EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista23583[chr16:89672117-89672737]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista23583[chr16:89672117-89672737]
Back to top
Tissue distribution of vista23583
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista23583[chr16:89672117-89672737]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr16 89672118 89672122 LFA1 TRANSFAC yes 12352294
chr16 89672118 89672122 LFA1 TRANSFAC yes 49422323
chr16 89672118 89672138 TP63 JASPAR yes 12352295
chr16 89672118 89672138 TP63 JASPAR yes 49422324
chr16 89672125 89672137 INSM1 JASPAR yes 12352296
chr16 89672125 89672137 INSM1 JASPAR yes 49422325
chr16 89672125 89672139 PLAG1 JASPAR yes 12352297
chr16 89672125 89672139 PLAG1 JASPAR yes 49422326
chr16 89672128 89672147 REST JASPAR yes 12352298
chr16 89672128 89672147 REST JASPAR yes 49422327
chr16 89672130 89672145 TFAP2A JASPAR yes 12352299
chr16 89672130 89672145 TFAP2C JASPAR yes 12352300
chr16 89672130 89672145 TFAP2A JASPAR yes 49422328
chr16 89672130 89672145 TFAP2C JASPAR yes 49422329
chr16 89672133 89672145 TFAP2A JASPAR yes 12352301
chr16 89672133 89672145 TFAP2B JASPAR yes 12352302
chr16 89672133 89672145 TFAP2C JASPAR yes 12352303
chr16 89672133 89672145 TFAP2A JASPAR yes 49422330
chr16 89672133 89672145 TFAP2B JASPAR yes 49422331
chr16 89672133 89672145 TFAP2C JASPAR yes 49422332
chr16 89672133 89672148 TFAP2A JASPAR yes 12352304
chr16 89672133 89672148 TFAP2C JASPAR yes 12352305
chr16 89672133 89672148 TFAP2A JASPAR yes 49422333
chr16 89672133 89672148 TFAP2C JASPAR yes 49422334
chr16 89672134 89672143 TFAP2A JASPAR yes 12352306
chr16 89672134 89672143 TFAP2A JASPAR yes 49422335
chr16 89672135 89672144 TFAP2A JASPAR yes 12352307
chr16 89672135 89672144 TFAP2A JASPAR yes 49422336
chr16 89672156 89672165 THAP1 JASPAR yes 12352308
chr16 89672156 89672165 THAP1 JASPAR yes 49422337
chr16 89672163 89672178 ZIC4 JASPAR yes 12352309
chr16 89672163 89672178 ZIC4 JASPAR yes 49422338
chr16 89672173 89672177 H4TF2 TRANSFAC yes 12352310
chr16 89672173 89672177 H4TF2 TRANSFAC yes 49422339
chr16 89672228 89672246 ESR1 JASPAR yes 12352311
chr16 89672228 89672246 ESR1 JASPAR yes 49422340
chr16 89672231 89672236 SP1 TRANSFAC yes 12352312
chr16 89672231 89672236 SP1 TRANSFAC yes 49422341
chr16 89672232 89672242 SP1 JASPAR yes 12352313
chr16 89672232 89672242 SP1 JASPAR yes 49422342
chr16 89672234 89672239 ETS2 TRANSFAC yes 12352314
chr16 89672234 89672239 ETS2 TRANSFAC yes 49422343
chr16 89672240 89672255 TFAP2A JASPAR yes 12352315
chr16 89672240 89672255 TFAP2C JASPAR yes 12352316
chr16 89672240 89672255 TFAP2A JASPAR yes 49422344
chr16 89672240 89672255 TFAP2C JASPAR yes 49422345
chr16 89672241 89672252 EBF1 JASPAR yes 12352317
chr16 89672241 89672252 EBF1 JASPAR yes 49422346
chr16 89672246 89672251 TFAP2A TRANSFAC yes 12352318
chr16 89672246 89672251 TFAP2A TRANSFAC yes 49422347
chr16 89672246 89672252 MZF1 JASPAR yes 12352319
chr16 89672246 89672252 MZF1 JASPAR yes 49422348
chr16 89672256 89672260 NFE TRANSFAC yes 12352320
