EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista35072[chr2:230195622-230196428]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista35072[chr2:230195622-230196428]
Back to top
Tissue distribution of vista35072
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista35072[chr2:230195622-230196428]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr2 230195637 230195647 ALX3 JASPAR yes 22224875
chr2 230195637 230195647 EMX1 JASPAR yes 22224876
chr2 230195637 230195647 EMX2 JASPAR yes 22224877
chr2 230195637 230195647 ESX1 JASPAR yes 22224878
chr2 230195637 230195647 GSX1 JASPAR yes 22224879
chr2 230195637 230195647 GSX2 JASPAR yes 22224880
chr2 230195637 230195647 HOXB2 JASPAR yes 22224881
chr2 230195637 230195647 HOXB3 JASPAR yes 22224882
chr2 230195637 230195647 LBX2 JASPAR yes 22224883
chr2 230195637 230195647 LHX2 JASPAR yes 22224884
chr2 230195637 230195647 LHX6 JASPAR yes 22224885
chr2 230195637 230195647 MEOX2 JASPAR yes 22224886
chr2 230195637 230195647 MIXL1 JASPAR yes 22224887
chr2 230195637 230195647 MNX1 JASPAR yes 22224888
chr2 230195637 230195647 NOTO JASPAR yes 22224889
chr2 230195637 230195647 POU6F1 JASPAR yes 22224890
chr2 230195637 230195647 RAX JASPAR yes 22224891
chr2 230195637 230195647 ALX3 JASPAR yes 81607703
chr2 230195637 230195647 EMX1 JASPAR yes 81607704
chr2 230195637 230195647 EMX2 JASPAR yes 81607705
chr2 230195637 230195647 ESX1 JASPAR yes 81607706
chr2 230195637 230195647 GSX1 JASPAR yes 81607707
chr2 230195637 230195647 GSX2 JASPAR yes 81607708
chr2 230195637 230195647 HOXB2 JASPAR yes 81607709
chr2 230195637 230195647 HOXB3 JASPAR yes 81607710
chr2 230195637 230195647 LBX2 JASPAR yes 81607711
chr2 230195637 230195647 LHX2 JASPAR yes 81607712
chr2 230195637 230195647 LHX6 JASPAR yes 81607713
chr2 230195637 230195647 MEOX2 JASPAR yes 81607714
chr2 230195637 230195647 MIXL1 JASPAR yes 81607715
chr2 230195637 230195647 MNX1 JASPAR yes 81607716
chr2 230195637 230195647 NOTO JASPAR yes 81607717
chr2 230195637 230195647 POU6F1 JASPAR yes 81607718
chr2 230195637 230195647 RAX JASPAR yes 81607719
chr2 230195638 230195646 BSX JASPAR yes 22224892
chr2 230195638 230195646 DLX6 JASPAR yes 22224893
chr2 230195638 230195646 EN1 JASPAR yes 22224894
chr2 230195638 230195646 ISX JASPAR yes 22224895
chr2 230195638 230195646 LBX1 JASPAR yes 22224896
chr2 230195638 230195646 LHX9 JASPAR yes 22224897
chr2 230195638 230195646 LMX1A JASPAR yes 22224898
chr2 230195638 230195646 LMX1B JASPAR yes 22224899
chr2 230195638 230195646 NKX6-1 JASPAR yes 22224900
chr2 230195638 230195646 NKX6-2 JASPAR yes 22224901
chr2 230195638 230195646 PAX4 JASPAR yes 22224902
chr2 230195638 230195646 PDX1 JASPAR yes 22224903
chr2 230195638 230195646 PRRX1 JASPAR yes 22224904
chr2 230195638 230195646 RAX2 JASPAR yes 22224905
chr2 230195638 230195646 SHOX JASPAR yes 22224906
chr2 230195638 230195646 UNCX JASPAR yes 22224907
chr2 230195638 230195646 VAX1 JASPAR yes 22224908
chr2 230195638 230195646 VAX2 JASPAR yes 22224909
chr2 230195638 230195646 VSX1 JASPAR yes 22224910
