 24207615
chr15 67393594 67393604 SREBF2 JASPAR yes 70545961
chr15 67393595 67393604 SNAI2 JASPAR yes 24207616
chr15 67393595 67393604 SNAI2 JASPAR yes 70545962
chr15 67393596 67393601 USF2 TRANSFAC yes 24207617
chr15 67393596 67393601 USF2 TRANSFAC yes 70545963
chr15 67393606 67393617 ETV2 JASPAR yes 24207618
chr15 67393606 67393617 ETV2 JASPAR yes 70545964
chr15 67393607 67393617 ERF JASPAR yes 24207619
chr15 67393607 67393617 ERG JASPAR yes 24207620
chr15 67393607 67393617 ETS1 JASPAR yes 24207621
chr15 67393607 67393617 FEV JASPAR yes 24207622
chr15 67393607 67393617 FLI1 JASPAR yes 24207623
chr15 67393607 67393617 ERF JASPAR yes 70545965
chr15 67393607 67393617 ERG JASPAR yes 70545966
chr15 67393607 67393617 ETS1 JASPAR yes 70545967
chr15 67393607 67393617 FEV JASPAR yes 70545968
chr15 67393607 67393617 FLI1 JASPAR yes 70545969
chr15 67393607 67393618 FLI1 JASPAR yes 24207624
chr15 67393607 67393618 FLI1 JASPAR yes 70545970
chr15 67393608 67393616 FEV JASPAR yes 24207625
chr15 67393608 67393616 FEV JASPAR yes 70545971
chr15 67393611 67393626 STAT2 JASPAR yes 24207626
chr15 67393611 67393626 STAT2 JASPAR yes 70545972
chr15 67393629 67393643 POU4F1 JASPAR yes 24207627
chr15 67393629 67393643 POU4F1 JASPAR yes 70545973
chr15 67393635 67393653 MAFF JASPAR yes 24207628
chr15 67393635 67393653 MAFF JASPAR yes 70545974
chr15 67393637 67393648 NRL JASPAR yes 24207629
chr15 67393637 67393648 NRL JASPAR yes 70545975
chr15 67393637 67393652 MAFK JASPAR yes 24207630
chr15 67393637 67393652 MAFK JASPAR yes 70545976
chr15 67393659 67393673 PLAG1 JASPAR yes 24207631
chr15 67393659 67393673 PLAG1 JASPAR yes 70545977
chr15 67393676 67393697 IRF1 JASPAR yes 24207632
chr15 67393676 67393697 IRF1 JASPAR yes 70545978
chr15 67393680 67393694 STAT1 JASPAR yes 24207633
chr15 67393680 67393694 STAT1 JASPAR yes 70545979
chr15 67393680 67393695 PRDM1 JASPAR yes 24207634
chr15 67393680 67393695 STAT2 JASPAR yes 24207635
chr15 67393680 67393695 PRDM1 JASPAR yes 70545980
chr15 67393680 67393695 STAT2 JASPAR yes 70545981
chr15 67393680 67393698 IRF2 JASPAR yes 24207636
chr15 67393680 67393698 IRF2 JASPAR yes 70545982
chr15 67393705 67393717 FOXC2 JASPAR yes 24207637
chr15 67393705 67393717 FOXC2 JASPAR yes 70545983
chr15 67393705 67393719 FOXF2 JASPAR yes 24207638
chr15 67393705 67393719 FOXF2 JASPAR yes 70545984
chr15 67393706 67393717 FOXB1 JASPAR yes 24207639
chr15 67393706 67393717 FOXC1 JASPAR yes 24207640
chr15 67393706 67393717 FOXB1 JASPAR yes 70545985
chr15 67393706 67393717 FOXC1 JASPAR yes 70545986
chr15 67393707 67393711 YY1 TRANSFAC yes 24207641
chr15 67393707 67393711 YY1 TRANSFAC yes 70545987
chr15 67393775 67393787 INSM1 JASPAR yes 24207642
chr15 67393775 67393787 INSM1 JASPAR yes 70545988
chr15 67393777 67393798 ZNF263 JASPAR yes 24207643
chr15 67393777 67393798 ZNF263 JASPAR yes 70545989
chr15 67393781 67393788 JUN TRANSFAC yes 24207644
chr15 67393781 67393788 JUN TRANSFAC yes 70545990
chr15 67393785 67393796 E2F6 JASPAR yes 24207645
chr15 67393785 67393796 E2F6 JASPAR yes 70545991
chr15 67393794 67393809 HSF1 JASPAR yes 24207646
chr15 67393794 67393809 HSF1 JASPAR yes 70545992
chr15 67393845 67393850 GATA2 JASPAR yes 24207647
chr15 67393845 67393850 GATA2 JASPAR yes 70545993
chr15 67393849 67393853 NFE TRANSFAC yes 24207648
chr15 67393849 67393853 NFE TRANSFAC yes 70545994
chr15 67393861 67393872 GCM1 JASPAR yes 24207649
chr15 67393861 67393872 GCM1 JASPAR yes 70545995
SNP sites on vista20416[chr15:67393197-67393867]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr15 67393343 rs1438387 A T no 4043826
chr15 67393529 rs551025385 G A
ATF2 BATF NFIC RREB1 RUNX3
4043827
chr15 67393803 rs77504710 A T
ATF2 HSF1 NFIC RUNX3
4043828
chr15 67393850 rs542309088 C G
GATA2 NFE NFIC RUNX3
4043829
Genes possibly regulated by vista20416[chr15:67393197-67393867]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr15 67356101 67487533 + SMAD3 ENSG00000166949.11 67356101 0.69 1.0 14051 62904
chr15 67435072 67439277 - RP11-342M21.2 ENSG00000259202.1 67439277 1.0 1.0 14052 54590
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista20416[chr15:67393197-67393867]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results