EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista49889[chr5:158839407-158839958]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista49889[chr5:158839407-158839958]
Back to top
Tissue distribution of vista49889
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista49889[chr5:158839407-158839958]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr5 158839430 158839443 ZBTB18 JASPAR yes 67291340
chr5 158839430 158839443 ZBTB18 JASPAR yes 70750074
chr5 158839432 158839444 TAL1 JASPAR yes 67291341
chr5 158839432 158839444 TAL1 JASPAR yes 70750075
chr5 158839444 158839458 SPIC JASPAR yes 67291342
chr5 158839444 158839458 SPIC JASPAR yes 70750076
chr5 158839445 158839458 ELF1 JASPAR yes 67291343
chr5 158839445 158839458 ELF1 JASPAR yes 70750077
chr5 158839448 158839458 GABPA JASPAR yes 67291344
chr5 158839448 158839458 GABPA JASPAR yes 70750078
chr5 158839464 158839476 PKNOX1 JASPAR yes 67291345
chr5 158839464 158839476 PKNOX1 JASPAR yes 70750079
chr5 158839471 158839474 MYB TRANSFAC yes 67291346
chr5 158839471 158839474 MYB TRANSFAC yes 70750080
chr5 158839471 158839483 TGIF1 JASPAR yes 67291347
chr5 158839471 158839483 TGIF1 JASPAR yes 70750081
chr5 158839474 158839487 NR2F1 JASPAR yes 67291348
chr5 158839474 158839487 NR2F1 JASPAR yes 70750082
chr5 158839476 158839484 NR4A2 JASPAR yes 67291349
chr5 158839476 158839484 NR4A2 JASPAR yes 70750083
chr5 158839478 158839482 ESR1 TRANSFAC yes 67291350
chr5 158839478 158839482 ESR1 TRANSFAC yes 70750084
chr5 158839490 158839498 FOXO3 JASPAR yes 67291351
chr5 158839490 158839498 FOXO3 JASPAR yes 70750085
chr5 158839494 158839504 MYF6 JASPAR yes 67291352
chr5 158839494 158839504 MYF6 JASPAR yes 70750086
chr5 158839511 158839518 SPIB JASPAR yes 67291353
chr5 158839511 158839518 SPIB JASPAR yes 70750087
chr5 158839513 158839524 NFKB1 JASPAR yes 67291354
chr5 158839513 158839524 NFKB1 JASPAR yes 70750088
chr5 158839514 158839524 NFKB1 JASPAR yes 67291355
chr5 158839514 158839524 RELA JASPAR yes 67291356
chr5 158839514 158839524 REL JASPAR yes 67291357
chr5 158839514 158839524 NFKB1 JASPAR yes 70750089
chr5 158839514 158839524 RELA JASPAR yes 70750090
chr5 158839514 158839524 REL JASPAR yes 70750091
chr5 158839514 158839525 NFKB1 JASPAR yes 67291358
chr5 158839514 158839525 NFKB1 JASPAR yes 70750092
chr5 158839519 158839529 MZF1 JASPAR yes 67291359
chr5 158839519 158839529 MZF1 JASPAR yes 70750093
chr5 158839520 158839541 ZNF263 JASPAR yes 67291360
chr5 158839520 158839541 ZNF263 JASPAR yes 70750094
chr5 158839522 158839528 SP1 TRANSFAC yes 67291361
chr5 158839522 158839528 SP1 TRANSFAC yes 70750095
chr5 158839522 158839532 SP1 JASPAR yes 67291362
chr5 158839522 158839532 SP1 JASPAR yes 70750096
chr5 158839534 158839546 INSM1 JASPAR yes 67291363
chr5 158839534 158839546 INSM1 JASPAR yes 70750097