chr2 230195638 230195646 VSX2 JASPAR yes 22224911
chr2 230195638 230195646 BSX JASPAR yes 81607720
chr2 230195638 230195646 DLX6 JASPAR yes 81607721
chr2 230195638 230195646 EN1 JASPAR yes 81607722
chr2 230195638 230195646 ISX JASPAR yes 81607723
chr2 230195638 230195646 LBX1 JASPAR yes 81607724
chr2 230195638 230195646 LHX9 JASPAR yes 81607725
chr2 230195638 230195646 LMX1A JASPAR yes 81607726
chr2 230195638 230195646 LMX1B JASPAR yes 81607727
chr2 230195638 230195646 NKX6-1 JASPAR yes 81607728
chr2 230195638 230195646 NKX6-2 JASPAR yes 81607729
chr2 230195638 230195646 PAX4 JASPAR yes 81607730
chr2 230195638 230195646 PDX1 JASPAR yes 81607731
chr2 230195638 230195646 PRRX1 JASPAR yes 81607732
chr2 230195638 230195646 RAX2 JASPAR yes 81607733
chr2 230195638 230195646 SHOX JASPAR yes 81607734
chr2 230195638 230195646 UNCX JASPAR yes 81607735
chr2 230195638 230195646 VAX1 JASPAR yes 81607736
chr2 230195638 230195646 VAX2 JASPAR yes 81607737
chr2 230195638 230195646 VSX1 JASPAR yes 81607738
chr2 230195638 230195646 VSX2 JASPAR yes 81607739
chr2 230195652 230195657 GATA2 JASPAR yes 22224912
chr2 230195652 230195657 GATA2 JASPAR yes 81607740
chr2 230195656 230195677 REST JASPAR yes 22224913
chr2 230195656 230195677 REST JASPAR yes 81607741
chr2 230195657 230195676 REST JASPAR yes 22224914
chr2 230195657 230195676 REST JASPAR yes 81607742
chr2 230195674 230195684 NFIA JASPAR yes 22224915
chr2 230195674 230195684 NFIA JASPAR yes 81607743
chr2 230195675 230195684 NFIX JASPAR yes 22224916
chr2 230195675 230195684 NFIX JASPAR yes 81607744
chr2 230195676 230195682 NFIC JASPAR yes 22224917
chr2 230195676 230195682 NFIC JASPAR yes 81607745
chr2 230195684 230195694 RELA JASPAR yes 22224918
chr2 230195684 230195694 RELA JASPAR yes 81607746
chr2 230195714 230195717 MYB TRANSFAC yes 22224919
chr2 230195714 230195717 MYB TRANSFAC yes 81607747
chr2 230195714 230195728 NR2F1 JASPAR yes 22224920
chr2 230195714 230195728 NR2F1 JASPAR yes 81607748
chr2 230195714 230195729 HNF4G JASPAR yes 22224921
chr2 230195714 230195729 HNF4G JASPAR yes 81607749
chr2 230195743 230195759 ZNF143 JASPAR yes 22224922
chr2 230195743 230195759 ZNF143 JASPAR yes 81607750
chr2 230195763 230195772 THAP1 JASPAR yes 22224923
chr2 230195763 230195772 THAP1 JASPAR yes 81607751
chr2 230195765 230195777 SRF JASPAR yes 22224924
chr2 230195765 230195777 SRF JASPAR yes 81607752
chr2 230195770 230195774 YY1 TRANSFAC yes 22224925
chr2 230195770 230195774 YY1 TRANSFAC yes 81607753
chr2 230195774 230195777 MYB TRANSFAC yes 22224926
chr2 230195774 230195777 MYB TRANSFAC yes 81607754
chr2 230195777 230195781 NFE TRANSFAC yes 22224927
chr2 230195777 230195781 NFE TRANSFAC yes 81607755
chr2 230195782 230195803 REST JASPAR yes 22224928
chr2 230195782 230195803 REST JASPAR yes 81607756
chr2 230195791 230195805 NR2F1 JASPAR yes 22224929
chr2 230195791 230195805 RXRG JASPAR yes 22224930
chr2 230195791 230195805 NR2F1 JASPAR yes 81607757
chr2 230195791 230195805 RXRG JASPAR yes 81607758
chr2 230195793 230195797 ESR1 TRANSFAC yes 22224931
chr2 230195793 230195797 ESR1 TRANSFAC yes 81607759
