EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista2545[chr1:94795618-94795987]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista2545[chr1:94795618-94795987]
Back to top
Tissue distribution of vista2545
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista2545[chr1:94795618-94795987]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 94795490 94796079 CTCF UCSC Txn Factor no Conserved 107815622
chr1 94795559 94795849 RAD21 UCSC Txn Factor no Conserved 107815627
chr1 94795622 94795640 RARA JASPAR yes 30874076
chr1 94795622 94795640 RARA JASPAR yes 118332655
chr1 94795623 94795634 E2F6 JASPAR yes 30874077
chr1 94795623 94795634 E2F6 JASPAR yes 118332656
chr1 94795624 94795629 SP1 TRANSFAC yes 30874078
chr1 94795624 94795629 SP1 TRANSFAC yes 118332657
chr1 94795627 94795632 ETS2 TRANSFAC yes 30874079
chr1 94795627 94795632 ETS2 TRANSFAC yes 118332658
chr1 94795631 94795649 IRF2 JASPAR yes 30874080
chr1 94795631 94795649 IRF2 JASPAR yes 118332659
chr1 94795632 94795653 IRF1 JASPAR yes 30874081
chr1 94795632 94795653 IRF1 JASPAR yes 118332660
chr1 94795634 94795649 PRDM1 JASPAR yes 30874082
chr1 94795634 94795649 PRDM1 JASPAR yes 118332661
chr1 94795635 94795649 STAT1 JASPAR yes 30874083
chr1 94795635 94795649 STAT1 JASPAR yes 118332662
chr1 94795636 94795650 IRF8 JASPAR yes 30874084
chr1 94795636 94795650 IRF8 JASPAR yes 118332663
chr1 94795636 94795651 IRF9 JASPAR yes 30874085
chr1 94795636 94795651 IRF9 JASPAR yes 118332664
chr1 94795637 94795655 IRF2 JASPAR yes 30874086
chr1 94795637 94795655 IRF2 JASPAR yes 118332665
chr1 94795638 94795659 IRF1 JASPAR yes 30874087
chr1 94795638 94795659 IRF1 JASPAR yes 118332666
chr1 94795639 94795653 PAX6 JASPAR yes 30874088
chr1 94795639 94795653 PAX6 JASPAR yes 118332667
chr1 94795640 94795655 STAT2 JASPAR yes 30874089
chr1 94795640 94795655 STAT2 JASPAR yes 118332668
chr1 94795641 94795655 STAT1 JASPAR yes 30874090
chr1 94795641 94795655 STAT1 JASPAR yes 118332669
chr1 94795648 94795653 H4TF1 TRANSFAC yes 30874091
chr1 94795648 94795653 H4TF1 TRANSFAC yes 118332670
chr1 94795659 94795671 E2F8 JASPAR yes 30874092
chr1 94795659 94795671 E2F8 JASPAR yes 118332671
chr1 94795669 94795675 HiNF-A TRANSFAC yes 30874093
chr1 94795669 94795675 HiNF-A TRANSFAC yes 118332672
chr1 94795687 94795706 CTCF JASPAR yes 30874094
chr1 94795687 94795706 CTCF JASPAR yes 118332673
chr1 94795702 94795713 STAT1 JASPAR yes 30874095
chr1 94795702 94795713 STAT1 JASPAR yes 118332674
chr1 94795707 94795722 AR JASPAR yes 30874096
chr1 94795707 94795722 AR JASPAR yes 118332675
chr1 94795707 94795724 NR3C1 JASPAR yes 30874097
chr1 94795707 94795724 NR3C2 JASPAR yes 30874098
chr1 94795707 94795724 NR3C1 JASPAR yes 118332676
chr1 94795707 94795724 NR3C2 JASPAR yes 118332677
chr1 94795707 94795725 ESR2 JASPAR yes 30874099
chr1 94795707 94795725 ESR2 JASPAR yes 118332678
chr1 94795708 94795723 ESR2 JASPAR yes 30874100
chr1 94795708 94795723 ESR2 JASPAR yes 118332679
chr1 94795722 94795726 YY1 TRANSFAC yes 30874101
