EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista40073[chr3:14863685-14864013]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista40073[chr3:14863685-14864013]
Back to top
Tissue distribution of vista40073
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista40073[chr3:14863685-14864013]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr3 14863681 14863691 NFIA JASPAR yes 633778
chr3 14863681 14863691 NFIA JASPAR yes 70942662
chr3 14863683 14863689 NFIC JASPAR yes 633779
chr3 14863683 14863689 NFIC JASPAR yes 70942663
chr3 14863707 14863711 YY1 TRANSFAC yes 633780
chr3 14863707 14863711 YY1 TRANSFAC yes 70942664
chr3 14863709 14863724 FOXA1 JASPAR yes 633781
chr3 14863709 14863724 FOXA1 JASPAR yes 70942665
chr3 14863710 14863716 TCF4 TRANSFAC yes 633782
chr3 14863710 14863716 TCF4 TRANSFAC yes 70942666
chr3 14863710 14863725 FOXP1 JASPAR yes 633783
chr3 14863710 14863725 FOXP1 JASPAR yes 70942667
chr3 14863711 14863720 SRY JASPAR yes 633784
chr3 14863711 14863720 SRY JASPAR yes 70942668
chr3 14863711 14863722 FOXP2 JASPAR yes 633785
chr3 14863711 14863722 FOXP2 JASPAR yes 70942669
chr3 14863711 14863723 FOXC2 JASPAR yes 633786
chr3 14863711 14863723 FOXC2 JASPAR yes 70942670
chr3 14863712 14863720 FOXD1 JASPAR yes 633787
chr3 14863712 14863720 FOXG1 JASPAR yes 633788
chr3 14863712 14863720 FOXO3 JASPAR yes 633789
chr3 14863712 14863720 FOXD1 JASPAR yes 70942671
chr3 14863712 14863720 FOXG1 JASPAR yes 70942672
chr3 14863712 14863720 FOXO3 JASPAR yes 70942673
chr3 14863712 14863723 FOXB1 JASPAR yes 633790
chr3 14863712 14863723 FOXC1 JASPAR yes 633791
chr3 14863712 14863723 FOXB1 JASPAR yes 70942674
chr3 14863712 14863723 FOXC1 JASPAR yes 70942675
chr3 14863713 14863720 FOXD2 JASPAR yes 633792
chr3 14863713 14863720 FOXI1 JASPAR yes 633793
chr3 14863713 14863720 FOXL1 JASPAR yes 633794
chr3 14863713 14863720 FOXO4 JASPAR yes 633795
chr3 14863713 14863720 FOXO6 JASPAR yes 633796
chr3 14863713 14863720 FOXP3 JASPAR yes 633797
chr3 14863713 14863720 FOXD2 JASPAR yes 70942676
chr3 14863713 14863720 FOXI1 JASPAR yes 70942677
chr3 14863713 14863720 FOXL1 JASPAR yes 70942678
chr3 14863713 14863720 FOXO4 JASPAR yes 70942679
chr3 14863713 14863720 FOXO6 JASPAR yes 70942680
chr3 14863713 14863720 FOXP3 JASPAR yes 70942681
chr3 14863713 14863721 FOXO3 JASPAR yes 633798
chr3 14863713 14863721 FOXO3 JASPAR yes 70942682
chr3 14863713 14863724 FOXA1 JASPAR yes 633799
chr3 14863713 14863724 FOXA1 JASPAR yes 70942683
chr3 14863719 14863723 YY1 TRANSFAC yes 633800
chr3 14863719 14863723 YY1 TRANSFAC yes 70942684
chr3 14863722 14863726 YY1 TRANSFAC yes 633801
chr3 14863722 14863726 YY1 TRANSFAC yes 70942685
chr3 14863723 14863736 SMAD2 JASPAR yes 633802
chr3 14863723 14863736 SMAD2 JASPAR yes 70942686
chr3 14863736 14863750 GATA2 JASPAR yes 633803
chr3 14863736 14863750 GATA2 JASPAR yes 70942687
chr3 14863740 14863748 GATA5 JASPAR yes 633804
chr3 14863740 14863748 GATA5 JASPAR yes 70942688
chr3 14863756 14863762 YY1 JASPAR yes 633805
chr3 14863756 14863762 YY1 JASPAR yes 70942689
chr3 14863761 14863767 TCF4 TRANSFAC yes 633806
chr3 14863761 14863767 TCF4 TRANSFAC yes 70942690
chr3 14863795 14863810 HSF1 JASPAR yes 633807
chr3 14863795 14863810 HSF1 JASPAR yes 70942691
chr3 14863796 14863809 HSF1 JASPAR yes 633808
chr3 14863796 14863809 HSF2 JASPAR yes 633809
chr3 14863796 14863809 HSF4 JASPAR yes 633810