chr16 89672256 89672260 NFE TRANSFAC yes 49422349
chr16 89672256 89672269 SMAD2 JASPAR yes 12352321
chr16 89672256 89672269 SMAD2 JASPAR yes 49422350
chr16 89672258 89672269 E2F6 JASPAR yes 12352322
chr16 89672258 89672269 E2F6 JASPAR yes 49422351
chr16 89672286 89672291 SP1 TRANSFAC yes 12352323
chr16 89672286 89672291 SP1 TRANSFAC yes 49422352
chr16 89672290 89672295 SP1 TRANSFAC yes 12352324
chr16 89672290 89672295 SP1 TRANSFAC yes 49422353
chr16 89672357 89672369 NHLH1 JASPAR yes 12352325
chr16 89672357 89672369 NHLH1 JASPAR yes 49422354
chr16 89672358 89672368 NHLH1 JASPAR yes 12352326
chr16 89672358 89672368 NHLH1 JASPAR yes 49422355
chr16 89672371 89672391 RREB1 JASPAR yes 12352327
chr16 89672371 89672391 RREB1 JASPAR yes 49422356
chr16 89672373 89672393 RREB1 JASPAR yes 12352328
chr16 89672373 89672393 RREB1 JASPAR yes 49422357
chr16 89672378 89672386 MGA JASPAR yes 12352329
chr16 89672378 89672386 MGA JASPAR yes 49422358
chr16 89672382 89672392 ZNF740 JASPAR yes 49422359
chr16 89672384 89672394 ZNF740 JASPAR yes 49422360
chr16 89672386 89672397 NFKB1 JASPAR yes 49422361
chr16 89672387 89672398 NFKB1 JASPAR yes 49422362
chr16 89672393 89672405 INSM1 JASPAR yes 49422363
chr16 89672394 89672405 TFAP2A JASPAR yes 49422364
chr16 89672394 89672405 TFAP2B JASPAR yes 49422365
chr16 89672407 89672412 SP1 TRANSFAC yes 49422366
chr16 89672427 89672439 INSM1 JASPAR yes 49422367
chr16 89672433 89672442 THAP1 JASPAR yes 49422368
chr16 89672435 89672441 YY1 JASPAR yes 49422369
chr16 89672451 89672455 NFE TRANSFAC yes 49422370
chr16 89672458 89672479 ZNF263 JASPAR yes 49422371
chr16 89672459 89672480 ZNF263 JASPAR yes 49422372
chr16 89672463 89672473 SP1 JASPAR yes 49422373
chr16 89672470 89672480 SP1 JASPAR yes 49422374
chr16 89672471 89672486 TFAP2C JASPAR yes 49422375
chr16 89672473 89672485 TFAP2A JASPAR yes 49422376
chr16 89672473 89672485 TFAP2B JASPAR yes 49422377
chr16 89672473 89672485 TFAP2C JASPAR yes 49422378
chr16 89672473 89672488 TFAP2A JASPAR yes 49422379
chr16 89672474 89672485 EBF1 JASPAR yes 49422380
chr16 89672499 89672509 ID4 JASPAR yes 49422381
chr16 89672499 89672509 TCF4 JASPAR yes 49422382
chr16 89672530 89672544 XBP1 JASPAR yes 49422383
chr16 89672531 89672545 CREB3 JASPAR yes 49422384
chr16 89672531 89672545 CREB3L1 JASPAR yes 49422385
chr16 89672536 89672541 ATF1 TRANSFAC yes 49422386
chr16 89672553 89672562 NFIX JASPAR yes 49422387
chr16 89672553 89672563 NFIA JASPAR yes 49422388
chr16 89672555 89672561 NFIC JASPAR yes 49422389
chr16 89672570 89672585 HSF1 JASPAR yes 49422390
chr16 89672571 89672584 HSF4 JASPAR yes 49422391
chr16 89672574 89672582 FOXO3 JASPAR yes 49422392
chr16 89672576 89672588 TAL1 JASPAR yes 49422393
chr16 89672577 89672590 ZBTB18 JASPAR yes 49422394
chr16 89672602 89672611 SNAI2 JASPAR yes 49422395
chr16 89672602 89672612 FIGLA JASPAR yes 49422396
chr16 89672602 89672612 MSC JASPAR yes 49422397
chr16 89672602 89672612 TCF3 JASPAR yes 49422398
chr16 89672607 89672622 RFX5 JASPAR yes 49422399
chr16 89672622 89672643 ZNF263 JASPAR yes 49422400
