EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista25966[chr17:73293570-73293940]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista25966[chr17:73293570-73293940]
Back to top
Tissue distribution of vista25966
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista25966[chr17:73293570-73293940]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 73293505 73293722 SPI1 UCSC Txn Factor no Conserved 108293382
chr17 73293562 73293577 HSF1 JASPAR yes 21295597
chr17 73293562 73293577 HSF1 JASPAR yes 55941416
chr17 73293572 73293578 PEA3 TRANSFAC yes 21295598
chr17 73293572 73293578 PEA3 TRANSFAC yes 55941417
chr17 73293572 73293582 ETV6 JASPAR yes 21295599
chr17 73293572 73293582 ETV6 JASPAR yes 55941418
chr17 73293573 73293581 EHF JASPAR yes 21295600
chr17 73293573 73293581 EHF JASPAR yes 55941419
chr17 73293574 73293581 SPI1 JASPAR yes 21295601
chr17 73293574 73293581 SPI1 JASPAR yes 55941420
chr17 73293579 73293595 NFYA JASPAR yes 21295602
chr17 73293579 73293595 NFYA JASPAR yes 55941421
chr17 73293603 73293609 GATA3 JASPAR yes 21295603
chr17 73293603 73293609 GATA3 JASPAR yes 55941422
chr17 73293608 73293623 ESR2 JASPAR yes 21295604
chr17 73293608 73293623 ESR2 JASPAR yes 55941423
chr17 73293609 73293613 LFA1 TRANSFAC yes 21295605
chr17 73293609 73293613 LFA1 TRANSFAC yes 55941424
chr17 73293609 73293625 RFX3 JASPAR yes 21295606
chr17 73293609 73293625 RFX4 JASPAR yes 21295607
chr17 73293609 73293625 RFX5 JASPAR yes 21295608
chr17 73293609 73293625 RFX3 JASPAR yes 55941425
chr17 73293609 73293625 RFX4 JASPAR yes 55941426
chr17 73293609 73293625 RFX5 JASPAR yes 55941427
chr17 73293610 73293629 RFX2 JASPAR yes 21295609
chr17 73293610 73293629 RFX2 JASPAR yes 55941428
chr17 73293612 73293627 RFX5 JASPAR yes 21295610
chr17 73293612 73293627 RFX5 JASPAR yes 55941429
chr17 73293615 73293624 NFIX JASPAR yes 21295611
chr17 73293615 73293624 NFIX JASPAR yes 55941430
chr17 73293616 73293622 NFIC JASPAR yes 21295612
chr17 73293616 73293622 NFIC JASPAR yes 55941431
chr17 73293620 73293641 IRF1 JASPAR yes 21295613
chr17 73293620 73293641 IRF1 JASPAR yes 55941432
chr17 73293622 73293637 STAT2 JASPAR yes 21295614
chr17 73293622 73293637 STAT2 JASPAR yes 55941433
chr17 73293623 73293637 SPI1 JASPAR yes 21295615
chr17 73293623 73293637 STAT1 JASPAR yes 21295616
chr17 73293623 73293637 SPI1 JASPAR yes 55941434
chr17 73293623 73293637 STAT1 JASPAR yes 55941435
chr17 73293626 73293631 ETS2 TRANSFAC yes 21295617
chr17 73293626 73293631 ETS2 TRANSFAC yes 55941436
chr17 73293628 73293643 FOXP1 JASPAR yes 21295618
chr17 73293628 73293643 FOXP1 JASPAR yes 55941437
chr17 73293633 73293648 LEF1 JASPAR yes 21295619
chr17 73293633 73293648 LEF1 JASPAR yes 55941438
chr17 73293634 73293648 TCF7L2 JASPAR yes 21295620
