EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista20418[chr15:67399103-67399775]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista20418[chr15:67399103-67399775]
Back to top
Tissue distribution of vista20418
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista20418[chr15:67399103-67399775]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr15 67399117 67399931 EP300 UCSC Txn Factor no Conserved 108149444
chr15 67399184 67399967 TCF12 UCSC Txn Factor no Conserved 108149449
chr15 67399204 67399669 JUND UCSC Txn Factor no Conserved 108149452
chr15 67399245 67399616 NR3C1 UCSC Txn Factor no Conserved 108149458
chr15 67399256 67399745 FOSL2 UCSC Txn Factor no Conserved 108149461
chr15 67399300 67399664 FOS UCSC Txn Factor no Conserved 108149472
chr15 67399301 67399701 JUN UCSC Txn Factor no Conserved 108149475
chr15 67399314 67399700 BCL3 UCSC Txn Factor no Conserved 108149480
chr15 67399394 67399958 GABPA UCSC Txn Factor no Conserved 108149504
chr15 67399106 67399116 GABPA JASPAR yes 24208284
chr15 67399106 67399116 GABPA JASPAR yes 70546049
chr15 67399106 67399119 ELF1 JASPAR yes 24208285
chr15 67399106 67399119 ELF1 JASPAR yes 70546050
chr15 67399170 67399182 PKNOX2 JASPAR yes 24208286
chr15 67399170 67399182 PKNOX2 JASPAR yes 70546051
chr15 67399176 67399187 PHOX2A JASPAR yes 24208287
chr15 67399176 67399187 PHOX2A JASPAR yes 70546052
chr15 67399180 67399187 GATA1 TRANSFAC yes 24208288
chr15 67399180 67399187 GATA1 TRANSFAC yes 70546053
chr15 67399191 67399211 TBX19 JASPAR yes 24208289
chr15 67399191 67399211 TBX19 JASPAR yes 70546054
chr15 67399193 67399209 T JASPAR yes 24208290
chr15 67399193 67399209 T JASPAR yes 70546055
chr15 67399200 67399210 TBX21 JASPAR yes 24208291
chr15 67399200 67399210 TBX21 JASPAR yes 70546056
chr15 67399200 67399211 TBX20 JASPAR yes 24208292
chr15 67399200 67399211 TBX2 JASPAR yes 24208293
chr15 67399200 67399211 TBX20 JASPAR yes 70546057
chr15 67399200 67399211 TBX2 JASPAR yes 70546058
chr15 67399200 67399213 EOMES JASPAR yes 24208294
chr15 67399200 67399213 EOMES JASPAR yes 70546059
chr15 67399201 67399209 MGA JASPAR yes 24208295
chr15 67399201 67399209 TBX15 JASPAR yes 24208296
chr15 67399201 67399209 TBX1 JASPAR yes 24208297
chr15 67399201 67399209 TBX4 JASPAR yes 24208298
chr15 67399201 67399209 TBX5 JASPAR yes 24208299
chr15 67399201 67399209 MGA JASPAR yes 70546060
chr15 67399201 67399209 TBX15 JASPAR yes 70546061
chr15 67399201 67399209 TBX1 JASPAR yes 70546062
chr15 67399201 67399209 TBX4 JASPAR yes 70546063
chr15 67399201 67399209 TBX5 JASPAR yes 70546064
chr15 67399201 67399211 TBR1 JASPAR yes 24208300
chr15 67399201 67399211 TBR1 JASPAR yes 70546065
chr15 67399227 67399231 YY1 TRANSFAC yes 24208301
chr15 67399227 67399231 YY1 TRANSFAC yes 70546066
chr15 67399227 67399238 HOXA10 JASPAR yes 24208302
chr15 67399227 67399238 HOXA10 JASPAR yes 70546067
chr15 67399228 67399237 CDX1 JASPAR yes 24208303
chr15 67399228 67399237 CDX1 JASPAR yes 70546068
chr15 67399228 67399239 CDX2 JASPAR yes 24208304
chr15 67399228 67399239 CDX2 JASPAR yes 70546069
chr15 67399231 67399246 TFAP2C JASPAR yes 24208305
chr15 67399231 67399246 TFAP2C JASPAR yes 70546070
chr15 67399234 67399246 TFAP2B JASPAR yes 24208306
chr15 67399234 67399246 TFAP2C JASPAR yes 24208307
