EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista46140[chr4:148752985-148753384]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista46140[chr4:148752985-148753384]
Back to top
Tissue distribution of vista46140
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista46140[chr4:148752985-148753384]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr4 148752917 148753298 JUN UCSC Txn Factor no Conserved 108533641
chr4 148752929 148753221 FOS UCSC Txn Factor no Conserved 108533642
chr4 148752988 148753198 FOSL2 UCSC Txn Factor no Conserved 108533643
chr4 148752981 148752992 BATF JASPAR yes 49292095
chr4 148752981 148752992 BATF JASPAR yes 93528615
chr4 148752983 148753003 PPARG JASPAR yes 49292096
chr4 148752983 148753003 PPARG JASPAR yes 93528616
chr4 148753013 148753017 NFE TRANSFAC yes 49292097
chr4 148753013 148753017 NFE TRANSFAC yes 93528617
chr4 148753033 148753044 STAT3 JASPAR yes 49292098
chr4 148753033 148753044 STAT3 JASPAR yes 93528618
chr4 148753053 148753064 FOSL2 JASPAR yes 49292099
chr4 148753053 148753064 JUNB JASPAR yes 49292100
chr4 148753053 148753064 FOSL2 JASPAR yes 93528619
chr4 148753053 148753064 JUNB JASPAR yes 93528620
chr4 148753054 148753065 FOS JASPAR yes 49292101
chr4 148753054 148753065 FOSL1 JASPAR yes 49292102
chr4 148753054 148753065 JUND JASPAR yes 49292103
chr4 148753054 148753065 NFE2 JASPAR yes 49292104
chr4 148753054 148753065 FOS JASPAR yes 93528621
chr4 148753054 148753065 FOSL1 JASPAR yes 93528622
chr4 148753054 148753065 JUND JASPAR yes 93528623
chr4 148753054 148753065 NFE2 JASPAR yes 93528624
chr4 148753055 148753064 JDP2 JASPAR yes 49292105
chr4 148753055 148753064 JDP2 JASPAR yes 93528625
chr4 148753055 148753066 JUNB JASPAR yes 49292106
chr4 148753055 148753066 JUNB JASPAR yes 93528626
chr4 148753055 148753069 JUN JASPAR yes 49292107
chr4 148753055 148753069 JUN JASPAR yes 93528627
chr4 148753056 148753067 BATF JASPAR yes 49292108
chr4 148753056 148753067 BATF JASPAR yes 93528628
chr4 148753056 148753071 AR JASPAR yes 49292109
chr4 148753056 148753071 AR JASPAR yes 93528629
chr4 148753073 148753087 JUN JASPAR yes 49292110
chr4 148753073 148753087 JUN JASPAR yes 93528630
chr4 148753076 148753087 FOSL2 JASPAR yes 49292111
chr4 148753076 148753087 JUNB JASPAR yes 49292112
chr4 148753076 148753087 FOSL2 JASPAR yes 93528631
chr4 148753076 148753087 JUNB JASPAR yes 93528632
chr4 148753077 148753088 FOS JASPAR yes 49292113
chr4 148753077 148753088 FOSL1 JASPAR yes 49292114
chr4 148753077 148753088 JUND JASPAR yes 49292115
chr4 148753077 148753088 NFE2 JASPAR yes 49292116
chr4 148753077 148753088 FOS JASPAR yes 93528633
chr4 148753077 148753088 FOSL1 JASPAR yes 93528634
chr4 148753077 148753088 JUND JASPAR yes 93528635
chr4 148753077 148753088 NFE2 JASPAR yes 93528636
chr4 148753078 148753085 JUN TRANSFAC yes 49292117
chr4 148753078 148753085 JUN TRANSFAC yes 93528637
chr4 148753078 148753087 JDP2 JASPAR yes 49292118
chr4 148753078 148753087 JDP2 JASPAR yes 93528638
chr4 148753078 148753089 FOSL2 JASPAR yes 49292119
chr4 148753078 148753089 JUNB JASPAR yes 49292120
chr4 148753078 148753089 FOSL2 JASPAR yes 93528639
chr4 148753078 148753089 JUNB JASPAR yes 93528640
chr4 148753078 148753092 JUN JASPAR yes 49292121
chr4 148753078 148753092 JUN JASPAR yes 93528641
chr4 148753079 148753090 BATF JASPAR yes 49292122
chr4 148753079 148753090 BATF JASPAR yes 93528642
chr4 148753080 148753090 POU6F2 JASPAR yes 49292123
chr4 148753080 148753090 POU6F2 JASPAR yes 93528643
chr4 148753081 148753091 MEOX1 JASPAR yes 49292124
chr4 148753081 148753091 MEOX1 JASPAR yes 93528644
chr4 148753082 148753096 POU1F1 JASPAR yes 49292125
chr4 148753082 148753096 POU1F1 JASPAR yes 93528645
chr4 148753084 148753088 YY1 TRANSFAC yes 49292126
chr4 148753084 148753088 YY1 TRANSFAC yes 93528646
chr4 148753125 148753138 ELF3 JASPAR yes 49292127
chr4 148753125 148753138 ELF3 JASPAR yes 93528647
chr4 148753126 148753137 ELF5 JASPAR yes 49292128
chr4 148753126 148753137 ELF5 JASPAR yes 93528648
chr4 148753126 148753138 EHF JASPAR yes 49292129
chr4 148753126 148753138 EHF JASPAR yes 93528649
chr4 148753146 148753150 YY1 TRANSFAC yes 49292130
chr4 148753146 148753150 YY1 TRANSFAC yes 93528650
chr4 148753146 148753159 ELF1 JASPAR yes 49292131