chr2 230195803 230195807 YY1 TRANSFAC yes 22224932
chr2 230195803 230195807 YY1 TRANSFAC yes 81607760
chr2 230195811 230195830 CTCF JASPAR yes 22224933
chr2 230195811 230195830 CTCF JASPAR yes 81607761
chr2 230195813 230195834 ZNF263 JASPAR yes 22224934
chr2 230195813 230195834 ZNF263 JASPAR yes 81607762
chr2 230195814 230195824 MZF1 JASPAR yes 22224935
chr2 230195814 230195824 MZF1 JASPAR yes 81607763
chr2 230195814 230195835 ZNF263 JASPAR yes 22224936
chr2 230195814 230195835 ZNF263 JASPAR yes 81607764
chr2 230195817 230195823 SP1 TRANSFAC yes 22224937
chr2 230195817 230195823 SP1 TRANSFAC yes 81607765
chr2 230195825 230195838 ELF1 JASPAR yes 22224938
chr2 230195825 230195838 ELF1 JASPAR yes 81607766
chr2 230195825 230195839 SPI1 JASPAR yes 22224939
chr2 230195825 230195839 SPIC JASPAR yes 22224940
chr2 230195825 230195839 SPI1 JASPAR yes 81607767
chr2 230195825 230195839 SPIC JASPAR yes 81607768
chr2 230195833 230195837 YY1 TRANSFAC yes 22224941
chr2 230195833 230195837 YY1 TRANSFAC yes 81607769
chr2 230195834 230195849 FOXP1 JASPAR yes 22224942
chr2 230195834 230195849 FOXP1 JASPAR yes 81607770
chr2 230195841 230195845 YY1 TRANSFAC yes 22224943
chr2 230195841 230195845 YY1 TRANSFAC yes 81607771
chr2 230195854 230195866 TAL1 JASPAR yes 22224944
chr2 230195854 230195866 TAL1 JASPAR yes 81607772
chr2 230195860 230195875 RUNX2 JASPAR yes 22224945
chr2 230195860 230195875 RUNX2 JASPAR yes 81607773
chr2 230195861 230195865 H4TF2 TRANSFAC yes 22224946
chr2 230195861 230195865 H4TF2 TRANSFAC yes 81607774
chr2 230195863 230195874 RUNX1 JASPAR yes 22224947
chr2 230195863 230195874 RUNX1 JASPAR yes 81607775
chr2 230195864 230195874 RUNX3 JASPAR yes 22224948
chr2 230195864 230195874 RUNX3 JASPAR yes 81607776
chr2 230195865 230195874 RUNX2 JASPAR yes 22224949
chr2 230195865 230195874 RUNX2 JASPAR yes 81607777
chr2 230195865 230195886 IRF1 JASPAR yes 22224950
chr2 230195865 230195886 IRF1 JASPAR yes 81607778
chr2 230195867 230195882 PRDM1 JASPAR yes 22224951
chr2 230195867 230195882 STAT2 JASPAR yes 22224952
chr2 230195867 230195882 PRDM1 JASPAR yes 81607779
chr2 230195867 230195882 STAT2 JASPAR yes 81607780
chr2 230195868 230195882 STAT1 JASPAR yes 22224953
chr2 230195868 230195882 STAT1 JASPAR yes 81607781
chr2 230195869 230195881 IRF1 JASPAR yes 22224954
chr2 230195869 230195881 IRF1 JASPAR yes 81607782
chr2 230195869 230195884 IRF9 JASPAR yes 22224955
chr2 230195869 230195884 IRF9 JASPAR yes 81607783
chr2 230195871 230195892 IRF1 JASPAR yes 22224956
chr2 230195871 230195892 IRF1 JASPAR yes 81607784
chr2 230195874 230195884 ERF JASPAR yes 22224957
chr2 230195874 230195884 ERF JASPAR yes 81607785
chr2 230195874 230195888 SPIC JASPAR yes 22224958
chr2 230195874 230195888 SPIC JASPAR yes 81607786
chr2 230195875 230195882 SPI1 JASPAR yes 22224959
chr2 230195875 230195882 SPI1 JASPAR yes 81607787
chr2 230195878 230195890 FOXI1 JASPAR yes 22224960
chr2 230195878 230195890 FOXI1 JASPAR yes 81607788
chr2 230195881 230195885 YY1 TRANSFAC yes 22224961
chr2 230195881 230195885 YY1 TRANSFAC yes 81607789
