EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista25953[chr17:72989354-72989561]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista25953[chr17:72989354-72989561]
Back to top
Tissue distribution of vista25953
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista25953[chr17:72989354-72989561]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 72989374 72989389 FOXP1 JASPAR yes 21294968
chr17 72989374 72989389 FOXP1 JASPAR yes 55927379
chr17 72989376 72989391 FOXP1 JASPAR yes 21294969
chr17 72989376 72989391 FOXP1 JASPAR yes 55927380
chr17 72989398 72989417 PAX5 JASPAR yes 21294970
chr17 72989398 72989417 PAX5 JASPAR yes 55927381
chr17 72989403 72989407 H4TF2 TRANSFAC yes 21294971
chr17 72989403 72989407 H4TF2 TRANSFAC yes 55927382
chr17 72989439 72989453 TLX1 JASPAR yes 21294972
chr17 72989439 72989453 TLX1 JASPAR yes 55927383
chr17 72989439 72989457 ESR2 JASPAR yes 21294973
chr17 72989439 72989457 ESR2 JASPAR yes 55927384
chr17 72989440 72989457 ESR1 JASPAR yes 21294974
chr17 72989440 72989457 ESR1 JASPAR yes 55927385
chr17 72989443 72989464 ZNF263 JASPAR yes 21294975
chr17 72989443 72989464 ZNF263 JASPAR yes 55927386
chr17 72989450 72989462 HINFP JASPAR yes 21294976
chr17 72989450 72989462 HINFP JASPAR yes 55927387
chr17 72989454 72989462 SP1 TRANSFAC yes 21294977
chr17 72989454 72989462 SP1 TRANSFAC yes 55927388
chr17 72989454 72989464 SP1 JASPAR yes 21294978
chr17 72989454 72989464 SP1 JASPAR yes 55927389
chr17 72989476 72989497 MAFG JASPAR yes 21294979
chr17 72989476 72989497 MAFG JASPAR yes 55927390
chr17 72989512 72989521 ZEB1 JASPAR yes 21294980
chr17 72989512 72989521 ZEB1 JASPAR yes 55927391
chr17 72989513 72989533 TP63 JASPAR yes 21294981
chr17 72989513 72989533 TP63 JASPAR yes 55927392
chr17 72989519 72989530 GCM1 JASPAR yes 21294982
chr17 72989519 72989530 GCM1 JASPAR yes 55927393
chr17 72989527 72989532 SP1 TRANSFAC yes 21294983
chr17 72989527 72989532 SP1 TRANSFAC yes 55927394
chr17 72989533 72989543 POU6F2 JASPAR yes 21294984
chr17 72989533 72989543 POU6F2 JASPAR yes 55927395
chr17 72989534 72989544 EMX1 JASPAR yes 21294985
chr17 72989534 72989544 EMX2 JASPAR yes 21294986
chr17 72989534 72989544 EN2 JASPAR yes 21294987
chr17 72989534 72989544 ESX1 JASPAR yes 21294988
chr17 72989534 72989544 GBX1 JASPAR yes 21294989
chr17 72989534 72989544 GBX2 JASPAR yes 21294990
chr17 72989534 72989544 GSX1 JASPAR yes 21294991
chr17 72989534 72989544 GSX2 JASPAR yes 21294992
chr17 72989534 72989544 HESX1 JASPAR yes 21294993
chr17 72989534 72989544 HOXA2 JASPAR yes 21294994
chr17 72989534 72989544 HOXB2 JASPAR yes 21294995
chr17 72989534 72989544 HOXB3 JASPAR yes 21294996
chr17 72989534 72989544 LBX2 JASPAR yes 21294997
chr17 72989534 72989544 LHX2 JASPAR yes 21294998
chr17 72989534 72989544 LHX6 JASPAR yes 21294999
chr17 72989534 72989544 MEOX1 JASPAR yes 21295000
chr17 72989534 72989544 MEOX2 JASPAR yes 21295001
chr17 72989534 72989544 MIXL1 JASPAR yes 21295002
chr17 72989534 72989544 MNX1 JASPAR yes 21295003
chr17 72989534 72989544 NOTO JASPAR yes 21295004
chr17 72989534 72989544 POU6F1 JASPAR yes 21295005
chr17 72989534 72989544 RAX JASPAR yes 21295006
chr17 72989534 72989544 EMX1 JASPAR yes 55927396
chr17 72989534 72989544 EMX2 JASPAR yes 55927397
chr17 72989534 72989544 EN2 JASPAR yes 55927398
chr17 72989534 72989544 ESX1 JASPAR yes 55927399
chr17 72989534 72989544 GBX1 JASPAR yes 55927400
chr17 72989534 72989544 GBX2 JASPAR yes 55927401
chr17 72989534 72989544 GSX1 JASPAR yes 55927402
chr17 72989534 72989544 GSX2 JASPAR yes 55927403
chr17 72989534 72989544 HESX1 JASPAR yes 55927404
chr17 72989534 72989544 HOXA2 JASPAR yes 55927405
chr17 72989534 72989544 HOXB2 JASPAR yes 55927406
chr17 72989534 72989544 HOXB3 JASPAR yes 55927407
chr17 72989534 72989544 LBX2 JASPAR yes 55927408
chr17 72989534 72989544 LHX2 JASPAR yes 55927409
chr17 72989534 72989544 LHX6 JASPAR yes 55927410
chr17 72989534 72989544 MEOX1 JASPAR yes 55927411
