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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4678[chr1:204289566-204289863]
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Tissue distribution of vista4678
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Transcription factor that possibly regulate vista4678[chr1:204289566-204289863]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 204289553 204289567 EBF1 JASPAR yes 34692244
chr1 204289553 204289567 EBF1 JASPAR yes 118437818
chr1 204289555 204289566 EBF1 JASPAR yes 34692246
chr1 204289555 204289566 EBF1 JASPAR yes 118437819
chr1 204289560 204289575 RUNX2 JASPAR yes 34692247
chr1 204289560 204289575 RUNX2 JASPAR yes 118437820
chr1 204289569 204289580 E2F6 JASPAR yes 34692248
chr1 204289569 204289580 E2F6 JASPAR yes 118437821
chr1 204289570 204289575 SP1 TRANSFAC yes 34692249
chr1 204289570 204289575 SP1 TRANSFAC yes 118437822
chr1 204289573 204289578 ETS2 TRANSFAC yes 34692250
chr1 204289573 204289578 ETS2 TRANSFAC yes 118437823
chr1 204289594 204289602 EHF JASPAR yes 34692251
chr1 204289594 204289602 EHF JASPAR yes 118437824
chr1 204289619 204289630 GCM1 JASPAR yes 34692252
chr1 204289619 204289630 GCM1 JASPAR yes 118437825
chr1 204289625 204289636 FOSL2 JASPAR yes 34692253
chr1 204289625 204289636 JUNB JASPAR yes 34692254
chr1 204289625 204289636 FOSL2 JASPAR yes 118437826
chr1 204289625 204289636 JUNB JASPAR yes 118437827
chr1 204289626 204289637 FOS JASPAR yes 34692255
chr1 204289626 204289637 FOSL1 JASPAR yes 34692256
chr1 204289626 204289637 JUND JASPAR yes 34692257
chr1 204289626 204289637 NFE2 JASPAR yes 34692258
chr1 204289626 204289637 FOS JASPAR yes 118437828
chr1 204289626 204289637 FOSL1 JASPAR yes 118437829
chr1 204289626 204289637 JUND JASPAR yes 118437830
chr1 204289626 204289637 NFE2 JASPAR yes 118437831
chr1 204289627 204289636 JDP2 JASPAR yes 34692259
chr1 204289627 204289636 JDP2 JASPAR yes 118437832
chr1 204289636 204289651 HSF1 JASPAR yes 34692260
chr1 204289636 204289651 HSF1 JASPAR yes 118437833
chr1 204289637 204289650 HSF4 JASPAR yes 34692261
chr1 204289637 204289650 HSF4 JASPAR yes 118437834
chr1 204289646 204289661 STAT2 JASPAR yes 34692262
chr1 204289646 204289661 STAT2 JASPAR yes 118437835
chr1 204289654 204289657 MYB TRANSFAC yes 34692263
chr1 204289654 204289657 MYB TRANSFAC yes 118437836
chr1 204289674 204289689 HSF1 JASPAR yes 34692264
chr1 204289674 204289689 HSF1 JASPAR yes 118437837
chr1 204289678 204289688 RELA JASPAR yes 34692265
chr1 204289678 204289688 REL JASPAR yes 34692266
chr1 204289678 204289688 RELA JASPAR yes 118437838
chr1 204289678 204289688 REL JASPAR yes 118437839
chr1 204289678 204289689 NFKB1 JASPAR yes 34692267
chr1 204289678 204289689 NFKB1 JASPAR yes 118437840
chr1 204289679 204289689 NFKB1 JASPAR yes 34692268
chr1 204289679 204289689 RELA JASPAR yes 34692269
chr1 204289679 204289689 REL JASPAR yes 34692270
chr1 204289679 204289689 NFKB1 JASPAR yes 118437841
