EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista2539[chr1:94744046-94744440]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista2539[chr1:94744046-94744440]
Back to top
Tissue distribution of vista2539
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista2539[chr1:94744046-94744440]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 94744054 94744057 MYB TRANSFAC yes 30867124
chr1 94744054 94744057 MYB TRANSFAC yes 118332380
chr1 94744075 94744091 RFX5 JASPAR yes 30867125
chr1 94744075 94744091 RFX5 JASPAR yes 118332381
chr1 94744080 94744091 ESRRB JASPAR yes 30867126
chr1 94744080 94744091 ESRRB JASPAR yes 118332382
chr1 94744084 94744095 CEBPB JASPAR yes 30867127
chr1 94744084 94744095 CEBPB JASPAR yes 118332383
chr1 94744084 94744096 DBP JASPAR yes 30867128
chr1 94744084 94744096 HLF JASPAR yes 30867129
chr1 94744084 94744096 TEF JASPAR yes 30867130
chr1 94744084 94744096 DBP JASPAR yes 118332384
chr1 94744084 94744096 HLF JASPAR yes 118332385
chr1 94744084 94744096 TEF JASPAR yes 118332386
chr1 94744085 94744095 CEBPB JASPAR yes 30867131
chr1 94744085 94744095 CEBPD JASPAR yes 30867132
chr1 94744085 94744095 CEBPE JASPAR yes 30867133
chr1 94744085 94744095 CEBPG JASPAR yes 30867134
chr1 94744085 94744095 CEBPB JASPAR yes 118332387
chr1 94744085 94744095 CEBPD JASPAR yes 118332388
chr1 94744085 94744095 CEBPE JASPAR yes 118332389
chr1 94744085 94744095 CEBPG JASPAR yes 118332390
chr1 94744085 94744096 CEBPA JASPAR yes 30867135
chr1 94744085 94744096 CEBPA JASPAR yes 118332391
chr1 94744090 94744098 BARX1 JASPAR yes 30867136
chr1 94744090 94744098 BARX1 JASPAR yes 118332392
chr1 94744104 94744118 TCF7L2 JASPAR yes 30867137
chr1 94744104 94744118 TCF7L2 JASPAR yes 118332393
chr1 94744104 94744119 LEF1 JASPAR yes 30867138
chr1 94744104 94744119 LEF1 JASPAR yes 118332394
chr1 94744117 94744128 FOXH1 JASPAR yes 30867139
chr1 94744117 94744128 FOXH1 JASPAR yes 118332395
chr1 94744121 94744127 ZNF354C JASPAR yes 30867140
chr1 94744121 94744127 ZNF354C JASPAR yes 118332396
chr1 94744123 94744131 TBX5 JASPAR yes 30867141
chr1 94744123 94744131 TBX5 JASPAR yes 118332397
chr1 94744123 94744132 ZEB1 JASPAR yes 30867142
chr1 94744123 94744132 ZEB1 JASPAR yes 118332398
chr1 94744124 94744134 FIGLA JASPAR yes 30867143
chr1 94744124 94744134 ID4 JASPAR yes 30867144
chr1 94744124 94744134 TCF3 JASPAR yes 30867145
chr1 94744124 94744134 TCF4 JASPAR yes 30867146
chr1 94744124 94744134 FIGLA JASPAR yes 118332399
chr1 94744124 94744134 ID4 JASPAR yes 118332400
chr1 94744124 94744134 TCF3 JASPAR yes 118332401
chr1 94744124 94744134 TCF4 JASPAR yes 118332402
chr1 94744126 94744131 USF2 TRANSFAC yes 30867147
chr1 94744126 94744131 USF2 TRANSFAC yes 118332403
chr1 94744133 94744143 CLOCK JASPAR yes 30867148
chr1 94744133 94744143 HEY1 JASPAR yes 30867149
chr1 94744133 94744143 MNT JASPAR yes 30867150
chr1 94744133 94744143 CLOCK JASPAR yes 118332404
chr1 94744133 94744143 HEY1 JASPAR yes 118332405
chr1 94744133 94744143 MNT JASPAR yes 118332406
chr1 94744135 94744140 MYC TRANSFAC yes 30867151
chr1 94744135 94744140 USF1 TRANSFAC yes 30867152
