EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista25453[chr17:60947655-60947933]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista25453[chr17:60947655-60947933]
Back to top
Tissue distribution of vista25453
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista25453[chr17:60947655-60947933]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 60947619 60947860 SRF UCSC Txn Factor no Conserved 108280875
chr17 60947665 60947668 MYB TRANSFAC yes 21270722
chr17 60947665 60947668 MYB TRANSFAC yes 55219332
chr17 60947666 60947682 ZNF143 JASPAR yes 21270723
chr17 60947666 60947682 ZNF143 JASPAR yes 55219333
chr17 60947675 60947691 POU4F2 JASPAR yes 21270724
chr17 60947675 60947691 POU4F3 JASPAR yes 21270725
chr17 60947675 60947691 POU4F2 JASPAR yes 55219334
chr17 60947675 60947691 POU4F3 JASPAR yes 55219335
chr17 60947677 60947691 POU4F1 JASPAR yes 21270726
chr17 60947677 60947691 POU4F1 JASPAR yes 55219336
chr17 60947687 60947706 RFX2 JASPAR yes 21270727
chr17 60947687 60947706 RFX2 JASPAR yes 55219337
chr17 60947691 60947707 RFX2 JASPAR yes 21270728
chr17 60947691 60947707 RFX3 JASPAR yes 21270729
chr17 60947691 60947707 RFX4 JASPAR yes 21270730
chr17 60947691 60947707 RFX5 JASPAR yes 21270731
chr17 60947691 60947707 RFX2 JASPAR yes 55219338
chr17 60947691 60947707 RFX3 JASPAR yes 55219339
chr17 60947691 60947707 RFX4 JASPAR yes 55219340
chr17 60947691 60947707 RFX5 JASPAR yes 55219341
chr17 60947692 60947711 RFX2 JASPAR yes 21270732
chr17 60947692 60947711 RFX2 JASPAR yes 55219342
chr17 60947694 60947709 RFX5 JASPAR yes 21270733
chr17 60947694 60947709 RFX5 JASPAR yes 55219343
chr17 60947699 60947713 TLX1 JASPAR yes 21270734
chr17 60947699 60947713 TLX1 JASPAR yes 55219344
chr17 60947734 60947739 TFAP2A TRANSFAC yes 21270735
chr17 60947734 60947739 TFAP2A TRANSFAC yes 55219345
chr17 60947734 60947740 MZF1 JASPAR yes 21270736
chr17 60947734 60947740 MZF1 JASPAR yes 55219346
chr17 60947734 60947747 NFKB1 JASPAR yes 21270737
chr17 60947734 60947747 NFKB2 JASPAR yes 21270738
chr17 60947734 60947747 NFKB1 JASPAR yes 55219347
chr17 60947734 60947747 NFKB2 JASPAR yes 55219348
chr17 60947735 60947745 NFKB1 JASPAR yes 21270739
chr17 60947735 60947745 RELA JASPAR yes 21270740
chr17 60947735 60947745 REL JASPAR yes 21270741
chr17 60947735 60947745 NFKB1 JASPAR yes 55219349
chr17 60947735 60947745 RELA JASPAR yes 55219350
chr17 60947735 60947745 REL JASPAR yes 55219351
chr17 60947735 60947746 NFKB1 JASPAR yes 21270742
chr17 60947735 60947746 NFKB1 JASPAR yes 55219352
chr17 60947736 60947746 NFKB1 JASPAR yes 21270743
chr17 60947736 60947746 NFKB1 JASPAR yes 55219353
chr17 60947740 60947758 SRF JASPAR yes 21270744
chr17 60947740 60947758 SRF JASPAR yes 55219354
chr17 60947741 60947746 ETS2 TRANSFAC yes 21270745
chr17 60947741 60947746 ETS2 TRANSFAC yes 55219355
chr17 60947743 60947752 SRF TRANSFAC yes 21270746
chr17 60947743 60947752 SRF TRANSFAC yes 55219356
chr17 60947743 60947755 SRF JASPAR yes 21270747
chr17 60947743 60947755 SRF JASPAR yes 55219357
chr17 60947744 60947754 HOXD13 JASPAR yes 21270748
chr17 60947744 60947754 HOXD13 JASPAR yes 55219358
chr17 60947744 60947755 HOXA10 JASPAR yes 21270749
chr17 60947744 60947755 HOXA10 JASPAR yes 55219359
chr17 60947745 60947754 CDX1 JASPAR yes 21270750
chr17 60947745 60947754 CDX1 JASPAR yes 55219360
chr17 60947745 60947756 CDX2 JASPAR yes 21270751
chr17 60947745 60947756 CDX2 JASPAR yes 55219361
chr17 60947755 60947759 YY1 TRANSFAC yes 21270752
chr17 60947755 60947759 YY1 TRANSFAC yes 55219362
chr17 60947757 60947763 ETS1 JASPAR yes 21270753
chr17 60947757 60947763 ETS1 JASPAR yes 55219363
chr17 60947796 60947815 RFX2 JASPAR yes 21270754
chr17 60947796 60947815 RFX2 JASPAR yes 55219364
chr17 60947799 60947804 MYC TRANSFAC yes 21270755
chr17 60947799 60947804 MYC TRANSFAC yes 55219365
chr17 60947800 60947819 RFX2 JASPAR yes 21270756