chr1 204289679 204289689 RELA JASPAR yes 118437842
chr1 204289679 204289689 REL JASPAR yes 118437843
chr1 204289684 204289696 TFAP2B JASPAR yes 34692271
chr1 204289684 204289696 TFAP2C JASPAR yes 34692272
chr1 204289684 204289696 TFAP2B JASPAR yes 118437844
chr1 204289684 204289696 TFAP2C JASPAR yes 118437845
chr1 204289684 204289699 TFAP2A JASPAR yes 34692273
chr1 204289684 204289699 TFAP2C JASPAR yes 34692274
chr1 204289684 204289699 TFAP2A JASPAR yes 118437846
chr1 204289684 204289699 TFAP2C JASPAR yes 118437847
chr1 204289685 204289696 EBF1 JASPAR yes 34692275
chr1 204289685 204289696 TFAP2A JASPAR yes 34692276
chr1 204289685 204289696 TFAP2B JASPAR yes 34692277
chr1 204289685 204289696 TFAP2C JASPAR yes 34692278
chr1 204289685 204289696 EBF1 JASPAR yes 118437848
chr1 204289685 204289696 TFAP2A JASPAR yes 118437849
chr1 204289685 204289696 TFAP2B JASPAR yes 118437850
chr1 204289685 204289696 TFAP2C JASPAR yes 118437851
chr1 204289686 204289695 TFAP2A JASPAR yes 34692279
chr1 204289686 204289695 TFAP2A JASPAR yes 118437852
chr1 204289691 204289695 LFA1 TRANSFAC yes 34692280
chr1 204289691 204289695 LFA1 TRANSFAC yes 118437853
chr1 204289695 204289716 IRF1 JASPAR yes 34692281
chr1 204289695 204289716 IRF1 JASPAR yes 118437854
chr1 204289699 204289705 GATA3 JASPAR yes 34692282
chr1 204289699 204289705 GATA3 JASPAR yes 118437855
chr1 204289699 204289713 STAT1 JASPAR yes 34692283
chr1 204289699 204289713 STAT1 JASPAR yes 118437856
chr1 204289699 204289714 PRDM1 JASPAR yes 34692284
chr1 204289699 204289714 STAT2 JASPAR yes 34692285
chr1 204289699 204289714 PRDM1 JASPAR yes 118437857
chr1 204289699 204289714 STAT2 JASPAR yes 118437858
chr1 204289715 204289719 ESR1 TRANSFAC yes 34692286
chr1 204289715 204289719 ESR1 TRANSFAC yes 118437859
chr1 204289722 204289736 FOXF2 JASPAR yes 34692287
chr1 204289722 204289736 FOXF2 JASPAR yes 118437860
chr1 204289726 204289737 NRL JASPAR yes 34692288
chr1 204289726 204289737 NRL JASPAR yes 118437861
chr1 204289726 204289741 MAFK JASPAR yes 34692289
chr1 204289726 204289741 MAFK JASPAR yes 118437862
chr1 204289744 204289749 SP1 TRANSFAC yes 34692290
chr1 204289744 204289749 SP1 TRANSFAC yes 118437863
chr1 204289748 204289769 ZNF263 JASPAR yes 34692291
chr1 204289748 204289769 ZNF263 JASPAR yes 118437864
chr1 204289766 204289777 STAT1 JASPAR yes 34692292
chr1 204289766 204289777 STAT3 JASPAR yes 34692293
chr1 204289766 204289777 STAT1 JASPAR yes 118437865
chr1 204289766 204289777 STAT3 JASPAR yes 118437866
chr1 204289767 204289778 STAT3 JASPAR yes 34692294
chr1 204289767 204289778 STAT3 JASPAR yes 118437867
chr1 204289767 204289782 HSF1 JASPAR yes 34692295
chr1 204289767 204289782 HSF1 JASPAR yes 118437868
chr1 204289768 204289781 HSF1 JASPAR yes 34692296
chr1 204289768 204289781 HSF2 JASPAR yes 34692297
chr1 204289768 204289781 HSF4 JASPAR yes 34692298
chr1 204289768 204289781 HSF1 JASPAR yes 118437869
chr1 204289768 204289781 HSF2 JASPAR yes 118437870
