EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista50064[chr5:169578231-169578535]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista50064[chr5:169578231-169578535]
Back to top
Tissue distribution of vista50064
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista50064[chr5:169578231-169578535]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr5 169578033 169578782 GABPA UCSC Txn Factor no Conserved 108537380
chr5 169578041 169578784 TCF7L2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537381
chr5 169578044 169578730 EP300 UCSC Txn Factor no Conserved 108537382
chr5 169578065 169578818 TEAD4 UCSC Txn Factor no Conserved 108537383
chr5 169578071 169578702 TCF12 UCSC Txn Factor no Conserved 108537384
chr5 169578180 169578665 JUND UCSC Txn Factor no Conserved 108537385
chr5 169578187 169578421 FOSL2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537386
chr5 169578225 169578875 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 108537387
chr5 169578274 169578900 GATA2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537388
chr5 169578382 169578664 CCNT2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537389
chr5 169578387 169578760 NR2F2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537390
chr5 169578392 169578641 ESR1 UCSC Txn Factor no Conserved 108537391
chr5 169578397 169578921 TFAP2C UCSC Txn Factor no Conserved 108537392
chr5 169578419 169578773 PML UCSC Txn Factor no Conserved 108537393
chr5 169578428 169578779 TAL1 UCSC Txn Factor no Conserved 108537394
chr5 169578441 169578683 JUNB UCSC Txn Factor no Conserved 108537395
chr5 169578464 169578664 FOSL1 UCSC Txn Factor no Conserved 108537396
chr5 169578471 169578706 STAT5A UCSC Txn Factor no Conserved 108537397
chr5 169578477 169578713 RCOR1 UCSC Txn Factor no Conserved 108537398
chr5 169578482 169578741 HDAC2 UCSC Txn Factor no Conserved 108537399
chr5 169578490 169578717 TRIM28 UCSC Txn Factor no Conserved 108537400
chr5 169578256 169578269 POU2F2 JASPAR yes 67670519
chr5 169578256 169578269 POU2F2 JASPAR yes 70757683
chr5 169578258 169578262 YY1 TRANSFAC yes 67670520
chr5 169578258 169578262 YY1 TRANSFAC yes 70757684
chr5 169578259 169578271 IRF1 JASPAR yes 67670521
chr5 169578259 169578271 IRF1 JASPAR yes 70757685
chr5 169578259 169578273 IRF8 JASPAR yes 67670522
chr5 169578259 169578273 IRF8 JASPAR yes 70757686
chr5 169578264 169578268 YY1 TRANSFAC yes 67670523
chr5 169578264 169578268 YY1 TRANSFAC yes 70757687
chr5 169578269 169578280 ESRRB JASPAR yes 67670524
chr5 169578269 169578280 ESRRB JASPAR yes 70757688
chr5 169578276 169578286 TEAD1 JASPAR yes 67670525
chr5 169578276 169578286 TEAD4 JASPAR yes 67670526
chr5 169578276 169578286 TEAD1 JASPAR yes 70757689
chr5 169578276 169578286 TEAD4 JASPAR yes 70757690
chr5 169578276 169578288 TEAD1 JASPAR yes 67670527