chr1 94744135 94744140 USF2 TRANSFAC yes 30867153
chr1 94744135 94744140 MYC TRANSFAC yes 118332407
chr1 94744135 94744140 USF1 TRANSFAC yes 118332408
chr1 94744135 94744140 USF2 TRANSFAC yes 118332409
chr1 94744135 94744150 TP53 JASPAR yes 30867154
chr1 94744135 94744150 TP53 JASPAR yes 118332410
chr1 94744169 94744174 ETS2 TRANSFAC yes 30867155
chr1 94744169 94744174 ETS2 TRANSFAC yes 118332411
chr1 94744173 94744179 HiNF-A TRANSFAC yes 30867156
chr1 94744173 94744179 HiNF-A TRANSFAC yes 118332412
chr1 94744198 94744208 POU6F2 JASPAR yes 30867157
chr1 94744198 94744208 POU6F2 JASPAR yes 118332413
chr1 94744199 94744209 GSX1 JASPAR yes 30867158
chr1 94744199 94744209 GSX2 JASPAR yes 30867159
chr1 94744199 94744209 HOXB3 JASPAR yes 30867160
chr1 94744199 94744209 GSX1 JASPAR yes 118332414
chr1 94744199 94744209 GSX2 JASPAR yes 118332415
chr1 94744199 94744209 HOXB3 JASPAR yes 118332416
chr1 94744199 94744210 HOXC13 JASPAR yes 30867161
chr1 94744199 94744210 HOXD12 JASPAR yes 30867162
chr1 94744199 94744210 HOXC13 JASPAR yes 118332417
chr1 94744199 94744210 HOXD12 JASPAR yes 118332418
chr1 94744200 94744208 NKX6-1 JASPAR yes 30867163
chr1 94744200 94744208 NKX6-2 JASPAR yes 30867164
chr1 94744200 94744208 NKX6-1 JASPAR yes 118332419
chr1 94744200 94744208 NKX6-2 JASPAR yes 118332420
chr1 94744200 94744210 HOXC10 JASPAR yes 30867165
chr1 94744200 94744210 HOXD13 JASPAR yes 30867166
chr1 94744200 94744210 HOXC10 JASPAR yes 118332421
chr1 94744200 94744210 HOXD13 JASPAR yes 118332422
chr1 94744200 94744216 POU4F2 JASPAR yes 30867167
chr1 94744200 94744216 POU4F3 JASPAR yes 30867168
chr1 94744200 94744216 POU4F2 JASPAR yes 118332423
chr1 94744200 94744216 POU4F3 JASPAR yes 118332424
chr1 94744202 94744206 YY1 TRANSFAC yes 30867169
chr1 94744202 94744206 YY1 TRANSFAC yes 118332425
chr1 94744208 94744220 MYBL1 JASPAR yes 30867170
chr1 94744208 94744220 MYBL1 JASPAR yes 118332426
chr1 94744213 94744216 MYB TRANSFAC yes 30867171
chr1 94744213 94744216 MYB TRANSFAC yes 118332427
chr1 94744218 94744229 YY2 JASPAR yes 30867172
chr1 94744218 94744229 YY2 JASPAR yes 118332428
chr1 94744219 94744240 ZNF263 JASPAR yes 30867173
chr1 94744219 94744240 ZNF263 JASPAR yes 118332429
chr1 94744222 94744237 NR2C2 JASPAR yes 30867174
chr1 94744222 94744237 NR2C2 JASPAR yes 118332430
chr1 94744222 94744243 ZNF263 JASPAR yes 30867175
chr1 94744222 94744243 ZNF263 JASPAR yes 118332431
chr1 94744223 94744237 RXRB JASPAR yes 30867176
chr1 94744223 94744237 RXRG JASPAR yes 30867177
chr1 94744223 94744237 RXRB JASPAR yes 118332432
chr1 94744223 94744237 RXRG JASPAR yes 118332433
chr1 94744229 94744249 PPARG JASPAR yes 30867178
chr1 94744229 94744249 PPARG JASPAR yes 118332434
chr1 94744235 94744242 PEA3 TRANSFAC yes 30867179
chr1 94744235 94744242 PEA3 TRANSFAC yes 118332435
chr1 94744242 94744257 HNF1A JASPAR yes 30867180
chr1 94744242 94744257 HNF1A JASPAR yes 118332436
chr1 94744243 94744253 EMX1 JASPAR yes 30867181
chr1 94744243 94744253 EMX2 JASPAR yes 30867182
chr1 94744243 94744253 ESX1 JASPAR yes 30867183
chr1 94744243 94744253 GBX1 JASPAR yes 30867184
chr1 94744243 94744253 GBX2 JASPAR yes 30867185
