EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista24905[chr17:43084352-43084694]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista24905[chr17:43084352-43084694]
Back to top
Tissue distribution of vista24905
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista24905[chr17:43084352-43084694]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 43084352 43084356 LFA1 TRANSFAC yes 21244268
chr17 43084352 43084356 LFA1 TRANSFAC yes 54423306
chr17 43084353 43084362 SNAI2 JASPAR yes 21244269
chr17 43084353 43084362 SNAI2 JASPAR yes 54423307
chr17 43084353 43084363 TCF4 JASPAR yes 21244270
chr17 43084353 43084363 TCF4 JASPAR yes 54423308
chr17 43084355 43084364 ZEB1 JASPAR yes 21244271
chr17 43084355 43084364 ZEB1 JASPAR yes 54423309
chr17 43084357 43084362 SP1 TRANSFAC yes 21244272
chr17 43084357 43084362 SP1 TRANSFAC yes 54423310
chr17 43084359 43084370 NFKB1 JASPAR yes 21244273
chr17 43084359 43084370 NFKB1 JASPAR yes 54423311
chr17 43084360 43084370 NFKB1 JASPAR yes 21244274
chr17 43084360 43084370 NFKB1 JASPAR yes 54423312
chr17 43084360 43084371 NFKB1 JASPAR yes 21244275
chr17 43084360 43084371 NFKB1 JASPAR yes 54423313
chr17 43084375 43084385 TEAD1 JASPAR yes 21244276
chr17 43084375 43084385 TEAD4 JASPAR yes 21244277
chr17 43084375 43084385 TEAD1 JASPAR yes 54423314
chr17 43084375 43084385 TEAD4 JASPAR yes 54423315
chr17 43084375 43084387 TEAD1 JASPAR yes 21244278
chr17 43084375 43084387 TEAD1 JASPAR yes 54423316
chr17 43084376 43084384 TEAD3 JASPAR yes 21244279
chr17 43084376 43084384 TEAD3 JASPAR yes 54423317
chr17 43084388 43084399 E2F4 JASPAR yes 21244280
chr17 43084388 43084399 E2F6 JASPAR yes 21244281
chr17 43084388 43084399 E2F4 JASPAR yes 54423318
chr17 43084388 43084399 E2F6 JASPAR yes 54423319
chr17 43084389 43084400 E2F1 JASPAR yes 21244282
chr17 43084389 43084400 E2F1 JASPAR yes 54423320
chr17 43084391 43084401 SP1 JASPAR yes 21244283
chr17 43084391 43084401 SP1 JASPAR yes 54423321
chr17 43084391 43084410 CTCF JASPAR yes 21244284
chr17 43084391 43084410 CTCF JASPAR yes 54423322
chr17 43084392 43084399 SP1 TRANSFAC yes 21244285
chr17 43084392 43084399 SP1 TRANSFAC yes 54423323
chr17 43084393 43084398 SP1 TRANSFAC yes 21244286
chr17 43084393 43084398 SP1 TRANSFAC yes 54423324
chr17 43084393 43084399 SP1 TRANSFAC yes 21244287
chr17 43084393 43084399 SP1 TRANSFAC yes 54423325
chr17 43084393 43084400 SP1 TRANSFAC yes 21244288
chr17 43084393 43084400 SP1 TRANSFAC yes 54423326
chr17 43084394 43084402 WT1 TRANSFAC yes 21244289
chr17 43084394 43084402 WT1 TRANSFAC yes 54423327
chr17 43084430 43084441 STAT3 JASPAR yes 21244290
chr17 43084430 43084441 STAT3 JASPAR yes 54423328
chr17 43084436 43084447 PHOX2A JASPAR yes 21244291
chr17 43084436 43084447 PHOX2A JASPAR yes 54423329
chr17 43084439 43084449 ALX3 JASPAR yes 21244292
chr17 43084439 43084449 ESX1 JASPAR yes 21244293
chr17 43084439 43084449 GSX1 JASPAR yes 21244294
chr17 43084439 43084449 GSX2 JASPAR yes 21244295
chr17 43084439 43084449 LBX2 JASPAR yes 21244296
chr17 43084439 43084449 MIXL1 JASPAR yes 21244297
chr17 43084439 43084449 MNX1 JASPAR yes 21244298
chr17 43084439 43084449 RAX JASPAR yes 21244299
