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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista2361[chr1:89594590-89594813]
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Tissue distribution of vista2361
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Transcription factor that possibly regulate vista2361[chr1:89594590-89594813]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 89594540 89594850 IRF1 UCSC Txn Factor no Conserved 107813409
chr1 89594592 89594613 IRF1 JASPAR yes 30590419
chr1 89594592 89594613 IRF1 JASPAR yes 118324247
chr1 89594594 89594609 IRF9 JASPAR yes 30590420
chr1 89594594 89594609 IRF9 JASPAR yes 118324248
chr1 89594595 89594609 IRF7 JASPAR yes 30590421
chr1 89594595 89594609 IRF7 JASPAR yes 118324249
chr1 89594596 89594611 PRDM1 JASPAR yes 30590422
chr1 89594596 89594611 PRDM1 JASPAR yes 118324250
chr1 89594605 89594619 FOXF2 JASPAR yes 30590423
chr1 89594605 89594619 FOXF2 JASPAR yes 118324251
chr1 89594605 89594620 FOXP1 JASPAR yes 30590424
chr1 89594605 89594620 FOXP1 JASPAR yes 118324252
chr1 89594606 89594617 FOXA1 JASPAR yes 30590425
chr1 89594606 89594617 FOXA1 JASPAR yes 118324253
chr1 89594606 89594621 FOXA1 JASPAR yes 30590426
chr1 89594606 89594621 FOXA1 JASPAR yes 118324254
chr1 89594606 89594622 SOX8 JASPAR yes 30590427
chr1 89594606 89594622 SOX8 JASPAR yes 118324255
chr1 89594607 89594619 FOXC2 JASPAR yes 30590428
chr1 89594607 89594619 FOXC2 JASPAR yes 118324256
chr1 89594608 89594619 FOXP2 JASPAR yes 30590429
chr1 89594608 89594619 FOXP2 JASPAR yes 118324257
chr1 89594608 89594629 IRF1 JASPAR yes 30590430
chr1 89594608 89594629 IRF1 JASPAR yes 118324258
chr1 89594637 89594657 RREB1 JASPAR yes 30590431
chr1 89594637 89594657 RREB1 JASPAR yes 118324259
chr1 89594639 89594659 RREB1 JASPAR yes 30590432
chr1 89594639 89594659 RREB1 JASPAR yes 118324260
chr1 89594641 89594661 RREB1 JASPAR yes 30590433
chr1 89594641 89594661 RREB1 JASPAR yes 118324261
chr1 89594665 89594686 IRF1 JASPAR yes 30590434
chr1 89594665 89594686 IRF1 JASPAR yes 118324262
chr1 89594669 89594684 PRDM1 JASPAR yes 30590435
chr1 89594669 89594684 PRDM1 JASPAR yes 118324263
chr1 89594669 89594687 IRF2 JASPAR yes 30590436
chr1 89594669 89594687 IRF2 JASPAR yes 118324264
chr1 89594671 89594692 IRF1 JASPAR yes 30590437
chr1 89594671 89594692 IRF1 JASPAR yes 118324265
chr1 89594673 89594688 IRF9 JASPAR yes 30590438
chr1 89594673 89594688 IRF9 JASPAR yes 118324266
chr1 89594674 89594680 TCF4 TRANSFAC yes 30590439
chr1 89594674 89594680 TCF4 TRANSFAC yes 118324267
chr1 89594674 89594688 IRF7 JASPAR yes 30590440
chr1 89594674 89594688 IRF8 JASPAR yes 30590441
chr1 89594674 89594688 IRF7 JASPAR yes 118324268
chr1 89594674 89594688 IRF8 JASPAR yes 118324269
chr1 89594675 89594689 STAT1 JASPAR yes 30590442
chr1 89594675 89594689 STAT1 JASPAR yes 118324270
chr1 89594675 89594690 PRDM1 JASPAR yes 30590443
chr1 89594675 89594690 STAT2 JASPAR yes 30590444
chr1 89594675 89594690 PRDM1 JASPAR yes 118324271
chr1 89594675 89594690 STAT2 JASPAR yes 118324272
chr1 89594675 89594693 IRF2 JASPAR yes 30590445
chr1 89594675 89594693 IRF2 JASPAR yes 118324273
chr1 89594676 89594688 IRF1 JASPAR yes 30590446
chr1 89594676 89594688 IRF1 JASPAR yes 118324274
chr1 89594698 89594702 YY1 TRANSFAC yes 30590447
chr1 89594698 89594702 YY1 TRANSFAC yes 118324275
chr1 89594698 89594709 CEBPB JASPAR yes 30590448
chr1 89594698 89594709 CEBPB JASPAR yes 118324276
chr1 89594698 89594713 MEF2C JASPAR yes 30590449
chr1 89594698 89594713 MEF2C JASPAR yes 118324277
chr1 89594699 89594710 CEBPA JASPAR yes 30590450
chr1 89594699 89594710 CEBPA JASPAR yes 118324278
chr1 89594699 89594714 MEF2A JASPAR yes 30590451
chr1 89594699 89594714 MEF2A JASPAR yes 118324279
chr1 89594700 89594712 MEF2A JASPAR yes 30590452
chr1 89594700 89594712 MEF2D JASPAR yes 30590453
chr1 89594700 89594712 MEF2A JASPAR yes 118324280
chr1 89594700 89594712 MEF2D JASPAR yes 118324281
chr1 89594713 89594730 BCL6B JASPAR yes 30590454
chr1 89594713 89594730 BCL6B JASPAR yes 118324282