chr2 230195903 230195913 TFE3 JASPAR yes 22224962
chr2 230195903 230195913 TFE3 JASPAR yes 81607790
chr2 230195914 230195928 CREB3 JASPAR yes 22224963
chr2 230195914 230195928 CREB3L1 JASPAR yes 22224964
chr2 230195914 230195928 CREB3 JASPAR yes 81607791
chr2 230195914 230195928 CREB3L1 JASPAR yes 81607792
chr2 230195971 230195992 MAFG JASPAR yes 22224965
chr2 230195971 230195992 MAFG JASPAR yes 81607793
chr2 230195986 230195996 EN2 JASPAR yes 22224966
chr2 230195986 230195996 EN2 JASPAR yes 81607794
chr2 230195987 230195995 DLX6 JASPAR yes 22224967
chr2 230195987 230195995 MSX1 JASPAR yes 22224968
chr2 230195987 230195995 DLX6 JASPAR yes 81607795
chr2 230195987 230195995 MSX1 JASPAR yes 81607796
chr2 230196002 230196011 NKX2-8 JASPAR yes 22224969
chr2 230196002 230196011 NKX2-8 JASPAR yes 81607797
chr2 230196058 230196068 NFIA JASPAR yes 22224970
chr2 230196058 230196068 NFIA JASPAR yes 81607798
chr2 230196059 230196068 NFIX JASPAR yes 22224971
chr2 230196059 230196068 NFIX JASPAR yes 81607799
chr2 230196060 230196066 NFIC JASPAR yes 22224972
chr2 230196060 230196066 NFIC JASPAR yes 81607800
chr2 230196060 230196079 CTCF JASPAR yes 22224973
chr2 230196060 230196079 CTCF JASPAR yes 81607801
chr2 230196066 230196087 ZNF263 JASPAR yes 22224974
chr2 230196066 230196087 ZNF263 JASPAR yes 81607802
chr2 230196069 230196079 SP1 JASPAR yes 22224975
chr2 230196069 230196079 SP1 JASPAR yes 81607803
chr2 230196072 230196093 ZNF263 JASPAR yes 22224976
chr2 230196072 230196093 ZNF263 JASPAR yes 81607804
chr2 230196137 230196152 ZIC3 JASPAR yes 22224977
chr2 230196137 230196152 ZIC3 JASPAR yes 81607805
chr2 230196144 230196157 SMAD2 JASPAR yes 22224978
chr2 230196144 230196157 SMAD2 JASPAR yes 81607806
chr2 230196158 230196162 LFA1 TRANSFAC yes 22224979
chr2 230196158 230196162 LFA1 TRANSFAC yes 81607807
chr2 230196163 230196174 USF2 JASPAR yes 22224980
chr2 230196163 230196174 USF2 JASPAR yes 81607808
chr2 230196164 230196174 FIGLA JASPAR yes 22224981
chr2 230196164 230196174 FIGLA JASPAR yes 81607809
chr2 230196166 230196171 USF2 TRANSFAC yes 22224982
chr2 230196166 230196171 USF2 TRANSFAC yes 81607810
chr2 230196171 230196175 H4TF2 TRANSFAC yes 22224983
chr2 230196171 230196175 H4TF2 TRANSFAC yes 81607811
chr2 230196173 230196194 ZNF263 JASPAR yes 22224984
chr2 230196173 230196194 ZNF263 JASPAR yes 81607812
chr2 230196174 230196195 ZNF263 JASPAR yes 22224985
chr2 230196174 230196195 ZNF263 JASPAR yes 81607813
chr2 230196211 230196215 YY1 TRANSFAC yes 22224986
chr2 230196211 230196215 YY1 TRANSFAC yes 81607814
chr2 230196212 230196220 FEV JASPAR yes 22224987
chr2 230196212 230196220 FEV JASPAR yes 81607815
chr2 230196261 230196265 YY1 TRANSFAC yes 22224988
chr2 230196261 230196265 YY1 TRANSFAC yes 81607816
chr2 230196269 230196281 HLF JASPAR yes 22224989
chr2 230196269 230196281 HLF JASPAR yes 81607817
chr2 230196270 230196280 CEBPB JASPAR yes 22224990
chr2 230196270 230196280 CEBPD JASPAR yes 22224991
chr2 230196270 230196280 CEBPE JASPAR yes 22224992
chr2 230196270 230196280 CEBPG JASPAR yes 22224993
