EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista44052[chr4:7208150-7208325]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista44052[chr4:7208150-7208325]
Back to top
Tissue distribution of vista44052
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista44052[chr4:7208150-7208325]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr4 7208159 7208163 NFE TRANSFAC yes 49197413
chr4 7208159 7208163 NFE TRANSFAC yes 88094466
chr4 7208184 7208204 ESR1 JASPAR yes 49197414
chr4 7208184 7208204 ESR1 JASPAR yes 88094467
chr4 7208197 7208211 TLX1 JASPAR yes 49197415
chr4 7208197 7208211 TLX1 JASPAR yes 88094468
chr4 7208221 7208224 MYB TRANSFAC yes 49197416
chr4 7208221 7208224 MYB TRANSFAC yes 88094469
chr4 7208227 7208232 ETS2 TRANSFAC yes 49197417
chr4 7208227 7208232 ETS2 TRANSFAC yes 88094470
chr4 7208237 7208251 PAX6 JASPAR yes 49197418
chr4 7208237 7208251 PAX6 JASPAR yes 88094471
chr4 7208238 7208241 MYB TRANSFAC yes 49197419
chr4 7208238 7208241 MYB TRANSFAC yes 88094472
chr4 7208243 7208251 HOXA5 JASPAR yes 49197420
chr4 7208243 7208251 HOXA5 JASPAR yes 88094473
chr4 7208244 7208254 EMX1 JASPAR yes 49197421
chr4 7208244 7208254 EMX2 JASPAR yes 49197422
chr4 7208244 7208254 ESX1 JASPAR yes 49197423
chr4 7208244 7208254 GBX1 JASPAR yes 49197424
chr4 7208244 7208254 GBX2 JASPAR yes 49197425
chr4 7208244 7208254 GSX1 JASPAR yes 49197426
chr4 7208244 7208254 GSX2 JASPAR yes 49197427
chr4 7208244 7208254 HESX1 JASPAR yes 49197428
chr4 7208244 7208254 HOXB2 JASPAR yes 49197429
chr4 7208244 7208254 HOXB3 JASPAR yes 49197430
chr4 7208244 7208254 LBX2 JASPAR yes 49197431
chr4 7208244 7208254 LHX2 JASPAR yes 49197432
chr4 7208244 7208254 LHX6 JASPAR yes 49197433
chr4 7208244 7208254 MEOX1 JASPAR yes 49197434
chr4 7208244 7208254 MEOX2 JASPAR yes 49197435
chr4 7208244 7208254 MIXL1 JASPAR yes 49197436
chr4 7208244 7208254 MNX1 JASPAR yes 49197437
chr4 7208244 7208254 NOTO JASPAR yes 49197438
chr4 7208244 7208254 POU6F1 JASPAR yes 49197439
chr4 7208244 7208254 RAX JASPAR yes 49197440
chr4 7208244 7208254 EMX1 JASPAR yes 88094474
chr4 7208244 7208254 EMX2 JASPAR yes 88094475
chr4 7208244 7208254 ESX1 JASPAR yes 88094476
chr4 7208244 7208254 GBX1 JASPAR yes 88094477
chr4 7208244 7208254 GBX2 JASPAR yes 88094478
chr4 7208244 7208254 GSX1 JASPAR yes 88094479
chr4 7208244 7208254 GSX2 JASPAR yes 88094480
chr4 7208244 7208254 HESX1 JASPAR yes 88094481
chr4 7208244 7208254 HOXB2 JASPAR yes 88094482
chr4 7208244 7208254 HOXB3 JASPAR yes 88094483
chr4 7208244 7208254 LBX2 JASPAR yes 88094484
chr4 7208244 7208254 LHX2 JASPAR yes 88094485
chr4 7208244 7208254 LHX6 JASPAR yes 88094486
chr4 7208244 7208254 MEOX1 JASPAR yes 88094487
chr4 7208244 7208254 MEOX2 JASPAR yes 88094488
chr4 7208244 7208254 MIXL1 JASPAR yes 88094489
chr4 7208244 7208254 MNX1 JASPAR yes 88094490
chr4 7208244 7208254 NOTO JASPAR yes 88094491
chr4 7208244 7208254 POU6F1 JASPAR yes 88094492
chr4 7208244 7208254 RAX JASPAR yes 88094493
chr4 7208245 7208253 BSX JASPAR yes 49197441
chr4 7208245 7208253 DLX6 JASPAR yes 49197442
chr4 7208245 7208253 EN1 JASPAR yes 49197443
chr4 7208245 7208253 ISX JASPAR yes 49197444
chr4 7208245 7208253 LBX1 JASPAR yes 49197445
chr4 7208245 7208253 LHX9 JASPAR yes 49197446
chr4 7208245 7208253 LMX1A JASPAR yes 49197447