chr5 158839563 158839573 SREBF1 JASPAR yes 67291364
chr5 158839563 158839573 SREBF2 JASPAR yes 67291365
chr5 158839563 158839573 SREBF1 JASPAR yes 70750098
chr5 158839563 158839573 SREBF2 JASPAR yes 70750099
chr5 158839574 158839595 REST JASPAR yes 67291366
chr5 158839574 158839595 REST JASPAR yes 70750100
chr5 158839585 158839589 LFA1 TRANSFAC yes 67291367
chr5 158839585 158839589 LFA1 TRANSFAC yes 70750101
chr5 158839590 158839601 EBF1 JASPAR yes 67291368
chr5 158839590 158839601 EBF1 JASPAR yes 70750102
chr5 158839594 158839599 TFAP2A TRANSFAC yes 67291369
chr5 158839594 158839599 TFAP2A TRANSFAC yes 70750103
chr5 158839594 158839600 MZF1 JASPAR yes 67291370
chr5 158839594 158839600 MZF1 JASPAR yes 70750104
chr5 158839603 158839607 YY1 TRANSFAC yes 67291371
chr5 158839603 158839607 YY1 TRANSFAC yes 70750105
chr5 158839605 158839615 NFATC3 JASPAR yes 67291372
chr5 158839605 158839615 NFATC3 JASPAR yes 70750106
chr5 158839607 158839614 NFATC2 JASPAR yes 67291373
chr5 158839607 158839614 NFATC2 JASPAR yes 70750107
chr5 158839623 158839638 MYBL2 JASPAR yes 67291374
chr5 158839623 158839638 MYBL2 JASPAR yes 70750108
chr5 158839636 158839650 TLX1 JASPAR yes 67291375
chr5 158839636 158839650 TLX1 JASPAR yes 70750109
chr5 158839637 158839652 JUND JASPAR yes 67291376
chr5 158839637 158839652 JUND JASPAR yes 70750110
chr5 158839638 158839651 JUN JASPAR yes 67291377
chr5 158839638 158839651 JUN JASPAR yes 70750111
chr5 158839639 158839653 ATF7 JASPAR yes 67291378
chr5 158839639 158839653 BATF3 JASPAR yes 67291379
chr5 158839639 158839653 ATF7 JASPAR yes 70750112
chr5 158839639 158839653 BATF3 JASPAR yes 70750113
chr5 158839640 158839652 JDP2 JASPAR yes 67291380
chr5 158839640 158839652 JDP2 JASPAR yes 70750114
chr5 158839640 158839655 JUND JASPAR yes 67291381
chr5 158839640 158839655 JUND JASPAR yes 70750115
chr5 158839663 158839674 EBF1 JASPAR yes 67291382
chr5 158839663 158839674 EBF1 JASPAR yes 70750116
chr5 158839663 158839677 EBF1 JASPAR yes 67291383
chr5 158839663 158839677 EBF1 JASPAR yes 70750117
chr5 158839665 158839676 EBF1 JASPAR yes 67291384
chr5 158839665 158839676 EBF1 JASPAR yes 70750118
chr5 158839669 158839674 TFAP2A TRANSFAC yes 67291385
chr5 158839669 158839674 TFAP2A TRANSFAC yes 70750119
chr5 158839669 158839675 MZF1 JASPAR yes 67291386
chr5 158839669 158839675 MZF1 JASPAR yes 70750120
chr5 158839679 158839682 MYB TRANSFAC yes 67291387
chr5 158839679 158839682 MYB TRANSFAC yes 70750121
chr5 158839698 158839711 ELF1 JASPAR yes 67291388
chr5 158839698 158839711 ELF1 JASPAR yes 70750122
chr5 158839703 158839714 NFKB1 JASPAR yes 67291389
chr5 158839703 158839714 NFKB1 JASPAR yes 70750123
chr5 158839718 158839733 PRDM1 JASPAR yes 67291390
chr5 158839718 158839733 PRDM1 JASPAR yes 70750124
chr5 158839729 158839741 TFAP2A JASPAR yes 67291391