chr3 14863796 14863809 HSF1 JASPAR yes 70942692
chr3 14863796 14863809 HSF2 JASPAR yes 70942693
chr3 14863796 14863809 HSF4 JASPAR yes 70942694
chr3 14863800 14863815 HSF1 JASPAR yes 633811
chr3 14863800 14863815 HSF1 JASPAR yes 70942695
chr3 14863801 14863814 HSF1 JASPAR yes 633812
chr3 14863801 14863814 HSF2 JASPAR yes 633813
chr3 14863801 14863814 HSF4 JASPAR yes 633814
chr3 14863801 14863814 HSF1 JASPAR yes 70942696
chr3 14863801 14863814 HSF2 JASPAR yes 70942697
chr3 14863801 14863814 HSF4 JASPAR yes 70942698
chr3 14863803 14863817 TLX1 JASPAR yes 633815
chr3 14863803 14863817 TLX1 JASPAR yes 70942699
chr3 14863804 14863818 TLX1 JASPAR yes 633816
chr3 14863804 14863818 TLX1 JASPAR yes 70942700
chr3 14863810 14863819 NFIX JASPAR yes 633817
chr3 14863810 14863819 NFIX JASPAR yes 70942701
chr3 14863812 14863818 NFIC JASPAR yes 633818
chr3 14863812 14863818 NFIC JASPAR yes 70942702
chr3 14863817 14863829 FOXI1 JASPAR yes 633819
chr3 14863817 14863829 FOXI1 JASPAR yes 70942703
chr3 14863830 14863843 ZBTB18 JASPAR yes 633820
chr3 14863830 14863843 ZBTB18 JASPAR yes 70942704
chr3 14863856 14863872 E2F2 JASPAR yes 633821
chr3 14863856 14863872 E2F2 JASPAR yes 70942705
chr3 14863857 14863862 NFY TRANSFAC yes 633822
chr3 14863857 14863862 NFY TRANSFAC yes 70942706
chr3 14863858 14863867 NFIX JASPAR yes 633823
chr3 14863858 14863867 NFIX JASPAR yes 70942707
chr3 14863858 14863869 TBX2 JASPAR yes 633824
chr3 14863858 14863869 TBX2 JASPAR yes 70942708
chr3 14863859 14863865 NFIC JASPAR yes 633825
chr3 14863859 14863865 NFIC JASPAR yes 70942709
chr3 14863867 14863877 HOXB13 JASPAR yes 633826
chr3 14863867 14863877 HOXD13 JASPAR yes 633827
chr3 14863867 14863877 HOXB13 JASPAR yes 70942710
chr3 14863867 14863877 HOXD13 JASPAR yes 70942711
chr3 14863867 14863878 HOXA10 JASPAR yes 633828
chr3 14863867 14863878 HOXA10 JASPAR yes 70942712
chr3 14863873 14863884 FOXA1 JASPAR yes 633829
chr3 14863873 14863884 FOXA1 JASPAR yes 70942713
chr3 14863873 14863888 FOXA1 JASPAR yes 633830
chr3 14863873 14863888 FOXA1 JASPAR yes 70942714
chr3 14863874 14863880 JUN TRANSFAC yes 633831
chr3 14863874 14863880 JUN TRANSFAC yes 70942715
chr3 14863874 14863885 FOXB1 JASPAR yes 633832
chr3 14863874 14863885 FOXC1 JASPAR yes 633833
chr3 14863874 14863885 FOXB1 JASPAR yes 70942716
chr3 14863874 14863885 FOXC1 JASPAR yes 70942717
chr3 14863874 14863886 FOXC2 JASPAR yes 633834
chr3 14863874 14863886 FOXC2 JASPAR yes 70942718
chr3 14863914 14863926 POU2F1 JASPAR yes 633835
chr3 14863914 14863926 POU2F1 JASPAR yes 70942719
chr3 14863915 14863925 MEF2A JASPAR yes 633836
chr3 14863915 14863925 MEF2A JASPAR yes 70942720
chr3 14863916 14863920 YY1 TRANSFAC yes 633837
chr3 14863916 14863920 YY1 TRANSFAC yes 70942721
chr3 14863916 14863925 POU5F1B JASPAR yes 633838
chr3 14863916 14863925 POU5F1B JASPAR yes 70942722
chr3 14863923 14863932 SRY JASPAR yes 633839
chr3 14863923 14863932 SRY JASPAR yes 70942723
chr3 14863934 14863954 ESR1 JASPAR yes 633840
chr3 14863934 14863954 ESR1 JASPAR yes 70942724
chr3 14863947 14863961 RORA JASPAR yes 633841
chr3 14863947 14863961 RORA JASPAR yes 70942725
chr3 14863955 14863963 HOXA5 JASPAR yes 633842
chr3 14863955 14863963 HOXA5 JASPAR yes 70942726
chr3 14863990 14864011 IRF1 JASPAR yes 633843
chr3 14863990 14864011 IRF1 JASPAR yes 70942727
chr3 14863991 14864006 FOXP1 JASPAR yes 633844
