EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista29935[chr19:54098247-54098689]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista29935[chr19:54098247-54098689]
Back to top
Tissue distribution of vista29935
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista29935[chr19:54098247-54098689]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr19 54098240 54098377 MXI1 UCSC Txn Factor no Conserved 108427290
chr19 54098247 54098250 MYB TRANSFAC yes 70876269
chr19 54098247 54098250 MYB TRANSFAC yes 113825992
chr19 54098249 54098265 GLIS1 JASPAR yes 70876270
chr19 54098249 54098265 GLIS1 JASPAR yes 113825993
chr19 54098258 54098276 ESR1 JASPAR yes 70876271
chr19 54098258 54098276 ESR1 JASPAR yes 113825994
chr19 54098260 54098264 H4TF2 TRANSFAC yes 70876272
chr19 54098260 54098264 H4TF2 TRANSFAC yes 113825995
chr19 54098293 54098297 LFA1 TRANSFAC yes 70876273
chr19 54098293 54098297 LFA1 TRANSFAC yes 113825996
chr19 54098316 54098323 MEIS1 JASPAR yes 70876274
chr19 54098316 54098323 MEIS1 JASPAR yes 113825997
chr19 54098316 54098324 MEIS2 JASPAR yes 70876275
chr19 54098316 54098324 MEIS2 JASPAR yes 113825998
chr19 54098333 54098337 ESR1 TRANSFAC yes 70876276
chr19 54098333 54098337 ESR1 TRANSFAC yes 113825999
chr19 54098337 54098351 CREB3L1 JASPAR yes 70876277
chr19 54098337 54098351 CREB3L1 JASPAR yes 113826000
chr19 54098338 54098348 MAX JASPAR yes 70876278
chr19 54098338 54098348 MAX JASPAR yes 113826001
chr19 54098338 54098349 USF1 JASPAR yes 70876279
chr19 54098338 54098349 USF1 JASPAR yes 113826002
chr19 54098339 54098349 HEY1 JASPAR yes 70876280
chr19 54098339 54098349 HEY2 JASPAR yes 70876281
chr19 54098339 54098349 MAX JASPAR yes 70876282
chr19 54098339 54098349 MNT JASPAR yes 70876283
chr19 54098339 54098349 HEY1 JASPAR yes 113826003
chr19 54098339 54098349 HEY2 JASPAR yes 113826004
chr19 54098339 54098349 MAX JASPAR yes 113826005
chr19 54098339 54098349 MNT JASPAR yes 113826006
chr19 54098340 54098347 USF1 JASPAR yes 70876284
chr19 54098340 54098347 USF1 JASPAR yes 113826007
chr19 54098341 54098346 MYC TRANSFAC yes 70876285
chr19 54098341 54098346 USF1 TRANSFAC yes 70876286
chr19 54098341 54098346 USF2 TRANSFAC yes 70876287
chr19 54098341 54098346 MYC TRANSFAC yes 113826008
chr19 54098341 54098346 USF1 TRANSFAC yes 113826009
chr19 54098341 54098346 USF2 TRANSFAC yes 113826010
chr19 54098341 54098348 USF1 JASPAR yes 70876288
chr19 54098341 54098348 USF1 JASPAR yes 113826011
chr19 54098359 54098371 IRF1 JASPAR yes 70876289
chr19 54098359 54098371 IRF1 JASPAR yes 113826012
chr19 54098394 54098400 TCF1 TRANSFAC yes 70876290
chr19 54098394 54098400 TCF1 TRANSFAC yes 113826013
chr19 54098406 54098419 ELF3 JASPAR yes 70876291
chr19 54098406 54098419 ELF3 JASPAR yes 113826014
chr19 54098407 54098418 ELF5 JASPAR yes 70876292
chr19 54098407 54098418 ELF5 JASPAR yes 113826015
chr19 54098408 54098414 PEA3 TRANSFAC yes 70876293
chr19 54098408 54098414 PEA3 TRANSFAC yes 113826016
chr19 54098408 54098418 ETV6 JASPAR yes 70876294
chr19 54098408 54098418 ETV6 JASPAR yes 113826017
chr19 54098408 54098419 FLI1 JASPAR yes 70876295
chr19 54098408 54098419 FLI1 JASPAR yes 113826018
chr19 54098409 54098417 EHF JASPAR yes 70876296
chr19 54098409 54098417 EHF JASPAR yes 113826019
chr19 54098410 54098417 SPI1 JASPAR yes 70876297