chr4 148753146 148753159 ELF1 JASPAR yes 93528651
chr4 148753147 148753155 FEV JASPAR yes 49292132
chr4 148753147 148753155 FEV JASPAR yes 93528652
chr4 148753162 148753167 GATA2 JASPAR yes 49292133
chr4 148753162 148753167 GATA2 JASPAR yes 93528653
chr4 148753182 148753199 BCL6B JASPAR yes 49292134
chr4 148753182 148753199 BCL6B JASPAR yes 93528654
chr4 148753212 148753233 ZNF263 JASPAR yes 49292135
chr4 148753212 148753233 ZNF263 JASPAR yes 93528655
chr4 148753216 148753228 INSM1 JASPAR yes 49292136
chr4 148753216 148753228 INSM1 JASPAR yes 93528656
chr4 148753219 148753233 PLAG1 JASPAR yes 49292137
chr4 148753219 148753233 PLAG1 JASPAR yes 93528657
chr4 148753226 148753232 NFE2 TRANSFAC yes 49292138
chr4 148753226 148753232 NFE2 TRANSFAC yes 93528658
chr4 148753228 148753237 SP1 TRANSFAC yes 49292139
chr4 148753228 148753237 SP1 TRANSFAC yes 93528659
chr4 148753229 148753235 SP1 TRANSFAC yes 49292140
chr4 148753229 148753235 SP1 TRANSFAC yes 93528660
chr4 148753231 148753236 SP1 TRANSFAC yes 49292141
chr4 148753231 148753236 SP1 TRANSFAC yes 93528661
chr4 148753239 148753259 RREB1 JASPAR yes 49292142
chr4 148753239 148753259 RREB1 JASPAR yes 93528662
chr4 148753242 148753262 RREB1 JASPAR yes 49292143
chr4 148753242 148753262 RREB1 JASPAR yes 93528663
chr4 148753243 148753263 RREB1 JASPAR yes 49292144
chr4 148753243 148753263 RREB1 JASPAR yes 93528664
chr4 148753246 148753266 RREB1 JASPAR yes 49292145
chr4 148753246 148753266 RREB1 JASPAR yes 93528665
chr4 148753247 148753267 RREB1 JASPAR yes 49292146
chr4 148753247 148753267 RREB1 JASPAR yes 93528666
chr4 148753249 148753269 RREB1 JASPAR yes 49292147
chr4 148753249 148753269 RREB1 JASPAR yes 93528667
chr4 148753250 148753265 RUNX2 JASPAR yes 49292148
chr4 148753250 148753265 RUNX2 JASPAR yes 93528668
chr4 148753251 148753271 RREB1 JASPAR yes 49292149
chr4 148753251 148753271 RREB1 JASPAR yes 93528669
chr4 148753272 148753284 TEAD1 JASPAR yes 49292150
chr4 148753272 148753284 TEAD1 JASPAR yes 93528670
chr4 148753278 148753289 DMRT3 JASPAR yes 49292151
chr4 148753278 148753289 DMRT3 JASPAR yes 93528671
chr4 148753282 148753285 MYB TRANSFAC yes 49292152
chr4 148753282 148753285 MYB TRANSFAC yes 93528672
chr4 148753291 148753295 YY1 TRANSFAC yes 49292153
chr4 148753291 148753295 YY1 TRANSFAC yes 93528673
chr4 148753292 148753303 HOXA10 JASPAR yes 49292154
chr4 148753292 148753303 HOXA10 JASPAR yes 93528674
chr4 148753293 148753303 MNX1 JASPAR yes 49292155
chr4 148753293 148753303 MNX1 JASPAR yes 93528675
chr4 148753294 148753302 BARX1 JASPAR yes 49292156
chr4 148753294 148753302 BARX1 JASPAR yes 93528676
chr4 148753315 148753328 DUXA JASPAR yes 49292157
chr4 148753315 148753328 DUXA JASPAR yes 93528677
chr4 148753316 148753327 DUX4 JASPAR yes 49292158
chr4 148753316 148753327 PHOX2A JASPAR yes 49292159
chr4 148753316 148753327 PROP1 JASPAR yes 49292160
chr4 148753316 148753327 DUX4 JASPAR yes 93528678
chr4 148753316 148753327 PHOX2A JASPAR yes 93528679
chr4 148753316 148753327 PROP1 JASPAR yes 93528680
chr4 148753330 148753344 MTF1 JASPAR yes 49292161
chr4 148753330 148753344 MTF1 JASPAR yes 93528681
chr4 148753337 148753349 NHLH1 JASPAR yes 49292162
chr4 148753337 148753349 NHLH1 JASPAR yes 93528682
chr4 148753337 148753358 MAFG JASPAR yes 49292163
chr4 148753337 148753358 MAFG JASPAR yes 93528683
chr4 148753369 148753373 YY1 TRANSFAC yes 49292164
chr4 148753369 148753373 YY1 TRANSFAC yes 93528684
SNP sites on vista46140[chr4:148752985-148753384]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr4 148753056 rs17023933 A C,G
AR BATF FOS FOSL1 FOSL2 JDP2 JUN JUNB JUND NFE2
7872497
chr4 148753223 rs199842614 CT C
INSM1 JUN PLAG1 ZNF263
7872498
chr4 148753233 rs10018553 C T
JUN PLAG1 SP1 ZNF263
7872499
chr4 148753235 rs893022 C A,G,T
JUN SP1
7872500
chr4 148753309 rs144317273 C T no 7872501
chr4 148753310 rs9996108 A G no 7872502
chr4 148753352 rs10018903 G A,T
MAFG
7872503
Genes possibly regulated by vista46140[chr4:148752985-148753384]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr4 148653214 148993931 + ARHGAP10 ENSG00000071205.7 148653214 0.85 1.0 5055 229
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista46140[chr4:148752985-148753384]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results