EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista26174[chr17:76248336-76248772]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista26174[chr17:76248336-76248772]
Back to top
Tissue distribution of vista26174
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista26174[chr17:76248336-76248772]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 76248368 76248764 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108301350
chr17 76248519 76248700 SPI1 UCSC Txn Factor no Conserved 108301370
chr17 76248325 76248346 REST JASPAR yes 21306096
chr17 76248325 76248346 REST JASPAR yes 56136705
chr17 76248338 76248353 PRDM1 JASPAR yes 21306097
chr17 76248338 76248353 PRDM1 JASPAR yes 56136707
chr17 76248368 76248373 SP1 TRANSFAC yes 21306098
chr17 76248368 76248373 SP1 TRANSFAC yes 56136708
chr17 76248380 76248389 ZEB1 JASPAR yes 21306099
chr17 76248380 76248389 ZEB1 JASPAR yes 56136709
chr17 76248381 76248394 NFKB1 JASPAR yes 21306100
chr17 76248381 76248394 NFKB1 JASPAR yes 56136710
chr17 76248391 76248406 TFAP2A JASPAR yes 21306101
chr17 76248391 76248406 TFAP2C JASPAR yes 21306102
chr17 76248391 76248406 TFAP2A JASPAR yes 56136711
chr17 76248391 76248406 TFAP2C JASPAR yes 56136712
chr17 76248393 76248408 TFAP2A JASPAR yes 21306103
chr17 76248393 76248408 TFAP2A JASPAR yes 56136713
chr17 76248394 76248405 TFAP2A JASPAR yes 21306104
chr17 76248394 76248405 TFAP2B JASPAR yes 21306105
chr17 76248394 76248405 TFAP2C JASPAR yes 21306106
chr17 76248394 76248405 TFAP2A JASPAR yes 56136714
chr17 76248394 76248405 TFAP2B JASPAR yes 56136715
chr17 76248394 76248405 TFAP2C JASPAR yes 56136716
chr17 76248395 76248404 TFAP2A JASPAR yes 21306107
chr17 76248395 76248404 TFAP2A JASPAR yes 56136717
chr17 76248410 76248422 NHLH1 JASPAR yes 21306108
chr17 76248410 76248422 NHLH1 JASPAR yes 56136718
chr17 76248411 76248421 NHLH1 JASPAR yes 21306109
chr17 76248411 76248421 NHLH1 JASPAR yes 56136719
chr17 76248436 76248442 ZNF354C JASPAR yes 21306110
chr17 76248436 76248442 ZNF354C JASPAR yes 56136720
chr17 76248455 76248471 RFX5 JASPAR yes 21306111
chr17 76248455 76248471 RFX5 JASPAR yes 56136721
chr17 76248456 76248475 RFX2 JASPAR yes 21306112
chr17 76248456 76248475 RFX2 JASPAR yes 56136722
chr17 76248458 76248473 RFX5 JASPAR yes 21306113
chr17 76248458 76248473 RFX5 JASPAR yes 56136723
chr17 76248464 76248476 ZBTB7A JASPAR yes 21306114
chr17 76248464 76248476 ZBTB7A JASPAR yes 56136724
chr17 76248465 76248480 RUNX2 JASPAR yes 21306115
chr17 76248465 76248480 RUNX2 JASPAR yes 56136725
chr17 76248466 76248476 RUNX3 JASPAR yes 21306116
chr17 76248466 76248476 RUNX3 JASPAR yes 56136726
chr17 76248466 76248486 RREB1 JASPAR yes 21306117
chr17 76248466 76248486 RREB1 JASPAR yes 56136727
chr17 76248481 76248495 PLAG1 JASPAR yes 21306118
chr17 76248481 76248495 PLAG1 JASPAR yes 56136728
