EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista35008[chr2:227781487-227781745]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista35008[chr2:227781487-227781745]
Back to top
Tissue distribution of vista35008
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista35008[chr2:227781487-227781745]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr2 227781472 227781493 IRF1 JASPAR yes 22221588
chr2 227781472 227781493 IRF1 JASPAR yes 81502370
chr2 227781476 227781491 PRDM1 JASPAR yes 22221589
chr2 227781476 227781491 PRDM1 JASPAR yes 81502371
chr2 227781478 227781499 IRF1 JASPAR yes 22221590
chr2 227781478 227781499 IRF1 JASPAR yes 81502372
chr2 227781485 227781490 ETS2 TRANSFAC yes 22221591
chr2 227781485 227781490 ETS2 TRANSFAC yes 81502373
chr2 227781485 227781493 FEV JASPAR yes 22221592
chr2 227781485 227781493 FEV JASPAR yes 81502374
chr2 227781495 227781515 PPARG JASPAR yes 22221593
chr2 227781495 227781515 PPARG JASPAR yes 81502375
chr2 227781520 227781526 TCF4 TRANSFAC yes 22221594
chr2 227781520 227781526 TCF4 TRANSFAC yes 81502376
chr2 227781553 227781561 HOXA5 JASPAR yes 22221595
chr2 227781553 227781561 HOXA5 JASPAR yes 81502377
chr2 227781554 227781564 MEOX1 JASPAR yes 22221596
chr2 227781554 227781564 MEOX2 JASPAR yes 22221597
chr2 227781554 227781564 MNX1 JASPAR yes 22221598
chr2 227781554 227781564 MEOX1 JASPAR yes 81502378
chr2 227781554 227781564 MEOX2 JASPAR yes 81502379
chr2 227781554 227781564 MNX1 JASPAR yes 81502380
chr2 227781559 227781573 SPI1 JASPAR yes 22221599
chr2 227781559 227781573 SPI1 JASPAR yes 81502381
chr2 227781560 227781573 ELF1 JASPAR yes 22221600
chr2 227781560 227781573 ELF1 JASPAR yes 81502382
chr2 227781561 227781573 EHF JASPAR yes 22221601
chr2 227781561 227781573 ELF1 JASPAR yes 22221602
chr2 227781561 227781573 ELF4 JASPAR yes 22221603
chr2 227781561 227781573 EHF JASPAR yes 81502383
chr2 227781561 227781573 ELF1 JASPAR yes 81502384
chr2 227781561 227781573 ELF4 JASPAR yes 81502385
chr2 227781561 227781574 ELF3 JASPAR yes 22221604
chr2 227781561 227781574 ELF3 JASPAR yes 81502386
chr2 227781562 227781573 ELF5 JASPAR yes 22221605
chr2 227781562 227781573 ETV2 JASPAR yes 22221606
chr2 227781562 227781573 ELF5 JASPAR yes 81502387
chr2 227781562 227781573 ETV2 JASPAR yes 81502388
chr2 227781563 227781573 ELK3 JASPAR yes 22221607
chr2 227781563 227781573 ERF JASPAR yes 22221608
chr2 227781563 227781573 ERG JASPAR yes 22221609
chr2 227781563 227781573 ETS1 JASPAR yes 22221610
chr2 227781563 227781573 ETV6 JASPAR yes 22221611
chr2 227781563 227781573 FEV JASPAR yes 22221612
chr2 227781563 227781573 FLI1 JASPAR yes 22221613
chr2 227781563 227781573 GABPA JASPAR yes 22221614
chr2 227781563 227781573 ELK3 JASPAR yes 81502389
chr2 227781563 227781573 ERF JASPAR yes 81502390
chr2 227781563 227781573 ERG JASPAR yes 81502391
chr2 227781563 227781573 ETS1 JASPAR yes 81502392
chr2 227781563 227781573 ETV6 JASPAR yes 81502393
chr2 227781563 227781573 FEV JASPAR yes 81502394
chr2 227781563 227781573 FLI1 JASPAR yes 81502395
chr2 227781563 227781573 GABPA JASPAR yes 81502396
chr2 227781563 227781574 ELK4 JASPAR yes 22221615
chr2 227781563 227781574 FLI1 JASPAR yes 22221616
chr2 227781563 227781574 ELK4 JASPAR yes 81502397
chr2 227781563 227781574 FLI1 JASPAR yes 81502398
chr2 227781564 227781572 EHF JASPAR yes 22221617
chr2 227781564 227781572 FEV JASPAR yes 22221618
chr2 227781564 227781572 EHF JASPAR yes 81502399
