EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista35271[chr2:235354817-235355457]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista35271[chr2:235354817-235355457]
Back to top
Tissue distribution of vista35271
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista35271[chr2:235354817-235355457]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr2 235354981 235355339 SPI1 UCSC Txn Factor no Conserved 108435838
chr2 235354804 235354817 NFKB1 JASPAR yes 22234895
chr2 235354804 235354817 NFKB2 JASPAR yes 22234896
chr2 235354804 235354817 NFKB1 JASPAR yes 81878830
chr2 235354804 235354817 NFKB2 JASPAR yes 81878831
chr2 235354826 235354831 H4TF1 TRANSFAC yes 22234897
chr2 235354826 235354831 H4TF1 TRANSFAC yes 81878832
chr2 235354867 235354883 SOX8 JASPAR yes 22234898
chr2 235354867 235354883 SOX8 JASPAR yes 81878833
chr2 235354869 235354881 PROX1 JASPAR yes 22234899
chr2 235354869 235354881 PROX1 JASPAR yes 81878834
chr2 235354887 235354905 ESR2 JASPAR yes 22234900
chr2 235354887 235354905 ESR2 JASPAR yes 81878835
chr2 235354888 235354905 ESR1 JASPAR yes 22234901
chr2 235354888 235354905 ESR1 JASPAR yes 81878836
chr2 235354888 235354906 ESR1 JASPAR yes 22234902
chr2 235354888 235354906 ESR1 JASPAR yes 81878837
chr2 235354889 235354904 ESR2 JASPAR yes 22234903
chr2 235354889 235354904 ESR2 JASPAR yes 81878838
chr2 235354889 235354909 ESR1 JASPAR yes 22234904
chr2 235354889 235354909 ESR1 JASPAR yes 81878839
chr2 235354910 235354925 LEF1 JASPAR yes 22234905
chr2 235354910 235354925 LEF1 JASPAR yes 81878840
chr2 235354911 235354925 NR2F1 JASPAR yes 22234906
chr2 235354911 235354925 NR2F1 JASPAR yes 81878841
chr2 235355025 235355029 ESR1 TRANSFAC yes 22234907
chr2 235355025 235355029 ESR1 TRANSFAC yes 81878842
chr2 235355040 235355046 SOX10 JASPAR yes 22234908
chr2 235355040 235355046 SOX10 JASPAR yes 81878843
chr2 235355043 235355055 INSM1 JASPAR yes 22234909
chr2 235355043 235355055 INSM1 JASPAR yes 81878844
chr2 235355064 235355069 ETS2 TRANSFAC yes 22234910
chr2 235355064 235355069 ETS2 TRANSFAC yes 81878845
chr2 235355074 235355079 ETS2 TRANSFAC yes 22234911
chr2 235355074 235355079 ETS2 TRANSFAC yes 81878846
chr2 235355076 235355096 TP53 JASPAR yes 22234912
chr2 235355076 235355096 TP53 JASPAR yes 81878847
chr2 235355084 235355095 NRF1 JASPAR yes 22234913
chr2 235355084 235355095 NRF1 JASPAR yes 81878848
chr2 235355088 235355097 HIC2 JASPAR yes 22234914
chr2 235355088 235355097 HIC2 JASPAR yes 81878849
chr2 235355094 235355104 GABPA JASPAR yes 22234915
chr2 235355094 235355104 GABPA JASPAR yes 81878850
chr2 235355094 235355105 ELF5 JASPAR yes 22234916
chr2 235355094 235355105 ELF5 JASPAR yes 81878851
chr2 235355095 235355116 ZNF263 JASPAR yes 22234917
chr2 235355095 235355116 ZNF263 JASPAR yes 81878852
chr2 235355096 235355102 ETS1 JASPAR yes 22234918
chr2 235355096 235355102 SPI1 JASPAR yes 22234919
chr2 235355096 235355102 ETS1 JASPAR yes 81878853
chr2 235355096 235355102 SPI1 JASPAR yes 81878854
chr2 235355096 235355106 ELK1 JASPAR yes 22234920
chr2 235355096 235355106 ELK1 JASPAR yes 81878855
chr2 235355100 235355110 REL JASPAR yes 22234921
chr2 235355100 235355110 REL JASPAR yes 81878856
chr2 235355100 235355121 IRF1 JASPAR yes 22234922
chr2 235355100 235355121 IRF1 JASPAR yes 81878857
chr2 235355101 235355111 NFKB1 JASPAR yes 22234923
chr2 235355101 235355111 NFKB1 JASPAR yes 81878858
chr2 235355103 235355114 ELF5 JASPAR yes 22234924