chr1 94744243 94744253 GSX1 JASPAR yes 30867186
chr1 94744243 94744253 GSX2 JASPAR yes 30867187
chr1 94744243 94744253 HESX1 JASPAR yes 30867188
chr1 94744243 94744253 HOXA2 JASPAR yes 30867189
chr1 94744243 94744253 HOXB2 JASPAR yes 30867190
chr1 94744243 94744253 HOXB3 JASPAR yes 30867191
chr1 94744243 94744253 LBX2 JASPAR yes 30867192
chr1 94744243 94744253 LHX2 JASPAR yes 30867193
chr1 94744243 94744253 LHX6 JASPAR yes 30867194
chr1 94744243 94744253 MEOX1 JASPAR yes 30867195
chr1 94744243 94744253 MEOX2 JASPAR yes 30867196
chr1 94744243 94744253 MIXL1 JASPAR yes 30867197
chr1 94744243 94744253 MNX1 JASPAR yes 30867198
chr1 94744243 94744253 NOTO JASPAR yes 30867199
chr1 94744243 94744253 POU6F1 JASPAR yes 30867200
chr1 94744243 94744253 RAX JASPAR yes 30867201
chr1 94744243 94744253 EMX1 JASPAR yes 118332437
chr1 94744243 94744253 EMX2 JASPAR yes 118332438
chr1 94744243 94744253 ESX1 JASPAR yes 118332439
chr1 94744243 94744253 GBX1 JASPAR yes 118332440
chr1 94744243 94744253 GBX2 JASPAR yes 118332441
chr1 94744243 94744253 GSX1 JASPAR yes 118332442
chr1 94744243 94744253 GSX2 JASPAR yes 118332443
chr1 94744243 94744253 HESX1 JASPAR yes 118332444
chr1 94744243 94744253 HOXA2 JASPAR yes 118332445
chr1 94744243 94744253 HOXB2 JASPAR yes 118332446
chr1 94744243 94744253 HOXB3 JASPAR yes 118332447
chr1 94744243 94744253 LBX2 JASPAR yes 118332448
chr1 94744243 94744253 LHX2 JASPAR yes 118332449
chr1 94744243 94744253 LHX6 JASPAR yes 118332450
chr1 94744243 94744253 MEOX1 JASPAR yes 118332451
chr1 94744243 94744253 MEOX2 JASPAR yes 118332452
chr1 94744243 94744253 MIXL1 JASPAR yes 118332453
chr1 94744243 94744253 MNX1 JASPAR yes 118332454
chr1 94744243 94744253 NOTO JASPAR yes 118332455
chr1 94744243 94744253 POU6F1 JASPAR yes 118332456
chr1 94744243 94744253 RAX JASPAR yes 118332457
chr1 94744243 94744259 POU4F3 JASPAR yes 30867202
chr1 94744243 94744259 POU4F3 JASPAR yes 118332458
chr1 94744244 94744252 BSX JASPAR yes 30867203
chr1 94744244 94744252 DLX6 JASPAR yes 30867204
chr1 94744244 94744252 EN1 JASPAR yes 30867205
chr1 94744244 94744252 ISX JASPAR yes 30867206
chr1 94744244 94744252 LBX1 JASPAR yes 30867207
chr1 94744244 94744252 LHX9 JASPAR yes 30867208
chr1 94744244 94744252 LMX1A JASPAR yes 30867209
chr1 94744244 94744252 LMX1B JASPAR yes 30867210
chr1 94744244 94744252 NKX6-1 JASPAR yes 30867211
chr1 94744244 94744252 NKX6-2 JASPAR yes 30867212
chr1 94744244 94744252 PAX4 JASPAR yes 30867213
chr1 94744244 94744252 PDX1 JASPAR yes 30867214
chr1 94744244 94744252 PRRX1 JASPAR yes 30867215
chr1 94744244 94744252 RAX2 JASPAR yes 30867216
chr1 94744244 94744252 SHOX JASPAR yes 30867217
chr1 94744244 94744252 UNCX JASPAR yes 30867218
chr1 94744244 94744252 VAX1 JASPAR yes 30867219
chr1 94744244 94744252 VAX2 JASPAR yes 30867220
chr1 94744244 94744252 VSX1 JASPAR yes 30867221
chr1 94744244 94744252 VSX2 JASPAR yes 30867222
chr1 94744244 94744252 BSX JASPAR yes 118332459
chr1 94744244 94744252 DLX6 JASPAR yes 118332460
chr1 94744244 94744252 EN1 JASPAR yes 118332461
chr1 94744244 94744252 ISX JASPAR yes 118332462
chr1 94744244 94744252 LBX1 JASPAR yes 118332463