chr2 230196270 230196280 CEBPB JASPAR yes 81607818
chr2 230196270 230196280 CEBPD JASPAR yes 81607819
chr2 230196270 230196280 CEBPE JASPAR yes 81607820
chr2 230196270 230196280 CEBPG JASPAR yes 81607821
chr2 230196279 230196294 HSF1 JASPAR yes 22224994
chr2 230196279 230196294 HSF1 JASPAR yes 81607822
chr2 230196286 230196290 YY1 TRANSFAC yes 22224995
chr2 230196286 230196290 YY1 TRANSFAC yes 81607823
chr2 230196295 230196299 YY1 TRANSFAC yes 22224996
chr2 230196295 230196299 YY1 TRANSFAC yes 81607824
chr2 230196345 230196353 FOXO3 JASPAR yes 22224997
chr2 230196345 230196353 FOXO3 JASPAR yes 81607825
chr2 230196349 230196359 SREBF2 JASPAR yes 22224998
chr2 230196349 230196359 SREBF2 JASPAR yes 81607826
chr2 230196350 230196359 SNAI2 JASPAR yes 22224999
chr2 230196350 230196359 SNAI2 JASPAR yes 81607827
chr2 230196351 230196356 USF2 TRANSFAC yes 22225000
chr2 230196351 230196356 USF2 TRANSFAC yes 81607828
chr2 230196355 230196360 ATF1 TRANSFAC yes 22225001
chr2 230196355 230196360 ATF1 TRANSFAC yes 81607829
chr2 230196365 230196372 NKX3-1 JASPAR yes 22225002
chr2 230196365 230196372 NKX3-1 JASPAR yes 81607830
chr2 230196370 230196377 NKX3-1 JASPAR yes 22225003
chr2 230196370 230196377 NKX3-1 JASPAR yes 81607831
chr2 230196377 230196387 MZF1 JASPAR yes 22225004
chr2 230196377 230196387 MZF1 JASPAR yes 81607832
chr2 230196400 230196405 USF2 TRANSFAC yes 22225005
chr2 230196400 230196405 USF2 TRANSFAC yes 81607833
chr2 230196404 230196418 SPIC JASPAR yes 22225006
chr2 230196404 230196418 SPIC JASPAR yes 81607834
chr2 230196426 230196429 MYB TRANSFAC yes 22225007
chr2 230196426 230196429 MYB TRANSFAC yes 81607835
SNP sites on vista35072[chr2:230195622-230196428]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr2 230195659 rs6735331 C T
REST
6423724
chr2 230195671 rs75701210 T C
REST
6423725
chr2 230195686 rs13387883 G A
RELA
6423726
chr2 230195697 rs2091785 C A,T no 6423727
chr2 230195767 rs2091784 C G
SRF THAP1
6423728
chr2 230195770 rs2091783 T G
SRF THAP1 YY1
6423729
chr2 230195778 rs116691291 C T
NFE
6423730
chr2 230195797 rs115219965 C T
ESR1 NR2F1 REST RXRG
6423731
chr2 230195843 rs535114610 AT A
FOXP1 YY1
6423732
chr2 230195844 rs114500986 T C
FOXP1 YY1
6423733
chr2 230195885 rs184594505 T A
FOXI1 IRF1 SPIC YY1
6423734
chr2 230195908 rs117948804 C T
TFE3
6423735
chr2 230195923 rs2091782 T C
CREB3 CREB3L1
6423736
chr2 230195987 rs56190103 C T
DLX6 EN2 MAFG MSX1
6423737
chr2 230196013 rs539364262 ACTT A no 6423738
chr2 230196109 rs112882251 A G no 6423739
chr2 230196119 rs74001827 C G,T no 6423740
chr2 230196256 rs111728020 T C no 6423741
chr2 230196359 rs61637867 C T
ATF1 SNAI2 SREBF2
6423742
chr2 230196360 rs112463832 G A
ATF1
6423743
Genes possibly regulated by vista35072[chr2:230195622-230196428]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr2 229715242 230136001 - PID1 ENSG00000153823.14 230136001 0.77 0.94 3214 40379
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista35072[chr2:230195622-230196428]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results