chr1 204289768 204289781 HSF4 JASPAR yes 118437871
chr1 204289772 204289787 HSF1 JASPAR yes 34692299
chr1 204289772 204289787 HSF1 JASPAR yes 118437872
chr1 204289773 204289786 HSF1 JASPAR yes 34692300
chr1 204289773 204289786 HSF1 JASPAR yes 118437873
chr1 204289783 204289787 H4TF2 TRANSFAC yes 34692301
chr1 204289783 204289787 H4TF2 TRANSFAC yes 118437874
chr1 204289789 204289793 NFE TRANSFAC yes 34692302
chr1 204289789 204289793 NFE TRANSFAC yes 118437875
chr1 204289789 204289794 GATA1 TRANSFAC yes 34692303
chr1 204289789 204289794 GATA1 TRANSFAC yes 118437876
chr1 204289789 204289795 GATA3 JASPAR yes 34692304
chr1 204289789 204289795 GATA3 JASPAR yes 118437877
chr1 204289796 204289802 MZF1 JASPAR yes 34692305
chr1 204289796 204289802 MZF1 JASPAR yes 118437878
chr1 204289826 204289837 E2F6 JASPAR yes 34692306
chr1 204289826 204289837 E2F6 JASPAR yes 118437879
chr1 204289833 204289843 CLOCK JASPAR yes 34692307
chr1 204289833 204289843 MAX JASPAR yes 34692308
chr1 204289833 204289843 MNT JASPAR yes 34692309
chr1 204289833 204289843 CLOCK JASPAR yes 118437880
chr1 204289833 204289843 MAX JASPAR yes 118437881
chr1 204289833 204289843 MNT JASPAR yes 118437882
chr1 204289834 204289841 USF1 JASPAR yes 34692310
chr1 204289834 204289841 USF1 JASPAR yes 118437883
chr1 204289834 204289844 MAX JASPAR yes 34692311
chr1 204289834 204289844 MAX JASPAR yes 118437884
chr1 204289835 204289840 MYC TRANSFAC yes 34692312
chr1 204289835 204289840 USF1 TRANSFAC yes 34692313
chr1 204289835 204289840 USF2 TRANSFAC yes 34692314
chr1 204289835 204289840 MYC TRANSFAC yes 118437885
chr1 204289835 204289840 USF1 TRANSFAC yes 118437886
chr1 204289835 204289840 USF2 TRANSFAC yes 118437887
chr1 204289835 204289843 USF1 TRANSFAC yes 34692315
chr1 204289835 204289843 USF1 TRANSFAC yes 118437888
chr1 204289857 204289871 MTF1 JASPAR yes 34692316
chr1 204289857 204289871 MTF1 JASPAR yes 118437889
SNP sites on vista4678[chr1:204289566-204289863]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 204289617 rs4245730 T C no 875127
chr1 204289642 rs184456010 C A
HSF1 HSF4
875128
chr1 204289666 rs7513133 C G no 875129
chr1 204289780 rs17333933 T G
HSF1 HSF2 HSF4
875130
chr1 204289820 rs557715062 C T no 875131
chr1 204289832 rs181874080 C T
E2F6
875132
Genes possibly regulated by vista4678[chr1:204289566-204289863]
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Details of Genes
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 204187979 204346793 - PLEKHA6 ENSG00000143850.8 204346793 0.89 1.0 1751 43070
chr1 204372515 204380919 - PPP1R15B ENSG00000158615.8 204380919 0.64 1.0 1752 8944
Expression level of Genes
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miRNAs possibly regulated by vista4678[chr1:204289566-204289863]
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Details of miRNAs
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
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No results