chr1 94795722 94795726 YY1 TRANSFAC yes 118332680
chr1 94795730 94795744 IRF7 JASPAR yes 30874102
chr1 94795730 94795744 IRF7 JASPAR yes 118332681
chr1 94795742 94795761 RFX2 JASPAR yes 30874103
chr1 94795742 94795761 RFX2 JASPAR yes 118332682
chr1 94795781 94795793 MYBL1 JASPAR yes 30874104
chr1 94795781 94795793 MYBL1 JASPAR yes 118332683
chr1 94795782 94795787 MYC TRANSFAC yes 30874105
chr1 94795782 94795787 MYC TRANSFAC yes 118332684
chr1 94795789 94795802 NR2F1 JASPAR yes 30874106
chr1 94795789 94795802 NR2F1 JASPAR yes 118332685
chr1 94795830 94795837 SPIB JASPAR yes 30874107
chr1 94795830 94795837 SPIB JASPAR yes 118332686
chr1 94795838 94795850 NHLH1 JASPAR yes 30874108
chr1 94795838 94795850 NHLH1 JASPAR yes 118332687
chr1 94795839 94795849 NHLH1 JASPAR yes 30874109
chr1 94795839 94795849 NHLH1 JASPAR yes 118332688
chr1 94795850 94795853 MYB TRANSFAC yes 30874110
chr1 94795850 94795853 MYB TRANSFAC yes 118332689
chr1 94795851 94795872 ZNF263 JASPAR yes 30874111
chr1 94795851 94795872 ZNF263 JASPAR yes 118332690
chr1 94795853 94795864 FLI1 JASPAR yes 30874112
chr1 94795853 94795864 FLI1 JASPAR yes 118332691
chr1 94795855 94795863 EHF JASPAR yes 30874113
chr1 94795855 94795863 EHF JASPAR yes 118332692
chr1 94795860 94795864 NFE TRANSFAC yes 30874114
chr1 94795860 94795864 NFE TRANSFAC yes 118332693
chr1 94795902 94795906 YY1 TRANSFAC yes 30874115
chr1 94795902 94795906 YY1 TRANSFAC yes 118332694
chr1 94795913 94795917 H1TF2 TRANSFAC yes 30874116
chr1 94795913 94795917 NFE TRANSFAC yes 30874117
chr1 94795913 94795917 SRF TRANSFAC yes 30874118
chr1 94795913 94795917 H1TF2 TRANSFAC yes 118332695
chr1 94795913 94795917 NFE TRANSFAC yes 118332696
chr1 94795913 94795917 SRF TRANSFAC yes 118332697
chr1 94795921 94795932 FOXA1 JASPAR yes 30874119
chr1 94795921 94795932 FOXA1 JASPAR yes 118332698
chr1 94795938 94795959 ZNF263 JASPAR yes 30874120
chr1 94795938 94795959 ZNF263 JASPAR yes 118332699
chr1 94795944 94795949 ETS2 TRANSFAC yes 30874121
chr1 94795944 94795949 ETS2 TRANSFAC yes 118332700
chr1 94795973 94795994 ZNF263 JASPAR yes 30874122
chr1 94795973 94795994 ZNF263 JASPAR yes 118332701
chr1 94795980 94796001 ZNF263 JASPAR yes 30874123
chr1 94795980 94796001 ZNF263 JASPAR yes 118332702
chr1 94795987 94795997 MZF1 JASPAR yes 30874124
chr1 94795987 94795997 MZF1 JASPAR yes 118332703
SNP sites on vista2545[chr1:94795618-94795987]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 94795791 rs17111448 G A
CTCF MYBL1 NR2F1 RAD21
494415
chr1 94795943 rs556588763 C A
CTCF ZNF263
494416
Genes possibly regulated by vista2545[chr1:94795618-94795987]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 94614544 94740624 - ARHGAP29 ENSG00000137962.8 94740624 0.84 1.0 911 45006
chr1 94883933 94984222 + ABCD3 ENSG00000117528.7 94883933 0.85 0.99 912 12054
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista2545[chr1:94795618-94795987]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results