chr17 76248498 76248512 RXRB JASPAR yes 21306119
chr17 76248498 76248512 RXRG JASPAR yes 21306120
chr17 76248498 76248512 RXRB JASPAR yes 56136729
chr17 76248498 76248512 RXRG JASPAR yes 56136730
chr17 76248498 76248513 NR2C2 JASPAR yes 21306121
chr17 76248498 76248513 NR2C2 JASPAR yes 56136731
chr17 76248528 76248543 NR2C2 JASPAR yes 21306122
chr17 76248528 76248543 NR2C2 JASPAR yes 56136732
chr17 76248536 76248546 SP1 JASPAR yes 21306123
chr17 76248536 76248546 SP1 JASPAR yes 56136733
chr17 76248541 76248551 ZNF740 JASPAR yes 21306124
chr17 76248541 76248551 ZNF740 JASPAR yes 56136734
chr17 76248555 76248570 RUNX2 JASPAR yes 21306125
chr17 76248555 76248570 RUNX2 JASPAR yes 56136735
chr17 76248558 76248569 RUNX1 JASPAR yes 21306126
chr17 76248558 76248569 RUNX1 JASPAR yes 56136736
chr17 76248559 76248569 RUNX3 JASPAR yes 21306127
chr17 76248559 76248569 RUNX3 JASPAR yes 56136737
chr17 76248560 76248569 RUNX2 JASPAR yes 21306128
chr17 76248560 76248569 RUNX2 JASPAR yes 56136738
chr17 76248573 76248577 NFE TRANSFAC yes 21306129
chr17 76248573 76248577 NFE TRANSFAC yes 56136739
chr17 76248585 76248598 EOMES JASPAR yes 21306130
chr17 76248585 76248598 EOMES JASPAR yes 56136740
chr17 76248587 76248597 TBR1 JASPAR yes 21306131
chr17 76248587 76248597 TBR1 JASPAR yes 56136741
chr17 76248587 76248598 TBX2 JASPAR yes 21306132
chr17 76248587 76248598 TBX2 JASPAR yes 56136742
chr17 76248588 76248598 TBX21 JASPAR yes 21306133
chr17 76248588 76248598 TBX21 JASPAR yes 56136743
chr17 76248589 76248597 MGA JASPAR yes 21306134
chr17 76248589 76248597 TBX15 JASPAR yes 21306135
chr17 76248589 76248597 TBX1 JASPAR yes 21306136
chr17 76248589 76248597 TBX4 JASPAR yes 21306137
chr17 76248589 76248597 TBX5 JASPAR yes 21306138
chr17 76248589 76248597 MGA JASPAR yes 56136744
chr17 76248589 76248597 TBX15 JASPAR yes 56136745
chr17 76248589 76248597 TBX1 JASPAR yes 56136746
chr17 76248589 76248597 TBX4 JASPAR yes 56136747
chr17 76248589 76248597 TBX5 JASPAR yes 56136748
chr17 76248589 76248598 ZEB1 JASPAR yes 21306139
chr17 76248589 76248598 ZEB1 JASPAR yes 56136749
chr17 76248589 76248601 PKNOX1 JASPAR yes 21306140
chr17 76248589 76248601 PKNOX2 JASPAR yes 21306141
chr17 76248589 76248601 TGIF1 JASPAR yes 21306142
chr17 76248589 76248601 TGIF2 JASPAR yes 21306143
chr17 76248589 76248601 PKNOX1 JASPAR yes 56136750
chr17 76248589 76248601 PKNOX2 JASPAR yes 56136751
chr17 76248589 76248601 TGIF1 JASPAR yes 56136752
chr17 76248589 76248601 TGIF2 JASPAR yes 56136753
chr17 76248590 76248600 FIGLA JASPAR yes 21306144
chr17 76248590 76248600 ID4 JASPAR yes 21306145
chr17 76248590 76248600 TCF3 JASPAR yes 21306146
chr17 76248590 76248600 TCF4 JASPAR yes 21306147
chr17 76248590 76248600 FIGLA JASPAR yes 56136754
chr17 76248590 76248600 ID4 JASPAR yes 56136755
chr17 76248590 76248600 TCF3 JASPAR yes 56136756
