EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista29839[chr19:51796169-51796569]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista29839[chr19:51796169-51796569]
Back to top
Tissue distribution of vista29839
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista29839[chr19:51796169-51796569]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr19 51796171 51796181 SP1 JASPAR yes 70870727
chr19 51796171 51796181 SP1 JASPAR yes 113771915
chr19 51796178 51796184 MZF1 JASPAR yes 70870728
chr19 51796178 51796184 MZF1 JASPAR yes 113771916
chr19 51796209 51796226 PAX1 JASPAR yes 70870729
chr19 51796209 51796226 PAX9 JASPAR yes 70870730
chr19 51796209 51796226 PAX1 JASPAR yes 113771917
chr19 51796209 51796226 PAX9 JASPAR yes 113771918
chr19 51796210 51796215 MYC TRANSFAC yes 70870731
chr19 51796210 51796215 MYC TRANSFAC yes 113771919
chr19 51796220 51796235 HNF4A JASPAR yes 70870732
chr19 51796220 51796235 HNF4A JASPAR yes 113771920
chr19 51796221 51796235 NR2F1 JASPAR yes 70870733
chr19 51796221 51796235 NR2F1 JASPAR yes 113771921
chr19 51796221 51796236 HNF4G JASPAR yes 70870734
chr19 51796221 51796236 LEF1 JASPAR yes 70870735
chr19 51796221 51796236 NR2C2 JASPAR yes 70870736
chr19 51796221 51796236 HNF4G JASPAR yes 113771922
chr19 51796221 51796236 LEF1 JASPAR yes 113771923
chr19 51796221 51796236 NR2C2 JASPAR yes 113771924
chr19 51796222 51796236 TCF7L2 JASPAR yes 70870737
chr19 51796222 51796236 TCF7L2 JASPAR yes 113771925
chr19 51796238 51796244 MZF1 JASPAR yes 70870738
chr19 51796238 51796244 MZF1 JASPAR yes 113771926
chr19 51796242 51796260 RARA JASPAR yes 70870739
chr19 51796242 51796260 RARA JASPAR yes 113771927
chr19 51796253 51796268 NR2C2 JASPAR yes 70870740
chr19 51796253 51796268 NR2C2 JASPAR yes 113771928
chr19 51796271 51796275 YY1 TRANSFAC yes 70870741
chr19 51796271 51796275 YY1 TRANSFAC yes 113771929
chr19 51796292 51796302 MYF6 JASPAR yes 70870742
chr19 51796292 51796302 MYF6 JASPAR yes 113771930
chr19 51796298 51796306 FOXO3 JASPAR yes 70870743
chr19 51796298 51796306 FOXO3 JASPAR yes 113771931
chr19 51796304 51796317 ELF1 JASPAR yes 70870744
chr19 51796304 51796317 ELF1 JASPAR yes 113771932
chr19 51796306 51796317 ETV2 JASPAR yes 70870745
chr19 51796306 51796317 ETV2 JASPAR yes 113771933
chr19 51796307 51796317 ERF JASPAR yes 70870746
chr19 51796307 51796317 ERG JASPAR yes 70870747
chr19 51796307 51796317 ETS1 JASPAR yes 70870748
chr19 51796307 51796317 FEV JASPAR yes 70870749
chr19 51796307 51796317 FLI1 JASPAR yes 70870750
chr19 51796307 51796317 ERF JASPAR yes 113771934
chr19 51796307 51796317 ERG JASPAR yes 113771935
chr19 51796307 51796317 ETS1 JASPAR yes 113771936
chr19 51796307 51796317 FEV JASPAR yes 113771937
chr19 51796307 51796317 FLI1 JASPAR yes 113771938
chr19 51796307 51796318 ELK4 JASPAR yes 70870751
chr19 51796307 51796318 FLI1 JASPAR yes 70870752
chr19 51796307 51796318 ELK4 JASPAR yes 113771939
chr19 51796307 51796318 FLI1 JASPAR yes 113771940
chr19 51796308 51796316 FEV JASPAR yes 70870753
chr19 51796308 51796316 FEV JASPAR yes 113771941
chr19 51796350 51796359 SOX9 JASPAR yes 70870754
chr19 51796350 51796359 SOX9 JASPAR yes 113771942
chr19 51796350 51796366 SOX4 JASPAR yes 70870755
chr19 51796350 51796366 SOX4 JASPAR yes 113771943
chr19 51796368 51796372 YY1 TRANSFAC yes 70870756
chr19 51796368 51796372 YY1 TRANSFAC yes 113771944
chr19 51796372 51796377 TFAP2A TRANSFAC yes 70870757
chr19 51796372 51796377 TFAP2A TRANSFAC yes 113771945
chr19 51796372 51796378 MZF1 JASPAR yes 70870758
chr19 51796372 51796378 MZF1 JASPAR yes 113771946
chr19 51796375 51796381 PEA3 TRANSFAC yes 70870759
chr19 51796375 51796381 PEA3 TRANSFAC yes 113771947
chr19 51796376 51796391 SCRT1 JASPAR yes 70870760
chr19 51796376 51796391 SCRT1 JASPAR yes 113771948
chr19 51796412 51796427 ZIC3 JASPAR yes 70870761
chr19 51796412 51796427 ZIC4 JASPAR yes 70870762
chr19 51796412 51796427 ZIC3 JASPAR yes 113771949
chr19 51796412 51796427 ZIC4 JASPAR yes 113771950
chr19 51796456 51796475 CTCF JASPAR yes 70870763