chr4 7208245 7208253 LMX1B JASPAR yes 49197448
chr4 7208245 7208253 NKX6-1 JASPAR yes 49197449
chr4 7208245 7208253 NKX6-2 JASPAR yes 49197450
chr4 7208245 7208253 PAX4 JASPAR yes 49197451
chr4 7208245 7208253 PDX1 JASPAR yes 49197452
chr4 7208245 7208253 PRRX1 JASPAR yes 49197453
chr4 7208245 7208253 RAX2 JASPAR yes 49197454
chr4 7208245 7208253 SHOX JASPAR yes 49197455
chr4 7208245 7208253 UNCX JASPAR yes 49197456
chr4 7208245 7208253 VAX1 JASPAR yes 49197457
chr4 7208245 7208253 VAX2 JASPAR yes 49197458
chr4 7208245 7208253 VSX1 JASPAR yes 49197459
chr4 7208245 7208253 VSX2 JASPAR yes 49197460
chr4 7208245 7208253 BSX JASPAR yes 88094494
chr4 7208245 7208253 DLX6 JASPAR yes 88094495
chr4 7208245 7208253 EN1 JASPAR yes 88094496
chr4 7208245 7208253 ISX JASPAR yes 88094497
chr4 7208245 7208253 LBX1 JASPAR yes 88094498
chr4 7208245 7208253 LHX9 JASPAR yes 88094499
chr4 7208245 7208253 LMX1A JASPAR yes 88094500
chr4 7208245 7208253 LMX1B JASPAR yes 88094501
chr4 7208245 7208253 NKX6-1 JASPAR yes 88094502
chr4 7208245 7208253 NKX6-2 JASPAR yes 88094503
chr4 7208245 7208253 PAX4 JASPAR yes 88094504
chr4 7208245 7208253 PDX1 JASPAR yes 88094505
chr4 7208245 7208253 PRRX1 JASPAR yes 88094506
chr4 7208245 7208253 RAX2 JASPAR yes 88094507
chr4 7208245 7208253 SHOX JASPAR yes 88094508
chr4 7208245 7208253 UNCX JASPAR yes 88094509
chr4 7208245 7208253 VAX1 JASPAR yes 88094510
chr4 7208245 7208253 VAX2 JASPAR yes 88094511
chr4 7208245 7208253 VSX1 JASPAR yes 88094512
chr4 7208245 7208253 VSX2 JASPAR yes 88094513
chr4 7208255 7208269 ZIC1 JASPAR yes 49197461
chr4 7208255 7208269 ZIC1 JASPAR yes 88094514
chr4 7208255 7208270 ZIC4 JASPAR yes 49197462
chr4 7208255 7208270 ZIC4 JASPAR yes 88094515
chr4 7208257 7208271 GLIS2 JASPAR yes 49197463
chr4 7208257 7208271 GLIS2 JASPAR yes 88094516
chr4 7208267 7208272 SP1 TRANSFAC yes 49197464
chr4 7208267 7208272 SP1 TRANSFAC yes 88094517
chr4 7208269 7208274 TFAP2A TRANSFAC yes 49197465
chr4 7208269 7208274 TFAP2A TRANSFAC yes 88094518
chr4 7208269 7208275 MZF1 JASPAR yes 49197466
chr4 7208269 7208275 MZF1 JASPAR yes 88094519
chr4 7208270 7208280 GSC2 JASPAR yes 49197467
chr4 7208270 7208280 GSC JASPAR yes 49197468
chr4 7208270 7208280 GSC2 JASPAR yes 88094520
chr4 7208270 7208280 GSC JASPAR yes 88094521
chr4 7208271 7208279 RHOXF1 JASPAR yes 49197469
chr4 7208271 7208279 RHOXF1 JASPAR yes 88094522
chr4 7208271 7208280 PITX3 JASPAR yes 49197470
chr4 7208271 7208280 PITX3 JASPAR yes 88094523
chr4 7208278 7208290 PKNOX2 JASPAR yes 49197471
chr4 7208278 7208290 PKNOX2 JASPAR yes 88094524
chr4 7208301 7208320 RFX2 JASPAR yes 49197472
chr4 7208301 7208320 RFX2 JASPAR yes 88094525
chr4 7208313 7208326 SMAD2 JASPAR yes 49197473
chr4 7208313 7208326 SMAD2 JASPAR yes 88094526
SNP sites on vista44052[chr4:7208150-7208325]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
Genes possibly regulated by vista44052[chr4:7208150-7208325]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr4 7194265 7744554 + SORCS2 ENSG00000184985.12 7194265 0.74 0.99 4518 86115
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista44052[chr4:7208150-7208325]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
chr4 7312223 7312244 + hsa-miR-4798-3p MIMAT0019975 7194294 0.002841011256158521 0.916667 0.0 1227
Expression level of miRNAs
Back to top