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  3. vista4641[chr1:203506114-203506504]
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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4641[chr1:203506114-203506504]
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Tissue distribution of vista4641
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Transcription factor that possibly regulate vista4641[chr1:203506114-203506504]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 203505895 203506660 TCF7L2 UCSC Txn Factor no Conserved 107859018
chr1 203506010 203506441 CEBPB UCSC Txn Factor no Conserved 107859028
chr1 203506053 203506478 EP300 UCSC Txn Factor no Conserved 107859038
chr1 203506080 203506360 STAT3 UCSC Txn Factor no Conserved 107859045
chr1 203506169 203506445 JUND UCSC Txn Factor no Conserved 107859056
chr1 203506113 203506134 ZNF263 JASPAR yes 34636682
chr1 203506113 203506134 ZNF263 JASPAR yes 118436122
chr1 203506117 203506132 PRDM1 JASPAR yes 34636683
chr1 203506117 203506132 PRDM1 JASPAR yes 118436123
chr1 203506118 203506122 YY1 TRANSFAC yes 34636684
chr1 203506118 203506122 YY1 TRANSFAC yes 118436124
chr1 203506118 203506132 STAT1 JASPAR yes 34636685
chr1 203506118 203506132 STAT1 JASPAR yes 118436125
chr1 203506125 203506133 EHF JASPAR yes 34636686
chr1 203506125 203506133 EHF JASPAR yes 118436126
chr1 203506127 203506132 ETS2 TRANSFAC yes 34636687
chr1 203506127 203506132 ETS2 TRANSFAC yes 118436127
chr1 203506130 203506141 TBX20 JASPAR yes 34636688
chr1 203506130 203506141 TBX20 JASPAR yes 118436128
chr1 203506131 203506141 TBX21 JASPAR yes 34636689
chr1 203506131 203506141 TBX21 JASPAR yes 118436129
chr1 203506151 203506163 HLF JASPAR yes 34636690
chr1 203506151 203506163 HLF JASPAR yes 118436130
chr1 203506152 203506162 CEBPG JASPAR yes 34636691
chr1 203506152 203506162 CEBPG JASPAR yes 118436131
chr1 203506171 203506182 CEBPA JASPAR yes 34636692
chr1 203506171 203506182 CEBPA JASPAR yes 118436132
chr1 203506172 203506182 CEBPB JASPAR yes 34636693
chr1 203506172 203506182 CEBPE JASPAR yes 34636694
chr1 203506172 203506182 CEBPG JASPAR yes 34636695
chr1 203506172 203506182 CEBPB JASPAR yes 118436133
chr1 203506172 203506182 CEBPE JASPAR yes 118436134
chr1 203506172 203506182 CEBPG JASPAR yes 118436135
chr1 203506172 203506183 CEBPB JASPAR yes 34636696
chr1 203506172 203506183 CEBPB JASPAR yes 118436136
chr1 203506175 203506179 LFA1 TRANSFAC yes 34636697
chr1 203506175 203506179 LFA1 TRANSFAC yes 118436137
chr1 203506214 203506225 STAT1 JASPAR yes 34636698
chr1 203506214 203506225 STAT3 JASPAR yes 34636699
chr1 203506214 203506225 STAT1 JASPAR yes 118436138
chr1 203506214 203506225 STAT3 JASPAR yes 118436139
chr1 203506216 203506229 HSF4 JASPAR yes 34636700
chr1 203506216 203506229 HSF4 JASPAR yes 118436140
chr1 203506220 203506235 HSF1 JASPAR yes 34636701
chr1 203506220 203506235 HSF1 JASPAR yes 118436141
chr1 203506225 203506241 SOX4 JASPAR yes 34636702
chr1 203506225 203506241 SOX4 JASPAR yes 118436142
chr1 203506233 203506251 MAFF JASPAR yes 34636703
chr1 203506233 203506251 MAFF JASPAR yes 118436143
chr1 203506242 203506248 GATA1 TRANSFAC yes 34636704
chr1 203506242 203506248 GATA1 TRANSFAC yes 118436144
chr1 203506242 203506250 GATA5 JASPAR yes 34636705
chr1 203506242 203506250 GATA5 JASPAR yes 118436145
chr1 203506247 203506264 RARA JASPAR yes 34636706
chr1 203506247 203506264 RARA JASPAR yes 118436146
chr1 203506248 203506252 LFA1 TRANSFAC yes 34636707
chr1 203506248 203506252 LFA1 TRANSFAC yes 118436147
chr1 203506264 203506275 CEBPA JASPAR yes 34636708
chr1 203506264 203506275 CEBPA JASPAR yes 118436148