chr17 60947800 60947819 RFX2 JASPAR yes 55219366
chr17 60947802 60947817 RFX5 JASPAR yes 21270757
chr17 60947802 60947817 RFX5 JASPAR yes 55219367
chr17 60947827 60947844 BCL6B JASPAR yes 21270758
chr17 60947827 60947844 BCL6B JASPAR yes 55219368
chr17 60947847 60947862 STAT2 JASPAR yes 21270759
chr17 60947847 60947862 STAT2 JASPAR yes 55219369
chr17 60947848 60947862 STAT1 JASPAR yes 21270760
chr17 60947848 60947862 STAT1 JASPAR yes 55219370
chr17 60947851 60947866 FOXP1 JASPAR yes 21270761
chr17 60947851 60947866 FOXP1 JASPAR yes 55219371
chr17 60947875 60947886 NRL JASPAR yes 21270762
chr17 60947875 60947886 NRL JASPAR yes 55219372
chr17 60947883 60947895 BHLHE23 JASPAR yes 21270763
chr17 60947883 60947895 BHLHE23 JASPAR yes 55219373
chr17 60947884 60947894 OLIG2 JASPAR yes 21270764
chr17 60947884 60947894 OLIG2 JASPAR yes 55219374
chr17 60947888 60947899 DMRT3 JASPAR yes 21270765
chr17 60947888 60947899 DMRT3 JASPAR yes 55219375
chr17 60947906 60947912 SOX10 JASPAR yes 21270766
chr17 60947906 60947912 SOX10 JASPAR yes 55219376
chr17 60947912 60947926 POU1F1 JASPAR yes 21270767
chr17 60947912 60947926 POU1F1 JASPAR yes 55219377
chr17 60947922 60947933 PHOX2A JASPAR yes 21270768
chr17 60947922 60947933 PROP1 JASPAR yes 21270769
chr17 60947922 60947933 PHOX2A JASPAR yes 55219378
chr17 60947922 60947933 PROP1 JASPAR yes 55219379
chr17 60947922 60947938 SOX8 JASPAR yes 21270770
chr17 60947922 60947938 SOX8 JASPAR yes 55219380
chr17 60947925 60947935 EMX1 JASPAR yes 21270771
chr17 60947925 60947935 EMX2 JASPAR yes 21270772
chr17 60947925 60947935 GSX1 JASPAR yes 21270773
chr17 60947925 60947935 HOXB3 JASPAR yes 21270774
chr17 60947925 60947935 LHX2 JASPAR yes 21270775
chr17 60947925 60947935 LHX6 JASPAR yes 21270776
chr17 60947925 60947935 MEOX1 JASPAR yes 21270777
chr17 60947925 60947935 MEOX2 JASPAR yes 21270778
chr17 60947925 60947935 POU6F1 JASPAR yes 21270779
chr17 60947925 60947935 EMX1 JASPAR yes 55219381
chr17 60947925 60947935 EMX2 JASPAR yes 55219382
chr17 60947925 60947935 GSX1 JASPAR yes 55219383
chr17 60947925 60947935 HOXB3 JASPAR yes 55219384
chr17 60947925 60947935 LHX2 JASPAR yes 55219385
chr17 60947925 60947935 LHX6 JASPAR yes 55219386
chr17 60947925 60947935 MEOX1 JASPAR yes 55219387
chr17 60947925 60947935 MEOX2 JASPAR yes 55219388
chr17 60947925 60947935 POU6F1 JASPAR yes 55219389
chr17 60947926 60947934 LBX1 JASPAR yes 21270780
chr17 60947926 60947934 PDX1 JASPAR yes 21270781
chr17 60947926 60947934 VAX1 JASPAR yes 21270782
chr17 60947926 60947934 VAX2 JASPAR yes 21270783
chr17 60947926 60947934 VSX1 JASPAR yes 21270784
chr17 60947926 60947934 VSX2 JASPAR yes 21270785
chr17 60947926 60947934 LBX1 JASPAR yes 55219390
chr17 60947926 60947934 PDX1 JASPAR yes 55219391
chr17 60947926 60947934 VAX1 JASPAR yes 55219392
chr17 60947926 60947934 VAX2 JASPAR yes 55219393
chr17 60947926 60947934 VSX1 JASPAR yes 55219394
chr17 60947926 60947934 VSX2 JASPAR yes 55219395
chr17 60947928 60947936 HOXA5 JASPAR yes 21270786
chr17 60947928 60947936 HOXA5 JASPAR yes 55219396
chr17 60947930 60947942 HNF1B JASPAR yes 21270787
chr17 60947930 60947942 HNF1B JASPAR yes 55219397
chr17 60947932 60947945 EOMES JASPAR yes 21270788
chr17 60947932 60947945 EOMES JASPAR yes 55219398
SNP sites on vista25453[chr17:60947655-60947933]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 60947779 rs117553826 G C
SRF
4975321
chr17 60947887 rs139838641 CAT C
BHLHE23 OLIG2
4975322
chr17 60947887 rs866376274 CAT C
BHLHE23 OLIG2
4975323
Genes possibly regulated by vista25453[chr17:60947655-60947933]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 60778675 60885705 - MARCH10 ENSG00000173838.7 60885705 0.95 0.94 16131 38050
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista25453[chr17:60947655-60947933]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results