chr2 235355103 235355114 ELF5 JASPAR yes 81878859
chr2 235355103 235355115 EHF JASPAR yes 22234925
chr2 235355103 235355115 ELF1 JASPAR yes 22234926
chr2 235355103 235355115 ELF4 JASPAR yes 22234927
chr2 235355103 235355115 EHF JASPAR yes 81878860
chr2 235355103 235355115 ELF1 JASPAR yes 81878861
chr2 235355103 235355115 ELF4 JASPAR yes 81878862
chr2 235355103 235355116 ELF1 JASPAR yes 22234928
chr2 235355103 235355116 ELF1 JASPAR yes 81878863
chr2 235355103 235355117 SPI1 JASPAR yes 22234929
chr2 235355103 235355117 SPIC JASPAR yes 22234930
chr2 235355103 235355117 SPI1 JASPAR yes 81878864
chr2 235355103 235355117 SPIC JASPAR yes 81878865
chr2 235355104 235355111 SPI1 JASPAR yes 22234931
chr2 235355104 235355111 SPI1 JASPAR yes 81878866
chr2 235355104 235355112 EHF JASPAR yes 22234932
chr2 235355104 235355112 EHF JASPAR yes 81878867
chr2 235355106 235355113 SPIB JASPAR yes 22234933
chr2 235355106 235355113 SPIB JASPAR yes 81878868
chr2 235355106 235355127 IRF1 JASPAR yes 22234934
chr2 235355106 235355127 IRF1 JASPAR yes 81878869
chr2 235355110 235355124 IRF8 JASPAR yes 22234935
chr2 235355110 235355124 IRF8 JASPAR yes 81878870
chr2 235355110 235355125 IRF9 JASPAR yes 22234936
chr2 235355110 235355125 IRF9 JASPAR yes 81878871
chr2 235355128 235355132 YY1 TRANSFAC yes 22234937
chr2 235355128 235355132 YY1 TRANSFAC yes 81878872
chr2 235355155 235355167 NHLH1 JASPAR yes 22234938
chr2 235355155 235355167 NHLH1 JASPAR yes 81878873
chr2 235355156 235355166 NHLH1 JASPAR yes 22234939
chr2 235355156 235355166 NHLH1 JASPAR yes 81878874
chr2 235355162 235355168 TCF4 TRANSFAC yes 22234940
chr2 235355162 235355168 TCF4 TRANSFAC yes 81878875
chr2 235355214 235355225 TFAP2A JASPAR yes 22234941
chr2 235355214 235355225 TFAP2B JASPAR yes 22234942
chr2 235355214 235355225 TFAP2C JASPAR yes 22234943
chr2 235355214 235355225 TFAP2A JASPAR yes 81878876
chr2 235355214 235355225 TFAP2B JASPAR yes 81878877
chr2 235355214 235355225 TFAP2C JASPAR yes 81878878
chr2 235355225 235355240 NR2C2 JASPAR yes 22234944
chr2 235355225 235355240 NR2C2 JASPAR yes 81878879
chr2 235355228 235355232 ESR1 TRANSFAC yes 22234945
chr2 235355228 235355232 ESR1 TRANSFAC yes 81878880
chr2 235355234 235355247 ELF1 JASPAR yes 22234946
chr2 235355234 235355247 ELF1 JASPAR yes 81878881
chr2 235355237 235355247 ETV6 JASPAR yes 22234947
chr2 235355237 235355247 ETV6 JASPAR yes 81878882
chr2 235355237 235355248 FLI1 JASPAR yes 22234948
chr2 235355237 235355248 FLI1 JASPAR yes 81878883
chr2 235355238 235355246 EHF JASPAR yes 22234949
chr2 235355238 235355246 EHF JASPAR yes 81878884
chr2 235355239 235355246 SPI1 JASPAR yes 22234950
chr2 235355239 235355246 SPI1 JASPAR yes 81878885
chr2 235355239 235355259 PPARG JASPAR yes 22234951
chr2 235355239 235355259 PPARG JASPAR yes 81878886
chr2 235355240 235355258 ESR1 JASPAR yes 22234952
chr2 235355240 235355258 ESR1 JASPAR yes 81878887
chr2 235355242 235355262 ESR1 JASPAR yes 22234953
chr2 235355242 235355262 ESR1 JASPAR yes 81878888
chr2 235355251 235355266 RUNX2 JASPAR yes 22234954
chr2 235355251 235355266 RUNX2 JASPAR yes 81878889
chr2 235355253 235355273 RREB1 JASPAR yes 22234955
chr2 235355253 235355273 RREB1 JASPAR yes 81878890
chr2 235355278 235355289 FLI1 JASPAR yes 22234956
chr2 235355278 235355289 FLI1 JASPAR yes 81878891
chr2 235355279 235355289 GABPA JASPAR yes 22234957
chr2 235355279 235355289 GABPA JASPAR yes 81878892
chr2 235355279 235355292 ELF1 JASPAR yes 22234958
