EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista29905[chr19:52324157-52325118]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista29905[chr19:52324157-52325118]
Back to top
Tissue distribution of vista29905
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista29905[chr19:52324157-52325118]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr19 52324175 52324185 MYF6 JASPAR yes 70874640
chr19 52324175 52324185 MYF6 JASPAR yes 113790617
chr19 52324176 52324191 RFX5 JASPAR yes 70874641
chr19 52324176 52324191 RFX5 JASPAR yes 113790618
chr19 52324177 52324182 MYC TRANSFAC yes 70874642
chr19 52324177 52324182 MYC TRANSFAC yes 113790619
chr19 52324185 52324199 RXRB JASPAR yes 70874643
chr19 52324185 52324199 RXRG JASPAR yes 70874644
chr19 52324185 52324199 RXRB JASPAR yes 113790620
chr19 52324185 52324199 RXRG JASPAR yes 113790621
chr19 52324202 52324212 NFIA JASPAR yes 70874645
chr19 52324202 52324212 NFIA JASPAR yes 113790622
chr19 52324203 52324212 NFIX JASPAR yes 70874646
chr19 52324203 52324212 NFIX JASPAR yes 113790623
chr19 52324204 52324210 NFIC JASPAR yes 70874647
chr19 52324204 52324210 NFIC JASPAR yes 113790624
chr19 52324206 52324217 USF2 JASPAR yes 70874648
chr19 52324206 52324217 USF2 JASPAR yes 113790625
chr19 52324206 52324220 JUN JASPAR yes 70874649
chr19 52324206 52324220 JUN JASPAR yes 113790626
chr19 52324210 52324221 FOSL1 JASPAR yes 70874650
chr19 52324210 52324221 JUND JASPAR yes 70874651
chr19 52324210 52324221 FOSL1 JASPAR yes 113790627
chr19 52324210 52324221 JUND JASPAR yes 113790628
chr19 52324212 52324218 JUN TRANSFAC yes 70874652
chr19 52324212 52324218 JUN TRANSFAC yes 113790629
chr19 52324250 52324259 SOX9 JASPAR yes 70874653
chr19 52324250 52324259 SOX9 JASPAR yes 113790630
chr19 52324254 52324271 RARA JASPAR yes 70874654
chr19 52324254 52324271 RARA JASPAR yes 113790631
chr19 52324263 52324274 ESRRA JASPAR yes 70874655
chr19 52324263 52324274 ESRRB JASPAR yes 70874656
chr19 52324263 52324274 ESRRA JASPAR yes 113790632
chr19 52324263 52324274 ESRRB JASPAR yes 113790633
chr19 52324264 52324272 NR4A2 JASPAR yes 70874657
chr19 52324264 52324272 NR4A2 JASPAR yes 113790634
chr19 52324265 52324275 RORA JASPAR yes 70874658
chr19 52324265 52324275 RORA JASPAR yes 113790635
chr19 52324283 52324304 REST JASPAR yes 70874659
chr19 52324283 52324304 REST JASPAR yes 113790636
chr19 52324306 52324317 NFE2L2 JASPAR yes 70874660
chr19 52324306 52324317 NFE2L2 JASPAR yes 113790637
chr19 52324344 52324348 YY1 TRANSFAC yes 70874661
chr19 52324344 52324348 YY1 TRANSFAC yes 113790638
chr19 52324362 52324372 SMAD3 JASPAR yes 70874662
chr19 52324362 52324372 SMAD3 JASPAR yes 113790639
chr19 52324376 52324381 H4TF1 TRANSFAC yes 70874663
chr19 52324376 52324381 H4TF1 TRANSFAC yes 113790640
chr19 52324396 52324405 PITX3 JASPAR yes 70874664
chr19 52324396 52324405 PITX3 JASPAR yes 113790641
chr19 52324396 52324406 GSC2 JASPAR yes 70874665
chr19 52324396 52324406 GSC JASPAR yes 70874666
chr19 52324396 52324406 GSC2 JASPAR yes 113790642