chr17 73293634 73293648 TCF7L2 JASPAR yes 55941439
chr17 73293637 73293643 LEF1 TRANSFAC yes 21295621
chr17 73293637 73293643 SOX10 JASPAR yes 21295622
chr17 73293637 73293643 LEF1 TRANSFAC yes 55941440
chr17 73293637 73293643 SOX10 JASPAR yes 55941441
chr17 73293639 73293660 IRF1 JASPAR yes 21295623
chr17 73293639 73293660 IRF1 JASPAR yes 55941442
chr17 73293651 73293669 MAFF JASPAR yes 21295624
chr17 73293651 73293669 MAFF JASPAR yes 55941443
chr17 73293652 73293667 MAFK JASPAR yes 21295625
chr17 73293652 73293667 MAFK JASPAR yes 55941444
chr17 73293656 73293667 NRL JASPAR yes 21295626
chr17 73293656 73293667 NRL JASPAR yes 55941445
chr17 73293659 73293673 JUN JASPAR yes 21295627
chr17 73293659 73293673 JUN JASPAR yes 55941446
chr17 73293661 73293672 BATF JASPAR yes 21295628
chr17 73293661 73293672 BATF JASPAR yes 55941447
chr17 73293662 73293673 JUNB JASPAR yes 21295629
chr17 73293662 73293673 JUNB JASPAR yes 55941448
chr17 73293663 73293674 FOS JASPAR yes 21295630
chr17 73293663 73293674 FOS JASPAR yes 55941449
chr17 73293664 73293673 JDP2 JASPAR yes 21295631
chr17 73293664 73293673 JDP2 JASPAR yes 55941450
chr17 73293665 73293676 BATF JASPAR yes 21295632
chr17 73293665 73293676 BATF JASPAR yes 55941451
chr17 73293680 73293695 MEF2C JASPAR yes 21295633
chr17 73293680 73293695 MEF2C JASPAR yes 55941452
chr17 73293681 73293702 IRF1 JASPAR yes 21295634
chr17 73293681 73293702 IRF1 JASPAR yes 55941453
chr17 73293683 73293697 IRF7 JASPAR yes 21295635
chr17 73293683 73293697 IRF7 JASPAR yes 55941454
chr17 73293684 73293699 FOXP1 JASPAR yes 21295636
chr17 73293684 73293699 FOXP1 JASPAR yes 55941455
chr17 73293686 73293701 FOXP1 JASPAR yes 21295637
chr17 73293686 73293701 MEF2C JASPAR yes 21295638
chr17 73293686 73293701 FOXP1 JASPAR yes 55941456
chr17 73293686 73293701 MEF2C JASPAR yes 55941457
chr17 73293686 73293707 IRF1 JASPAR yes 21295639
chr17 73293686 73293707 IRF1 JASPAR yes 55941458
chr17 73293687 73293702 FOXP1 JASPAR yes 21295640
chr17 73293687 73293702 FOXP1 JASPAR yes 55941459
chr17 73293687 73293708 IRF1 JASPAR yes 21295641
chr17 73293687 73293708 IRF1 JASPAR yes 55941460
chr17 73293688 73293703 FOXP1 JASPAR yes 21295642
chr17 73293688 73293703 FOXP1 JASPAR yes 55941461
chr17 73293688 73293709 IRF1 JASPAR yes 21295643
chr17 73293688 73293709 IRF1 JASPAR yes 55941462
chr17 73293689 73293704 FOXP1 JASPAR yes 21295644
chr17 73293689 73293704 FOXP1 JASPAR yes 55941463
chr17 73293690 73293696 TBP TRANSFAC yes 21295645
chr17 73293690 73293696 TBP TRANSFAC yes 55941464
chr17 73293691 73293706 FOXP1 JASPAR yes 21295646
chr17 73293691 73293706 FOXP1 JASPAR yes 55941465
chr17 73293692 73293713 IRF1 JASPAR yes 21295647
chr17 73293692 73293713 IRF1 JASPAR yes 55941466
chr17 73293693 73293708 FOXP1 JASPAR yes 21295648
