EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista42411[chr3:129295610-129296083]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista42411[chr3:129295610-129296083]
Back to top
Tissue distribution of vista42411
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista42411[chr3:129295610-129296083]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr3 129295654 129295868 FOXA1 UCSC Txn Factor no Conserved 108530365
chr3 129295595 129295610 AR JASPAR yes 5667166
chr3 129295595 129295610 AR JASPAR yes 71051275
chr3 129295613 129295618 SP1 TRANSFAC yes 5667167
chr3 129295613 129295618 SP1 TRANSFAC yes 71051276
chr3 129295629 129295634 SP1 TRANSFAC yes 5667168
chr3 129295629 129295634 SP1 TRANSFAC yes 71051277
chr3 129295647 129295659 MEF2B JASPAR yes 5667169
chr3 129295647 129295659 MEF2D JASPAR yes 5667170
chr3 129295647 129295659 MEF2B JASPAR yes 71051278
chr3 129295647 129295659 MEF2D JASPAR yes 71051279
chr3 129295648 129295652 NFE TRANSFAC yes 5667171
chr3 129295648 129295652 NFE TRANSFAC yes 71051280
chr3 129295652 129295656 YY1 TRANSFAC yes 5667172
chr3 129295652 129295656 YY1 TRANSFAC yes 71051281
chr3 129295669 129295674 GATA2 JASPAR yes 5667173
chr3 129295669 129295674 GATA2 JASPAR yes 71051282
chr3 129295672 129295676 H1TF2 TRANSFAC yes 5667174
chr3 129295672 129295676 NFE TRANSFAC yes 5667175
chr3 129295672 129295676 SRF TRANSFAC yes 5667176
chr3 129295672 129295676 H1TF2 TRANSFAC yes 71051283
chr3 129295672 129295676 NFE TRANSFAC yes 71051284
chr3 129295672 129295676 SRF TRANSFAC yes 71051285
chr3 129295676 129295688 FOXI1 JASPAR yes 5667177
chr3 129295676 129295688 FOXI1 JASPAR yes 71051286
chr3 129295688 129295708 PPARG JASPAR yes 5667178
chr3 129295688 129295708 PPARG JASPAR yes 71051287
chr3 129295701 129295707 MZF1 JASPAR yes 5667179
chr3 129295701 129295707 MZF1 JASPAR yes 71051288
chr3 129295735 129295739 H1TF2 TRANSFAC yes 5667180
chr3 129295735 129295739 NFE TRANSFAC yes 5667181
chr3 129295735 129295739 SRF TRANSFAC yes 5667182
chr3 129295735 129295739 H1TF2 TRANSFAC yes 71051289
chr3 129295735 129295739 NFE TRANSFAC yes 71051290
chr3 129295735 129295739 SRF TRANSFAC yes 71051291
chr3 129295737 129295745 FOXL1 JASPAR yes 5667183
chr3 129295737 129295745 FOXL1 JASPAR yes 71051292
chr3 129295738 129295754 POU4F2 JASPAR yes 5667184
chr3 129295738 129295754 POU4F2 JASPAR yes 71051293
chr3 129295739 129295754 FOXA1 JASPAR yes 5667185
chr3 129295739 129295754 FOXA1 JASPAR yes 71051294
chr3 129295741 129295759 MAFF JASPAR yes 5667186
chr3 129295741 129295759 MAFF JASPAR yes 71051295
chr3 129295743 129295747 YY1 TRANSFAC yes 5667187
chr3 129295743 129295747 YY1 TRANSFAC yes 71051296
chr3 129295743 129295754 FOXA1 JASPAR yes 5667188
chr3 129295743 129295754 NRL JASPAR yes 5667189
chr3 129295743 129295754 FOXA1 JASPAR yes 71051297
chr3 129295743 129295754 NRL JASPAR yes 71051298
chr3 129295743 129295758 MAFK JASPAR yes 5667190
chr3 129295743 129295758 MAFK JASPAR yes 71051299
chr3 129295743 129295764 MAFG JASPAR yes 5667191
chr3 129295743 129295764 MAFG JASPAR yes 71051300
chr3 129295748 129295762 FOXF2 JASPAR yes 5667192
chr3 129295748 129295762 FOXF2 JASPAR yes 71051301
chr3 129295748 129295763 FOXP1 JASPAR yes 5667193
chr3 129295748 129295763 FOXP1 JASPAR yes 71051302
chr3 129295749 129295760 FOXA1 JASPAR yes 5667194
chr3 129295749 129295760 FOXA1 JASPAR yes 71051303
chr3 129295749 129295764 FOXA1 JASPAR yes 5667195
chr3 129295749 129295764 FOXA1 JASPAR yes 71051304
chr3 129295750 129295756 JUN TRANSFAC yes 5667196
chr3 129295750 129295756 JUN TRANSFAC yes 71051305
chr3 129295750 129295761 FOXB1 JASPAR yes 5667197