chr19 54098410 54098417 SPI1 JASPAR yes 113826020
chr19 54098416 54098430 TCF7L2 JASPAR yes 70876298
chr19 54098416 54098430 TCF7L2 JASPAR yes 113826021
chr19 54098416 54098431 LEF1 JASPAR yes 70876299
chr19 54098416 54098431 LEF1 JASPAR yes 113826022
chr19 54098433 54098445 INSM1 JASPAR yes 70876300
chr19 54098433 54098445 INSM1 JASPAR yes 113826023
chr19 54098433 54098453 RREB1 JASPAR yes 70876301
chr19 54098433 54098453 RREB1 JASPAR yes 113826024
chr19 54098434 54098454 RREB1 JASPAR yes 70876302
chr19 54098434 54098454 RREB1 JASPAR yes 113826025
chr19 54098441 54098451 ZNF740 JASPAR yes 70876303
chr19 54098441 54098451 ZNF740 JASPAR yes 113826026
chr19 54098442 54098452 ZNF740 JASPAR yes 70876304
chr19 54098442 54098452 ZNF740 JASPAR yes 113826027
chr19 54098443 54098453 SP1 JASPAR yes 70876305
chr19 54098443 54098453 ZNF740 JASPAR yes 70876306
chr19 54098443 54098453 SP1 JASPAR yes 113826028
chr19 54098443 54098453 ZNF740 JASPAR yes 113826029
chr19 54098444 54098454 SP1 JASPAR yes 70876307
chr19 54098444 54098454 ZNF740 JASPAR yes 70876308
chr19 54098444 54098454 SP1 JASPAR yes 113826030
chr19 54098444 54098454 ZNF740 JASPAR yes 113826031
chr19 54098445 54098455 SP1 JASPAR yes 70876309
chr19 54098445 54098455 ZNF740 JASPAR yes 70876310
chr19 54098445 54098455 SP1 JASPAR yes 113826032
chr19 54098445 54098455 ZNF740 JASPAR yes 113826033
chr19 54098447 54098458 NFKB1 JASPAR yes 70876311
chr19 54098447 54098458 NFKB1 JASPAR yes 113826034
chr19 54098447 54098460 NFKB1 JASPAR yes 70876312
chr19 54098447 54098460 NFKB2 JASPAR yes 70876313
chr19 54098447 54098460 NFKB1 JASPAR yes 113826035
chr19 54098447 54098460 NFKB2 JASPAR yes 113826036
chr19 54098448 54098459 NFKB1 JASPAR yes 70876314
chr19 54098448 54098459 NFKB1 JASPAR yes 113826037
chr19 54098449 54098460 NFKB1 JASPAR yes 70876315
chr19 54098449 54098460 NFKB1 JASPAR yes 113826038
chr19 54098452 54098456 H4TF2 TRANSFAC yes 70876316
chr19 54098452 54098456 H4TF2 TRANSFAC yes 113826039
chr19 54098454 54098460 MZF1 JASPAR yes 70876317
chr19 54098454 54098460 MZF1 JASPAR yes 113826040
chr19 54098461 54098474 ZBTB18 JASPAR yes 70876318
chr19 54098461 54098474 ZBTB18 JASPAR yes 113826041
chr19 54098469 54098486 BCL6B JASPAR yes 70876319
chr19 54098469 54098486 BCL6B JASPAR yes 113826042
chr19 54098472 54098490 NFYA JASPAR yes 70876320
chr19 54098472 54098490 NFYA JASPAR yes 113826043
chr19 54098475 54098491 NFYA JASPAR yes 70876321
chr19 54098475 54098491 NFYA JASPAR yes 113826044
chr19 54098478 54098493 NFYB JASPAR yes 70876322
chr19 54098478 54098493 NFYB JASPAR yes 113826045
chr19 54098480 54098485 NFY TRANSFAC yes 70876323
chr19 54098480 54098485 NFY TRANSFAC yes 113826046
chr19 54098489 54098493 LFA1 TRANSFAC yes 70876324
chr19 54098489 54098493 LFA1 TRANSFAC yes 113826047
chr19 54098509 54098520 EBF1 JASPAR yes 70876325
chr19 54098509 54098520 EBF1 JASPAR yes 113826048
chr19 54098517 54098522 SP1 TRANSFAC yes 70876326
chr19 54098517 54098522 SP1 TRANSFAC yes 113826049
chr19 54098521 54098525 H1TF2 TRANSFAC yes 70876327
chr19 54098521 54098525 NFE TRANSFAC yes 70876328
chr19 54098521 54098525 SRF TRANSFAC yes 70876329
chr19 54098521 54098525 H1TF2 TRANSFAC yes 113826050
chr19 54098521 54098525 NFE TRANSFAC yes 113826051
chr19 54098521 54098525 SRF TRANSFAC yes 113826052