chr19 51796456 51796475 CTCF JASPAR yes 113771951
chr19 51796457 51796472 ZIC3 JASPAR yes 70870764
chr19 51796457 51796472 ZIC4 JASPAR yes 70870765
chr19 51796457 51796472 ZIC3 JASPAR yes 113771952
chr19 51796457 51796472 ZIC4 JASPAR yes 113771953
chr19 51796458 51796472 ZIC1 JASPAR yes 70870766
chr19 51796458 51796472 ZIC1 JASPAR yes 113771954
chr19 51796461 51796470 SNAI2 JASPAR yes 70870767
chr19 51796461 51796470 SNAI2 JASPAR yes 113771955
chr19 51796467 51796481 NR2F1 JASPAR yes 70870768
chr19 51796467 51796481 NR2F1 JASPAR yes 113771956
chr19 51796474 51796484 NHLH1 JASPAR yes 70870769
chr19 51796474 51796484 NHLH1 JASPAR yes 113771957
chr19 51796484 51796505 ZNF263 JASPAR yes 70870770
chr19 51796484 51796505 ZNF263 JASPAR yes 113771958
chr19 51796489 51796504 PRDM1 JASPAR yes 70870771
chr19 51796489 51796504 STAT2 JASPAR yes 70870772
chr19 51796489 51796504 PRDM1 JASPAR yes 113771959
chr19 51796489 51796504 STAT2 JASPAR yes 113771960
chr19 51796493 51796498 ETS2 TRANSFAC yes 70870773
chr19 51796493 51796498 ETS2 TRANSFAC yes 113771961
chr19 51796505 51796516 NFIL3 JASPAR yes 70870774
chr19 51796505 51796516 NFIL3 JASPAR yes 113771962
chr19 51796506 51796518 DBP JASPAR yes 70870775
chr19 51796506 51796518 HLF JASPAR yes 70870776
chr19 51796506 51796518 TEF JASPAR yes 70870777
chr19 51796506 51796518 DBP JASPAR yes 113771963
chr19 51796506 51796518 HLF JASPAR yes 113771964
chr19 51796506 51796518 TEF JASPAR yes 113771965
chr19 51796508 51796519 NFIL3 JASPAR yes 70870778
chr19 51796508 51796519 NFIL3 JASPAR yes 113771966
chr19 51796511 51796515 TEAD2 TRANSFAC yes 70870779
chr19 51796511 51796515 TEAD2 TRANSFAC yes 113771967
chr19 51796512 51796520 RHOXF1 JASPAR yes 70870780
chr19 51796512 51796520 RHOXF1 JASPAR yes 113771968
chr19 51796543 51796555 PKNOX1 JASPAR yes 70870781
chr19 51796543 51796555 PKNOX2 JASPAR yes 70870782
chr19 51796543 51796555 TGIF1 JASPAR yes 70870783
chr19 51796543 51796555 TGIF2 JASPAR yes 70870784
chr19 51796543 51796555 PKNOX1 JASPAR yes 113771969
chr19 51796543 51796555 PKNOX2 JASPAR yes 113771970
chr19 51796543 51796555 TGIF1 JASPAR yes 113771971
chr19 51796543 51796555 TGIF2 JASPAR yes 113771972
chr19 51796543 51796556 ZBTB18 JASPAR yes 70870785
chr19 51796543 51796556 ZBTB18 JASPAR yes 113771973
chr19 51796544 51796554 MSC JASPAR yes 70870786
chr19 51796544 51796554 MYF6 JASPAR yes 70870787
chr19 51796544 51796554 NHLH1 JASPAR yes 70870788
chr19 51796544 51796554 TFAP4 JASPAR yes 70870789
chr19 51796544 51796554 MSC JASPAR yes 113771974
chr19 51796544 51796554 MYF6 JASPAR yes 113771975
chr19 51796544 51796554 NHLH1 JASPAR yes 113771976
chr19 51796544 51796554 TFAP4 JASPAR yes 113771977
chr19 51796549 51796553 NFE TRANSFAC yes 70870790
chr19 51796549 51796553 NFE TRANSFAC yes 113771978
SNP sites on vista29839[chr19:51796169-51796569]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
Genes possibly regulated by vista29839[chr19:51796169-51796569]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr19 51728320 51747115 + CD33 ENSG00000105383.10 51728320 0.93 0.99 17913 32151
chr19 51749603 51772584 + SIGLECL1 ENSG00000179213.9 51749603 0.99 0.0 17914 53434
chr19 51815102 51833608 + IGLON5 ENSG00000142549.9 51815102 0.86 0.99 17915 81467
chr19 51834790 51845378 - VSIG10L ENSG00000186806.5 51845378 0.97 1.0 17916 51191
chr19 51848423 51869672 - ETFB ENSG00000105379.5 51869672 0.92 0.98 17917 26897
chr19 51853627 51871353 - CTD-2616J11.11 ENSG00000269403.1 51871353 0.94 0.76 17918 25216
chr19 51870352 51872257 - CLDND2 ENSG00000160318.2 51872257 0.65 0.99 17919 24312
chr19 51874860 51875969 - NKG7 ENSG00000105374.5 51875969 0.93 1.0 17920 20600
chr19 51883163 51891214 - LIM2 ENSG00000105370.3 51891214 0.92 1.0 17921 5355
chr19 51891543 51893828 - CTD-2616J11.4 ENSG00000262874.1 51893828 0.94 1.0 17922 2741
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista29839[chr19:51796169-51796569]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results