chr3 129295750 129295761 FOXC1 JASPAR yes 5667198
chr3 129295750 129295761 FOXB1 JASPAR yes 71051306
chr3 129295750 129295761 FOXC1 JASPAR yes 71051307
chr3 129295750 129295762 FOXC2 JASPAR yes 5667199
chr3 129295750 129295762 FOXC2 JASPAR yes 71051308
chr3 129295751 129295762 FOXP2 JASPAR yes 5667200
chr3 129295751 129295762 FOXP2 JASPAR yes 71051309
chr3 129295753 129295760 FOXD2 JASPAR yes 5667201
chr3 129295753 129295760 FOXI1 JASPAR yes 5667202
chr3 129295753 129295760 FOXL1 JASPAR yes 5667203
chr3 129295753 129295760 FOXO4 JASPAR yes 5667204
chr3 129295753 129295760 FOXO6 JASPAR yes 5667205
chr3 129295753 129295760 FOXP3 JASPAR yes 5667206
chr3 129295753 129295760 FOXD2 JASPAR yes 71051310
chr3 129295753 129295760 FOXI1 JASPAR yes 71051311
chr3 129295753 129295760 FOXL1 JASPAR yes 71051312
chr3 129295753 129295760 FOXO4 JASPAR yes 71051313
chr3 129295753 129295760 FOXO6 JASPAR yes 71051314
chr3 129295753 129295760 FOXP3 JASPAR yes 71051315
chr3 129295753 129295761 FOXD1 JASPAR yes 5667207
chr3 129295753 129295761 FOXO3 JASPAR yes 5667208
chr3 129295753 129295761 FOXD1 JASPAR yes 71051316
chr3 129295753 129295761 FOXO3 JASPAR yes 71051317
chr3 129295771 129295782 FOXH1 JASPAR yes 5667209
chr3 129295771 129295782 FOXH1 JASPAR yes 71051318
chr3 129295792 129295804 NHLH1 JASPAR yes 5667210
chr3 129295792 129295804 NHLH1 JASPAR yes 71051319
chr3 129295793 129295803 NHLH1 JASPAR yes 5667211
chr3 129295793 129295803 NHLH1 JASPAR yes 71051320
chr3 129295808 129295819 FLI1 JASPAR yes 5667212
chr3 129295808 129295819 FLI1 JASPAR yes 71051321
chr3 129295809 129295819 GABPA JASPAR yes 5667213
chr3 129295809 129295819 GABPA JASPAR yes 71051322
chr3 129295809 129295820 ELF5 JASPAR yes 5667214
chr3 129295809 129295820 ETV2 JASPAR yes 5667215
chr3 129295809 129295820 ELF5 JASPAR yes 71051323
chr3 129295809 129295820 ETV2 JASPAR yes 71051324
chr3 129295809 129295822 ELF1 JASPAR yes 5667216
chr3 129295809 129295822 ELF1 JASPAR yes 71051325
chr3 129295809 129295823 SPI1 JASPAR yes 5667217
chr3 129295809 129295823 SPIC JASPAR yes 5667218
chr3 129295809 129295823 SPI1 JASPAR yes 71051326
chr3 129295809 129295823 SPIC JASPAR yes 71051327
chr3 129295813 129295825 FOXI1 JASPAR yes 5667219
chr3 129295813 129295825 FOXI1 JASPAR yes 71051328
chr3 129295814 129295828 FOXF2 JASPAR yes 5667220
chr3 129295814 129295828 FOXF2 JASPAR yes 71051329
chr3 129295822 129295837 RUNX2 JASPAR yes 5667221
chr3 129295822 129295837 RUNX2 JASPAR yes 71051330
chr3 129295829 129295842 SMAD2 JASPAR yes 5667222
chr3 129295829 129295842 SMAD2 JASPAR yes 71051331
chr3 129295833 129295846 ZBTB18 JASPAR yes 5667223
chr3 129295833 129295846 ZBTB18 JASPAR yes 71051332
chr3 129295834 129295846 PKNOX1 JASPAR yes 5667224
chr3 129295834 129295846 PKNOX2 JASPAR yes 5667225
chr3 129295834 129295846 TGIF1 JASPAR yes 5667226
chr3 129295834 129295846 TGIF2 JASPAR yes 5667227
chr3 129295834 129295846 PKNOX1 JASPAR yes 71051333
chr3 129295834 129295846 PKNOX2 JASPAR yes 71051334
chr3 129295834 129295846 TGIF1 JASPAR yes 71051335
chr3 129295834 129295846 TGIF2 JASPAR yes 71051336
chr3 129295844 129295859 ZIC3 JASPAR yes 5667228
chr3 129295844 129295859 ZIC3 JASPAR yes 71051337
chr3 129295856 129295870 RORA JASPAR yes 5667229
chr3 129295856 129295870 RORA JASPAR yes 71051338
chr3 129295859 129295869 RORA JASPAR yes 5667230
chr3 129295859 129295869 RORA JASPAR yes 71051339
chr3 129295864 129295868 ESR1 TRANSFAC yes 5667231
chr3 129295864 129295868 ESR1 TRANSFAC yes 71051340
chr3 129295885 129295889 H4TF2 TRANSFAC yes 5667232
chr3 129295885 129295889 H4TF2 TRANSFAC yes 71051341