chr17 73293693 73293708 FOXP1 JASPAR yes 55941467
chr17 73293696 73293710 SPIC JASPAR yes 21295649
chr17 73293696 73293710 STAT1 JASPAR yes 21295650
chr17 73293696 73293710 SPIC JASPAR yes 55941468
chr17 73293696 73293710 STAT1 JASPAR yes 55941469
chr17 73293696 73293711 PRDM1 JASPAR yes 21295651
chr17 73293696 73293711 STAT2 JASPAR yes 21295652
chr17 73293696 73293711 PRDM1 JASPAR yes 55941470
chr17 73293696 73293711 STAT2 JASPAR yes 55941471
chr17 73293696 73293717 IRF1 JASPAR yes 21295653
chr17 73293696 73293717 IRF1 JASPAR yes 55941472
chr17 73293698 73293719 IRF1 JASPAR yes 21295654
chr17 73293698 73293719 IRF1 JASPAR yes 55941473
chr17 73293700 73293721 IRF1 JASPAR yes 21295655
chr17 73293700 73293721 ZNF263 JASPAR yes 21295656
chr17 73293700 73293721 IRF1 JASPAR yes 55941474
chr17 73293700 73293721 ZNF263 JASPAR yes 55941475
chr17 73293702 73293723 IRF1 JASPAR yes 21295657
chr17 73293702 73293723 IRF1 JASPAR yes 55941476
chr17 73293726 73293730 NFE TRANSFAC yes 21295658
chr17 73293726 73293730 NFE TRANSFAC yes 55941477
chr17 73293734 73293737 MYB TRANSFAC yes 21295659
chr17 73293734 73293737 MYB TRANSFAC yes 55941478
chr17 73293749 73293754 H4TF1 TRANSFAC yes 21295660
chr17 73293749 73293754 H4TF1 TRANSFAC yes 55941479
chr17 73293752 73293766 SPIC JASPAR yes 21295661
chr17 73293752 73293766 SPIC JASPAR yes 55941480
chr17 73293760 73293764 YY1 TRANSFAC yes 21295662
chr17 73293760 73293764 YY1 TRANSFAC yes 55941481
chr17 73293761 73293773 IRF1 JASPAR yes 21295663
chr17 73293761 73293773 IRF1 JASPAR yes 55941482
chr17 73293761 73293775 IRF7 JASPAR yes 21295664
chr17 73293761 73293775 IRF7 JASPAR yes 55941483
chr17 73293783 73293797 EBF1 JASPAR yes 21295665
chr17 73293783 73293797 EBF1 JASPAR yes 55941484
chr17 73293785 73293796 EBF1 JASPAR yes 21295666
chr17 73293785 73293796 EBF1 JASPAR yes 55941485
chr17 73293798 73293813 LEF1 JASPAR yes 21295667
chr17 73293798 73293813 LEF1 JASPAR yes 55941486
chr17 73293828 73293839 FOSL2 JASPAR yes 21295668
chr17 73293828 73293839 FOSL2 JASPAR yes 55941487
chr17 73293852 73293861 NKX2-8 JASPAR yes 21295669
chr17 73293852 73293861 NKX2-8 JASPAR yes 55941488
chr17 73293852 73293867 ZIC3 JASPAR yes 21295670
chr17 73293852 73293867 ZIC3 JASPAR yes 55941489
chr17 73293868 73293873 SP1 TRANSFAC yes 21295671
chr17 73293868 73293873 SP1 TRANSFAC yes 55941490
chr17 73293869 73293874 SP1 TRANSFAC yes 21295672
chr17 73293869 73293874 SP1 TRANSFAC yes 55941491
chr17 73293872 73293877 SP1 TRANSFAC yes 21295673
chr17 73293872 73293877 SP1 TRANSFAC yes 55941492
chr17 73293881 73293895 ATF7 JASPAR yes 21295674
chr17 73293881 73293895 BATF3 JASPAR yes 21295675
chr17 73293881 73293895 ATF7 JASPAR yes 55941493
chr17 73293881 73293895 BATF3 JASPAR yes 55941494
