EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista43359[chr3:181438058-181438556]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista43359[chr3:181438058-181438556]
Back to top
Tissue distribution of vista43359
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista43359[chr3:181438058-181438556]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr3 181438057 181438064 SPI1 JASPAR yes 8058992
chr3 181438057 181438064 SPI1 JASPAR yes 71095177
chr3 181438078 181438084 YY1 JASPAR yes 8058993
chr3 181438078 181438084 YY1 JASPAR yes 71095178
chr3 181438079 181438099 TP53 JASPAR yes 8058994
chr3 181438079 181438099 TP53 JASPAR yes 71095179
chr3 181438081 181438102 REST JASPAR yes 8058995
chr3 181438081 181438102 REST JASPAR yes 71095180
chr3 181438082 181438101 REST JASPAR yes 8058996
chr3 181438082 181438101 REST JASPAR yes 71095181
chr3 181438084 181438093 HIC2 JASPAR yes 8058997
chr3 181438084 181438093 HIC2 JASPAR yes 71095182
chr3 181438087 181438091 LFA1 TRANSFAC yes 8058998
chr3 181438087 181438091 LFA1 TRANSFAC yes 71095183
chr3 181438102 181438108 MAZ TRANSFAC yes 8058999
chr3 181438102 181438108 MAZ TRANSFAC yes 71095184
chr3 181438115 181438123 TEAD3 JASPAR yes 8059000
chr3 181438115 181438123 TEAD3 JASPAR yes 71095185
chr3 181438119 181438128 THAP1 JASPAR yes 8059001
chr3 181438119 181438128 THAP1 JASPAR yes 71095186
chr3 181438122 181438126 LFA1 TRANSFAC yes 8059002
chr3 181438122 181438126 LFA1 TRANSFAC yes 71095187
chr3 181438128 181438137 SP1 TRANSFAC yes 8059003
chr3 181438128 181438137 SP1 TRANSFAC yes 71095188
chr3 181438130 181438137 SP1 TRANSFAC yes 8059004
chr3 181438130 181438137 SP1 TRANSFAC yes 71095189
chr3 181438130 181438150 RREB1 JASPAR yes 8059005
chr3 181438130 181438150 RREB1 JASPAR yes 71095190
chr3 181438131 181438136 SP1 TRANSFAC yes 8059006
chr3 181438131 181438136 SP1 TRANSFAC yes 71095191
chr3 181438131 181438137 SP1 TRANSFAC yes 8059007
chr3 181438131 181438137 SP1 TRANSFAC yes 71095192
chr3 181438131 181438138 SP1 TRANSFAC yes 8059008
chr3 181438131 181438138 SP1 TRANSFAC yes 71095193
chr3 181438137 181438148 GCM1 JASPAR yes 8059009
chr3 181438137 181438148 GCM1 JASPAR yes 71095194
chr3 181438137 181438156 CTCF JASPAR yes 8059010
chr3 181438137 181438156 CTCF JASPAR yes 71095195
chr3 181438151 181438169 NR3C1 JASPAR yes 8059011
chr3 181438151 181438169 NR3C1 JASPAR yes 71095196
chr3 181438156 181438172 SOX4 JASPAR yes 8059012
chr3 181438156 181438172 SOX4 JASPAR yes 71095197
chr3 181438157 181438167 MEOX1 JASPAR yes 8059013
chr3 181438157 181438167 MEOX2 JASPAR yes 8059014
chr3 181438157 181438167 POU6F1 JASPAR yes 8059015
chr3 181438157 181438167 MEOX1 JASPAR yes 71095198
chr3 181438157 181438167 MEOX2 JASPAR yes 71095199
chr3 181438157 181438167 POU6F1 JASPAR yes 71095200
chr3 181438160 181438168 HOXA5 JASPAR yes 8059016
chr3 181438160 181438168 HOXA5 JASPAR yes 71095201
chr3 181438191 181438205 EBF1 JASPAR yes 8059017
chr3 181438191 181438205 EBF1 JASPAR yes 71095202
chr3 181438192 181438203 EBF1 JASPAR yes 8059018
chr3 181438192 181438203 EBF1 JASPAR yes 71095203
chr3 181438241 181438251 SP1 JASPAR yes 8059019
chr3 181438241 181438251 SP1 JASPAR yes 71095204
chr3 181438243 181438253 ZNF740 JASPAR yes 8059020
chr3 181438243 181438253 ZNF740 JASPAR yes 71095205
chr3 181438251 181438261 TFE3 JASPAR yes 8059021
chr3 181438251 181438261 TFE3 JASPAR yes 71095206
chr3 181438252 181438264 CREB1 JASPAR yes 8059022
chr3 181438252 181438264 CREB1 JASPAR yes 71095207
chr3 181438254 181438268 ATF7 JASPAR yes 8059023
chr3 181438254 181438268 BATF3 JASPAR yes 8059024
chr3 181438254 181438268 ATF7 JASPAR yes 71095208
chr3 181438254 181438268 BATF3 JASPAR yes 71095209
chr3 181438255 181438267 JDP2 JASPAR yes 8059025
chr3 181438255 181438267 JDP2 JASPAR yes 71095210
chr3 181438257 181438262 ATF1 TRANSFAC yes 8059026
chr3 181438257 181438262 ATF1 TRANSFAC yes 71095211
chr3 181438257 181438265 CREB1 JASPAR yes 8059027
chr3 181438257 181438265 CREB1 JASPAR yes 71095212
chr3 181438259 181438264 ATF1 TRANSFAC yes 8059028
chr3 181438259 181438264 ATF1 TRANSFAC yes 71095213
