EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista4895[chr1:209571959-209572357]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4895[chr1:209571959-209572357]
Back to top
Tissue distribution of vista4895
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista4895[chr1:209571959-209572357]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 209571982 209572317 STAT1 UCSC Txn Factor no Conserved 107865715
chr1 209571993 209572313 MAFK UCSC Txn Factor no Conserved 107865718
chr1 209571998 209572198 ELK1 UCSC Txn Factor no Conserved 107865721
chr1 209571998 209572358 MYC UCSC Txn Factor no Conserved 107865723
chr1 209572001 209572356 STAT3 UCSC Txn Factor no Conserved 107865725
chr1 209572058 209572346 FOS UCSC Txn Factor no Conserved 107865730
chr1 209571954 209571962 ISL2 JASPAR yes 34971244
chr1 209571954 209571962 ISL2 JASPAR yes 118448079
chr1 209571973 209571978 ETS2 TRANSFAC yes 34971245
chr1 209571973 209571978 ETS2 TRANSFAC yes 118448080
chr1 209571973 209571981 FEV JASPAR yes 34971246
chr1 209571973 209571981 FEV JASPAR yes 118448081
chr1 209571979 209571989 SREBF2 JASPAR yes 34971247
chr1 209571979 209571989 SREBF2 JASPAR yes 118448082
chr1 209571997 209572008 GCM1 JASPAR yes 34971248
chr1 209571997 209572008 GCM1 JASPAR yes 118448083
chr1 209572010 209572030 TP63 JASPAR yes 34971249
chr1 209572010 209572030 TP63 JASPAR yes 118448084
chr1 209572010 209572031 ZNF263 JASPAR yes 34971250
chr1 209572010 209572031 ZNF263 JASPAR yes 118448085
chr1 209572018 209572027 ZEB1 JASPAR yes 34971251
chr1 209572018 209572027 ZEB1 JASPAR yes 118448086
chr1 209572020 209572037 RXRA JASPAR yes 34971252
chr1 209572020 209572037 RXRA JASPAR yes 118448087
chr1 209572021 209572026 USF2 TRANSFAC yes 34971253
chr1 209572021 209572026 USF2 TRANSFAC yes 118448088
chr1 209572030 209572035 SP1 TRANSFAC yes 34971254
chr1 209572030 209572035 SP1 TRANSFAC yes 118448089
chr1 209572032 209572041 SP1 TRANSFAC yes 34971255
chr1 209572032 209572041 SP1 TRANSFAC yes 118448090
chr1 209572035 209572041 NFE2 TRANSFAC yes 34971256
chr1 209572035 209572041 NFE2 TRANSFAC yes 118448091
chr1 209572072 209572090 SRF JASPAR yes 34971257
chr1 209572072 209572090 SRF JASPAR yes 118448092
chr1 209572073 209572082 NFIX JASPAR yes 34971258
chr1 209572073 209572082 NFIX JASPAR yes 118448093
chr1 209572073 209572083 NFIA JASPAR yes 34971259
chr1 209572073 209572083 NFIA JASPAR yes 118448094
chr1 209572074 209572090 SRF JASPAR yes 34971260
chr1 209572074 209572090 SRF JASPAR yes 118448095
chr1 209572075 209572081 NFIC JASPAR yes 34971261
chr1 209572075 209572081 NFIC JASPAR yes 118448096
chr1 209572097 209572110 ELF1 JASPAR yes 34971262
chr1 209572097 209572110 ELF1 JASPAR yes 118448097
chr1 209572099 209572110 ETV2 JASPAR yes 34971263
chr1 209572099 209572110 ETV2 JASPAR yes 118448098
chr1 209572100 209572110 ERF JASPAR yes 34971264
chr1 209572100 209572110 ETS1 JASPAR yes 34971265