chr17 73293882 73293894 JDP2 JASPAR yes 21295676
chr17 73293882 73293894 JDP2 JASPAR yes 55941495
chr17 73293884 73293889 ATF1 TRANSFAC yes 21295677
chr17 73293884 73293889 ATF1 TRANSFAC yes 55941496
chr17 73293884 73293892 CREB1 JASPAR yes 21295678
chr17 73293884 73293892 CREB1 JASPAR yes 55941497
chr17 73293886 73293891 ATF1 TRANSFAC yes 21295679
chr17 73293886 73293891 ATF1 TRANSFAC yes 55941498
chr17 73293917 73293928 CEBPB JASPAR yes 21295680
chr17 73293917 73293928 CEBPB JASPAR yes 55941499
chr17 73293928 73293932 NFE TRANSFAC yes 21295681
chr17 73293928 73293932 NFE TRANSFAC yes 55941500
chr17 73293935 73293950 MEF2A JASPAR yes 21295682
chr17 73293935 73293950 MEF2A JASPAR yes 55941501
chr17 73293936 73293948 MEF2A JASPAR yes 21295683
chr17 73293936 73293948 MEF2B JASPAR yes 21295684
chr17 73293936 73293948 MEF2D JASPAR yes 21295685
chr17 73293936 73293948 MEF2A JASPAR yes 55941502
chr17 73293936 73293948 MEF2B JASPAR yes 55941503
chr17 73293936 73293948 MEF2D JASPAR yes 55941504
chr17 73293937 73293947 MEF2A JASPAR yes 21295686
chr17 73293937 73293947 MEF2A JASPAR yes 55941505
chr17 73293938 73293949 CDX2 JASPAR yes 21295687
chr17 73293938 73293949 CDX2 JASPAR yes 55941506
chr17 73293939 73293950 HOXA10 JASPAR yes 21295688
chr17 73293939 73293950 HOXA10 JASPAR yes 55941507
chr17 73293940 73293949 CDX1 JASPAR yes 21295689
chr17 73293940 73293949 CDX1 JASPAR yes 55941508
chr17 73293940 73293950 HOXA13 JASPAR yes 21295690
chr17 73293940 73293950 HOXB13 JASPAR yes 21295691
chr17 73293940 73293950 HOXD13 JASPAR yes 21295692
chr17 73293940 73293950 HOXA13 JASPAR yes 55941509
chr17 73293940 73293950 HOXB13 JASPAR yes 55941510
chr17 73293940 73293950 HOXD13 JASPAR yes 55941511
SNP sites on vista25966[chr17:73293570-73293940]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 73293692 rs55703044 A T
FOXP1 IRF1 IRF7 MEF2C SPI1 TBP
5055319
chr17 73293700 rs532961405 AAAAG A
FOXP1 IRF1 MEF2C PRDM1 SPI1 SPIC STAT1 STAT2 ZNF263
5055320
chr17 73293760 rs8078411 C G
SPIC YY1
5055321
chr17 73293826 rs115258996 G C no 5055322
chr17 73293851 rs115808959 C T no 5055323
Genes possibly regulated by vista25966[chr17:73293570-73293940]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 73201754 73231853 + NUP85 ENSG00000125450.6 73201754 0.71 1.0 16243 8184
chr17 73232694 73258444 - GGA3 ENSG00000125447.12 73258444 0.62 1.0 16244 64874
chr17 73257755 73262454 + MRPS7 ENSG00000125445.6 73257755 0.8 0.99 16245 64185
chr17 73262309 73267308 - MIF4GD ENSG00000125457.9 73267308 0.69 1.0 16246 73738
chr17 73269073 73285591 - SLC25A19 ENSG00000125454.7 73285591 0.92 1.0 16247 92021
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista25966[chr17:73293570-73293940]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results