EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista4920[chr1:209833148-209833823]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4920[chr1:209833148-209833823]
Back to top
Tissue distribution of vista4920
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista4920[chr1:209833148-209833823]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 209833189 209833589 FOS UCSC Txn Factor no Conserved 107866370
chr1 209833362 209833613 GATA2 UCSC Txn Factor no Conserved 107866382
chr1 209833150 209833164 SPIC JASPAR yes 34988762
chr1 209833150 209833164 SPIC JASPAR yes 118449370
chr1 209833155 209833160 ETS2 TRANSFAC yes 34988763
chr1 209833155 209833160 ETS2 TRANSFAC yes 118449371
chr1 209833206 209833220 IRF7 JASPAR yes 34988764
chr1 209833206 209833220 IRF7 JASPAR yes 118449372
chr1 209833207 209833221 ONECUT2 JASPAR yes 34988765
chr1 209833207 209833221 ONECUT3 JASPAR yes 34988766
chr1 209833207 209833221 ONECUT2 JASPAR yes 118449373
chr1 209833207 209833221 ONECUT3 JASPAR yes 118449374
chr1 209833209 209833220 FOXB1 JASPAR yes 34988767
chr1 209833209 209833220 FOXC1 JASPAR yes 34988768
chr1 209833209 209833220 FOXB1 JASPAR yes 118449375
chr1 209833209 209833220 FOXC1 JASPAR yes 118449376
chr1 209833209 209833221 FOXC2 JASPAR yes 34988769
chr1 209833209 209833221 FOXC2 JASPAR yes 118449377
chr1 209833210 209833222 FOXI1 JASPAR yes 34988770
chr1 209833210 209833222 FOXI1 JASPAR yes 118449378
chr1 209833217 209833221 TEAD2 TRANSFAC yes 34988771
chr1 209833217 209833221 TEAD2 TRANSFAC yes 118449379
chr1 209833225 209833228 MYB TRANSFAC yes 34988772
chr1 209833225 209833228 MYB TRANSFAC yes 118449380
chr1 209833228 209833232 YY1 TRANSFAC yes 34988773
chr1 209833228 209833232 YY1 TRANSFAC yes 118449381
chr1 209833235 209833256 IRF1 JASPAR yes 34988774
chr1 209833235 209833256 IRF1 JASPAR yes 118449382
chr1 209833237 209833252 PRDM1 JASPAR yes 34988775
chr1 209833237 209833252 STAT2 JASPAR yes 34988776
chr1 209833237 209833252 PRDM1 JASPAR yes 118449383
chr1 209833237 209833252 STAT2 JASPAR yes 118449384
chr1 209833245 209833249 YY1 TRANSFAC yes 34988777
chr1 209833245 209833249 YY1 TRANSFAC yes 118449385
chr1 209833281 209833285 YY1 TRANSFAC yes 34988778
chr1 209833281 209833285 YY1 TRANSFAC yes 118449386
chr1 209833282 209833293 HOXC13 JASPAR yes 34988779
chr1 209833282 209833293 HOXC13 JASPAR yes 118449387
chr1 209833284 209833295 STAT1 JASPAR yes 34988780
chr1 209833284 209833295 STAT1 JASPAR yes 118449388
chr1 209833286 209833299 HSF1 JASPAR yes 34988781
chr1 209833286 209833299 HSF2 JASPAR yes 34988782
chr1 209833286 209833299 HSF4 JASPAR yes 34988783
chr1 209833286 209833299 HSF1 JASPAR yes 118449389
chr1 209833286 209833299 HSF2 JASPAR yes 118449390
chr1 209833286 209833299 HSF4 JASPAR yes 118449391
chr1 209833289 209833305 SOX8 JASPAR yes 34988784
chr1 209833289 209833305 SOX8 JASPAR yes 118449392
chr1 209833306 209833321 FOXP1 JASPAR yes 34988785
chr1 209833306 209833321 FOXP1 JASPAR yes 118449393
chr1 209833339 209833357 TP63 JASPAR yes 34988786
chr1 209833339 209833357 TP63 JASPAR yes 118449394