chr1 209572100 209572110 ERF JASPAR yes 118448099
chr1 209572100 209572110 ETS1 JASPAR yes 118448100
chr1 209572100 209572111 ELK4 JASPAR yes 34971266
chr1 209572100 209572111 FLI1 JASPAR yes 34971267
chr1 209572100 209572111 ELK4 JASPAR yes 118448101
chr1 209572100 209572111 FLI1 JASPAR yes 118448102
chr1 209572124 209572139 TFAP2A JASPAR yes 34971268
chr1 209572124 209572139 TFAP2A JASPAR yes 118448103
chr1 209572126 209572141 TFAP2A JASPAR yes 34971269
chr1 209572126 209572141 TFAP2C JASPAR yes 34971270
chr1 209572126 209572141 TFAP2A JASPAR yes 118448104
chr1 209572126 209572141 TFAP2C JASPAR yes 118448105
chr1 209572127 209572138 TFAP2A JASPAR yes 34971271
chr1 209572127 209572138 TFAP2B JASPAR yes 34971272
chr1 209572127 209572138 TFAP2C JASPAR yes 34971273
chr1 209572127 209572138 TFAP2A JASPAR yes 118448106
chr1 209572127 209572138 TFAP2B JASPAR yes 118448107
chr1 209572127 209572138 TFAP2C JASPAR yes 118448108
chr1 209572127 209572139 INSM1 JASPAR yes 34971274
chr1 209572127 209572139 INSM1 JASPAR yes 118448109
chr1 209572128 209572137 TFAP2A JASPAR yes 34971275
chr1 209572128 209572137 TFAP2A JASPAR yes 118448110
chr1 209572132 209572137 SP1 TRANSFAC yes 34971276
chr1 209572132 209572137 SP1 TRANSFAC yes 118448111
chr1 209572138 209572150 FOXI1 JASPAR yes 34971277
chr1 209572138 209572150 FOXI1 JASPAR yes 118448112
chr1 209572142 209572154 PKNOX2 JASPAR yes 34971278
chr1 209572142 209572154 TGIF1 JASPAR yes 34971279
chr1 209572142 209572154 TGIF2 JASPAR yes 34971280
chr1 209572142 209572154 PKNOX2 JASPAR yes 118448113
chr1 209572142 209572154 TGIF1 JASPAR yes 118448114
chr1 209572142 209572154 TGIF2 JASPAR yes 118448115
chr1 209572142 209572155 ZBTB18 JASPAR yes 34971281
chr1 209572142 209572155 ZBTB18 JASPAR yes 118448116
chr1 209572143 209572153 CLOCK JASPAR yes 34971282
chr1 209572143 209572153 NEUROG2 JASPAR yes 34971283
chr1 209572143 209572153 CLOCK JASPAR yes 118448117
chr1 209572143 209572153 NEUROG2 JASPAR yes 118448118
chr1 209572143 209572161 TP53 JASPAR yes 34971284
chr1 209572143 209572161 TP73 JASPAR yes 34971285
chr1 209572143 209572161 TP53 JASPAR yes 118448119
chr1 209572143 209572161 TP73 JASPAR yes 118448120
chr1 209572145 209572163 MAFF JASPAR yes 34971286
chr1 209572145 209572163 MAFF JASPAR yes 118448121
chr1 209572146 209572161 MAFK JASPAR yes 34971287
chr1 209572146 209572161 MAFK JASPAR yes 118448122
chr1 209572150 209572161 NRL JASPAR yes 34971288
chr1 209572150 209572161 NRL JASPAR yes 118448123
chr1 209572155 209572159 YY1 TRANSFAC yes 34971289
chr1 209572155 209572159 YY1 TRANSFAC yes 118448124
chr1 209572155 209572170 STAT1 JASPAR yes 34971290
chr1 209572155 209572170 STAT1 JASPAR yes 118448125
chr1 209572157 209572168 STAT1 JASPAR yes 34971291
chr1 209572157 209572168 STAT3 JASPAR yes 34971292
chr1 209572157 209572168 STAT1 JASPAR yes 118448126