chr3 181438266 181438279 TFAP2A JASPAR yes 8059029
chr3 181438266 181438279 TFAP2B JASPAR yes 8059030
chr3 181438266 181438279 TFAP2C JASPAR yes 8059031
chr3 181438266 181438279 TFAP2A JASPAR yes 71095214
chr3 181438266 181438279 TFAP2B JASPAR yes 71095215
chr3 181438266 181438279 TFAP2C JASPAR yes 71095216
chr3 181438291 181438302 DUX4 JASPAR yes 8059032
chr3 181438291 181438302 DUX4 JASPAR yes 71095217
chr3 181438300 181438315 HSF1 JASPAR yes 8059033
chr3 181438300 181438315 HSF1 JASPAR yes 71095218
chr3 181438301 181438314 HSF1 JASPAR yes 8059034
chr3 181438301 181438314 HSF2 JASPAR yes 8059035
chr3 181438301 181438314 HSF4 JASPAR yes 8059036
chr3 181438301 181438314 HSF1 JASPAR yes 71095219
chr3 181438301 181438314 HSF2 JASPAR yes 71095220
chr3 181438301 181438314 HSF4 JASPAR yes 71095221
chr3 181438315 181438319 LFA1 TRANSFAC yes 8059037
chr3 181438315 181438319 LFA1 TRANSFAC yes 71095222
chr3 181438370 181438380 SP1 JASPAR yes 8059038
chr3 181438370 181438380 SP1 JASPAR yes 71095223
chr3 181438385 181438396 NFKB1 JASPAR yes 8059039
chr3 181438385 181438396 NFKB1 JASPAR yes 71095224
chr3 181438397 181438409 INSM1 JASPAR yes 8059040
chr3 181438397 181438409 INSM1 JASPAR yes 71095225
chr3 181438407 181438412 SP1 TRANSFAC yes 8059041
chr3 181438407 181438412 SP1 TRANSFAC yes 71095226
chr3 181438407 181438413 SP1 TRANSFAC yes 8059042
chr3 181438407 181438413 SP1 TRANSFAC yes 71095227
chr3 181438407 181438414 SP1 TRANSFAC yes 8059043
chr3 181438407 181438414 SP1 TRANSFAC yes 71095228
chr3 181438410 181438424 PLAG1 JASPAR yes 8059044
chr3 181438410 181438424 PLAG1 JASPAR yes 71095229
chr3 181438419 181438429 SP1 JASPAR yes 8059045
chr3 181438419 181438429 SP1 JASPAR yes 71095230
chr3 181438434 181438449 RUNX2 JASPAR yes 8059046
chr3 181438434 181438449 RUNX2 JASPAR yes 71095231
chr3 181438435 181438438 MYB TRANSFAC yes 8059047
chr3 181438435 181438438 MYB TRANSFAC yes 71095232
chr3 181438435 181438445 RUNX3 JASPAR yes 8059048
chr3 181438435 181438445 RUNX3 JASPAR yes 71095233
chr3 181438435 181438446 RUNX1 JASPAR yes 8059049
chr3 181438435 181438446 RUNX1 JASPAR yes 71095234
chr3 181438451 181438454 MYB TRANSFAC yes 8059050
chr3 181438451 181438454 MYB TRANSFAC yes 71095235
chr3 181438451 181438467 ZNF143 JASPAR yes 8059051
chr3 181438451 181438467 ZNF143 JASPAR yes 71095236
chr3 181438456 181438464 OTX2 JASPAR yes 8059052
chr3 181438456 181438464 OTX2 JASPAR yes 71095237
chr3 181438463 181438470 NKX3-1 JASPAR yes 8059053
chr3 181438463 181438470 NKX3-1 JASPAR yes 71095238
chr3 181438504 181438509 SP1 TRANSFAC yes 8059054
chr3 181438504 181438509 SP1 TRANSFAC yes 71095239
chr3 181438513 181438528 MEF2A JASPAR yes 8059055
chr3 181438513 181438528 MEF2A JASPAR yes 71095240
chr3 181438520 181438528 FOXL1 JASPAR yes 8059056
chr3 181438520 181438528 FOXL1 JASPAR yes 71095241
chr3 181438524 181438537 POU3F3 JASPAR yes 8059057
chr3 181438524 181438537 POU3F3 JASPAR yes 71095242
chr3 181438525 181438537 POU3F1 JASPAR yes 8059058
chr3 181438525 181438537 POU3F2 JASPAR yes 8059059
chr3 181438525 181438537 POU3F1 JASPAR yes 71095243
chr3 181438525 181438537 POU3F2 JASPAR yes 71095244
chr3 181438528 181438540 FOXI1 JASPAR yes 8059060
chr3 181438528 181438540 FOXI1 JASPAR yes 71095245
chr3 181438531 181438535 YY1 TRANSFAC yes 8059061
chr3 181438531 181438535 YY1 TRANSFAC yes 71095246
chr3 181438543 181438554 RUNX1 JASPAR yes 8059062
chr3 181438543 181438554 RUNX1 JASPAR yes 71095247
SNP sites on vista43359[chr3:181438058-181438556]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr3 181438149 rs527275458 A G
CTCF RREB1
7235266
chr3 181438414 rs182582180 C G
PLAG1 SP1
7235267
chr3 181438531 rs187238832 T A
FOXI1 POU3F1 POU3F2 POU3F3 YY1
7235268
Genes possibly regulated by vista43359[chr3:181438058-181438556]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr3 181429714 181432221 + SOX2 ENSG00000181449.2 181429714 0.93 0.94 4305 91656
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista43359[chr3:181438058-181438556]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results