chr5 169578276 169578288 TEAD1 JASPAR yes 70757691
chr5 169578276 169578293 BCL6B JASPAR yes 67670528
chr5 169578276 169578293 BCL6B JASPAR yes 70757692
chr5 169578277 169578285 TEAD3 JASPAR yes 67670529
chr5 169578277 169578285 TEAD3 JASPAR yes 70757693
chr5 169578289 169578294 ETS2 TRANSFAC yes 67670530
chr5 169578289 169578294 ETS2 TRANSFAC yes 70757694
chr5 169578296 169578307 NFE2L2 JASPAR yes 67670531
chr5 169578296 169578307 NFE2L2 JASPAR yes 70757695
chr5 169578326 169578335 NFIX JASPAR yes 67670532
chr5 169578326 169578335 NFIX JASPAR yes 70757696
chr5 169578326 169578336 NFIA JASPAR yes 67670533
chr5 169578326 169578336 NFIA JASPAR yes 70757697
chr5 169578328 169578334 NFIC JASPAR yes 67670534
chr5 169578328 169578334 NFIC JASPAR yes 70757698
chr5 169578333 169578338 ETS2 TRANSFAC yes 67670535
chr5 169578333 169578338 ETS2 TRANSFAC yes 70757699
chr5 169578345 169578349 YY1 TRANSFAC yes 67670536
chr5 169578345 169578349 YY1 TRANSFAC yes 70757700
chr5 169578362 169578373 NFKB1 JASPAR yes 67670537
chr5 169578362 169578373 NFKB1 JASPAR yes 70757701
chr5 169578362 169578383 IRF1 JASPAR yes 67670538
chr5 169578362 169578383 IRF1 JASPAR yes 70757702
chr5 169578363 169578376 POU2F2 JASPAR yes 67670539
chr5 169578363 169578376 POU2F2 JASPAR yes 70757703
chr5 169578366 169578378 IRF1 JASPAR yes 67670540
chr5 169578366 169578378 IRF1 JASPAR yes 70757704
chr5 169578366 169578380 IRF7 JASPAR yes 67670541
chr5 169578366 169578380 IRF7 JASPAR yes 70757705
chr5 169578368 169578383 MEF2C JASPAR yes 67670542
chr5 169578368 169578383 MEF2C JASPAR yes 70757706
chr5 169578371 169578375 YY1 TRANSFAC yes 67670543
chr5 169578371 169578375 YY1 TRANSFAC yes 70757707
chr5 169578377 169578381 TEAD2 TRANSFAC yes 67670544
chr5 169578377 169578381 TEAD2 TRANSFAC yes 70757708
chr5 169578377 169578387 HESX1 JASPAR yes 67670545
chr5 169578377 169578387 HESX1 JASPAR yes 70757709
chr5 169578378 169578386 DLX6 JASPAR yes 67670546
chr5 169578378 169578386 MSX2 JASPAR yes 67670547
chr5 169578378 169578386 DLX6 JASPAR yes 70757710
chr5 169578378 169578386 MSX2 JASPAR yes 70757711
chr5 169578383 169578397 NR2F1 JASPAR yes 67670548
chr5 169578383 169578397 NR2F1 JASPAR yes 70757712
chr5 169578389 169578407 ESR2 JASPAR yes 67670549
chr5 169578389 169578407 ESR2 JASPAR yes 70757713
chr5 169578391 169578406 ESR2 JASPAR yes 67670550
chr5 169578391 169578406 ESR2 JASPAR yes 70757714
chr5 169578391 169578411 ESR1 JASPAR yes 67670551
chr5 169578391 169578411 ESR1 JASPAR yes 70757715
chr5 169578405 169578410 TFAP2A TRANSFAC yes 67670552
chr5 169578405 169578410 TFAP2A TRANSFAC yes 70757716
chr5 169578405 169578411 MZF1 JASPAR yes 67670553
chr5 169578405 169578411 MZF1 JASPAR yes 70757717
chr5 169578408 169578413 GATA2 JASPAR yes 67670554
chr5 169578408 169578413 GATA2 JASPAR yes 70757718
chr5 169578434 169578440 SOX10 JASPAR yes 67670555
