EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista49572[chr5:148188522-148188838]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista49572[chr5:148188522-148188838]
Back to top
Tissue distribution of vista49572
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista49572[chr5:148188522-148188838]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr5 148188540 148188555 TFAP2A JASPAR yes 66762305
chr5 148188540 148188555 TFAP2C JASPAR yes 66762306
chr5 148188540 148188555 TFAP2A JASPAR yes 70735191
chr5 148188540 148188555 TFAP2C JASPAR yes 70735192
chr5 148188542 148188557 TFAP2A JASPAR yes 66762307
chr5 148188542 148188557 TFAP2C JASPAR yes 66762308
chr5 148188542 148188557 TFAP2A JASPAR yes 70735193
chr5 148188542 148188557 TFAP2C JASPAR yes 70735194
chr5 148188543 148188555 TFAP2A JASPAR yes 66762309
chr5 148188543 148188555 TFAP2B JASPAR yes 66762310
chr5 148188543 148188555 TFAP2C JASPAR yes 66762311
chr5 148188543 148188555 TFAP2A JASPAR yes 70735195
chr5 148188543 148188555 TFAP2B JASPAR yes 70735196
chr5 148188543 148188555 TFAP2C JASPAR yes 70735197
chr5 148188550 148188554 LFA1 TRANSFAC yes 66762312
chr5 148188550 148188554 LFA1 TRANSFAC yes 70735198
chr5 148188588 148188597 PITX3 JASPAR yes 66762313
chr5 148188588 148188597 PITX3 JASPAR yes 70735199
chr5 148188588 148188598 GSC JASPAR yes 66762314
chr5 148188588 148188598 GSC JASPAR yes 70735200
chr5 148188589 148188597 RHOXF1 JASPAR yes 66762315
chr5 148188589 148188597 RHOXF1 JASPAR yes 70735201
chr5 148188592 148188598 ZNF354C JASPAR yes 66762316
chr5 148188592 148188598 ZNF354C JASPAR yes 70735202
chr5 148188601 148188609 MEIS2 JASPAR yes 66762317
chr5 148188601 148188609 MEIS3 JASPAR yes 66762318
chr5 148188601 148188609 MEIS2 JASPAR yes 70735203
chr5 148188601 148188609 MEIS3 JASPAR yes 70735204
chr5 148188602 148188606 NFE TRANSFAC yes 66762319
chr5 148188602 148188606 NFE TRANSFAC yes 70735205
chr5 148188602 148188609 MEIS1 JASPAR yes 66762320
chr5 148188602 148188609 MEIS1 JASPAR yes 70735206
chr5 148188611 148188625 XBP1 JASPAR yes 66762321
chr5 148188611 148188625 XBP1 JASPAR yes 70735207
chr5 148188612 148188626 CREB3L1 JASPAR yes 66762322
chr5 148188612 148188626 CREB3L1 JASPAR yes 70735208
chr5 148188614 148188632 MAFF JASPAR yes 66762323
chr5 148188614 148188632 MAFF JASPAR yes 70735209
chr5 148188637 148188657 TP63 JASPAR yes 66762324
chr5 148188637 148188657 TP63 JASPAR yes 70735210
chr5 148188678 148188693 HSF1 JASPAR yes 66762325
chr5 148188678 148188693 HSF1 JASPAR yes 70735211
chr5 148188687 148188707 TP53 JASPAR yes 66762326
chr5 148188687 148188707 TP53 JASPAR yes 70735212
chr5 148188690 148188708 TP53 JASPAR yes 66762327
chr5 148188690 148188708 TP53 JASPAR yes 70735213
chr5 148188706 148188721 HSF1 JASPAR yes 66762328
chr5 148188706 148188721 HSF1 JASPAR yes 70735214
chr5 148188706 148188727 ZNF263 JASPAR yes 66762329
chr5 148188706 148188727 ZNF263 JASPAR yes 70735215