chr1 94744244 94744252 LHX9 JASPAR yes 118332464
chr1 94744244 94744252 LMX1A JASPAR yes 118332465
chr1 94744244 94744252 LMX1B JASPAR yes 118332466
chr1 94744244 94744252 NKX6-1 JASPAR yes 118332467
chr1 94744244 94744252 NKX6-2 JASPAR yes 118332468
chr1 94744244 94744252 PAX4 JASPAR yes 118332469
chr1 94744244 94744252 PDX1 JASPAR yes 118332470
chr1 94744244 94744252 PRRX1 JASPAR yes 118332471
chr1 94744244 94744252 RAX2 JASPAR yes 118332472
chr1 94744244 94744252 SHOX JASPAR yes 118332473
chr1 94744244 94744252 UNCX JASPAR yes 118332474
chr1 94744244 94744252 VAX1 JASPAR yes 118332475
chr1 94744244 94744252 VAX2 JASPAR yes 118332476
chr1 94744244 94744252 VSX1 JASPAR yes 118332477
chr1 94744244 94744252 VSX2 JASPAR yes 118332478
chr1 94744244 94744254 POU6F2 JASPAR yes 30867223
chr1 94744244 94744254 POU6F2 JASPAR yes 118332479
chr1 94744244 94744260 POU4F2 JASPAR yes 30867224
chr1 94744244 94744260 POU4F3 JASPAR yes 30867225
chr1 94744244 94744260 POU4F2 JASPAR yes 118332480
chr1 94744244 94744260 POU4F3 JASPAR yes 118332481
chr1 94744245 94744255 PAX3 JASPAR yes 30867226
chr1 94744245 94744255 PAX7 JASPAR yes 30867227
chr1 94744245 94744255 PAX3 JASPAR yes 118332482
chr1 94744245 94744255 PAX7 JASPAR yes 118332483
chr1 94744246 94744260 POU4F1 JASPAR yes 30867228
chr1 94744246 94744260 POU4F1 JASPAR yes 118332484
chr1 94744247 94744260 HNF1B JASPAR yes 30867229
chr1 94744247 94744260 HNF1B JASPAR yes 118332485
chr1 94744252 94744263 PHOX2A JASPAR yes 30867230
chr1 94744252 94744263 PROP1 JASPAR yes 30867231
chr1 94744252 94744263 PHOX2A JASPAR yes 118332486
chr1 94744252 94744263 PROP1 JASPAR yes 118332487
chr1 94744256 94744267 PROP1 JASPAR yes 30867232
chr1 94744256 94744267 PROP1 JASPAR yes 118332488
chr1 94744285 94744289 H4TF2 TRANSFAC yes 30867233
chr1 94744285 94744289 H4TF2 TRANSFAC yes 118332489
chr1 94744292 94744303 DMRT3 JASPAR yes 30867234
chr1 94744292 94744303 DMRT3 JASPAR yes 118332490
chr1 94744294 94744299 GATA2 JASPAR yes 30867235
chr1 94744294 94744299 GATA2 JASPAR yes 118332491
chr1 94744303 94744317 POU1F1 JASPAR yes 30867236
chr1 94744303 94744317 POU1F1 JASPAR yes 118332492
chr1 94744304 94744316 POU3F1 JASPAR yes 30867237
chr1 94744304 94744316 POU3F2 JASPAR yes 30867238
chr1 94744304 94744316 POU3F1 JASPAR yes 118332493
chr1 94744304 94744316 POU3F2 JASPAR yes 118332494
chr1 94744304 94744317 POU3F3 JASPAR yes 30867239
chr1 94744304 94744317 POU3F3 JASPAR yes 118332495
chr1 94744305 94744309 YY1 TRANSFAC yes 30867240
chr1 94744305 94744309 YY1 TRANSFAC yes 118332496
chr1 94744305 94744317 POU2F1 JASPAR yes 30867241
chr1 94744305 94744317 POU2F1 JASPAR yes 118332497
chr1 94744313 94744317 YY1 TRANSFAC yes 30867242
chr1 94744313 94744317 YY1 TRANSFAC yes 118332498
chr1 94744325 94744329 TEAD2 TRANSFAC yes 30867243
chr1 94744325 94744329 TEAD2 TRANSFAC yes 118332499
chr1 94744325 94744330 TBP TRANSFAC yes 30867244
chr1 94744325 94744330 TBP TRANSFAC yes 118332500
chr1 94744325 94744331 TFIID TRANSFAC yes 30867245
chr1 94744325 94744331 TFIID TRANSFAC yes 118332501
chr1 94744337 94744348 HOXA10 JASPAR yes 30867246