chr17 43084439 43084449 ALX3 JASPAR yes 54423330
chr17 43084439 43084449 ESX1 JASPAR yes 54423331
chr17 43084439 43084449 GSX1 JASPAR yes 54423332
chr17 43084439 43084449 GSX2 JASPAR yes 54423333
chr17 43084439 43084449 LBX2 JASPAR yes 54423334
chr17 43084439 43084449 MIXL1 JASPAR yes 54423335
chr17 43084439 43084449 MNX1 JASPAR yes 54423336
chr17 43084439 43084449 RAX JASPAR yes 54423337
chr17 43084440 43084444 H1TF2 TRANSFAC yes 21244300
chr17 43084440 43084444 NFE TRANSFAC yes 21244301
chr17 43084440 43084444 SRF TRANSFAC yes 21244302
chr17 43084440 43084444 H1TF2 TRANSFAC yes 54423338
chr17 43084440 43084444 NFE TRANSFAC yes 54423339
chr17 43084440 43084444 SRF TRANSFAC yes 54423340
chr17 43084440 43084448 BARX1 JASPAR yes 21244303
chr17 43084440 43084448 BSX JASPAR yes 21244304
chr17 43084440 43084448 DLX6 JASPAR yes 21244305
chr17 43084440 43084448 ISX JASPAR yes 21244306
chr17 43084440 43084448 LBX1 JASPAR yes 21244307
chr17 43084440 43084448 LHX9 JASPAR yes 21244308
chr17 43084440 43084448 MSX1 JASPAR yes 21244309
chr17 43084440 43084448 MSX2 JASPAR yes 21244310
chr17 43084440 43084448 NKX6-2 JASPAR yes 21244311
chr17 43084440 43084448 PRRX1 JASPAR yes 21244312
chr17 43084440 43084448 RAX2 JASPAR yes 21244313
chr17 43084440 43084448 SHOX JASPAR yes 21244314
chr17 43084440 43084448 UNCX JASPAR yes 21244315
chr17 43084440 43084448 BARX1 JASPAR yes 54423341
chr17 43084440 43084448 BSX JASPAR yes 54423342
chr17 43084440 43084448 DLX6 JASPAR yes 54423343
chr17 43084440 43084448 ISX JASPAR yes 54423344
chr17 43084440 43084448 LBX1 JASPAR yes 54423345
chr17 43084440 43084448 LHX9 JASPAR yes 54423346
chr17 43084440 43084448 MSX1 JASPAR yes 54423347
chr17 43084440 43084448 MSX2 JASPAR yes 54423348
chr17 43084440 43084448 NKX6-2 JASPAR yes 54423349
chr17 43084440 43084448 PRRX1 JASPAR yes 54423350
chr17 43084440 43084448 RAX2 JASPAR yes 54423351
chr17 43084440 43084448 SHOX JASPAR yes 54423352
chr17 43084440 43084448 UNCX JASPAR yes 54423353
chr17 43084440 43084450 HOXA13 JASPAR yes 21244316
chr17 43084440 43084450 HOXB13 JASPAR yes 21244317
chr17 43084440 43084450 HOXD13 JASPAR yes 21244318
chr17 43084440 43084450 HOXA13 JASPAR yes 54423354
chr17 43084440 43084450 HOXB13 JASPAR yes 54423355
chr17 43084440 43084450 HOXD13 JASPAR yes 54423356
chr17 43084472 43084489 ZNF410 JASPAR yes 21244319
chr17 43084472 43084489 ZNF410 JASPAR yes 54423357
chr17 43084476 43084494 NR3C1 JASPAR yes 21244320
chr17 43084476 43084494 NR3C1 JASPAR yes 54423358
chr17 43084535 43084545 ALX3 JASPAR yes 21244321
chr17 43084535 43084545 ALX3 JASPAR yes 54423359
chr17 43084537 43084548 DUX4 JASPAR yes 21244322
chr17 43084537 43084548 PHOX2A JASPAR yes 21244323
chr17 43084537 43084548 DUX4 JASPAR yes 54423360
chr17 43084537 43084548 PHOX2A JASPAR yes 54423361
chr17 43084539 43084544 MYB TRANSFAC yes 21244324
chr17 43084539 43084544 MYB TRANSFAC yes 54423362
chr17 43084550 43084571 ZNF263 JASPAR yes 21244325
chr17 43084550 43084571 ZNF263 JASPAR yes 54423363
chr17 43084551 43084555 LFA1 TRANSFAC yes 21244326
chr17 43084551 43084555 LFA1 TRANSFAC yes 54423364