chr5 148188707 148188720 HSF1 JASPAR yes 66762330
chr5 148188707 148188720 HSF2 JASPAR yes 66762331
chr5 148188707 148188720 HSF4 JASPAR yes 66762332
chr5 148188707 148188720 HSF1 JASPAR yes 70735216
chr5 148188707 148188720 HSF2 JASPAR yes 70735217
chr5 148188707 148188720 HSF4 JASPAR yes 70735218
chr5 148188714 148188728 SPI1 JASPAR yes 66762333
chr5 148188714 148188728 SPIC JASPAR yes 66762334
chr5 148188714 148188728 SPI1 JASPAR yes 70735219
chr5 148188714 148188728 SPIC JASPAR yes 70735220
chr5 148188715 148188723 EHF JASPAR yes 66762335
chr5 148188715 148188723 EHF JASPAR yes 70735221
chr5 148188716 148188734 SRF JASPAR yes 66762336
chr5 148188716 148188734 SRF JASPAR yes 70735222
chr5 148188722 148188726 YY1 TRANSFAC yes 66762337
chr5 148188722 148188726 YY1 TRANSFAC yes 70735223
chr5 148188736 148188748 YY1 JASPAR yes 66762338
chr5 148188736 148188748 YY1 JASPAR yes 70735224
chr5 148188739 148188745 YY1 JASPAR yes 66762339
chr5 148188739 148188745 YY1 JASPAR yes 70735225
chr5 148188744 148188759 FOXP1 JASPAR yes 66762340
chr5 148188744 148188759 FOXP1 JASPAR yes 70735226
chr5 148188744 148188765 IRF1 JASPAR yes 66762341
chr5 148188744 148188765 IRF1 JASPAR yes 70735227
chr5 148188745 148188757 FOXC2 JASPAR yes 66762342
chr5 148188745 148188757 FOXC2 JASPAR yes 70735228
chr5 148188745 148188758 POU2F2 JASPAR yes 66762343
chr5 148188745 148188758 POU2F2 JASPAR yes 70735229
chr5 148188746 148188757 FOXC1 JASPAR yes 66762344
chr5 148188746 148188757 FOXC1 JASPAR yes 70735230
chr5 148188746 148188761 PRDM1 JASPAR yes 66762345
chr5 148188746 148188761 STAT2 JASPAR yes 66762346
chr5 148188746 148188761 PRDM1 JASPAR yes 70735231
chr5 148188746 148188761 STAT2 JASPAR yes 70735232
chr5 148188747 148188751 YY1 TRANSFAC yes 66762347
chr5 148188747 148188751 YY1 TRANSFAC yes 70735233
chr5 148188747 148188761 STAT1 JASPAR yes 66762348
chr5 148188747 148188761 STAT1 JASPAR yes 70735234
chr5 148188748 148188760 IRF1 JASPAR yes 66762349
chr5 148188748 148188760 IRF1 JASPAR yes 70735235
chr5 148188748 148188762 IRF7 JASPAR yes 66762350
chr5 148188748 148188762 IRF7 JASPAR yes 70735236
chr5 148188752 148188763 FLI1 JASPAR yes 66762351
chr5 148188752 148188763 FLI1 JASPAR yes 70735237
chr5 148188752 148188765 ELF3 JASPAR yes 66762352
chr5 148188752 148188765 ELF3 JASPAR yes 70735238
chr5 148188753 148188757 YY1 TRANSFAC yes 66762353
chr5 148188753 148188757 YY1 TRANSFAC yes 70735239
chr5 148188753 148188764 ELF5 JASPAR yes 66762354
chr5 148188753 148188764 ELF5 JASPAR yes 70735240
chr5 148188753 148188765 EHF JASPAR yes 66762355
chr5 148188753 148188765 ELF1 JASPAR yes 66762356
chr5 148188753 148188765 ELF4 JASPAR yes 66762357
chr5 148188753 148188765 EHF JASPAR yes 70735241
chr5 148188753 148188765 ELF1 JASPAR yes 70735242
chr5 148188753 148188765 ELF4 JASPAR yes 70735243
chr5 148188753 148188766 ELF1 JASPAR yes 66762358