chr17 72989534 72989544 MEOX2 JASPAR yes 55927412
chr17 72989534 72989544 MIXL1 JASPAR yes 55927413
chr17 72989534 72989544 MNX1 JASPAR yes 55927414
chr17 72989534 72989544 NOTO JASPAR yes 55927415
chr17 72989534 72989544 POU6F1 JASPAR yes 55927416
chr17 72989534 72989544 RAX JASPAR yes 55927417
chr17 72989535 72989543 BSX JASPAR yes 21295007
chr17 72989535 72989543 DLX6 JASPAR yes 21295008
chr17 72989535 72989543 EN1 JASPAR yes 21295009
chr17 72989535 72989543 ISX JASPAR yes 21295010
chr17 72989535 72989543 LBX1 JASPAR yes 21295011
chr17 72989535 72989543 LHX9 JASPAR yes 21295012
chr17 72989535 72989543 LMX1A JASPAR yes 21295013
chr17 72989535 72989543 LMX1B JASPAR yes 21295014
chr17 72989535 72989543 NKX6-1 JASPAR yes 21295015
chr17 72989535 72989543 NKX6-2 JASPAR yes 21295016
chr17 72989535 72989543 PAX4 JASPAR yes 21295017
chr17 72989535 72989543 PDX1 JASPAR yes 21295018
chr17 72989535 72989543 PRRX1 JASPAR yes 21295019
chr17 72989535 72989543 RAX2 JASPAR yes 21295020
chr17 72989535 72989543 SHOX JASPAR yes 21295021
chr17 72989535 72989543 UNCX JASPAR yes 21295022
chr17 72989535 72989543 VAX1 JASPAR yes 21295023
chr17 72989535 72989543 VAX2 JASPAR yes 21295024
chr17 72989535 72989543 VSX1 JASPAR yes 21295025
chr17 72989535 72989543 VSX2 JASPAR yes 21295026
chr17 72989535 72989543 BSX JASPAR yes 55927418
chr17 72989535 72989543 DLX6 JASPAR yes 55927419
chr17 72989535 72989543 EN1 JASPAR yes 55927420
chr17 72989535 72989543 ISX JASPAR yes 55927421
chr17 72989535 72989543 LBX1 JASPAR yes 55927422
chr17 72989535 72989543 LHX9 JASPAR yes 55927423
chr17 72989535 72989543 LMX1A JASPAR yes 55927424
chr17 72989535 72989543 LMX1B JASPAR yes 55927425
chr17 72989535 72989543 NKX6-1 JASPAR yes 55927426
chr17 72989535 72989543 NKX6-2 JASPAR yes 55927427
chr17 72989535 72989543 PAX4 JASPAR yes 55927428
chr17 72989535 72989543 PDX1 JASPAR yes 55927429
chr17 72989535 72989543 PRRX1 JASPAR yes 55927430
chr17 72989535 72989543 RAX2 JASPAR yes 55927431
chr17 72989535 72989543 SHOX JASPAR yes 55927432
chr17 72989535 72989543 UNCX JASPAR yes 55927433
chr17 72989535 72989543 VAX1 JASPAR yes 55927434
chr17 72989535 72989543 VAX2 JASPAR yes 55927435
chr17 72989535 72989543 VSX1 JASPAR yes 55927436
chr17 72989535 72989543 VSX2 JASPAR yes 55927437
chr17 72989536 72989546 PAX3 JASPAR yes 21295027
chr17 72989536 72989546 PAX7 JASPAR yes 21295028
chr17 72989536 72989546 PAX3 JASPAR yes 55927438
chr17 72989536 72989546 PAX7 JASPAR yes 55927439
chr17 72989536 72989547 PHOX2A JASPAR yes 21295029
chr17 72989536 72989547 PROP1 JASPAR yes 21295030
chr17 72989536 72989547 PHOX2A JASPAR yes 55927440
chr17 72989536 72989547 PROP1 JASPAR yes 55927441
SNP sites on vista25953[chr17:72989354-72989561]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 72989377 rs186899955 C G
FOXP1
5053062
chr17 72989411 rs4788855 C T
PAX5
5053063
Genes possibly regulated by vista25953[chr17:72989354-72989561]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 72873428 72889708 - FADS6 ENSG00000172782.7 72889708 0.92 0.83 16229 354
chr17 72912176 72919351 - USH1G ENSG00000182040.4 72919351 0.95 1.0 16230 29997
chr17 72920370 72930007 + OTOP2 ENSG00000183034.8 72920370 0.99 0.93 16231 31016
chr17 72931814 72946087 + OTOP3 ENSG00000182938.4 72931814 1.0 1.0 16232 42460
chr17 72946838 72969261 - HID1 ENSG00000167861.11 72969261 0.91 1.0 16233 79907
chr17 72983727 73001895 + CDR2L ENSG00000109089.7 72983727 0.75 1.0 16234 94373
chr17 73008765 73017356 + ICT1 ENSG00000167862.5 73008765 0.56 1.0 16235 80796
chr17 73028670 73061984 + KCTD2 ENSG00000180901.6 73028670 0.67 1.0 16236 60891
chr17 73034958 73043080 - ATP5H ENSG00000167863.7 73043080 0.58 0.99 16237 46481
chr17 73083822 73102257 + SLC16A5 ENSG00000170190.11 73083822 0.87 1.0 16238 5739
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista25953[chr17:72989354-72989561]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results