chr19 52324396 52324406 GSC JASPAR yes 113790643
chr19 52324397 52324405 OTX1 JASPAR yes 70874667
chr19 52324397 52324405 OTX2 JASPAR yes 70874668
chr19 52324397 52324405 OTX1 JASPAR yes 113790644
chr19 52324397 52324405 OTX2 JASPAR yes 113790645
chr19 52324402 52324411 ZEB1 JASPAR yes 70874669
chr19 52324402 52324411 ZEB1 JASPAR yes 113790646
chr19 52324405 52324410 USF2 TRANSFAC yes 70874670
chr19 52324405 52324410 USF2 TRANSFAC yes 113790647
chr19 52324421 52324436 RUNX2 JASPAR yes 70874671
chr19 52324421 52324436 RUNX2 JASPAR yes 113790648
chr19 52324422 52324432 RUNX3 JASPAR yes 70874672
chr19 52324422 52324432 RUNX3 JASPAR yes 113790649
chr19 52324429 52324444 SOX21 JASPAR yes 70874673
chr19 52324429 52324444 SOX21 JASPAR yes 113790650
chr19 52324429 52324445 SOX4 JASPAR yes 70874674
chr19 52324429 52324445 SOX4 JASPAR yes 113790651
chr19 52324433 52324437 NFE TRANSFAC yes 70874675
chr19 52324433 52324437 NFE TRANSFAC yes 113790652
chr19 52324497 52324503 NFIC JASPAR yes 70874676
chr19 52324497 52324503 NFIC JASPAR yes 113790653
chr19 52324497 52324511 TLX1 JASPAR yes 70874677
chr19 52324497 52324511 TLX1 JASPAR yes 113790654
chr19 52324498 52324512 TLX1 JASPAR yes 70874678
chr19 52324498 52324512 TLX1 JASPAR yes 113790655
chr19 52324504 52324513 NFIX JASPAR yes 70874679
chr19 52324504 52324513 NFIX JASPAR yes 113790656
chr19 52324504 52324514 NFIA JASPAR yes 70874680
chr19 52324504 52324514 NFIA JASPAR yes 113790657
chr19 52324506 52324512 NFIC JASPAR yes 70874681
chr19 52324506 52324512 NFIC JASPAR yes 113790658
chr19 52324529 52324532 MYB TRANSFAC yes 70874682
chr19 52324529 52324532 MYB TRANSFAC yes 113790659
chr19 52324563 52324566 MYB TRANSFAC yes 70874683
chr19 52324563 52324566 MYB TRANSFAC yes 113790660
chr19 52324594 52324608 EBF1 JASPAR yes 70874684
chr19 52324594 52324608 EBF1 JASPAR yes 113790661
chr19 52324595 52324610 ZBTB33 JASPAR yes 70874685
chr19 52324595 52324610 ZBTB33 JASPAR yes 113790662
chr19 52324603 52324617 NR2F1 JASPAR yes 70874686
chr19 52324603 52324617 NR2F1 JASPAR yes 113790663
chr19 52324625 52324640 STAT2 JASPAR yes 70874687
chr19 52324625 52324640 STAT2 JASPAR yes 113790664
chr19 52324632 52324637 MYC TRANSFAC yes 70874688
chr19 52324632 52324637 MYC TRANSFAC yes 113790665
chr19 52324646 52324656 MZF1 JASPAR yes 70874689
chr19 52324646 52324656 MZF1 JASPAR yes 113790666
chr19 52324671 52324677 ZNF354C JASPAR yes 70874690
chr19 52324671 52324677 ZNF354C JASPAR yes 113790667
chr19 52324673 52324678 GATA2 JASPAR yes 70874691
chr19 52324673 52324678 GATA2 JASPAR yes 113790668
chr19 52324699 52324704 GATA2 JASPAR yes 70874692
chr19 52324699 52324704 GATA2 JASPAR yes 113790669
chr19 52324723 52324743 RREB1 JASPAR yes 70874693
chr19 52324723 52324743 RREB1 JASPAR yes 113790670
chr19 52324730 52324736 SOX10 JASPAR yes 70874694
chr19 52324730 52324736 SOX10 JASPAR yes 113790671
chr19 52324737 52324748 NFE2L2 JASPAR yes 70874695
chr19 52324737 52324748 NFE2L2 JASPAR yes 113790672
chr19 52324740 52324750 SP1 JASPAR yes 70874696