chr15 67399234 67399246 TFAP2B JASPAR yes 70546071
chr15 67399234 67399246 TFAP2C JASPAR yes 70546072
chr15 67399234 67399248 EBF1 JASPAR yes 24208308
chr15 67399234 67399248 EBF1 JASPAR yes 70546073
chr15 67399236 67399247 EBF1 JASPAR yes 24208309
chr15 67399236 67399247 EBF1 JASPAR yes 70546074
chr15 67399275 67399281 MZF1 JASPAR yes 24208310
chr15 67399275 67399281 MZF1 JASPAR yes 70546075
chr15 67399299 67399316 BCL6B JASPAR yes 24208311
chr15 67399299 67399316 BCL6B JASPAR yes 70546076
chr15 67399300 67399315 STAT1 JASPAR yes 24208312
chr15 67399300 67399315 STAT1 JASPAR yes 70546077
chr15 67399374 67399378 NFE TRANSFAC yes 24208313
chr15 67399374 67399378 NFE TRANSFAC yes 70546078
chr15 67399405 67399416 FOSL1 JASPAR yes 24208314
chr15 67399405 67399416 FOSL1 JASPAR yes 70546079
chr15 67399406 67399417 FOSL2 JASPAR yes 24208315
chr15 67399406 67399417 JUNB JASPAR yes 24208316
chr15 67399406 67399417 FOSL2 JASPAR yes 70546080
chr15 67399406 67399417 JUNB JASPAR yes 70546081
chr15 67399406 67399420 JUN JASPAR yes 24208317
chr15 67399406 67399420 JUN JASPAR yes 70546082
chr15 67399407 67399418 BATF JASPAR yes 24208318
chr15 67399407 67399418 BATF JASPAR yes 70546083
chr15 67399421 67399432 E2F6 JASPAR yes 24208319
chr15 67399421 67399432 E2F6 JASPAR yes 70546084
chr15 67399470 67399485 FOXA1 JASPAR yes 24208320
chr15 67399470 67399485 FOXA1 JASPAR yes 70546085
chr15 67399472 67399484 FOXC2 JASPAR yes 24208321
chr15 67399472 67399484 FOXC2 JASPAR yes 70546086
chr15 67399473 67399481 FOXD1 JASPAR yes 24208322
chr15 67399473 67399481 FOXG1 JASPAR yes 24208323
chr15 67399473 67399481 FOXO3 JASPAR yes 24208324
chr15 67399473 67399481 FOXD1 JASPAR yes 70546087
chr15 67399473 67399481 FOXG1 JASPAR yes 70546088
chr15 67399473 67399481 FOXO3 JASPAR yes 70546089
chr15 67399473 67399484 FOXB1 JASPAR yes 24208325
chr15 67399473 67399484 FOXC1 JASPAR yes 24208326
chr15 67399473 67399484 FOXB1 JASPAR yes 70546090
chr15 67399473 67399484 FOXC1 JASPAR yes 70546091
chr15 67399474 67399481 FOXD2 JASPAR yes 24208327
chr15 67399474 67399481 FOXI1 JASPAR yes 24208328
chr15 67399474 67399481 FOXL1 JASPAR yes 24208329
chr15 67399474 67399481 FOXO4 JASPAR yes 24208330
chr15 67399474 67399481 FOXO6 JASPAR yes 24208331
chr15 67399474 67399481 FOXP3 JASPAR yes 24208332
chr15 67399474 67399481 FOXD2 JASPAR yes 70546092
chr15 67399474 67399481 FOXI1 JASPAR yes 70546093
chr15 67399474 67399481 FOXL1 JASPAR yes 70546094
chr15 67399474 67399481 FOXO4 JASPAR yes 70546095
chr15 67399474 67399481 FOXO6 JASPAR yes 70546096
chr15 67399474 67399481 FOXP3 JASPAR yes 70546097
chr15 67399474 67399485 FOXA1 JASPAR yes 24208333
chr15 67399474 67399485 FOXA1 JASPAR yes 70546098
chr15 67399486 67399496 HOXA13 JASPAR yes 24208334
chr15 67399486 67399496 HOXA13 JASPAR yes 70546099
chr15 67399487 67399491 YY1 TRANSFAC yes 24208335
chr15 67399487 67399491 YY1 TRANSFAC yes 70546100
chr15 67399488 67399503 FOXP1 JASPAR yes 24208336
chr15 67399488 67399503 FOXP1 JASPAR yes 70546101
chr15 67399489 67399504 FOXP1 JASPAR yes 24208337
chr15 67399489 67399504 FOXP1 JASPAR yes 70546102
chr15 67399490 67399496 TBP TRANSFAC yes 24208338
chr15 67399490 67399496 TBP TRANSFAC yes 70546103
chr15 67399490 67399505 FOXP1 JASPAR yes 24208339
chr15 67399490 67399505 FOXP1 JASPAR yes 70546104
