EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista4897[chr1:209578512-209578819]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4897[chr1:209578512-209578819]
Back to top
Tissue distribution of vista4897
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista4897[chr1:209578512-209578819]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 209578506 209578517 CDX2 JASPAR yes 34972219
chr1 209578506 209578517 CDX2 JASPAR yes 118448153
chr1 209578507 209578518 HOXA10 JASPAR yes 34972220
chr1 209578507 209578518 HOXA10 JASPAR yes 118448154
chr1 209578508 209578517 CDX1 JASPAR yes 34972221
chr1 209578508 209578517 CDX1 JASPAR yes 118448155
chr1 209578508 209578518 HOXA13 JASPAR yes 34972222
chr1 209578508 209578518 HOXB13 JASPAR yes 34972223
chr1 209578508 209578518 HOXD13 JASPAR yes 34972224
chr1 209578508 209578518 HOXA13 JASPAR yes 118448156
chr1 209578508 209578518 HOXB13 JASPAR yes 118448157
chr1 209578508 209578518 HOXD13 JASPAR yes 118448158
chr1 209578515 209578520 ETS2 TRANSFAC yes 34972225
chr1 209578515 209578520 ETS2 TRANSFAC yes 118448159
chr1 209578555 209578570 FOXP1 JASPAR yes 34972226
chr1 209578555 209578570 FOXP1 JASPAR yes 118448160
chr1 209578556 209578567 FOXA1 JASPAR yes 34972227
chr1 209578556 209578567 FOXA1 JASPAR yes 118448161
chr1 209578556 209578571 FOXA1 JASPAR yes 34972228
chr1 209578556 209578571 FOXA1 JASPAR yes 118448162
chr1 209578557 209578568 FOXC1 JASPAR yes 34972229
chr1 209578557 209578568 FOXC1 JASPAR yes 118448163
chr1 209578557 209578569 FOXC2 JASPAR yes 34972230
chr1 209578557 209578569 FOXC2 JASPAR yes 118448164
chr1 209578558 209578569 FOXP2 JASPAR yes 34972231
chr1 209578558 209578569 FOXP2 JASPAR yes 118448165
chr1 209578559 209578563 TEAD2 TRANSFAC yes 34972232
chr1 209578559 209578563 TEAD2 TRANSFAC yes 118448166
chr1 209578559 209578564 TBP TRANSFAC yes 34972233
chr1 209578559 209578564 TBP TRANSFAC yes 118448167
chr1 209578560 209578568 FOXG1 JASPAR yes 34972234
chr1 209578560 209578568 FOXO3 JASPAR yes 34972235
chr1 209578560 209578568 FOXG1 JASPAR yes 118448168
chr1 209578560 209578568 FOXO3 JASPAR yes 118448169
chr1 209578578 209578582 YY1 TRANSFAC yes 34972236
chr1 209578578 209578582 YY1 TRANSFAC yes 118448170
chr1 209578582 209578588 TBP TRANSFAC yes 34972237
chr1 209578582 209578588 TBP TRANSFAC yes 118448171
chr1 209578591 209578612 ZNF263 JASPAR yes 34972238
chr1 209578591 209578612 ZNF263 JASPAR yes 118448172
chr1 209578594 209578615 ZNF263 JASPAR yes 34972239
chr1 209578594 209578615 ZNF263 JASPAR yes 118448173
chr1 209578599 209578620 ZNF263 JASPAR yes 34972240
chr1 209578599 209578620 ZNF263 JASPAR yes 118448174
chr1 209578602 209578623 ZNF263 JASPAR yes 34972241
chr1 209578602 209578623 ZNF263 JASPAR yes 118448175
chr1 209578608 209578618 SP1 JASPAR yes 34972242
chr1 209578608 209578618 SP1 JASPAR yes 118448176
chr1 209578608 209578629 ZNF263 JASPAR yes 34972243
chr1 209578608 209578629 ZNF263 JASPAR yes 118448177
chr1 209578613 209578628 NR2C2 JASPAR yes 34972244