chr2 235355279 235355292 ELF1 JASPAR yes 81878893
chr2 235355285 235355289 NFE TRANSFAC yes 22234959
chr2 235355285 235355289 NFE TRANSFAC yes 81878894
chr2 235355293 235355303 SP1 JASPAR yes 22234960
chr2 235355293 235355303 SP1 JASPAR yes 81878895
chr2 235355296 235355311 HNF4A JASPAR yes 22234961
chr2 235355296 235355311 HNF4A JASPAR yes 81878896
chr2 235355297 235355312 HNF4G JASPAR yes 22234962
chr2 235355297 235355312 NR2C2 JASPAR yes 22234963
chr2 235355297 235355312 HNF4G JASPAR yes 81878897
chr2 235355297 235355312 NR2C2 JASPAR yes 81878898
chr2 235355303 235355309 NFE2 TRANSFAC yes 22234964
chr2 235355303 235355309 NFE2 TRANSFAC yes 81878899
chr2 235355329 235355344 HNF4G JASPAR yes 22234965
chr2 235355329 235355344 HNF4G JASPAR yes 81878900
chr2 235355330 235355345 HNF4A JASPAR yes 22234966
chr2 235355330 235355345 HNF4A JASPAR yes 81878901
chr2 235355348 235355359 EBF1 JASPAR yes 22234967
chr2 235355348 235355359 EBF1 JASPAR yes 81878902
chr2 235355350 235355361 STAT3 JASPAR yes 22234968
chr2 235355350 235355361 STAT3 JASPAR yes 81878903
chr2 235355355 235355360 ETS2 TRANSFAC yes 22234969
chr2 235355355 235355360 ETS2 TRANSFAC yes 81878904
chr2 235355374 235355386 HES5 JASPAR yes 22234970
chr2 235355374 235355386 HES5 JASPAR yes 81878905
chr2 235355379 235355390 ESRRB JASPAR yes 22234971
chr2 235355379 235355390 ESRRB JASPAR yes 81878906
chr2 235355404 235355415 ESRRA JASPAR yes 22234972
chr2 235355404 235355415 ESRRB JASPAR yes 22234973
chr2 235355404 235355415 ESRRA JASPAR yes 81878907
chr2 235355404 235355415 ESRRB JASPAR yes 81878908
chr2 235355424 235355436 PROX1 JASPAR yes 22234974
chr2 235355424 235355436 PROX1 JASPAR yes 81878909
chr2 235355451 235355462 TBX20 JASPAR yes 22234975
chr2 235355451 235355462 TBX20 JASPAR yes 81878910
chr2 235355453 235355461 MGA JASPAR yes 22234976
chr2 235355453 235355461 TBX15 JASPAR yes 22234977
chr2 235355453 235355461 TBX1 JASPAR yes 22234978
chr2 235355453 235355461 TBX4 JASPAR yes 22234979
chr2 235355453 235355461 TBX5 JASPAR yes 22234980
chr2 235355453 235355461 MGA JASPAR yes 81878911
chr2 235355453 235355461 TBX15 JASPAR yes 81878912
chr2 235355453 235355461 TBX1 JASPAR yes 81878913
chr2 235355453 235355461 TBX4 JASPAR yes 81878914
chr2 235355453 235355461 TBX5 JASPAR yes 81878915
chr2 235355456 235355470 GLIS2 JASPAR yes 22234981
chr2 235355456 235355470 GLIS3 JASPAR yes 22234982
chr2 235355456 235355470 GLIS2 JASPAR yes 81878916
chr2 235355456 235355470 GLIS3 JASPAR yes 81878917
SNP sites on vista35271[chr2:235354817-235355457]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr2 235354863 rs116451166 G A,T no 6452999
chr2 235354864 rs10178170 T G no 6453000
chr2 235354892 rs149346570 G A
ESR1 ESR2
6453001
chr2 235354921 rs13405740 G C,T
LEF1 NR2F1
6453002
chr2 235355064 rs10210757 C T
ETS2 SPI1
6453003
chr2 235355067 rs140188110 C T
ETS2 SPI1
6453004
chr2 235355211 rs538436748 C T
SPI1
6453005
chr2 235355235 rs531155060 G GAGTGAGGA
ELF1 NR2C2 SPI1
6453006
chr2 235355375 rs144037376 C A,G,T
HES5
6453007
chr2 235355383 rs188942775 G A
ESRRB HES5
6453008
Genes possibly regulated by vista35271[chr2:235354817-235355457]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr2 235401685 235405697 - ARL4C ENSG00000188042.5 235405697 0.85 0.98 3276 49760
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista35271[chr2:235354817-235355457]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results