chr1 209833341 209833356 TP53 JASPAR yes 34988787
chr1 209833341 209833356 TP53 JASPAR yes 118449395
chr1 209833354 209833362 NR4A2 JASPAR yes 34988788
chr1 209833354 209833362 NR4A2 JASPAR yes 118449396
chr1 209833359 209833365 LEF1 TRANSFAC yes 34988789
chr1 209833359 209833365 TCF4 TRANSFAC yes 34988790
chr1 209833359 209833365 LEF1 TRANSFAC yes 118449397
chr1 209833359 209833365 TCF4 TRANSFAC yes 118449398
chr1 209833363 209833374 FOS JASPAR yes 34988791
chr1 209833363 209833374 FOSL1 JASPAR yes 34988792
chr1 209833363 209833374 JUND JASPAR yes 34988793
chr1 209833363 209833374 NFE2 JASPAR yes 34988794
chr1 209833363 209833374 FOS JASPAR yes 118449399
chr1 209833363 209833374 FOSL1 JASPAR yes 118449400
chr1 209833363 209833374 JUND JASPAR yes 118449401
chr1 209833363 209833374 NFE2 JASPAR yes 118449402
chr1 209833364 209833373 JDP2 JASPAR yes 34988795
chr1 209833364 209833373 JDP2 JASPAR yes 118449403
chr1 209833364 209833375 FOSL2 JASPAR yes 34988796
chr1 209833364 209833375 JUNB JASPAR yes 34988797
chr1 209833364 209833375 FOSL2 JASPAR yes 118449404
chr1 209833364 209833375 JUNB JASPAR yes 118449405
chr1 209833364 209833378 JUN JASPAR yes 34988798
chr1 209833364 209833378 JUN JASPAR yes 118449406
chr1 209833365 209833376 BATF JASPAR yes 34988799
chr1 209833365 209833376 BATF JASPAR yes 118449407
chr1 209833370 209833391 ZNF263 JASPAR yes 34988800
chr1 209833370 209833391 ZNF263 JASPAR yes 118449408
chr1 209833372 209833379 SPIB JASPAR yes 34988801
chr1 209833372 209833379 SPIB JASPAR yes 118449409
chr1 209833374 209833395 ZNF263 JASPAR yes 34988802
chr1 209833374 209833395 ZNF263 JASPAR yes 118449410
chr1 209833382 209833393 E2F6 JASPAR yes 34988803
chr1 209833382 209833393 E2F6 JASPAR yes 118449411
chr1 209833382 209833399 RARA JASPAR yes 34988804
chr1 209833382 209833399 RARA JASPAR yes 118449412
chr1 209833393 209833403 RORA JASPAR yes 34988805
chr1 209833393 209833403 RORA JASPAR yes 118449413
chr1 209833402 209833419 RARA JASPAR yes 34988806
chr1 209833402 209833419 RXRA JASPAR yes 34988807
chr1 209833402 209833419 RARA JASPAR yes 118449414
chr1 209833402 209833419 RXRA JASPAR yes 118449415
chr1 209833449 209833466 PAX1 JASPAR yes 34988808
chr1 209833449 209833466 PAX9 JASPAR yes 34988809
chr1 209833449 209833466 PAX1 JASPAR yes 118449416
chr1 209833449 209833466 PAX9 JASPAR yes 118449417
chr1 209833450 209833464 PAX6 JASPAR yes 34988810
chr1 209833450 209833464 PAX6 JASPAR yes 118449418
chr1 209833457 209833473 SOX8 JASPAR yes 34988811
chr1 209833457 209833473 SOX8 JASPAR yes 118449419
chr1 209833468 209833479 NFIL3 JASPAR yes 34988812
chr1 209833468 209833479 NFIL3 JASPAR yes 118449420
chr1 209833475 209833481 GATA3 JASPAR yes 34988813
chr1 209833475 209833481 GATA3 JASPAR yes 118449421
chr1 209833482 209833492 NFATC3 JASPAR yes 34988814
chr1 209833482 209833492 NFATC3 JASPAR yes 118449422
chr1 209833484 209833490 ETS1 JASPAR yes 34988815
chr1 209833484 209833490 ETS1 JASPAR yes 118449423
chr1 209833490 209833501 STAT3 JASPAR yes 34988816