chr5 158839729 158839741 TFAP2B JASPAR yes 67291392
chr5 158839729 158839741 TFAP2C JASPAR yes 67291393
chr5 158839729 158839741 TFAP2A JASPAR yes 70750125
chr5 158839729 158839741 TFAP2B JASPAR yes 70750126
chr5 158839729 158839741 TFAP2C JASPAR yes 70750127
chr5 158839729 158839744 TFAP2A JASPAR yes 67291394
chr5 158839729 158839744 TFAP2A JASPAR yes 70750128
chr5 158839730 158839741 TFAP2A JASPAR yes 67291395
chr5 158839730 158839741 TFAP2A JASPAR yes 70750129
chr5 158839740 158839753 POU2F2 JASPAR yes 67291396
chr5 158839740 158839753 POU2F2 JASPAR yes 70750130
chr5 158839746 158839760 POU1F1 JASPAR yes 67291397
chr5 158839746 158839760 POU1F1 JASPAR yes 70750131
chr5 158839747 158839759 POU3F1 JASPAR yes 67291398
chr5 158839747 158839759 POU3F2 JASPAR yes 67291399
chr5 158839747 158839759 POU3F1 JASPAR yes 70750132
chr5 158839747 158839759 POU3F2 JASPAR yes 70750133
chr5 158839747 158839760 POU3F3 JASPAR yes 67291400
chr5 158839747 158839760 POU3F3 JASPAR yes 70750134
chr5 158839748 158839752 YY1 TRANSFAC yes 67291401
chr5 158839748 158839752 YY1 TRANSFAC yes 70750135
chr5 158839748 158839760 POU2F1 JASPAR yes 67291402
chr5 158839748 158839760 POU2F1 JASPAR yes 70750136
chr5 158839749 158839758 POU3F4 JASPAR yes 67291403
chr5 158839749 158839758 POU5F1B JASPAR yes 67291404
chr5 158839749 158839758 POU3F4 JASPAR yes 70750137
chr5 158839749 158839758 POU5F1B JASPAR yes 70750138
chr5 158839757 158839770 POU3F3 JASPAR yes 67291405
chr5 158839757 158839770 POU3F3 JASPAR yes 70750139
chr5 158839757 158839771 POU1F1 JASPAR yes 67291406
chr5 158839757 158839771 POU1F1 JASPAR yes 70750140
chr5 158839759 158839770 PHOX2A JASPAR yes 67291407
chr5 158839759 158839770 PROP1 JASPAR yes 67291408
chr5 158839759 158839770 PHOX2A JASPAR yes 70750141
chr5 158839759 158839770 PROP1 JASPAR yes 70750142
chr5 158839763 158839779 POU4F2 JASPAR yes 67291409
chr5 158839763 158839779 POU4F3 JASPAR yes 67291410
chr5 158839763 158839779 POU4F2 JASPAR yes 70750143
chr5 158839763 158839779 POU4F3 JASPAR yes 70750144
chr5 158839765 158839779 POU4F1 JASPAR yes 67291411
chr5 158839765 158839779 POU4F1 JASPAR yes 70750145
chr5 158839766 158839775 SRY JASPAR yes 67291412
chr5 158839766 158839775 SRY JASPAR yes 70750146
chr5 158839768 158839771 MYB TRANSFAC yes 67291413
chr5 158839768 158839771 MYB TRANSFAC yes 70750147
chr5 158839785 158839793 FOXO3 JASPAR yes 67291414
chr5 158839785 158839793 FOXO3 JASPAR yes 70750148
chr5 158839800 158839812 POU3F2 JASPAR yes 67291415
chr5 158839800 158839812 POU3F2 JASPAR yes 70750149
chr5 158839822 158839830 RHOXF1 JASPAR yes 67291416
chr5 158839822 158839830 RHOXF1 JASPAR yes 70750150
chr5 158839832 158839843 BATF JASPAR yes 67291417
chr5 158839832 158839843 BATF JASPAR yes 70750151
chr5 158839834 158839844 GSX2 JASPAR yes 67291418
chr5 158839834 158839844 HOXB3 JASPAR yes 67291419
