EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista2544[chr1:94792807-94793133]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista2544[chr1:94792807-94793133]
Back to top
Tissue distribution of vista2544
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista2544[chr1:94792807-94793133]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 94792733 94793368 GATA2 UCSC Txn Factor no Conserved 107815593
chr1 94792807 94792810 MYB TRANSFAC yes 30873717
chr1 94792807 94792810 MYB TRANSFAC yes 118332602
chr1 94792812 94792831 PAX5 JASPAR yes 30873718
chr1 94792812 94792831 PAX5 JASPAR yes 118332603
chr1 94792814 94792824 NKX2-3 JASPAR yes 30873719
chr1 94792814 94792824 NKX2-3 JASPAR yes 118332604
chr1 94792815 94792824 NKX2-8 JASPAR yes 30873720
chr1 94792815 94792824 NKX2-8 JASPAR yes 118332605
chr1 94792844 94792854 NFATC3 JASPAR yes 30873721
chr1 94792844 94792854 NFATC3 JASPAR yes 118332606
chr1 94792857 94792874 RARA JASPAR yes 30873722
chr1 94792857 94792874 RARA JASPAR yes 118332607
chr1 94792859 94792874 NR2C2 JASPAR yes 30873723
chr1 94792859 94792874 NR2C2 JASPAR yes 118332608
chr1 94792860 94792874 RXRB JASPAR yes 30873724
chr1 94792860 94792874 RXRG JASPAR yes 30873725
chr1 94792860 94792874 RXRB JASPAR yes 118332609
chr1 94792860 94792874 RXRG JASPAR yes 118332610
chr1 94792862 94792866 LFA1 TRANSFAC yes 30873726
chr1 94792862 94792866 LFA1 TRANSFAC yes 118332611
chr1 94792865 94792876 ESRRA JASPAR yes 30873727
chr1 94792865 94792876 ESRRA JASPAR yes 118332612
chr1 94792865 94792878 NR2F1 JASPAR yes 30873728
chr1 94792865 94792878 NR2F1 JASPAR yes 118332613
chr1 94792866 94792886 PPARG JASPAR yes 30873729
chr1 94792866 94792886 PPARG JASPAR yes 118332614
chr1 94792868 94792883 ESR2 JASPAR yes 30873730
chr1 94792868 94792883 ESR2 JASPAR yes 118332615
chr1 94792869 94792873 ESR1 TRANSFAC yes 30873731
chr1 94792869 94792873 ESR1 TRANSFAC yes 118332616
chr1 94792888 94792899 E2F1 JASPAR yes 30873732
chr1 94792888 94792899 E2F1 JASPAR yes 118332617
chr1 94792889 94792900 E2F4 JASPAR yes 30873733
chr1 94792889 94792900 E2F6 JASPAR yes 30873734
chr1 94792889 94792900 E2F4 JASPAR yes 118332618
chr1 94792889 94792900 E2F6 JASPAR yes 118332619
chr1 94792910 94792923 ELF1 JASPAR yes 30873735
chr1 94792910 94792923 ELF1 JASPAR yes 118332620
chr1 94792913 94792923 ETV6 JASPAR yes 30873736
chr1 94792913 94792923 ETV6 JASPAR yes 118332621
chr1 94792914 94792922 EHF JASPAR yes 30873737
chr1 94792914 94792922 EHF JASPAR yes 118332622
chr1 94792915 94792922 SPI1 JASPAR yes 30873738
chr1 94792915 94792922 SPI1 JASPAR yes 118332623
chr1 94792931 94792945 GATA2 JASPAR yes 30873739
chr1 94792931 94792945 GATA2 JASPAR yes 118332624
chr1 94792933 94792939 GATA1 TRANSFAC yes 30873740
chr1 94792933 94792939 GATA1 TRANSFAC yes 118332625
chr1 94792933 94792941 GATA5 JASPAR yes 30873741
chr1 94792933 94792941 GATA5 JASPAR yes 118332626
chr1 94792944 94792947 MYB TRANSFAC yes 30873742
chr1 94792944 94792947 MYB TRANSFAC yes 118332627
chr1 94792950 94792958 FEV JASPAR yes 30873743
chr1 94792950 94792958 FEV JASPAR yes 118332628
chr1 94792952 94792966 STAT1 JASPAR yes 30873744
chr1 94792952 94792966 STAT1 JASPAR yes 118332629