chr3 14863991 14864006 FOXP1 JASPAR yes 70942728
chr3 14863991 14864012 IRF1 JASPAR yes 633845
chr3 14863991 14864012 IRF1 JASPAR yes 70942729
chr3 14863992 14864003 FOXP2 JASPAR yes 633846
chr3 14863992 14864003 FOXP2 JASPAR yes 70942730
chr3 14863993 14864008 FOXP1 JASPAR yes 633847
chr3 14863993 14864008 FOXP1 JASPAR yes 70942731
chr3 14863995 14864010 FOXP1 JASPAR yes 633848
chr3 14863995 14864010 FOXP1 JASPAR yes 70942732
chr3 14863995 14864016 IRF1 JASPAR yes 633849
chr3 14863995 14864016 IRF1 JASPAR yes 70942733
chr3 14863996 14864011 FOXP1 JASPAR yes 633850
chr3 14863996 14864011 FOXP1 JASPAR yes 70942734
chr3 14863997 14864012 FOXP1 JASPAR yes 633851
chr3 14863997 14864012 FOXP1 JASPAR yes 70942735
chr3 14863998 14864013 FOXP1 JASPAR yes 633852
chr3 14863998 14864013 FOXP1 JASPAR yes 70942736
chr3 14863999 14864014 FOXP1 JASPAR yes 633853
chr3 14863999 14864014 FOXP1 JASPAR yes 70942737
chr3 14864001 14864016 FOXP1 JASPAR yes 633854
chr3 14864001 14864016 FOXP1 JASPAR yes 70942738
chr3 14864008 14864018 GSX2 JASPAR yes 633855
chr3 14864008 14864018 LBX2 JASPAR yes 633856
chr3 14864008 14864018 MIXL1 JASPAR yes 633857
chr3 14864008 14864018 MNX1 JASPAR yes 633858
chr3 14864008 14864018 RAX JASPAR yes 633859
chr3 14864008 14864018 GSX2 JASPAR yes 70942739
chr3 14864008 14864018 LBX2 JASPAR yes 70942740
chr3 14864008 14864018 MIXL1 JASPAR yes 70942741
chr3 14864008 14864018 MNX1 JASPAR yes 70942742
chr3 14864008 14864018 RAX JASPAR yes 70942743
chr3 14864009 14864017 ISX JASPAR yes 633860
chr3 14864009 14864017 LHX9 JASPAR yes 633861
chr3 14864009 14864017 LMX1B JASPAR yes 633862
chr3 14864009 14864017 PRRX1 JASPAR yes 633863
chr3 14864009 14864017 RAX2 JASPAR yes 633864
chr3 14864009 14864017 SHOX JASPAR yes 633865
chr3 14864009 14864017 UNCX JASPAR yes 633866
chr3 14864009 14864017 ISX JASPAR yes 70942744
chr3 14864009 14864017 LHX9 JASPAR yes 70942745
chr3 14864009 14864017 LMX1B JASPAR yes 70942746
chr3 14864009 14864017 PRRX1 JASPAR yes 70942747
chr3 14864009 14864017 RAX2 JASPAR yes 70942748
chr3 14864009 14864017 SHOX JASPAR yes 70942749
chr3 14864009 14864017 UNCX JASPAR yes 70942750
chr3 14864009 14864023 ONECUT3 JASPAR yes 633867
chr3 14864009 14864023 ONECUT3 JASPAR yes 70942751
chr3 14864010 14864020 PAX3 JASPAR yes 633868
chr3 14864010 14864020 PAX7 JASPAR yes 633869
chr3 14864010 14864020 PAX3 JASPAR yes 70942752
chr3 14864010 14864020 PAX7 JASPAR yes 70942753
chr3 14864010 14864021 PHOX2A JASPAR yes 633870
chr3 14864010 14864021 PHOX2A JASPAR yes 70942754
chr3 14864013 14864026 DUXA JASPAR yes 633871
chr3 14864013 14864026 DUXA JASPAR yes 70942755
SNP sites on vista40073[chr3:14863685-14864013]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr3 14863721 rs7620288 A G
FOXA1 FOXB1 FOXC1 FOXC2 FOXO3 FOXP1 FOXP2 YY1
6572134
chr3 14863741 rs561480134 CGT C
GATA2 GATA5
6572135
chr3 14863779 rs139394692 G A no 6572136
chr3 14863861 rs9833087 T A
E2F2 NFIC NFIX NFY TBX2
6572137
chr3 14863984 rs572087130 A G no 6572138
Genes possibly regulated by vista40073[chr3:14863685-14864013]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr3 14860469 14975895 + FGD5 ENSG00000154783.6 14860469 0.84 0.93 3437 96784
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista40073[chr3:14863685-14864013]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results