chr5 158839834 158839844 MEOX2 JASPAR yes 67291420
chr5 158839834 158839844 MNX1 JASPAR yes 67291421
chr5 158839834 158839844 GSX2 JASPAR yes 70750152
chr5 158839834 158839844 HOXB3 JASPAR yes 70750153
chr5 158839834 158839844 MEOX2 JASPAR yes 70750154
chr5 158839834 158839844 MNX1 JASPAR yes 70750155
chr5 158839834 158839845 HOXA10 JASPAR yes 67291422
chr5 158839834 158839845 HOXC11 JASPAR yes 67291423
chr5 158839834 158839845 HOXC12 JASPAR yes 67291424
chr5 158839834 158839845 HOXD12 JASPAR yes 67291425
chr5 158839834 158839845 HOXA10 JASPAR yes 70750156
chr5 158839834 158839845 HOXC11 JASPAR yes 70750157
chr5 158839834 158839845 HOXC12 JASPAR yes 70750158
chr5 158839834 158839845 HOXD12 JASPAR yes 70750159
chr5 158839835 158839843 NKX6-1 JASPAR yes 67291426
chr5 158839835 158839843 NKX6-1 JASPAR yes 70750160
chr5 158839835 158839845 HOXC10 JASPAR yes 67291427
chr5 158839835 158839845 HOXD11 JASPAR yes 67291428
chr5 158839835 158839845 HOXC10 JASPAR yes 70750161
chr5 158839835 158839845 HOXD11 JASPAR yes 70750162
chr5 158839837 158839841 YY1 TRANSFAC yes 67291429
chr5 158839837 158839841 YY1 TRANSFAC yes 70750163
chr5 158839861 158839872 ELF5 JASPAR yes 67291430
chr5 158839861 158839872 ELF5 JASPAR yes 70750164
chr5 158839864 158839870 ETS1 JASPAR yes 67291431
chr5 158839864 158839870 ETS1 JASPAR yes 70750165
chr5 158839867 158839888 IRF1 JASPAR yes 67291432
chr5 158839867 158839888 IRF1 JASPAR yes 70750166
chr5 158839901 158839916 RUNX2 JASPAR yes 67291433
chr5 158839901 158839916 RUNX2 JASPAR yes 70750167
chr5 158839911 158839921 CLOCK JASPAR yes 67291434
chr5 158839911 158839921 CLOCK JASPAR yes 70750168
chr5 158839936 158839955 PAX5 JASPAR yes 67291435
chr5 158839936 158839955 PAX5 JASPAR yes 70750169
chr5 158839943 158839957 ONECUT3 JASPAR yes 67291436
chr5 158839943 158839957 ONECUT3 JASPAR yes 70750170
SNP sites on vista49889[chr5:158839407-158839958]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr5 158839423 rs192322474 G A no 8653465
chr5 158839433 rs144078667 T TACAGATGTAGAC
TAL1 ZBTB18
8653466
chr5 158839433 rs368828389 T TACAGATGTAGAC
TAL1 ZBTB18
8653467
chr5 158839453 rs540287267 G A
ELF1 GABPA SPIC
8653468
chr5 158839507 rs183643871 G A no 8653469
chr5 158839512 rs1422877 A G
SPIB
8653470
chr5 158839569 rs190787064 G A
SREBF1 SREBF2
8653471
chr5 158839720 rs368239444 C A
PRDM1
8653472
chr5 158839745 rs12651787 T C
POU2F2
8653473
chr5 158839865 rs544956376 C T
ELF5 ETS1
8653474
Genes possibly regulated by vista49889[chr5:158839407-158839958]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr5 158741791 158757895 - IL12B ENSG00000113302.4 158757895 0.99 0.93 5937 18488
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista49889[chr5:158839407-158839958]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results