chr3 129295891 129295903 EHF JASPAR yes 5667233
chr3 129295891 129295903 ELF1 JASPAR yes 5667234
chr3 129295891 129295903 ELF4 JASPAR yes 5667235
chr3 129295891 129295903 EHF JASPAR yes 71051342
chr3 129295891 129295903 ELF1 JASPAR yes 71051343
chr3 129295891 129295903 ELF4 JASPAR yes 71051344
chr3 129295893 129295902 ELK4 JASPAR yes 5667236
chr3 129295893 129295902 ELK4 JASPAR yes 71051345
chr3 129295893 129295903 GABPA JASPAR yes 5667237
chr3 129295893 129295903 GABPA JASPAR yes 71051346
chr3 129295893 129295904 ELK4 JASPAR yes 5667238
chr3 129295893 129295904 ELK4 JASPAR yes 71051347
chr3 129295895 129295901 ETS1 JASPAR yes 5667239
chr3 129295895 129295901 SPI1 JASPAR yes 5667240
chr3 129295895 129295901 ETS1 JASPAR yes 71051348
chr3 129295895 129295901 SPI1 JASPAR yes 71051349
chr3 129295902 129295905 MYB TRANSFAC yes 5667241
chr3 129295902 129295905 MYB TRANSFAC yes 71051350
chr3 129295905 129295917 TEAD1 JASPAR yes 5667242
chr3 129295905 129295917 TEAD1 JASPAR yes 71051351
chr3 129295926 129295931 SP1 TRANSFAC yes 5667243
chr3 129295926 129295931 SP1 TRANSFAC yes 71051352
chr3 129295972 129295976 H4TF2 TRANSFAC yes 5667244
chr3 129295972 129295976 H4TF2 TRANSFAC yes 71051353
chr3 129295972 129295993 ZNF263 JASPAR yes 5667245
chr3 129295972 129295993 ZNF263 JASPAR yes 71051354
chr3 129296025 129296046 REST JASPAR yes 5667246
chr3 129296025 129296046 REST JASPAR yes 71051355
chr3 129296028 129296042 EBF1 JASPAR yes 5667247
chr3 129296028 129296042 EBF1 JASPAR yes 71051356
chr3 129296028 129296043 ZIC3 JASPAR yes 5667248
chr3 129296028 129296043 ZIC4 JASPAR yes 5667249
chr3 129296028 129296043 ZIC3 JASPAR yes 71051357
chr3 129296028 129296043 ZIC4 JASPAR yes 71051358
chr3 129296029 129296040 EBF1 JASPAR yes 5667250
chr3 129296029 129296040 EBF1 JASPAR yes 71051359
chr3 129296029 129296043 ZIC1 JASPAR yes 5667251
chr3 129296029 129296043 ZIC1 JASPAR yes 71051360
chr3 129296030 129296036 MZF1 JASPAR yes 5667252
chr3 129296030 129296036 MZF1 JASPAR yes 71051361
chr3 129296040 129296058 MAFF JASPAR yes 5667253
chr3 129296040 129296058 MAFF JASPAR yes 71051362
chr3 129296041 129296056 MAFK JASPAR yes 5667254
chr3 129296041 129296056 MAFK JASPAR yes 71051363
chr3 129296045 129296056 FOXA1 JASPAR yes 5667255
chr3 129296045 129296056 FOXA1 JASPAR yes 71051364
chr3 129296045 129296060 FOXA1 JASPAR yes 5667256
chr3 129296045 129296060 FOXA1 JASPAR yes 71051365
SNP sites on vista42411[chr3:129295610-129296083]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr3 129295615 rs370560204 G A
SP1
7026955
chr3 129295619 rs77230559 C T no 7026956
chr3 129295625 rs564010367 C T no 7026957
chr3 129295654 rs72990018 A G
FOXA1 MEF2B MEF2D YY1
7026958
chr3 129295690 rs568068901 A G
FOXA1 PPARG
7026959
chr3 129295706 rs76818681 C T
FOXA1 MZF1 PPARG
7026960
chr3 129295747 rs140282963 T C
FOXA1 MAFF MAFG MAFK NRL POU4F2 YY1
7026961
chr3 129295980 rs142301727 CCT C
ZNF263
7026962
chr3 129295980 rs866978029 CCT C
ZNF263
7026963
chr3 129296020 rs2625961 C T no 7026964
chr3 129296037 rs556166555 G A,C
EBF1 REST ZIC1 ZIC3 ZIC4
7026965
Genes possibly regulated by vista42411[chr3:129295610-129296083]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr3 129247483 129254012 + RHO ENSG00000163914.4 129247483 0.85 1.0 4072 51873
chr3 129262057 129270310 + H1FOO ENSG00000178804.3 129262057 0.97 1.0 4073 66447
chr3 129274018 129325661 - PLXND1 ENSG00000004399.8 129325661 0.81 1.0 4074 70422
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista42411[chr3:129295610-129296083]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results