EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista46129[chr4:148639177-148639323]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista46129[chr4:148639177-148639323]
Back to top
Tissue distribution of vista46129
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista46129[chr4:148639177-148639323]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr4 148639171 148639181 TBX21 JASPAR yes 49291593
chr4 148639171 148639181 TBX21 JASPAR yes 93513072
chr4 148639171 148639182 TBX20 JASPAR yes 49291594
chr4 148639171 148639182 TBX2 JASPAR yes 49291595
chr4 148639171 148639182 TBX20 JASPAR yes 93513073
chr4 148639171 148639182 TBX2 JASPAR yes 93513074
chr4 148639171 148639184 EOMES JASPAR yes 49291596
chr4 148639171 148639184 EOMES JASPAR yes 93513075
chr4 148639172 148639180 MGA JASPAR yes 49291597
chr4 148639172 148639180 TBX15 JASPAR yes 49291598
chr4 148639172 148639180 TBX1 JASPAR yes 49291599
chr4 148639172 148639180 TBX4 JASPAR yes 49291600
chr4 148639172 148639180 TBX5 JASPAR yes 49291601
chr4 148639172 148639180 MGA JASPAR yes 93513076
chr4 148639172 148639180 TBX15 JASPAR yes 93513077
chr4 148639172 148639180 TBX1 JASPAR yes 93513078
chr4 148639172 148639180 TBX4 JASPAR yes 93513079
chr4 148639172 148639180 TBX5 JASPAR yes 93513080
chr4 148639172 148639182 TBR1 JASPAR yes 49291602
chr4 148639172 148639182 TBR1 JASPAR yes 93513081
chr4 148639183 148639198 RUNX2 JASPAR yes 49291603
chr4 148639183 148639198 RUNX2 JASPAR yes 93513082
chr4 148639184 148639187 MYB TRANSFAC yes 49291604
chr4 148639184 148639187 MYB TRANSFAC yes 93513083
chr4 148639184 148639195 RUNX1 JASPAR yes 49291605
chr4 148639184 148639195 RUNX1 JASPAR yes 93513084
chr4 148639194 148639200 MZF1 JASPAR yes 49291606
chr4 148639194 148639200 MZF1 JASPAR yes 93513085
chr4 148639198 148639216 NR3C1 JASPAR yes 49291607
chr4 148639198 148639216 NR3C1 JASPAR yes 93513086
chr4 148639207 148639227 TP53 JASPAR yes 49291608
chr4 148639207 148639227 TP53 JASPAR yes 93513087
chr4 148639210 148639220 RORA JASPAR yes 49291609
chr4 148639210 148639220 RORA JASPAR yes 93513088
chr4 148639211 148639222 ESRRA JASPAR yes 49291610
chr4 148639211 148639222 ESRRB JASPAR yes 49291611
chr4 148639211 148639222 ESRRA JASPAR yes 93513089
chr4 148639211 148639222 ESRRB JASPAR yes 93513090
chr4 148639215 148639219 ESR1 TRANSFAC yes 49291612
chr4 148639215 148639219 ESR1 TRANSFAC yes 93513091
chr4 148639227 148639248 IRF1 JASPAR yes 49291613
chr4 148639227 148639248 IRF1 JASPAR yes 93513092
chr4 148639232 148639247 FOXP1 JASPAR yes 49291614
chr4 148639232 148639247 FOXP1 JASPAR yes 93513093
chr4 148639233 148639254 IRF1 JASPAR yes 49291615
chr4 148639233 148639254 IRF1 JASPAR yes 93513094
chr4 148639254 148639265 STAT1 JASPAR yes 49291616
chr4 148639254 148639265 STAT3 JASPAR yes 49291617
chr4 148639254 148639265 STAT1 JASPAR yes 93513095
chr4 148639254 148639265 STAT3 JASPAR yes 93513096
chr4 148639262 148639277 JUND JASPAR yes 49291618
chr4 148639262 148639277 JUND JASPAR yes 93513097
chr4 148639263 148639276 JUN JASPAR yes 49291619
chr4 148639263 148639276 JUN JASPAR yes 93513098
chr4 148639264 148639277 ATF4 JASPAR yes 49291620
chr4 148639264 148639277 ATF4 JASPAR yes 93513099
chr4 148639264 148639278 ATF7 JASPAR yes 49291621
chr4 148639264 148639278 ATF7 JASPAR yes 93513100
chr4 148639265 148639277 DBP JASPAR yes 49291622
chr4 148639265 148639277 HLF JASPAR yes 49291623
chr4 148639265 148639277 JDP2 JASPAR yes 49291624
chr4 148639265 148639277 TEF JASPAR yes 49291625
chr4 148639265 148639277 DBP JASPAR yes 93513101
chr4 148639265 148639277 HLF JASPAR yes 93513102
chr4 148639265 148639277 JDP2 JASPAR yes 93513103
chr4 148639265 148639277 TEF JASPAR yes 93513104
chr4 148639266 148639277 CEBPB JASPAR yes 49291626
chr4 148639266 148639277 CEBPB JASPAR yes 93513105
chr4 148639267 148639278 NFIL3 JASPAR yes 49291627
chr4 148639267 148639278 NFIL3 JASPAR yes 93513106
chr4 148639276 148639281 MYB TRANSFAC yes 49291628
chr4 148639276 148639281 MYB TRANSFAC yes 93513107
chr4 148639281 148639295 GATA2 JASPAR yes 49291629
chr4 148639281 148639295 GATA2 JASPAR yes 93513108
chr4 148639282 148639303 IRF1 JASPAR yes 49291630
chr4 148639282 148639303 IRF1 JASPAR yes 93513109
chr4 148639283 148639290 GATA3 TRANSFAC yes 49291631
chr4 148639283 148639290 GATA3 TRANSFAC yes 93513110
chr4 148639283 148639291 GATA5 JASPAR yes 49291632
chr4 148639283 148639291 GATA5 JASPAR yes 93513111
chr4 148639286 148639289 MYB TRANSFAC yes 49291633
chr4 148639286 148639289 MYB TRANSFAC yes 93513112
chr4 148639286 148639301 PRDM1 JASPAR yes 49291634
chr4 148639286 148639301 PRDM1 JASPAR yes 93513113
chr4 148639288 148639309 IRF1 JASPAR yes 49291635
chr4 148639288 148639309 IRF1 JASPAR yes 93513114
chr4 148639292 148639306 SPI1 JASPAR yes 49291636
chr4 148639292 148639306 SPI1 JASPAR yes 93513115
chr4 148639292 148639307 STAT2 JASPAR yes 49291637
chr4 148639292 148639307 STAT2 JASPAR yes 93513116
chr4 148639304 148639307 MYB TRANSFAC yes 49291638
chr4 148639304 148639307 MYB TRANSFAC yes 93513117
SNP sites on vista46129[chr4:148639177-148639323]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
Genes possibly regulated by vista46129[chr4:148639177-148639323]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr4 148558936 148605381 - PRMT10 ENSG00000164169.8 148605381 0.71 0.99 5054 66204
chr4 148653214 148993931 + ARHGAP10 ENSG00000071205.7 148653214 0.85 1.0 5055 86109
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista46129[chr4:148639177-148639323]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
chr4 148703790 148703811 + hsa-miR-4799-3p MIMAT0019977 148653238 0.007591344448385952 0.887154 0.0 1272
Expression level of miRNAs
Back to top