chr5 148188753 148188766 ELF1 JASPAR yes 70735244
chr5 148188754 148188762 FEV JASPAR yes 66762359
chr5 148188754 148188762 FEV JASPAR yes 70735245
chr5 148188763 148188784 ZNF263 JASPAR yes 66762360
chr5 148188763 148188784 ZNF263 JASPAR yes 70735246
chr5 148188764 148188785 ZNF263 JASPAR yes 66762361
chr5 148188764 148188785 ZNF263 JASPAR yes 70735247
chr5 148188767 148188788 ZNF263 JASPAR yes 66762362
chr5 148188767 148188788 ZNF263 JASPAR yes 70735248
chr5 148188772 148188793 IRF1 JASPAR yes 66762363
chr5 148188772 148188793 ZNF263 JASPAR yes 66762364
chr5 148188772 148188793 IRF1 JASPAR yes 70735249
chr5 148188772 148188793 ZNF263 JASPAR yes 70735250
chr5 148188775 148188789 SPI1 JASPAR yes 66762365
chr5 148188775 148188789 SPIC JASPAR yes 66762366
chr5 148188775 148188789 SPI1 JASPAR yes 70735251
chr5 148188775 148188789 SPIC JASPAR yes 70735252
chr5 148188776 148188784 EHF JASPAR yes 66762367
chr5 148188776 148188784 EHF JASPAR yes 70735253
chr5 148188778 148188785 SPIB JASPAR yes 66762368
chr5 148188778 148188785 SPIB JASPAR yes 70735254
chr5 148188785 148188795 MZF1 JASPAR yes 66762369
chr5 148188785 148188795 MZF1 JASPAR yes 70735255
chr5 148188785 148188797 E2F8 JASPAR yes 66762370
chr5 148188785 148188797 E2F8 JASPAR yes 70735256
chr5 148188788 148188794 SP1 TRANSFAC yes 66762371
chr5 148188788 148188794 SP1 TRANSFAC yes 70735257
chr5 148188811 148188814 MYB TRANSFAC yes 66762372
chr5 148188811 148188814 MYB TRANSFAC yes 70735258
chr5 148188812 148188828 SOX8 JASPAR yes 66762373
chr5 148188812 148188828 SOX8 JASPAR yes 70735259
chr5 148188812 148188833 IRF1 JASPAR yes 66762374
chr5 148188812 148188833 IRF1 JASPAR yes 70735260
chr5 148188818 148188839 IRF1 JASPAR yes 66762375
chr5 148188818 148188839 IRF1 JASPAR yes 70735261
chr5 148188820 148188835 PRDM1 JASPAR yes 66762376
chr5 148188820 148188835 PRDM1 JASPAR yes 70735262
chr5 148188822 148188834 IRF1 JASPAR yes 66762377
chr5 148188822 148188834 IRF1 JASPAR yes 70735263
chr5 148188832 148188838 TCF4 TRANSFAC yes 66762378
chr5 148188832 148188838 TCF4 TRANSFAC yes 70735264
chr5 148188834 148188848 GATA2 JASPAR yes 66762379
chr5 148188834 148188848 GATA2 JASPAR yes 70735265
chr5 148188838 148188846 GATA5 JASPAR yes 66762380
chr5 148188838 148188846 GATA5 JASPAR yes 70735266
SNP sites on vista49572[chr5:148188522-148188838]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr5 148188760 rs188327213 C T
EHF ELF1 ELF3 ELF4 ELF5 FEV FLI1 IRF1 IRF7 PRDM1 STAT1 STAT2
8602772
chr5 148188817 rs530329592 A G
IRF1 SOX8
8602773
chr5 148188838 rs185020 C T
GATA2 GATA5 IRF1 TCF4
8602774
Genes possibly regulated by vista49572[chr5:148188522-148188838]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr5 148206156 148208196 + ADRB2 ENSG00000169252.4 148206156 0.84 0.9 5859 82682
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista49572[chr5:148188522-148188838]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results