chr19 54098529 54098533 YY1 TRANSFAC yes 70876330
chr19 54098529 54098533 YY1 TRANSFAC yes 113826053
chr19 54098531 54098540 NKX2-8 JASPAR yes 70876331
chr19 54098531 54098540 NKX2-8 JASPAR yes 113826054
chr19 54098531 54098541 NKX2-3 JASPAR yes 70876332
chr19 54098531 54098541 NKX2-3 JASPAR yes 113826055
chr19 54098532 54098540 ISL2 JASPAR yes 70876333
chr19 54098532 54098540 ISL2 JASPAR yes 113826056
chr19 54098532 54098541 NKX3-2 JASPAR yes 70876334
chr19 54098532 54098541 NKX3-2 JASPAR yes 113826057
chr19 54098538 54098543 SP1 TRANSFAC yes 70876335
chr19 54098538 54098543 SP1 TRANSFAC yes 113826058
chr19 54098561 54098565 H4TF2 TRANSFAC yes 70876336
chr19 54098561 54098565 H4TF2 TRANSFAC yes 113826059
chr19 54098563 54098573 ID4 JASPAR yes 70876337
chr19 54098563 54098573 TCF3 JASPAR yes 70876338
chr19 54098563 54098573 TCF4 JASPAR yes 70876339
chr19 54098563 54098573 ID4 JASPAR yes 113826060
chr19 54098563 54098573 TCF3 JASPAR yes 113826061
chr19 54098563 54098573 TCF4 JASPAR yes 113826062
chr19 54098566 54098585 PAX5 JASPAR yes 70876340
chr19 54098566 54098585 PAX5 JASPAR yes 113826063
chr19 54098578 54098591 SMAD2 JASPAR yes 70876341
chr19 54098578 54098591 SMAD2 JASPAR yes 113826064
chr19 54098587 54098600 POU2F2 JASPAR yes 70876342
chr19 54098587 54098600 POU2F2 JASPAR yes 113826065
chr19 54098608 54098613 GATA1 TRANSFAC yes 70876343
chr19 54098608 54098613 GATA1 TRANSFAC yes 113826066
chr19 54098625 54098630 TFAP2A TRANSFAC yes 70876344
chr19 54098625 54098630 TFAP2A TRANSFAC yes 113826067
chr19 54098625 54098631 MZF1 JASPAR yes 70876345
chr19 54098625 54098631 MZF1 JASPAR yes 113826068
chr19 54098627 54098632 ETS2 TRANSFAC yes 70876346
chr19 54098627 54098632 ETS2 TRANSFAC yes 113826069
chr19 54098632 54098643 FOXP2 JASPAR yes 70876347
chr19 54098632 54098643 FOXP2 JASPAR yes 113826070
chr19 54098632 54098646 FOXF2 JASPAR yes 70876348
chr19 54098632 54098646 FOXF2 JASPAR yes 113826071
chr19 54098635 54098643 GATA3 JASPAR yes 70876349
chr19 54098635 54098643 GATA3 JASPAR yes 113826072
chr19 54098644 54098657 HSF2 JASPAR yes 70876350
chr19 54098644 54098657 HSF2 JASPAR yes 113826073
chr19 54098649 54098662 HSF2 JASPAR yes 70876351
chr19 54098649 54098662 HSF2 JASPAR yes 113826074
chr19 54098656 54098661 ATF1 TRANSFAC yes 70876352
chr19 54098656 54098661 ATF1 TRANSFAC yes 113826075
chr19 54098673 54098688 IRF9 JASPAR yes 70876353
chr19 54098673 54098688 IRF9 JASPAR yes 113826076
chr19 54098682 54098687 ETS2 TRANSFAC yes 70876354
chr19 54098682 54098687 ETS2 TRANSFAC yes 113826077
chr19 54098682 54098697 PRDM1 JASPAR yes 70876355
chr19 54098682 54098697 PRDM1 JASPAR yes 113826078
SNP sites on vista29935[chr19:54098247-54098689]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
Genes possibly regulated by vista29935[chr19:54098247-54098689]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr19 54024235 54083523 + ZNF331 ENSG00000130844.12 54024235 0.86 0.81 17979 25988
chr19 54102882 54106751 - CTB-167G5.5 ENSG00000268864.1 54106751 0.94 0.96 17980 91938
chr19 54135310 54140263 + DPRX ENSG00000204595.1 54135310 0.92 0.94 17981 63379
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista29935[chr19:54098247-54098689]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results