chr1 203506273 203506294 IRF1 JASPAR yes 34636709
chr1 203506273 203506294 IRF1 JASPAR yes 118436149
chr1 203506277 203506292 PRDM1 JASPAR yes 34636710
chr1 203506277 203506292 STAT2 JASPAR yes 34636711
chr1 203506277 203506292 PRDM1 JASPAR yes 118436150
chr1 203506277 203506292 STAT2 JASPAR yes 118436151
chr1 203506286 203506300 BATF3 JASPAR yes 34636712
chr1 203506286 203506300 BATF3 JASPAR yes 118436152
chr1 203506288 203506306 MAFF JASPAR yes 34636713
chr1 203506288 203506306 MAFF JASPAR yes 118436153
chr1 203506291 203506304 JUN JASPAR yes 34636714
chr1 203506291 203506304 JUN JASPAR yes 118436154
chr1 203506293 203506304 NRL JASPAR yes 34636715
chr1 203506293 203506304 NRL JASPAR yes 118436155
chr1 203506308 203506321 DUXA JASPAR yes 34636716
chr1 203506308 203506321 DUXA JASPAR yes 118436156
chr1 203506309 203506320 DUX4 JASPAR yes 34636717
chr1 203506309 203506320 DUX4 JASPAR yes 118436157
chr1 203506316 203506330 JUN JASPAR yes 34636718
chr1 203506316 203506330 JUN JASPAR yes 118436158
chr1 203506319 203506330 FOSL2 JASPAR yes 34636719
chr1 203506319 203506330 JUNB JASPAR yes 34636720
chr1 203506319 203506330 FOSL2 JASPAR yes 118436159
chr1 203506319 203506330 JUNB JASPAR yes 118436160
chr1 203506320 203506331 FOS JASPAR yes 34636721
chr1 203506320 203506331 FOSL1 JASPAR yes 34636722
chr1 203506320 203506331 JUND JASPAR yes 34636723
chr1 203506320 203506331 NFE2 JASPAR yes 34636724
chr1 203506320 203506331 FOS JASPAR yes 118436161
chr1 203506320 203506331 FOSL1 JASPAR yes 118436162
chr1 203506320 203506331 JUND JASPAR yes 118436163
chr1 203506320 203506331 NFE2 JASPAR yes 118436164
chr1 203506321 203506330 JDP2 JASPAR yes 34636725
chr1 203506321 203506330 JDP2 JASPAR yes 118436165
chr1 203506321 203506332 FOSL2 JASPAR yes 34636726
chr1 203506321 203506332 JUNB JASPAR yes 34636727
chr1 203506321 203506332 FOSL2 JASPAR yes 118436166
chr1 203506321 203506332 JUNB JASPAR yes 118436167
chr1 203506327 203506339 GLI2 JASPAR yes 34636728
chr1 203506327 203506339 ZBTB7B JASPAR yes 34636729
chr1 203506327 203506339 ZBTB7C JASPAR yes 34636730
chr1 203506327 203506339 GLI2 JASPAR yes 118436168
chr1 203506327 203506339 ZBTB7B JASPAR yes 118436169
chr1 203506327 203506339 ZBTB7C JASPAR yes 118436170
chr1 203506328 203506340 ZBTB7A JASPAR yes 34636731
chr1 203506328 203506340 ZBTB7A JASPAR yes 118436171
chr1 203506336 203506342 TCF4 TRANSFAC yes 34636732
chr1 203506336 203506342 TCF4 TRANSFAC yes 118436172
chr1 203506349 203506363 PLAG1 JASPAR yes 34636733
chr1 203506349 203506363 PLAG1 JASPAR yes 118436173
chr1 203506357 203506372 NR2C2 JASPAR yes 34636734
chr1 203506357 203506372 NR2C2 JASPAR yes 118436174
chr1 203506366 203506387 ZNF263 JASPAR yes 34636735
chr1 203506366 203506387 ZNF263 JASPAR yes 118436175
chr1 203506369 203506390 ZNF263 JASPAR yes 34636736
chr1 203506369 203506390 ZNF263 JASPAR yes 118436176
chr1 203506370 203506391 ZNF263 JASPAR yes 34636737
chr1 203506370 203506391 ZNF263 JASPAR yes 118436177
chr1 203506392 203506401 NFIX JASPAR yes 34636738
chr1 203506392 203506401 NFIX JASPAR yes 118436178
chr1 203506392 203506402 NFIA JASPAR yes 34636739
chr1 203506392 203506402 NFIA JASPAR yes 118436179
chr1 203506394 203506400 NFIC JASPAR yes 34636740
chr1 203506394 203506400 NFIC JASPAR yes 118436180
chr1 203506399 203506414 HNF4G JASPAR yes 34636741
chr1 203506399 203506414 HNF4G JASPAR yes 118436181
chr1 203506400 203506414 NR2F1 JASPAR yes 34636742
chr1 203506400 203506414 NR2F1 JASPAR yes 118436182
chr1 203506400 203506415 HNF4A JASPAR yes 34636743
chr1 203506400 203506415 HNF4A JASPAR yes 118436183
chr1 203506412 203506427 RFX5 JASPAR yes 34636744
chr1 203506412 203506427 RFX5 JASPAR yes 118436184