chr17 43084561 43084582 ZNF263 JASPAR yes 21244327
chr17 43084561 43084582 ZNF263 JASPAR yes 54423365
chr17 43084564 43084585 ZNF263 JASPAR yes 21244328
chr17 43084564 43084585 ZNF263 JASPAR yes 54423366
chr17 43084567 43084588 ZNF263 JASPAR yes 21244329
chr17 43084567 43084588 ZNF263 JASPAR yes 54423367
chr17 43084585 43084597 PROX1 JASPAR yes 21244330
chr17 43084585 43084597 PROX1 JASPAR yes 54423368
chr17 43084598 43084603 SP1 TRANSFAC yes 21244331
chr17 43084598 43084603 SP1 TRANSFAC yes 54423369
chr17 43084623 43084633 MZF1 JASPAR yes 21244332
chr17 43084623 43084633 MZF1 JASPAR yes 54423370
chr17 43084626 43084632 SP1 TRANSFAC yes 21244333
chr17 43084626 43084632 SP1 TRANSFAC yes 54423371
chr17 43084626 43084636 SP1 JASPAR yes 21244334
chr17 43084626 43084636 ZNF740 JASPAR yes 21244335
chr17 43084626 43084636 SP1 JASPAR yes 54423372
chr17 43084626 43084636 ZNF740 JASPAR yes 54423373
chr17 43084646 43084659 ATF4 JASPAR yes 21244336
chr17 43084646 43084659 ATF4 JASPAR yes 54423374
chr17 43084647 43084658 CEBPA JASPAR yes 21244337
chr17 43084647 43084658 CEBPA JASPAR yes 54423375
chr17 43084648 43084659 CEBPB JASPAR yes 21244338
chr17 43084648 43084659 CEBPB JASPAR yes 54423376
chr17 43084658 43084664 SP1 TRANSFAC yes 21244339
chr17 43084658 43084664 SP1 TRANSFAC yes 54423377
chr17 43084658 43084668 SP1 JASPAR yes 21244340
chr17 43084658 43084668 SP1 JASPAR yes 54423378
chr17 43084658 43084679 ZNF263 JASPAR yes 21244341
chr17 43084658 43084679 ZNF263 JASPAR yes 54423379
chr17 43084667 43084671 NFE TRANSFAC yes 21244342
chr17 43084667 43084671 NFE TRANSFAC yes 54423380
chr17 43084671 43084692 ZNF263 JASPAR yes 21244343
chr17 43084671 43084692 ZNF263 JASPAR yes 54423381
chr17 43084675 43084696 ZNF263 JASPAR yes 21244344
chr17 43084675 43084696 ZNF263 JASPAR yes 54423382
chr17 43084676 43084691 PRDM1 JASPAR yes 21244345
chr17 43084676 43084691 PRDM1 JASPAR yes 54423383
chr17 43084678 43084682 YY1 TRANSFAC yes 21244346
chr17 43084678 43084682 YY1 TRANSFAC yes 54423384
chr17 43084683 43084694 E2F6 JASPAR yes 21244347
chr17 43084683 43084694 E2F6 JASPAR yes 54423385
SNP sites on vista24905[chr17:43084352-43084694]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 43084388 rs534273613 C T
E2F4 E2F6
4892899
chr17 43084402 rs376200729 G A
CTCF WT1
4892900
chr17 43084427 rs370345867 G A no 4892901
chr17 43084455 rs75353403 G A no 4892902
chr17 43084575 rs116720292 G A,C,T
ZNF263
4892903
chr17 43084693 rs185730874 C T
E2F6 ZNF263
4892904
Genes possibly regulated by vista24905[chr17:43084352-43084694]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 42982376 42994305 - GFAP ENSG00000131095.7 42994305 0.89 0.99 15939 9953
chr17 43002077 43025082 - KIF18B ENSG00000186185.9 43025082 0.95 1.0 15940 40730
chr17 43037061 43045439 - C1QL1 ENSG00000131094.3 43045439 0.86 0.99 15941 61087
chr17 43100708 43138473 - DCAKD ENSG00000172992.7 43138473 0.57 0.99 15942 46221
chr17 43128978 43186384 + NMT1 ENSG00000136448.7 43128978 0.75 1.0 15943 55716
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista24905[chr17:43084352-43084694]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results