chr19 52324740 52324750 SP1 JASPAR yes 113790673
chr19 52324748 52324752 H1TF2 TRANSFAC yes 70874697
chr19 52324748 52324752 NFE TRANSFAC yes 70874698
chr19 52324748 52324752 SRF TRANSFAC yes 70874699
chr19 52324748 52324752 H1TF2 TRANSFAC yes 113790674
chr19 52324748 52324752 NFE TRANSFAC yes 113790675
chr19 52324748 52324752 SRF TRANSFAC yes 113790676
chr19 52324760 52324769 NFIX JASPAR yes 70874700
chr19 52324760 52324769 NFIX JASPAR yes 113790677
chr19 52324760 52324770 NFIA JASPAR yes 70874701
chr19 52324760 52324770 NFIA JASPAR yes 113790678
chr19 52324762 52324768 NFIC JASPAR yes 70874702
chr19 52324762 52324768 NFIC JASPAR yes 113790679
chr19 52324780 52324794 RORA JASPAR yes 70874703
chr19 52324780 52324794 RORA JASPAR yes 113790680
chr19 52324786 52324802 SOX8 JASPAR yes 70874704
chr19 52324786 52324802 SOX8 JASPAR yes 113790681
chr19 52324788 52324792 YY1 TRANSFAC yes 70874705
chr19 52324788 52324792 YY1 TRANSFAC yes 113790682
chr19 52324790 52324799 SRY JASPAR yes 70874706
chr19 52324790 52324799 SRY JASPAR yes 113790683
chr19 52324804 52324810 TCF4 TRANSFAC yes 70874707
chr19 52324804 52324810 TCF4 TRANSFAC yes 113790684
chr19 52324812 52324827 PRDM1 JASPAR yes 70874708
chr19 52324812 52324827 PRDM1 JASPAR yes 113790685
chr19 52324833 52324841 MEIS2 JASPAR yes 70874709
chr19 52324833 52324841 MEIS3 JASPAR yes 70874710
chr19 52324833 52324841 MEIS2 JASPAR yes 113790686
chr19 52324833 52324841 MEIS3 JASPAR yes 113790687
chr19 52324836 52324847 FLI1 JASPAR yes 70874711
chr19 52324836 52324847 FLI1 JASPAR yes 113790688
chr19 52324839 52324860 ZNF263 JASPAR yes 70874712
chr19 52324839 52324860 ZNF263 JASPAR yes 113790689
chr19 52324840 52324861 ZNF263 JASPAR yes 70874713
chr19 52324840 52324861 ZNF263 JASPAR yes 113790690
chr19 52324842 52324863 ZNF263 JASPAR yes 70874714
chr19 52324842 52324863 ZNF263 JASPAR yes 113790691
chr19 52324844 52324865 ZNF263 JASPAR yes 70874715
chr19 52324844 52324865 ZNF263 JASPAR yes 113790692
chr19 52324845 52324858 ELF1 JASPAR yes 70874716
chr19 52324845 52324858 ELF1 JASPAR yes 113790693
chr19 52324845 52324866 ZNF263 JASPAR yes 70874717
chr19 52324845 52324866 ZNF263 JASPAR yes 113790694
chr19 52324848 52324869 IRF1 JASPAR yes 70874718
chr19 52324848 52324869 ZNF263 JASPAR yes 70874719
chr19 52324848 52324869 IRF1 JASPAR yes 113790695
chr19 52324848 52324869 ZNF263 JASPAR yes 113790696
chr19 52324849 52324854 ETS2 TRANSFAC yes 70874720
chr19 52324849 52324854 ETS2 TRANSFAC yes 113790697
chr19 52324849 52324870 ZNF263 JASPAR yes 70874721
chr19 52324849 52324870 ZNF263 JASPAR yes 113790698
chr19 52324851 52324872 ZNF263 JASPAR yes 70874722
chr19 52324851 52324872 ZNF263 JASPAR yes 113790699
chr19 52324852 52324867 PRDM1 JASPAR yes 70874723
chr19 52324852 52324867 PRDM1 JASPAR yes 113790700
chr19 52324853 52324874 ZNF263 JASPAR yes 70874724
chr19 52324853 52324874 ZNF263 JASPAR yes 113790701
chr19 52324854 52324875 IRF1 JASPAR yes 70874725
chr19 52324854 52324875 IRF1 JASPAR yes 113790702
chr19 52324856 52324877 ZNF263 JASPAR yes 70874726