chr15 67399490 67399511 IRF1 JASPAR yes 24208340
chr15 67399490 67399511 IRF1 JASPAR yes 70546105
chr15 67399491 67399506 FOXP1 JASPAR yes 24208341
chr15 67399491 67399506 FOXP1 JASPAR yes 70546106
chr15 67399493 67399508 FOXP1 JASPAR yes 24208342
chr15 67399493 67399508 FOXP1 JASPAR yes 70546107
chr15 67399503 67399517 POU1F1 JASPAR yes 24208343
chr15 67399503 67399517 POU1F1 JASPAR yes 70546108
chr15 67399507 67399517 HOXC10 JASPAR yes 24208344
chr15 67399507 67399517 HOXD13 JASPAR yes 24208345
chr15 67399507 67399517 HOXC10 JASPAR yes 70546109
chr15 67399507 67399517 HOXD13 JASPAR yes 70546110
chr15 67399507 67399518 HOXC13 JASPAR yes 24208346
chr15 67399507 67399518 HOXD12 JASPAR yes 24208347
chr15 67399507 67399518 HOXC13 JASPAR yes 70546111
chr15 67399507 67399518 HOXD12 JASPAR yes 70546112
chr15 67399507 67399521 JUN JASPAR yes 24208348
chr15 67399507 67399521 JUN JASPAR yes 70546113
chr15 67399508 67399518 GSX1 JASPAR yes 24208349
chr15 67399508 67399518 GSX2 JASPAR yes 24208350
chr15 67399508 67399518 HOXB3 JASPAR yes 24208351
chr15 67399508 67399518 GSX1 JASPAR yes 70546114
chr15 67399508 67399518 GSX2 JASPAR yes 70546115
chr15 67399508 67399518 HOXB3 JASPAR yes 70546116
chr15 67399509 67399517 NKX6-1 JASPAR yes 24208352
chr15 67399509 67399517 NKX6-2 JASPAR yes 24208353
chr15 67399509 67399517 NKX6-1 JASPAR yes 70546117
chr15 67399509 67399517 NKX6-2 JASPAR yes 70546118
chr15 67399509 67399519 POU6F2 JASPAR yes 24208354
chr15 67399509 67399519 POU6F2 JASPAR yes 70546119
chr15 67399509 67399520 BATF JASPAR yes 24208355
chr15 67399509 67399520 BATF JASPAR yes 70546120
chr15 67399510 67399521 FOSL2 JASPAR yes 24208356
chr15 67399510 67399521 JUNB JASPAR yes 24208357
chr15 67399510 67399521 FOSL2 JASPAR yes 70546121
chr15 67399510 67399521 JUNB JASPAR yes 70546122
chr15 67399511 67399522 FOS JASPAR yes 24208358
chr15 67399511 67399522 FOSL1 JASPAR yes 24208359
chr15 67399511 67399522 JUND JASPAR yes 24208360
chr15 67399511 67399522 NFE2 JASPAR yes 24208361
chr15 67399511 67399522 FOS JASPAR yes 70546123
chr15 67399511 67399522 FOSL1 JASPAR yes 70546124
chr15 67399511 67399522 JUND JASPAR yes 70546125
chr15 67399511 67399522 NFE2 JASPAR yes 70546126
chr15 67399512 67399521 JDP2 JASPAR yes 24208362
chr15 67399512 67399521 JDP2 JASPAR yes 70546127
chr15 67399512 67399523 FOSL2 JASPAR yes 24208363
chr15 67399512 67399523 JUNB JASPAR yes 24208364
chr15 67399512 67399523 FOSL2 JASPAR yes 70546128
chr15 67399512 67399523 JUNB JASPAR yes 70546129
chr15 67399512 67399526 JUN JASPAR yes 24208365
chr15 67399512 67399526 JUN JASPAR yes 70546130
chr15 67399513 67399524 BATF JASPAR yes 24208366
chr15 67399513 67399524 BATF JASPAR yes 70546131
chr15 67399515 67399532 PAX1 JASPAR yes 24208367
chr15 67399515 67399532 PAX1 JASPAR yes 70546132
chr15 67399525 67399528 MYB TRANSFAC yes 24208368
chr15 67399525 67399528 MYB TRANSFAC yes 70546133
chr15 67399565 67399571 NFIC JASPAR yes 24208369
chr15 67399565 67399571 NFIC JASPAR yes 70546134
chr15 67399570 67399575 ETS2 TRANSFAC yes 24208370
chr15 67399570 67399575 ETS2 TRANSFAC yes 70546135
chr15 67399580 67399594 E2F7 JASPAR yes 24208371
chr15 67399580 67399594 E2F7 JASPAR yes 70546136
chr15 67399584 67399589 SP1 TRANSFAC yes 24208372
chr15 67399584 67399589 SP1 TRANSFAC yes 70546137