chr1 209578613 209578628 NR2C2 JASPAR yes 118448178
chr1 209578614 209578628 RXRG JASPAR yes 34972245
chr1 209578614 209578628 RXRG JASPAR yes 118448179
chr1 209578628 209578632 YY1 TRANSFAC yes 34972246
chr1 209578628 209578632 YY1 TRANSFAC yes 118448180
chr1 209578633 209578643 HOXA13 JASPAR yes 34972247
chr1 209578633 209578643 HOXB13 JASPAR yes 34972248
chr1 209578633 209578643 HOXD13 JASPAR yes 34972249
chr1 209578633 209578643 HOXA13 JASPAR yes 118448181
chr1 209578633 209578643 HOXB13 JASPAR yes 118448182
chr1 209578633 209578643 HOXD13 JASPAR yes 118448183
chr1 209578640 209578645 TFAP2A TRANSFAC yes 34972250
chr1 209578640 209578645 TFAP2A TRANSFAC yes 118448184
chr1 209578640 209578646 MZF1 JASPAR yes 34972251
chr1 209578640 209578646 MZF1 JASPAR yes 118448185
chr1 209578667 209578678 TFAP2C JASPAR yes 34972252
chr1 209578667 209578678 TFAP2C JASPAR yes 118448186
chr1 209578676 209578691 JUND JASPAR yes 34972253
chr1 209578676 209578691 JUND JASPAR yes 118448187
chr1 209578705 209578713 E2F1 JASPAR yes 34972254
chr1 209578705 209578713 E2F1 JASPAR yes 118448188
chr1 209578710 209578719 RUNX2 JASPAR yes 34972255
chr1 209578710 209578719 RUNX2 JASPAR yes 118448189
chr1 209578710 209578720 RUNX3 JASPAR yes 34972256
chr1 209578710 209578720 RUNX3 JASPAR yes 118448190
chr1 209578715 209578730 TP53 JASPAR yes 34972257
chr1 209578715 209578730 TP53 JASPAR yes 118448191
chr1 209578752 209578757 ETS2 TRANSFAC yes 34972258
chr1 209578752 209578757 ETS2 TRANSFAC yes 118448192
chr1 209578769 209578782 HSF1 JASPAR yes 34972259
chr1 209578769 209578782 HSF1 JASPAR yes 118448193
chr1 209578773 209578788 TFAP2C JASPAR yes 34972260
chr1 209578773 209578788 TFAP2C JASPAR yes 118448194
chr1 209578776 209578787 TFAP2A JASPAR yes 34972261
chr1 209578776 209578787 TFAP2B JASPAR yes 34972262
chr1 209578776 209578787 TFAP2C JASPAR yes 34972263
chr1 209578776 209578787 TFAP2A JASPAR yes 118448195
chr1 209578776 209578787 TFAP2B JASPAR yes 118448196
chr1 209578776 209578787 TFAP2C JASPAR yes 118448197
chr1 209578802 209578813 STAT1 JASPAR yes 34972264
chr1 209578802 209578813 STAT3 JASPAR yes 34972265
chr1 209578802 209578813 STAT1 JASPAR yes 118448198
chr1 209578802 209578813 STAT3 JASPAR yes 118448199
chr1 209578813 209578817 YY1 TRANSFAC yes 34972266
chr1 209578813 209578817 YY1 TRANSFAC yes 118448200
SNP sites on vista4897[chr1:209578512-209578819]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 209578677 rs192186765 C T
JUND TFAP2C
905898
chr1 209578707 rs74155482 C A,T
E2F1
905899
Genes possibly regulated by vista4897[chr1:209578512-209578819]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
Expression level of Genes
Back to top
No results
miRNAs possibly regulated by vista4897[chr1:209578512-209578819]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
chr1 209605548 209605568 + hsa-miR-205-3p MIMAT0009197 209602164 6.382842918235782e-05 0.947205 0.692021 121
Expression level of miRNAs
Back to top