chr17 76248590 76248600 TCF4 JASPAR yes 56136757
chr17 76248591 76248600 SNAI2 JASPAR yes 21306148
chr17 76248591 76248600 SNAI2 JASPAR yes 56136758
chr17 76248592 76248597 USF2 TRANSFAC yes 21306149
chr17 76248592 76248597 USF2 TRANSFAC yes 56136759
chr17 76248592 76248613 IRF1 JASPAR yes 21306150
chr17 76248592 76248613 IRF1 JASPAR yes 56136760
chr17 76248595 76248599 NFE TRANSFAC yes 21306151
chr17 76248595 76248599 NFE TRANSFAC yes 56136761
chr17 76248595 76248609 JUN JASPAR yes 21306152
chr17 76248595 76248609 JUN JASPAR yes 56136762
chr17 76248600 76248611 FLI1 JASPAR yes 21306153
chr17 76248600 76248611 FLI1 JASPAR yes 56136763
chr17 76248601 76248611 GABPA JASPAR yes 21306154
chr17 76248601 76248611 GABPA JASPAR yes 56136764
chr17 76248601 76248614 ELF1 JASPAR yes 21306155
chr17 76248601 76248614 ELF1 JASPAR yes 56136765
chr17 76248602 76248609 SPI1 JASPAR yes 21306156
chr17 76248602 76248609 SPI1 JASPAR yes 56136766
chr17 76248602 76248610 FEV JASPAR yes 21306157
chr17 76248602 76248610 FEV JASPAR yes 56136767
chr17 76248603 76248624 ZNF263 JASPAR yes 21306158
chr17 76248603 76248624 ZNF263 JASPAR yes 56136768
chr17 76248604 76248609 ETS2 TRANSFAC yes 21306159
chr17 76248604 76248609 ETS2 TRANSFAC yes 56136769
chr17 76248608 76248618 MZF1 JASPAR yes 21306160
chr17 76248608 76248618 MZF1 JASPAR yes 56136770
chr17 76248624 76248633 SNAI2 JASPAR yes 21306161
chr17 76248624 76248633 SNAI2 JASPAR yes 56136771
chr17 76248624 76248634 TCF3 JASPAR yes 21306162
chr17 76248624 76248634 TCF4 JASPAR yes 21306163
chr17 76248624 76248634 TCF3 JASPAR yes 56136772
chr17 76248624 76248634 TCF4 JASPAR yes 56136773
chr17 76248626 76248635 ZEB1 JASPAR yes 21306164
chr17 76248626 76248635 ZEB1 JASPAR yes 56136774
chr17 76248628 76248633 SP1 TRANSFAC yes 21306165
chr17 76248628 76248633 SP1 TRANSFAC yes 56136775
chr17 76248631 76248636 SP1 TRANSFAC yes 21306166
chr17 76248631 76248636 SP1 TRANSFAC yes 56136776
chr17 76248631 76248646 RUNX2 JASPAR yes 21306167
chr17 76248631 76248646 RUNX2 JASPAR yes 56136777
chr17 76248635 76248645 RUNX3 JASPAR yes 21306168
chr17 76248635 76248645 RUNX3 JASPAR yes 56136778
chr17 76248636 76248645 RUNX2 JASPAR yes 21306169
chr17 76248636 76248645 RUNX2 JASPAR yes 56136779
chr17 76248644 76248655 NRL JASPAR yes 21306170
chr17 76248644 76248655 NRL JASPAR yes 56136780
chr17 76248653 76248660 SPI1 JASPAR yes 21306171
chr17 76248653 76248660 SPI1 JASPAR yes 56136781
chr17 76248653 76248661 FEV JASPAR yes 21306172
chr17 76248653 76248661 FEV JASPAR yes 56136782
chr17 76248655 76248660 ETS2 TRANSFAC yes 21306173
chr17 76248655 76248660 ETS2 TRANSFAC yes 56136783
chr17 76248674 76248695 ZNF263 JASPAR yes 21306174
chr17 76248674 76248695 ZNF263 JASPAR yes 56136784
chr17 76248694 76248705 TBX20 JASPAR yes 21306175
chr17 76248694 76248705 TBX20 JASPAR yes 56136785
chr17 76248695 76248703 MGA JASPAR yes 21306176