chr15 67399611 67399626 TFAP2A JASPAR yes 24208373
chr15 67399611 67399626 TFAP2A JASPAR yes 70546138
chr15 67399614 67399633 RFX2 JASPAR yes 24208374
chr15 67399614 67399633 RFX2 JASPAR yes 70546139
chr15 67399620 67399625 ETS2 TRANSFAC yes 24208375
chr15 67399620 67399625 ETS2 TRANSFAC yes 70546140
chr15 67399642 67399650 GATA3 JASPAR yes 24208376
chr15 67399642 67399650 GATA3 JASPAR yes 70546141
chr15 67399685 67399696 E2F6 JASPAR yes 24208377
chr15 67399685 67399696 E2F6 JASPAR yes 70546142
chr15 67399688 67399696 TBX15 JASPAR yes 24208378
chr15 67399688 67399696 TBX15 JASPAR yes 70546143
chr15 67399688 67399697 ZEB1 JASPAR yes 24208379
chr15 67399688 67399697 ZEB1 JASPAR yes 70546144
chr15 67399688 67399702 ZIC1 JASPAR yes 24208380
chr15 67399688 67399702 ZIC1 JASPAR yes 70546145
chr15 67399688 67399703 ZIC3 JASPAR yes 24208381
chr15 67399688 67399703 ZIC4 JASPAR yes 24208382
chr15 67399688 67399703 ZIC3 JASPAR yes 70546146
chr15 67399688 67399703 ZIC4 JASPAR yes 70546147
chr15 67399689 67399699 TCF3 JASPAR yes 24208383
chr15 67399689 67399699 TCF4 JASPAR yes 24208384
chr15 67399689 67399699 TCF3 JASPAR yes 70546148
chr15 67399689 67399699 TCF4 JASPAR yes 70546149
chr15 67399690 67399699 SNAI2 JASPAR yes 24208385
chr15 67399690 67399699 SNAI2 JASPAR yes 70546150
chr15 67399691 67399696 USF2 TRANSFAC yes 24208386
chr15 67399691 67399696 USF2 TRANSFAC yes 70546151
chr15 67399745 67399750 H4TF1 TRANSFAC yes 24208387
chr15 67399745 67399750 H4TF1 TRANSFAC yes 70546152
chr15 67399767 67399780 SMAD2 JASPAR yes 24208388
chr15 67399767 67399780 SMAD2 JASPAR yes 70546153
SNP sites on vista20418[chr15:67399103-67399775]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr15 67399104 rs117925867 T G no 4043910
chr15 67399129 rs60475227 G A
EP300
4043911
chr15 67399206 rs77372436 G C
EOMES EP300 JUND MGA T TBR1 TBX1 TBX15 TBX19 TBX2 TBX20 TBX21 TBX4 TBX5 TCF12
4043912
chr15 67399216 rs113514844 G A
EP300 JUND TCF12
4043913
chr15 67399368 rs147374309 T TTGGC
BCL3 EP300 FOS FOSL2 JUN JUND NR3C1 TCF12
4043914
chr15 67399400 rs145658395 C G
BCL3 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND NR3C1 TCF12
4043915
chr15 67399466 rs79367929 C T
BCL3 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND NR3C1 TCF12
4043916
chr15 67399546 rs11071932 G A
BCL3 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND NR3C1 TCF12
4043917
chr15 67399573 rs186602296 G C
BCL3 EP300 ETS2 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND NR3C1 TCF12
4043918
chr15 67399586 rs191046938 G A,C
BCL3 E2F7 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND NR3C1 SP1 TCF12
4043919
chr15 67399627 rs201335275 AC A
BCL3 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND RFX2 TCF12
4043920
chr15 67399652 rs61261487 G A
BCL3 EP300 FOS FOSL2 GABPA JUN JUND TCF12
4043921
chr15 67399682 rs549194881 G A
BCL3 EP300 FOSL2 GABPA JUN TCF12
4043922
Genes possibly regulated by vista20418[chr15:67399103-67399775]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr15 67356101 67487533 + SMAD3 ENSG00000166949.11 67356101 0.69 1.0 14051 56998
chr15 67435072 67439277 - RP11-342M21.2 ENSG00000259202.1 67439277 1.0 1.0 14052 60498
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista20418[chr15:67399103-67399775]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results