EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista25894[chr17:72276235-72276702]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista25894[chr17:72276235-72276702]
Back to top
Tissue distribution of vista25894
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista25894[chr17:72276235-72276702]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 72276277 72276292 JUND JASPAR yes 21291758
chr17 72276277 72276292 JUND JASPAR yes 55901294
chr17 72276278 72276291 JUN JASPAR yes 21291759
chr17 72276278 72276291 JUN JASPAR yes 55901295
chr17 72276279 72276293 ATF7 JASPAR yes 21291760
chr17 72276279 72276293 BATF3 JASPAR yes 21291761
chr17 72276279 72276293 ATF7 JASPAR yes 55901296
chr17 72276279 72276293 BATF3 JASPAR yes 55901297
chr17 72276280 72276292 JDP2 JASPAR yes 21291762
chr17 72276280 72276292 JDP2 JASPAR yes 55901298
chr17 72276295 72276313 RARA JASPAR yes 21291763
chr17 72276295 72276313 RARA JASPAR yes 55901299
chr17 72276301 72276314 NR2F1 JASPAR yes 21291764
chr17 72276301 72276314 NR2F1 JASPAR yes 55901300
chr17 72276302 72276317 LEF1 JASPAR yes 21291765
chr17 72276302 72276317 NR2C2 JASPAR yes 21291766
chr17 72276302 72276317 LEF1 JASPAR yes 55901301
chr17 72276302 72276317 NR2C2 JASPAR yes 55901302
chr17 72276303 72276311 NR4A2 JASPAR yes 21291767
chr17 72276303 72276311 NR4A2 JASPAR yes 55901303
chr17 72276303 72276317 RXRB JASPAR yes 21291768
chr17 72276303 72276317 RXRB JASPAR yes 55901304
chr17 72276305 72276309 ESR1 TRANSFAC yes 21291769
chr17 72276305 72276309 ESR1 TRANSFAC yes 55901305
chr17 72276307 72276318 ESRRA JASPAR yes 21291770
chr17 72276307 72276318 ESRRB JASPAR yes 21291771
chr17 72276307 72276318 ESRRA JASPAR yes 55901306
chr17 72276307 72276318 ESRRB JASPAR yes 55901307
chr17 72276311 72276315 LFA1 TRANSFAC yes 21291772
chr17 72276311 72276315 LFA1 TRANSFAC yes 55901308
chr17 72276342 72276346 YY1 TRANSFAC yes 21291773
chr17 72276342 72276346 YY1 TRANSFAC yes 55901309
chr17 72276344 72276354 HOXD11 JASPAR yes 21291774
chr17 72276344 72276354 HOXD11 JASPAR yes 55901310
chr17 72276344 72276355 HOXC11 JASPAR yes 21291775
chr17 72276344 72276355 HOXC12 JASPAR yes 21291776
chr17 72276344 72276355 HOXC11 JASPAR yes 55901311
chr17 72276344 72276355 HOXC12 JASPAR yes 55901312
chr17 72276356 72276370 POU1F1 JASPAR yes 21291777
chr17 72276356 72276370 POU1F1 JASPAR yes 55901313
chr17 72276378 72276386 EHF JASPAR yes 21291778
chr17 72276378 72276386 EHF JASPAR yes 55901314
chr17 72276380 72276385 ETS2 TRANSFAC yes 21291779
chr17 72276380 72276385 ETS2 TRANSFAC yes 55901315
chr17 72276388 72276403 HNF4A JASPAR yes 21291780
chr17 72276388 72276403 HNF4A JASPAR yes 55901316
chr17 72276389 72276403 RXRB JASPAR yes 21291781
chr17 72276389 72276403 RXRG JASPAR yes 21291782
chr17 72276389 72276403 RXRB JASPAR yes 55901317
chr17 72276389 72276403 RXRG JASPAR yes 55901318
chr17 72276389 72276404 HNF4G JASPAR yes 21291783
chr17 72276389 72276404 HNF4G JASPAR yes 55901319
chr17 72276399 72276409 SP1 JASPAR yes 21291784
chr17 72276399 72276409 SP1 JASPAR yes 55901320
chr17 72276400 72276406 SP1 TRANSFAC yes 21291785
chr17 72276400 72276406 SP1 TRANSFAC yes 55901321
chr17 72276400 72276410 SP1 JASPAR yes 21291786
chr17 72276400 72276410 SP1 JASPAR yes 55901322
chr17 72276420 72276441 IRF1 JASPAR yes 21291787
chr17 72276420 72276441 IRF1 JASPAR yes 55901323
chr17 72276422 72276437 PRDM1 JASPAR yes 21291788
chr17 72276422 72276437 STAT2 JASPAR yes 21291789
chr17 72276422 72276437 PRDM1 JASPAR yes 55901324
chr17 72276422 72276437 STAT2 JASPAR yes 55901325
chr17 72276423 72276437 STAT1 JASPAR yes 21291790
chr17 72276423 72276437 STAT1 JASPAR yes 55901326
chr17 72276427 72276442 PRDM1 JASPAR yes 21291791
chr17 72276427 72276442 PRDM1 JASPAR yes 55901327
chr17 72276429 72276433 YY1 TRANSFAC yes 21291792
chr17 72276429 72276433 YY1 TRANSFAC yes 55901328
chr17 72276457 72276469 PKNOX1 JASPAR yes 21291793
chr17 72276457 72276469 PKNOX2 JASPAR yes 21291794