chr1 94792952 94792967 STAT2 JASPAR yes 30873745
chr1 94792952 94792967 STAT2 JASPAR yes 118332630
chr1 94792953 94792965 IRF1 JASPAR yes 30873746
chr1 94792953 94792965 IRF1 JASPAR yes 118332631
chr1 94792981 94792990 VENTX JASPAR yes 30873747
chr1 94792981 94792990 VENTX JASPAR yes 118332632
chr1 94792981 94792991 EN2 JASPAR yes 30873748
chr1 94792981 94792991 ESX1 JASPAR yes 30873749
chr1 94792981 94792991 GBX2 JASPAR yes 30873750
chr1 94792981 94792991 EN2 JASPAR yes 118332633
chr1 94792981 94792991 ESX1 JASPAR yes 118332634
chr1 94792981 94792991 GBX2 JASPAR yes 118332635
chr1 94792982 94792990 BARX1 JASPAR yes 30873751
chr1 94792982 94792990 BARX1 JASPAR yes 118332636
chr1 94793001 94793005 LFA1 TRANSFAC yes 30873752
chr1 94793001 94793005 LFA1 TRANSFAC yes 118332637
chr1 94793003 94793014 FLI1 JASPAR yes 30873753
chr1 94793003 94793014 FLI1 JASPAR yes 118332638
chr1 94793004 94793012 EHF JASPAR yes 30873754
chr1 94793004 94793012 EHF JASPAR yes 118332639
chr1 94793008 94793013 ETS2 TRANSFAC yes 30873755
chr1 94793008 94793013 ETS2 TRANSFAC yes 118332640
chr1 94793033 94793040 SPIB JASPAR yes 30873756
chr1 94793033 94793040 SPIB JASPAR yes 118332641
chr1 94793067 94793072 SP1 TRANSFAC yes 30873757
chr1 94793067 94793072 SP1 TRANSFAC yes 118332642
chr1 94793067 94793073 SP1 TRANSFAC yes 30873758
chr1 94793067 94793073 SP1 TRANSFAC yes 118332643
chr1 94793068 94793076 SP1 TRANSFAC yes 30873759
chr1 94793068 94793076 WT1 TRANSFAC yes 30873760
chr1 94793068 94793076 SP1 TRANSFAC yes 118332644
chr1 94793068 94793076 WT1 TRANSFAC yes 118332645
chr1 94793070 94793077 SP1 TRANSFAC yes 30873761
chr1 94793070 94793077 SP1 TRANSFAC yes 118332646
chr1 94793070 94793080 SP1 JASPAR yes 30873762
chr1 94793070 94793080 SP1 JASPAR yes 118332647
chr1 94793070 94793091 ZNF263 JASPAR yes 30873763
chr1 94793070 94793091 ZNF263 JASPAR yes 118332648
chr1 94793071 94793079 SP1 TRANSFAC yes 30873764
chr1 94793071 94793079 SP1 TRANSFAC yes 118332649
chr1 94793071 94793080 SP1 TRANSFAC yes 30873765
chr1 94793071 94793080 SP1 TRANSFAC yes 118332650
chr1 94793072 94793077 SP1 TRANSFAC yes 30873766
chr1 94793072 94793077 SP1 TRANSFAC yes 118332651
chr1 94793073 94793078 SP1 TRANSFAC yes 30873767
chr1 94793073 94793078 SP1 TRANSFAC yes 118332652
chr1 94793073 94793079 SP1 TRANSFAC yes 30873768
chr1 94793073 94793079 SP1 TRANSFAC yes 118332653
chr1 94793101 94793113 TEAD1 JASPAR yes 30873769
chr1 94793101 94793113 TEAD1 JASPAR yes 118332654
SNP sites on vista2544[chr1:94792807-94793133]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 94792934 rs201925198 TGATAAGGC T
GATA1 GATA2 GATA5
494385
chr1 94792967 rs115893915 C G,T
GATA2 STAT2
494386
chr1 94792971 rs114454401 G A
GATA2
494387
chr1 94793098 rs115195187 G A
GATA2
494388
Genes possibly regulated by vista2544[chr1:94792807-94793133]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 94614544 94740624 - ARHGAP29 ENSG00000137962.8 94740624 0.84 1.0 911 47817
chr1 94883933 94984222 + ABCD3 ENSG00000117528.7 94883933 0.85 0.99 912 9200
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista2544[chr1:94792807-94793133]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results