chr1 209572157 209572168 STAT3 JASPAR yes 118448127
chr1 209572166 209572182 SOX8 JASPAR yes 34971293
chr1 209572166 209572182 SOX8 JASPAR yes 118448128
chr1 209572187 209572198 NFIL3 JASPAR yes 34971294
chr1 209572187 209572198 NFIL3 JASPAR yes 118448129
chr1 209572188 209572200 DBP JASPAR yes 34971295
chr1 209572188 209572200 HLF JASPAR yes 34971296
chr1 209572188 209572200 TEF JASPAR yes 34971297
chr1 209572188 209572200 DBP JASPAR yes 118448130
chr1 209572188 209572200 HLF JASPAR yes 118448131
chr1 209572188 209572200 TEF JASPAR yes 118448132
chr1 209572190 209572201 NFIL3 JASPAR yes 34971298
chr1 209572190 209572201 NFIL3 JASPAR yes 118448133
chr1 209572195 209572198 MYB TRANSFAC yes 34971299
chr1 209572195 209572198 MYB TRANSFAC yes 118448134
chr1 209572214 209572225 FOXH1 JASPAR yes 34971300
chr1 209572214 209572225 FOXH1 JASPAR yes 118448135
chr1 209572227 209572232 ETS2 TRANSFAC yes 34971301
chr1 209572227 209572232 ETS2 TRANSFAC yes 118448136
chr1 209572229 209572249 TP53 JASPAR yes 34971302
chr1 209572229 209572249 TP53 JASPAR yes 118448137
chr1 209572232 209572243 STAT3 JASPAR yes 34971303
chr1 209572232 209572243 STAT3 JASPAR yes 118448138
chr1 209572286 209572300 CREB3 JASPAR yes 34971304
chr1 209572286 209572300 CREB3L1 JASPAR yes 34971305
chr1 209572286 209572300 CREB3 JASPAR yes 118448139
chr1 209572286 209572300 CREB3L1 JASPAR yes 118448140
chr1 209572287 209572301 XBP1 JASPAR yes 34971306
chr1 209572287 209572301 XBP1 JASPAR yes 118448141
chr1 209572299 209572309 HMBOX1 JASPAR yes 34971307
chr1 209572299 209572309 HMBOX1 JASPAR yes 118448142
chr1 209572325 209572340 HNF4A JASPAR yes 34971308
chr1 209572325 209572340 HNF4A JASPAR yes 118448143
chr1 209572326 209572341 HNF4G JASPAR yes 34971309
chr1 209572326 209572341 HNF4G JASPAR yes 118448144
chr1 209572348 209572352 YY1 TRANSFAC yes 34971310
chr1 209572348 209572352 YY1 TRANSFAC yes 118448145
SNP sites on vista4895[chr1:209571959-209572357]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 209572012 rs77640695 C A
ELK1 MAFK MYC STAT1 STAT3 TP63 ZNF263
905821
chr1 209572032 rs77842629 C T
ELK1 MAFK MYC RXRA SP1 STAT1 STAT3
905822
chr1 209572117 rs74155481 C T
ELK1 FOS MAFK MYC STAT1 STAT3
905823
chr1 209572146 rs527523626 CAT C
CLOCK ELK1 FOS FOXI1 MAFF MAFK MYC NEUROG2 PKNOX2 STAT1 STAT3 TGIF1 TGIF2 TP53 TP73 ZBTB18
905824
chr1 209572184 rs561339845 C A
ELK1 FOS MAFK MYC STAT1 STAT3
905825
chr1 209572262 rs143627759 C G
FOS MAFK MYC STAT1 STAT3
905826
Genes possibly regulated by vista4895[chr1:209571959-209572357]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
Expression level of Genes
Back to top
No results
miRNAs possibly regulated by vista4895[chr1:209571959-209572357]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
chr1 209605548 209605568 + hsa-miR-205-3p MIMAT0009197 209602164 4.9987503124218944e-05 0.947205 0.692021 121
Expression level of miRNAs
Back to top