chr1 89594714 89594729 STAT1 JASPAR yes 30590455
chr1 89594714 89594729 STAT1 JASPAR yes 118324283
chr1 89594716 89594727 STAT1 JASPAR yes 30590456
chr1 89594716 89594727 STAT3 JASPAR yes 30590457
chr1 89594716 89594727 STAT1 JASPAR yes 118324284
chr1 89594716 89594727 STAT3 JASPAR yes 118324285
chr1 89594720 89594728 FEV JASPAR yes 30590458
chr1 89594720 89594728 FEV JASPAR yes 118324286
chr1 89594725 89594737 NHLH1 JASPAR yes 30590459
chr1 89594725 89594737 NHLH1 JASPAR yes 118324287
chr1 89594726 89594736 NHLH1 JASPAR yes 30590460
chr1 89594726 89594736 TFAP4 JASPAR yes 30590461
chr1 89594726 89594736 NHLH1 JASPAR yes 118324288
chr1 89594726 89594736 TFAP4 JASPAR yes 118324289
chr1 89594747 89594758 CDX2 JASPAR yes 30590462
chr1 89594747 89594758 CDX2 JASPAR yes 118324290
chr1 89594748 89594759 HOXA10 JASPAR yes 30590463
chr1 89594748 89594759 HOXA10 JASPAR yes 118324291
chr1 89594749 89594758 CDX1 JASPAR yes 30590464
chr1 89594749 89594758 CDX1 JASPAR yes 118324292
chr1 89594749 89594759 HOXA13 JASPAR yes 30590465
chr1 89594749 89594759 HOXB13 JASPAR yes 30590466
chr1 89594749 89594759 HOXD13 JASPAR yes 30590467
chr1 89594749 89594759 HOXA13 JASPAR yes 118324293
chr1 89594749 89594759 HOXB13 JASPAR yes 118324294
chr1 89594749 89594759 HOXD13 JASPAR yes 118324295
chr1 89594759 89594763 NFE TRANSFAC yes 30590468
chr1 89594759 89594763 NFE TRANSFAC yes 118324296
chr1 89594761 89594771 BARHL2 JASPAR yes 30590469
chr1 89594761 89594771 BARHL2 JASPAR yes 118324297
chr1 89594776 89594787 CDX2 JASPAR yes 30590470
chr1 89594776 89594787 CDX2 JASPAR yes 118324298
chr1 89594777 89594788 HOXA10 JASPAR yes 30590471
chr1 89594777 89594788 HOXA10 JASPAR yes 118324299
chr1 89594777 89594792 SOX21 JASPAR yes 30590472
chr1 89594777 89594792 SOX21 JASPAR yes 118324300
chr1 89594778 89594787 CDX1 JASPAR yes 30590473
chr1 89594778 89594787 CDX1 JASPAR yes 118324301
chr1 89594778 89594788 HOXA13 JASPAR yes 30590474
chr1 89594778 89594788 HOXB13 JASPAR yes 30590475
chr1 89594778 89594788 HOXA13 JASPAR yes 118324302
chr1 89594778 89594788 HOXB13 JASPAR yes 118324303
chr1 89594785 89594800 TFAP2C JASPAR yes 30590476
chr1 89594785 89594800 TFAP2C JASPAR yes 118324304
chr1 89594788 89594799 EBF1 JASPAR yes 30590477
chr1 89594788 89594799 EBF1 JASPAR yes 118324305
chr1 89594799 89594810 DUX4 JASPAR yes 30590478
chr1 89594799 89594810 DUX4 JASPAR yes 118324306
chr1 89594808 89594814 SOX10 JASPAR yes 30590479
chr1 89594808 89594814 SOX10 JASPAR yes 118324307
chr1 89594809 89594825 POU4F3 JASPAR yes 30590480
chr1 89594809 89594825 POU4F3 JASPAR yes 118324308
chr1 89594811 89594825 POU4F1 JASPAR yes 30590481
chr1 89594811 89594825 POU4F1 JASPAR yes 118324309
chr1 89594812 89594826 POU4F1 JASPAR yes 30590482
chr1 89594812 89594826 POU4F1 JASPAR yes 118324310
SNP sites on vista2361[chr1:89594590-89594813]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 89594608 rs201378110 AAAAT A
FOXA1 FOXC2 FOXF2 FOXP1 FOXP2 IRF1 IRF7 IRF9 PRDM1 SOX8
468093
chr1 89594608 rs371864245 AAAAT A
FOXA1 FOXC2 FOXF2 FOXP1 FOXP2 IRF1 IRF7 IRF9 PRDM1 SOX8
468094
chr1 89594638 rs10624590 C CGT
IRF1 RREB1
468095
chr1 89594638 rs34495331 C CGT,CGTGT
IRF1 RREB1
468096
chr1 89594675 rs115705250 A T
IRF1 IRF2 IRF7 IRF8 IRF9 PRDM1 STAT1 STAT2 TCF4
468097
chr1 89594773 rs181287654 C T
IRF1
468098
chr1 89594777 rs116239772 G A
CDX2 HOXA10 IRF1 SOX21
468099
Genes possibly regulated by vista2361[chr1:89594590-89594813]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 89518002 89531043 - GBP1 ENSG00000117228.9 89531043 0.74 0.96 875 36453
chr1 89571815 89616139 - GBP2 ENSG00000162645.8 89616139 0.73 0.94 876 78674
chr1 89597434 89641723 - GBP7 ENSG00000213512.1 89641723 1.0 0.0 877 53090
chr1 89646831 89664615 - GBP4 ENSG00000162654.8 89664615 0.83 0.88 878 30198
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista2361[chr1:89594590-89594813]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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No results