chr1 203506414 203506430 RFX5 JASPAR yes 34636745
chr1 203506414 203506430 RFX5 JASPAR yes 118436185
chr1 203506421 203506426 MYB TRANSFAC yes 34636746
chr1 203506421 203506426 MYB TRANSFAC yes 118436186
chr1 203506437 203506442 NFY TRANSFAC yes 34636747
chr1 203506437 203506442 NFY TRANSFAC yes 118436187
chr1 203506447 203506458 STAT1 JASPAR yes 34636748
chr1 203506447 203506458 STAT3 JASPAR yes 34636749
chr1 203506447 203506458 STAT1 JASPAR yes 118436188
chr1 203506447 203506458 STAT3 JASPAR yes 118436189
chr1 203506448 203506461 TFAP2A JASPAR yes 34636750
chr1 203506448 203506461 TFAP2B JASPAR yes 34636751
chr1 203506448 203506461 TFAP2C JASPAR yes 34636752
chr1 203506448 203506461 TFAP2A JASPAR yes 118436190
chr1 203506448 203506461 TFAP2B JASPAR yes 118436191
chr1 203506448 203506461 TFAP2C JASPAR yes 118436192
chr1 203506452 203506457 ETS2 TRANSFAC yes 34636753
chr1 203506452 203506457 ETS2 TRANSFAC yes 118436193
chr1 203506486 203506498 POU2F1 JASPAR yes 34636754
chr1 203506486 203506498 POU2F1 JASPAR yes 118436194
chr1 203506486 203506499 POU3F3 JASPAR yes 34636755
chr1 203506486 203506499 POU3F3 JASPAR yes 118436195
chr1 203506486 203506500 POU1F1 JASPAR yes 34636756
chr1 203506486 203506500 POU1F1 JASPAR yes 118436196
chr1 203506487 203506499 POU3F1 JASPAR yes 34636757
chr1 203506487 203506499 POU3F2 JASPAR yes 34636758
chr1 203506487 203506499 POU3F1 JASPAR yes 118436197
chr1 203506487 203506499 POU3F2 JASPAR yes 118436198
chr1 203506488 203506497 POU3F4 JASPAR yes 34636759
chr1 203506488 203506497 POU5F1B JASPAR yes 34636760
chr1 203506488 203506497 POU3F4 JASPAR yes 118436199
chr1 203506488 203506497 POU5F1B JASPAR yes 118436200
chr1 203506491 203506501 EMX1 JASPAR yes 34636761
chr1 203506491 203506501 EVX1 JASPAR yes 34636762
chr1 203506491 203506501 EVX2 JASPAR yes 34636763
chr1 203506491 203506501 HOXA2 JASPAR yes 34636764
chr1 203506491 203506501 HOXB2 JASPAR yes 34636765
chr1 203506491 203506501 HOXB3 JASPAR yes 34636766
chr1 203506491 203506501 NOTO JASPAR yes 34636767
chr1 203506491 203506501 EMX1 JASPAR yes 118436201
chr1 203506491 203506501 EVX1 JASPAR yes 118436202
chr1 203506491 203506501 EVX2 JASPAR yes 118436203
chr1 203506491 203506501 HOXA2 JASPAR yes 118436204
chr1 203506491 203506501 HOXB2 JASPAR yes 118436205
chr1 203506491 203506501 HOXB3 JASPAR yes 118436206
chr1 203506491 203506501 NOTO JASPAR yes 118436207
chr1 203506492 203506502 POU6F2 JASPAR yes 34636768
chr1 203506492 203506502 POU6F2 JASPAR yes 118436208
chr1 203506497 203506515 RARA JASPAR yes 34636769
chr1 203506497 203506515 RARA JASPAR yes 118436209
SNP sites on vista4641[chr1:203506114-203506504]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 203506286 rs541327430 A G,T
BATF3 CEBPB EP300 IRF1 JUND PRDM1 STAT2 STAT3 TCF7L2
869061
chr1 203506380 rs115687397 G A
CEBPB EP300 JUND TCF7L2 ZNF263
869062
chr1 203506405 rs570158202 C T
CEBPB EP300 HNF4A HNF4G JUND NR2F1 TCF7L2
869063
chr1 203506437 rs552569120 T C
CEBPB EP300 JUND NFY TCF7L2
869064
chr1 203506452 rs566087170 C T
EP300 ETS2 STAT1 STAT3 TCF7L2 TFAP2A TFAP2B TFAP2C
869065
Genes possibly regulated by vista4641[chr1:203506114-203506504]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 203444956 203460480 + PRELP ENSG00000188783.5 203444956 0.8 0.78 1739 38842
chr1 203463271 203477992 + OPTC ENSG00000188770.5 203463271 0.94 1.0 1740 57157
chr1 203595689 203713209 + ATP2B4 ENSG00000058668.10 203595689 0.84 1.0 1741 10815
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista4641[chr1:203506114-203506504]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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No results