chr1 209833490 209833501 STAT3 JASPAR yes 118449424
chr1 209833503 209833514 FLI1 JASPAR yes 34988817
chr1 209833503 209833514 FLI1 JASPAR yes 118449425
chr1 209833534 209833555 REST JASPAR yes 34988818
chr1 209833534 209833555 REST JASPAR yes 118449426
chr1 209833535 209833554 REST JASPAR yes 34988819
chr1 209833535 209833554 REST JASPAR yes 118449427
chr1 209833537 209833546 NKX3-2 JASPAR yes 34988820
chr1 209833537 209833546 NKX3-2 JASPAR yes 118449428
chr1 209833538 209833546 ISL2 JASPAR yes 34988821
chr1 209833538 209833546 ISL2 JASPAR yes 118449429
chr1 209833570 209833576 PEA3 TRANSFAC yes 34988822
chr1 209833570 209833576 PEA3 TRANSFAC yes 118449430
chr1 209833571 209833579 EHF JASPAR yes 34988823
chr1 209833571 209833579 EHF JASPAR yes 118449431
chr1 209833574 209833595 ZNF263 JASPAR yes 34988824
chr1 209833574 209833595 ZNF263 JASPAR yes 118449432
chr1 209833575 209833580 ETS2 TRANSFAC yes 34988825
chr1 209833575 209833580 ETS2 TRANSFAC yes 118449433
chr1 209833578 209833599 ZNF263 JASPAR yes 34988826
chr1 209833578 209833599 ZNF263 JASPAR yes 118449434
chr1 209833579 209833600 ZNF263 JASPAR yes 34988827
chr1 209833579 209833600 ZNF263 JASPAR yes 118449435
chr1 209833582 209833603 ZNF263 JASPAR yes 34988828
chr1 209833582 209833603 ZNF263 JASPAR yes 118449436
chr1 209833583 209833596 ELF1 JASPAR yes 34988829
chr1 209833583 209833596 ELF1 JASPAR yes 118449437
chr1 209833583 209833604 ZNF263 JASPAR yes 34988830
chr1 209833583 209833604 ZNF263 JASPAR yes 118449438
chr1 209833586 209833596 GABPA JASPAR yes 34988831
chr1 209833586 209833596 GABPA JASPAR yes 118449439
chr1 209833586 209833597 FLI1 JASPAR yes 34988832
chr1 209833586 209833597 FLI1 JASPAR yes 118449440
chr1 209833587 209833595 EHF JASPAR yes 34988833
chr1 209833587 209833595 EHF JASPAR yes 118449441
chr1 209833593 209833599 MAZ TRANSFAC yes 34988834
chr1 209833593 209833599 MAZ TRANSFAC yes 118449442
chr1 209833593 209833604 E2F6 JASPAR yes 34988835
chr1 209833593 209833604 E2F6 JASPAR yes 118449443
chr1 209833617 209833620 MYB TRANSFAC yes 34988836
chr1 209833617 209833620 MYB TRANSFAC yes 118449444
chr1 209833620 209833631 GCM1 JASPAR yes 34988837
chr1 209833620 209833631 GCM1 JASPAR yes 118449445
chr1 209833632 209833636 YY1 TRANSFAC yes 34988838
chr1 209833632 209833636 YY1 TRANSFAC yes 118449446
chr1 209833647 209833650 MYB TRANSFAC yes 34988839
chr1 209833647 209833650 MYB TRANSFAC yes 118449447
chr1 209833669 209833684 RUNX2 JASPAR yes 34988840
chr1 209833669 209833684 RUNX2 JASPAR yes 118449448
chr1 209833669 209833690 IRF1 JASPAR yes 34988841
chr1 209833669 209833690 IRF1 JASPAR yes 118449449
chr1 209833671 209833686 IRF9 JASPAR yes 34988842
chr1 209833671 209833686 IRF9 JASPAR yes 118449450
chr1 209833672 209833686 IRF7 JASPAR yes 34988843
chr1 209833672 209833686 IRF7 JASPAR yes 118449451
chr1 209833704 209833709 GATA1 TRANSFAC yes 34988844
chr1 209833704 209833709 GATA1 TRANSFAC yes 118449452
chr1 209833711 209833715 YY1 TRANSFAC yes 34988845
chr1 209833711 209833715 YY1 TRANSFAC yes 118449453