chr19 52324856 52324877 ZNF263 JASPAR yes 113790703
chr19 52324857 52324878 ZNF263 JASPAR yes 70874727
chr19 52324857 52324878 ZNF263 JASPAR yes 113790704
chr19 52324858 52324872 SPIC JASPAR yes 70874728
chr19 52324858 52324872 SPIC JASPAR yes 113790705
chr19 52324858 52324873 PRDM1 JASPAR yes 70874729
chr19 52324858 52324873 PRDM1 JASPAR yes 113790706
chr19 52324869 52324875 PEA3 TRANSFAC yes 70874730
chr19 52324869 52324875 PEA3 TRANSFAC yes 113790707
chr19 52324897 52324907 MAX JASPAR yes 70874731
chr19 52324897 52324907 MAX JASPAR yes 113790708
chr19 52324897 52324908 USF2 JASPAR yes 70874732
chr19 52324897 52324908 USF2 JASPAR yes 113790709
chr19 52324903 52324918 HSF1 JASPAR yes 70874733
chr19 52324903 52324918 HSF1 JASPAR yes 113790710
chr19 52324904 52324917 HSF4 JASPAR yes 70874734
chr19 52324904 52324917 HSF4 JASPAR yes 113790711
chr19 52324917 52324922 TFAP2A TRANSFAC yes 70874735
chr19 52324917 52324922 TFAP2A TRANSFAC yes 113790712
chr19 52324917 52324923 MZF1 JASPAR yes 70874736
chr19 52324917 52324923 MZF1 JASPAR yes 113790713
chr19 52324918 52324929 NFKB1 JASPAR yes 70874737
chr19 52324918 52324929 NFKB1 JASPAR yes 113790714
chr19 52324924 52324940 POU4F2 JASPAR yes 70874738
chr19 52324924 52324940 POU4F2 JASPAR yes 113790715
chr19 52324940 52324944 YY1 TRANSFAC yes 70874739
chr19 52324940 52324944 YY1 TRANSFAC yes 113790716
chr19 52325031 52325046 STAT2 JASPAR yes 70874740
chr19 52325031 52325046 STAT2 JASPAR yes 113790717
chr19 52325048 52325063 TFAP2A JASPAR yes 70874741
chr19 52325048 52325063 TFAP2C JASPAR yes 70874742
chr19 52325048 52325063 TFAP2A JASPAR yes 113790718
chr19 52325048 52325063 TFAP2C JASPAR yes 113790719
chr19 52325054 52325065 ESRRB JASPAR yes 70874743
chr19 52325054 52325065 ESRRB JASPAR yes 113790720
chr19 52325090 52325102 YY1 JASPAR yes 70874744
chr19 52325090 52325102 YY1 JASPAR yes 113790721
chr19 52325093 52325099 YY1 JASPAR yes 70874745
chr19 52325093 52325099 YY1 JASPAR yes 113790722
chr19 52325098 52325107 THAP1 JASPAR yes 70874746
chr19 52325098 52325107 THAP1 JASPAR yes 113790723
chr19 52325103 52325118 SOX21 JASPAR yes 70874747
chr19 52325103 52325118 SOX21 JASPAR yes 113790724
SNP sites on vista29905[chr19:52324157-52325118]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
Genes possibly regulated by vista29905[chr19:52324157-52325118]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr19 52216365 52227247 - HAS1 ENSG00000105509.6 52227247 0.99 0.99 17933 3090
chr19 52248425 52307363 - FPR1 ENSG00000171051.4 52307363 0.97 0.99 17934 83206
chr19 52255279 52273779 + FPR2 ENSG00000171049.8 52255279 0.96 1.0 17935 31122
chr19 52298416 52329442 + FPR3 ENSG00000187474.4 52298416 0.88 0.95 17936 74259
chr19 52359055 52394203 - ZNF577 ENSG00000161551.8 52394203 0.81 1.0 17937 30915
chr19 52392477 52408293 - ZNF649 ENSG00000198093.6 52408293 0.78 0.99 17938 16825
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista29905[chr19:52324157-52325118]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results