chr2 227781564 227781572 FEV JASPAR yes 81502400
chr2 227781565 227781572 SPI1 JASPAR yes 22221619
chr2 227781565 227781572 SPI1 JASPAR yes 81502401
chr2 227781584 227781593 SNAI2 JASPAR yes 22221620
chr2 227781584 227781593 SNAI2 JASPAR yes 81502402
chr2 227781584 227781594 FIGLA JASPAR yes 22221621
chr2 227781584 227781594 ID4 JASPAR yes 22221622
chr2 227781584 227781594 TCF3 JASPAR yes 22221623
chr2 227781584 227781594 TCF4 JASPAR yes 22221624
chr2 227781584 227781594 FIGLA JASPAR yes 81502403
chr2 227781584 227781594 ID4 JASPAR yes 81502404
chr2 227781584 227781594 TCF3 JASPAR yes 81502405
chr2 227781584 227781594 TCF4 JASPAR yes 81502406
chr2 227781595 227781616 IRF1 JASPAR yes 22221625
chr2 227781595 227781616 IRF1 JASPAR yes 81502407
chr2 227781597 227781612 IRF9 JASPAR yes 22221626
chr2 227781597 227781612 IRF9 JASPAR yes 81502408
chr2 227781598 227781612 IRF7 JASPAR yes 22221627
chr2 227781598 227781612 IRF8 JASPAR yes 22221628
chr2 227781598 227781612 IRF7 JASPAR yes 81502409
chr2 227781598 227781612 IRF8 JASPAR yes 81502410
chr2 227781599 227781613 SPIC JASPAR yes 22221629
chr2 227781599 227781613 SPIC JASPAR yes 81502411
chr2 227781599 227781614 PRDM1 JASPAR yes 22221630
chr2 227781599 227781614 STAT2 JASPAR yes 22221631
chr2 227781599 227781614 PRDM1 JASPAR yes 81502412
chr2 227781599 227781614 STAT2 JASPAR yes 81502413
chr2 227781599 227781617 IRF2 JASPAR yes 22221632
chr2 227781599 227781617 IRF2 JASPAR yes 81502414
chr2 227781607 227781618 FOXC1 JASPAR yes 22221633
chr2 227781607 227781618 FOXC1 JASPAR yes 81502415
chr2 227781607 227781619 FOXC2 JASPAR yes 22221634
chr2 227781607 227781619 FOXC2 JASPAR yes 81502416
chr2 227781607 227781625 NR3C1 JASPAR yes 22221635
chr2 227781607 227781625 NR3C1 JASPAR yes 81502417
chr2 227781628 227781636 HOXA5 JASPAR yes 22221636
chr2 227781628 227781636 HOXA5 JASPAR yes 81502418
chr2 227781666 227781680 TCF7L2 JASPAR yes 22221637
chr2 227781666 227781680 TCF7L2 JASPAR yes 81502419
chr2 227781670 227781676 TCF4 TRANSFAC yes 22221638
chr2 227781670 227781676 TCF4 TRANSFAC yes 81502420
chr2 227781674 227781693 CTCF JASPAR yes 22221639
chr2 227781674 227781693 CTCF JASPAR yes 81502421
chr2 227781685 227781691 YY1 JASPAR yes 22221640
chr2 227781685 227781691 YY1 JASPAR yes 81502422
chr2 227781698 227781714 E2F2 JASPAR yes 22221641
chr2 227781698 227781714 E2F2 JASPAR yes 81502423
chr2 227781705 227781720 SOX21 JASPAR yes 22221642
chr2 227781705 227781720 SOX21 JASPAR yes 81502424
chr2 227781732 227781738 SOX10 JASPAR yes 22221643
chr2 227781732 227781738 SOX10 JASPAR yes 81502425
chr2 227781735 227781740 ETS2 TRANSFAC yes 22221644
chr2 227781735 227781740 ETS2 TRANSFAC yes 81502426
chr2 227781735 227781743 EHF JASPAR yes 22221645
chr2 227781735 227781743 EHF JASPAR yes 81502427
SNP sites on vista35008[chr2:227781487-227781745]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr2 227781500 rs140373766 A G
PPARG
6413270
chr2 227781600 rs10177995 T C
IRF1 IRF2 IRF7 IRF8 IRF9 PRDM1 SPIC STAT2
6413271
chr2 227781742 rs11884016 G A
EHF
6413272
Genes possibly regulated by vista35008[chr2:227781487-227781745]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr2 227700297 227863931 + RHBDD1 ENSG00000144468.12 227700297 0.74 1.0 3203 18810
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista35008[chr2:227781487-227781745]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results