chr1 94744337 94744348 HOXA10 JASPAR yes 118332502
chr1 94744338 94744348 EMX1 JASPAR yes 30867247
chr1 94744338 94744348 GBX2 JASPAR yes 30867248
chr1 94744338 94744348 GSX1 JASPAR yes 30867249
chr1 94744338 94744348 GSX2 JASPAR yes 30867250
chr1 94744338 94744348 HOXB2 JASPAR yes 30867251
chr1 94744338 94744348 HOXB3 JASPAR yes 30867252
chr1 94744338 94744348 MEOX1 JASPAR yes 30867253
chr1 94744338 94744348 MEOX2 JASPAR yes 30867254
chr1 94744338 94744348 MIXL1 JASPAR yes 30867255
chr1 94744338 94744348 MNX1 JASPAR yes 30867256
chr1 94744338 94744348 EMX1 JASPAR yes 118332503
chr1 94744338 94744348 GBX2 JASPAR yes 118332504
chr1 94744338 94744348 GSX1 JASPAR yes 118332505
chr1 94744338 94744348 GSX2 JASPAR yes 118332506
chr1 94744338 94744348 HOXB2 JASPAR yes 118332507
chr1 94744338 94744348 HOXB3 JASPAR yes 118332508
chr1 94744338 94744348 MEOX1 JASPAR yes 118332509
chr1 94744338 94744348 MEOX2 JASPAR yes 118332510
chr1 94744338 94744348 MIXL1 JASPAR yes 118332511
chr1 94744338 94744348 MNX1 JASPAR yes 118332512
chr1 94744339 94744347 LMX1A JASPAR yes 30867257
chr1 94744339 94744347 LMX1B JASPAR yes 30867258
chr1 94744339 94744347 NKX6-1 JASPAR yes 30867259
chr1 94744339 94744347 NKX6-2 JASPAR yes 30867260
chr1 94744339 94744347 PDX1 JASPAR yes 30867261
chr1 94744339 94744347 VAX1 JASPAR yes 30867262
chr1 94744339 94744347 VAX2 JASPAR yes 30867263
chr1 94744339 94744347 VSX1 JASPAR yes 30867264
chr1 94744339 94744347 LMX1A JASPAR yes 118332513
chr1 94744339 94744347 LMX1B JASPAR yes 118332514
chr1 94744339 94744347 NKX6-1 JASPAR yes 118332515
chr1 94744339 94744347 NKX6-2 JASPAR yes 118332516
chr1 94744339 94744347 PDX1 JASPAR yes 118332517
chr1 94744339 94744347 VAX1 JASPAR yes 118332518
chr1 94744339 94744347 VAX2 JASPAR yes 118332519
chr1 94744339 94744347 VSX1 JASPAR yes 118332520
chr1 94744342 94744358 POU4F2 JASPAR yes 30867265
chr1 94744342 94744358 POU4F2 JASPAR yes 118332521
chr1 94744347 94744354 NKX3-1 JASPAR yes 30867266
chr1 94744347 94744354 NKX3-1 JASPAR yes 118332522
chr1 94744393 94744397 NFE TRANSFAC yes 30867267
chr1 94744393 94744397 NFE TRANSFAC yes 118332523
chr1 94744393 94744400 MEIS1 JASPAR yes 30867268
chr1 94744393 94744400 MEIS1 JASPAR yes 118332524
chr1 94744397 94744409 FOXI1 JASPAR yes 30867269
chr1 94744397 94744409 FOXI1 JASPAR yes 118332525
chr1 94744418 94744421 MYB TRANSFAC yes 30867270
chr1 94744418 94744421 MYB TRANSFAC yes 118332526
chr1 94744431 94744435 YY1 TRANSFAC yes 30867271
chr1 94744431 94744435 YY1 TRANSFAC yes 118332527
SNP sites on vista2539[chr1:94744046-94744440]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 94744103 rs542979745 C T no 493876
chr1 94744127 rs557068123 C T
FIGLA FOXH1 ID4 TBX5 TCF3 TCF4 USF2 ZEB1 ZNF354C
493877
chr1 94744372 rs150044351 G A no 493878
Genes possibly regulated by vista2539[chr1:94744046-94744440]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 94614544 94740624 - ARHGAP29 ENSG00000137962.8 94740624 0.84 1.0 911 96578
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista2539[chr1:94744046-94744440]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results