chr1 209833713 209833725 E2F8 JASPAR yes 34988846
chr1 209833713 209833725 E2F8 JASPAR yes 118449454
chr1 209833732 209833737 GATA2 JASPAR yes 34988847
chr1 209833732 209833737 GATA2 JASPAR yes 118449455
chr1 209833735 209833738 MYB TRANSFAC yes 34988848
chr1 209833735 209833738 MYB TRANSFAC yes 118449456
chr1 209833737 209833749 MEF2B JASPAR yes 34988849
chr1 209833737 209833749 MEF2B JASPAR yes 118449457
chr1 209833788 209833793 GATA2 JASPAR yes 34988850
chr1 209833788 209833793 GATA2 JASPAR yes 118449458
chr1 209833789 209833799 MEOX2 JASPAR yes 34988851
chr1 209833789 209833799 MEOX2 JASPAR yes 118449459
chr1 209833791 209833809 IRF2 JASPAR yes 34988852
chr1 209833791 209833809 IRF2 JASPAR yes 118449460
chr1 209833792 209833803 ESRRB JASPAR yes 34988853
chr1 209833792 209833803 ESRRB JASPAR yes 118449461
chr1 209833793 209833808 LEF1 JASPAR yes 34988854
chr1 209833793 209833808 LEF1 JASPAR yes 118449462
chr1 209833794 209833808 TCF7L2 JASPAR yes 34988855
chr1 209833794 209833808 TCF7L2 JASPAR yes 118449463
chr1 209833796 209833808 IRF1 JASPAR yes 34988856
chr1 209833796 209833808 IRF1 JASPAR yes 118449464
chr1 209833797 209833803 LEF1 TRANSFAC yes 34988857
chr1 209833797 209833803 TCF4 TRANSFAC yes 34988858
chr1 209833797 209833803 LEF1 TRANSFAC yes 118449465
chr1 209833797 209833803 TCF4 TRANSFAC yes 118449466
chr1 209833821 209833836 HNF4A JASPAR yes 34988859
chr1 209833821 209833836 HNF4A JASPAR yes 118449467
chr1 209833822 209833837 HNF4G JASPAR yes 34988860
chr1 209833822 209833837 HNF4G JASPAR yes 118449468
SNP sites on vista4920[chr1:209833148-209833823]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 209833171 rs567376991 C T no 908120
chr1 209833230 rs151239658 A G
FOS YY1
908121
chr1 209833313 rs7542062 T C
FOS FOXP1
908122
chr1 209833347 rs11437405 T TC
FOS TP53 TP63
908123
chr1 209833372 rs183825801 A G
BATF FOS FOSL1 FOSL2 GATA2 JDP2 JUN JUNB JUND NFE2 SPIB ZNF263
908124
chr1 209833428 rs140457872 G A
FOS GATA2
908125
chr1 209833446 rs7542165 T C
FOS GATA2
908126
chr1 209833449 rs144272527 G A
FOS GATA2 PAX1 PAX9
908127
chr1 209833465 rs12030610 C A
FOS GATA2 PAX1 PAX9 SOX8
908128
chr1 209833495 rs12030611 C T
FOS GATA2 STAT3
908129
chr1 209833595 rs114021886 G A
E2F6 EHF ELF1 FLI1 GABPA GATA2 MAZ ZNF263
908130
chr1 209833614 rs75687116 C T no 908131
chr1 209833703 rs146588398 G A no 908132
chr1 209833753 rs548343918 C G no 908133
Genes possibly regulated by vista4920[chr1:209833148-209833823]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 209757062 209787283 + CAMK1G ENSG00000008118.5 209757062 0.97 0.98 1805 23914
chr1 209788215 209825811 - LAMB3 ENSG00000196878.8 209825811 0.99 1.0 1806 92663
chr1 209848765 209849733 + G0S2 ENSG00000123689.5 209848765 0.85 0.99 1807 85058
chr1 209859510 209908295 + HSD11B1 ENSG00000117594.5 209859510 0.98 0.87 1808 74313
chr1 209929377 209955668 + TRAF3IP3 ENSG00000009790.10 209929377 0.93 1.0 1809 4446
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista4920[chr1:209833148-209833823]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results