chr16 89672623 89672627 LFA1 TRANSFAC yes 49422401
chr16 89672635 89672645 ZNF740 JASPAR yes 49422402
chr16 89672636 89672641 TFAP2A TRANSFAC yes 49422403
chr16 89672636 89672642 MZF1 JASPAR yes 49422404
chr16 89672638 89672644 MAZ TRANSFAC yes 49422405
chr16 89672649 89672654 NFY TRANSFAC yes 49422406
chr16 89672656 89672670 RORA JASPAR yes 49422407
chr16 89672657 89672660 MYB TRANSFAC yes 49422408
chr16 89672661 89672679 ESR1 JASPAR yes 49422409
chr16 89672661 89672679 ESR2 JASPAR yes 49422410
chr16 89672662 89672668 ESR1 TRANSFAC yes 49422411
chr16 89672663 89672678 ESR2 JASPAR yes 49422412
chr16 89672664 89672668 ESR1 TRANSFAC yes 49422413
chr16 89672679 89672686 SP1 TRANSFAC yes 49422414
chr16 89672679 89672689 SP1 JASPAR yes 49422415
chr16 89672680 89672688 SP1 TRANSFAC yes 49422416
chr16 89672680 89672689 SP1 TRANSFAC yes 49422417
chr16 89672680 89672690 SP1 JASPAR yes 49422418
chr16 89672681 89672686 SP1 TRANSFAC yes 49422419
chr16 89672681 89672692 E2F4 JASPAR yes 49422420
chr16 89672682 89672687 SP1 TRANSFAC yes 49422421
chr16 89672682 89672688 SP1 TRANSFAC yes 49422422
chr16 89672700 89672715 TFAP2C JASPAR yes 49422423
chr16 89672702 89672715 TFAP2A JASPAR yes 49422424
chr16 89672702 89672715 TFAP2B JASPAR yes 49422425
chr16 89672702 89672715 TFAP2C JASPAR yes 49422426
chr16 89672703 89672714 EBF1 JASPAR yes 49422427
chr16 89672716 89672728 INSM1 JASPAR yes 49422428
SNP sites on vista23583[chr16:89672117-89672737]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr16 89672134 rs13329740 G C
INSM1 PLAG1 REST TFAP2A TFAP2B TFAP2C TP63
4678339
chr16 89672155 rs1991508 C T no 4678340
chr16 89672295 rs114465643 G A
SP1
4678341
chr16 89672339 rs545455533 C A,T no 4678342
chr16 89672368 rs8058428 C T
NHLH1
4678343
chr16 89672389 rs74037238 G C
NFKB1 RREB1 ZNF740
4678344
chr16 89672412 rs541234701 G A
SP1
4678345
chr16 89672451 rs8057288 G C
NFE
4678346
chr16 89672489 rs373438003 C T no 4678347
chr16 89672582 rs391773 A G
FOXO3 HSF1 HSF4 TAL1 ZBTB18
4678348
chr16 89672613 rs116271619 G A
RFX5
4678349
chr16 89672715 rs668009 T C
TFAP2A TFAP2B TFAP2C
4678350
chr16 89672729 rs12918760 T G no 4678351
Genes possibly regulated by vista23583[chr16:89672117-89672737]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr16 89627065 89630950 + RPL13 ENSG00000167526.9 89627065 0.73 1.0 15178 54948
chr16 89642176 89663654 + CPNE7 ENSG00000178773.10 89642176 0.86 1.0 15179 70059
chr16 89679716 89704839 + DPEP1 ENSG00000015413.5 89679716 0.97 0.99 15180 93021
chr16 89710839 89724253 - CHMP1A ENSG00000131165.10 89724253 0.53 1.0 15181 48484
chr16 89724210 89737680 + SPATA33 ENSG00000167523.9 89724210 0.77 1.0 15182 48527
chr16 89747145 89762772 + CDK10 ENSG00000185324.17 89747145 0.74 1.0 15183 25592
chr16 89749028 89752977 - RP11-368I7.4 ENSG00000260259.1 89752977 0.87 1.0 15184 19760
chr16 89762751 89768113 - SPATA2L ENSG00000158792.11 89768113 0.67 1.0 15185 4624
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista23583[chr16:89672117-89672737]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results