chr17 76248695 76248703 TBX15 JASPAR yes 21306177
chr17 76248695 76248703 TBX1 JASPAR yes 21306178
chr17 76248695 76248703 TBX4 JASPAR yes 21306179
chr17 76248695 76248703 TBX5 JASPAR yes 21306180
chr17 76248695 76248703 MGA JASPAR yes 56136786
chr17 76248695 76248703 TBX15 JASPAR yes 56136787
chr17 76248695 76248703 TBX1 JASPAR yes 56136788
chr17 76248695 76248703 TBX4 JASPAR yes 56136789
chr17 76248695 76248703 TBX5 JASPAR yes 56136790
chr17 76248695 76248710 NR2C2 JASPAR yes 21306181
chr17 76248695 76248710 NR2C2 JASPAR yes 56136791
chr17 76248704 76248725 ZNF263 JASPAR yes 21306182
chr17 76248704 76248725 ZNF263 JASPAR yes 56136792
chr17 76248720 76248728 EHF JASPAR yes 21306183
chr17 76248720 76248728 EHF JASPAR yes 56136793
chr17 76248726 76248737 E2F4 JASPAR yes 21306184
chr17 76248726 76248737 E2F6 JASPAR yes 21306185
chr17 76248726 76248737 E2F4 JASPAR yes 56136794
chr17 76248726 76248737 E2F6 JASPAR yes 56136795
chr17 76248727 76248738 E2F1 JASPAR yes 21306186
chr17 76248727 76248738 E2F1 JASPAR yes 56136796
chr17 76248750 76248762 GLI2 JASPAR yes 21306187
chr17 76248750 76248762 GLI2 JASPAR yes 56136797
chr17 76248751 76248763 ZBTB7A JASPAR yes 21306188
chr17 76248751 76248763 ZBTB7A JASPAR yes 56136798
chr17 76248756 76248760 H4TF2 TRANSFAC yes 21306189
chr17 76248756 76248760 H4TF2 TRANSFAC yes 56136799
SNP sites on vista26174[chr17:76248336-76248772]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 76248375 rs566677967 TGAGCCCAGGTGAGGCCCCTAGCCCGAGGCTCC T
RUNX3
5084047
chr17 76248376 rs546406907 G A
RUNX3
5084048
chr17 76248403 rs143349830 G C,T
RUNX3 TFAP2A TFAP2B TFAP2C
5084049
chr17 76248408 rs542464005 G A
RUNX3 TFAP2A
5084050
chr17 76248540 rs147530365 C T
NR2C2 RUNX3 SP1 SPI1
5084051
chr17 76248666 rs72909022 C T
RUNX3 SPI1
5084052
chr17 76248677 rs12602740 A G
RUNX3 SPI1 ZNF263
5084053
chr17 76248683 rs371672958 G A,C,T
RUNX3 SPI1 ZNF263
5084054
chr17 76248689 rs535228050 C T
RUNX3 SPI1 ZNF263
5084055
chr17 76248721 rs112088073 G A
EHF RUNX3 ZNF263
5084056
chr17 76248733 rs553911544 C T
E2F1 E2F4 E2F6 RUNX3
5084057
Genes possibly regulated by vista26174[chr17:76248336-76248772]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 76164639 76169608 + SYNGR2 ENSG00000108639.3 76164639 0.86 1.0 16304 16303
chr17 76170160 76183314 - TK1 ENSG00000167900.7 76183314 0.92 1.0 16305 34978
chr17 76183398 76203782 + AFMID ENSG00000183077.11 76183398 0.86 0.99 16306 35062
chr17 76210267 76221717 + BIRC5 ENSG00000089685.10 76210267 0.96 0.99 16307 61931
chr17 76210462 76220740 - AC087645.1 ENSG00000268310.1 76220740 0.98 1.0 16308 72404
chr17 76227391 76237068 + TMEM235 ENSG00000204278.8 76227391 0.99 1.0 16309 79055
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista26174[chr17:76248336-76248772]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results