chr17 72276457 72276469 TGIF2 JASPAR yes 21291795
chr17 72276457 72276469 PKNOX1 JASPAR yes 55901329
chr17 72276457 72276469 PKNOX2 JASPAR yes 55901330
chr17 72276457 72276469 TGIF2 JASPAR yes 55901331
chr17 72276475 72276484 NKX3-2 JASPAR yes 21291796
chr17 72276475 72276484 NKX3-2 JASPAR yes 55901332
chr17 72276492 72276496 ESR1 TRANSFAC yes 21291797
chr17 72276492 72276496 ESR1 TRANSFAC yes 55901333
chr17 72276496 72276508 NHLH1 JASPAR yes 21291798
chr17 72276496 72276508 NHLH1 JASPAR yes 55901334
chr17 72276497 72276507 NHLH1 JASPAR yes 21291799
chr17 72276497 72276507 NHLH1 JASPAR yes 55901335
chr17 72276541 72276551 SP1 JASPAR yes 21291800
chr17 72276541 72276551 SP1 JASPAR yes 55901336
chr17 72276554 72276558 H1TF2 TRANSFAC yes 21291801
chr17 72276554 72276558 NFE TRANSFAC yes 21291802
chr17 72276554 72276558 SRF TRANSFAC yes 21291803
chr17 72276554 72276558 H1TF2 TRANSFAC yes 55901337
chr17 72276554 72276558 NFE TRANSFAC yes 55901338
chr17 72276554 72276558 SRF TRANSFAC yes 55901339
chr17 72276556 72276571 ZIC3 JASPAR yes 21291804
chr17 72276556 72276571 ZIC3 JASPAR yes 55901340
chr17 72276582 72276594 HES5 JASPAR yes 21291805
chr17 72276582 72276594 HES5 JASPAR yes 55901341
chr17 72276602 72276622 ESR1 JASPAR yes 21291806
chr17 72276602 72276622 ESR1 JASPAR yes 55901342
chr17 72276616 72276623 E2F1 TRANSFAC yes 21291807
chr17 72276616 72276623 E2F1 TRANSFAC yes 55901343
chr17 72276618 72276632 ZIC1 JASPAR yes 21291808
chr17 72276618 72276632 ZIC1 JASPAR yes 55901344
chr17 72276628 72276633 TFAP2A TRANSFAC yes 21291809
chr17 72276628 72276633 TFAP2A TRANSFAC yes 55901345
chr17 72276628 72276634 MZF1 JASPAR yes 21291810
chr17 72276628 72276634 MZF1 JASPAR yes 55901346
chr17 72276628 72276641 NFKB1 JASPAR yes 21291811
chr17 72276628 72276641 NFKB2 JASPAR yes 21291812
chr17 72276628 72276641 NFKB1 JASPAR yes 55901347
chr17 72276628 72276641 NFKB2 JASPAR yes 55901348
chr17 72276629 72276640 NFKB1 JASPAR yes 21291813
chr17 72276629 72276640 NFKB1 JASPAR yes 55901349
chr17 72276630 72276635 ETS2 TRANSFAC yes 21291814
chr17 72276630 72276635 ETS2 TRANSFAC yes 55901350
chr17 72276630 72276640 NFKB1 JASPAR yes 21291815
chr17 72276630 72276640 RELA JASPAR yes 21291816
chr17 72276630 72276640 NFKB1 JASPAR yes 55901351
chr17 72276630 72276640 RELA JASPAR yes 55901352
chr17 72276630 72276641 NFKB1 JASPAR yes 21291817
chr17 72276630 72276641 NFKB1 JASPAR yes 55901353
chr17 72276640 72276655 PRDM1 JASPAR yes 21291818
chr17 72276640 72276655 PRDM1 JASPAR yes 55901354
chr17 72276651 72276655 NFE TRANSFAC yes 21291819
chr17 72276651 72276655 NFE TRANSFAC yes 55901355
chr17 72276674 72276678 NFE TRANSFAC yes 21291820
chr17 72276674 72276678 NFE TRANSFAC yes 55901356
chr17 72276692 72276707 HSF1 JASPAR yes 21291821
chr17 72276692 72276707 HSF1 JASPAR yes 55901357
chr17 72276695 72276700 H4TF1 TRANSFAC yes 21291822
chr17 72276695 72276700 H4TF1 TRANSFAC yes 55901358
SNP sites on vista25894[chr17:72276235-72276702]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 72276539 rs80197728 G A no 5048309
chr17 72276622 rs560413121 C T
E2F1 ESR1 ZIC1
5048310
Genes possibly regulated by vista25894[chr17:72276235-72276702]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 72199721 72206794 + RPL38 ENSG00000172809.8 72199721 0.64 1.0 16208 23486
chr17 72209653 72258155 + TTYH2 ENSG00000141540.6 72209653 0.79 1.0 16209 33418
chr17 72270386 72311023 + DNAI2 ENSG00000171595.9 72270386 0.96 1.0 16210 94151
chr17 72322349 72351959 + KIF19 ENSG00000196169.10 72322349 0.95 1.0 16211 54353
chr17 72346906 72348271 - AC103809.2 ENSG00000268626.1 72348271 1.0 0.0 16212 28431
chr17 72352555 72358085 - BTBD17 ENSG00000204347.3 72358085 0.87 1.0 16213 18617
chr17 72363546 72368761 + GPR142 ENSG00000257008.2 72363546 0.94 0.0 16214 13156
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista25894[chr17:72276235-72276702]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results