chr5 169578434 169578440 SOX10 JASPAR yes 70757719
chr5 169578439 169578444 GATA1 TRANSFAC yes 67670556
chr5 169578439 169578444 GATA1 TRANSFAC yes 70757720
chr5 169578449 169578454 SP1 TRANSFAC yes 67670557
chr5 169578449 169578454 SP1 TRANSFAC yes 70757721
chr5 169578449 169578467 ESR1 JASPAR yes 67670558
chr5 169578449 169578467 ESR1 JASPAR yes 70757722
chr5 169578461 169578476 TFAP2A JASPAR yes 67670559
chr5 169578461 169578476 TFAP2C JASPAR yes 67670560
chr5 169578461 169578476 TFAP2A JASPAR yes 70757723
chr5 169578461 169578476 TFAP2C JASPAR yes 70757724
chr5 169578462 169578473 EBF1 JASPAR yes 67670561
chr5 169578462 169578473 EBF1 JASPAR yes 70757725
chr5 169578467 169578477 SP1 JASPAR yes 67670562
chr5 169578467 169578477 SP1 JASPAR yes 70757726
chr5 169578469 169578475 MAZ TRANSFAC yes 67670563
chr5 169578469 169578475 MAZ TRANSFAC yes 70757727
chr5 169578472 169578478 SP1 TRANSFAC yes 67670564
chr5 169578472 169578478 SP1 TRANSFAC yes 70757728
chr5 169578473 169578478 SP1 TRANSFAC yes 67670565
chr5 169578473 169578478 SP1 TRANSFAC yes 70757729
chr5 169578474 169578479 SP1 TRANSFAC yes 67670566
chr5 169578474 169578479 SP1 TRANSFAC yes 70757730
chr5 169578481 169578495 TLX1 JASPAR yes 67670567
chr5 169578481 169578495 TLX1 JASPAR yes 70757731
chr5 169578482 169578496 TLX1 JASPAR yes 67670568
chr5 169578482 169578496 TLX1 JASPAR yes 70757732
chr5 169578516 169578533 RARA JASPAR yes 67670569
chr5 169578516 169578533 RARA JASPAR yes 70757733
chr5 169578519 169578530 EBF1 JASPAR yes 67670570
chr5 169578519 169578530 EBF1 JASPAR yes 70757734
chr5 169578524 169578537 NR2F1 JASPAR yes 67670571
chr5 169578524 169578537 NR2F1 JASPAR yes 70757735
chr5 169578525 169578543 ESR2 JASPAR yes 67670572
chr5 169578525 169578543 ESR2 JASPAR yes 70757736
chr5 169578527 169578542 ESR2 JASPAR yes 67670573
chr5 169578527 169578542 ESR2 JASPAR yes 70757737
chr5 169578527 169578547 ESR1 JASPAR yes 67670574
chr5 169578527 169578547 ESR1 JASPAR yes 70757738
chr5 169578528 169578532 ESR1 TRANSFAC yes 67670575
chr5 169578528 169578532 ESR1 TRANSFAC yes 70757739
SNP sites on vista50064[chr5:169578231-169578535]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr5 169578235 rs73800718 G A
EP300 FOSL2 GABPA JUND POLR2A TCF12 TCF7L2 TEAD4
8688792
chr5 169578246 rs889004 T C
EP300 FOSL2 GABPA JUND POLR2A TCF12 TCF7L2 TEAD4
8688793
chr5 169578365 rs143687901 G A
EP300 FOSL2 GABPA GATA2 IRF1 JUND NFKB1 POLR2A POU2F2 TCF12 TCF7L2 TEAD4
8688794
chr5 169578389 rs13164988 C T
CCNT2 EP300 ESR2 FOSL2 GABPA GATA2 JUND NR2F1 NR2F2 POLR2A TCF12 TCF7L2 TEAD4
8688795
chr5 169578418 rs889005 T C
CCNT2 EP300 ESR1 FOSL2 GABPA GATA2 JUND NR2F2 POLR2A TCF12 TCF7L2 TEAD4 TFAP2C
8688796
chr5 169578469 rs76714813 G C
CCNT2 EBF1 EP300 ESR1 FOSL1 GABPA GATA2 JUNB JUND MAZ NR2F2 PML POLR2A SP1 TAL1 TCF12 TCF7L2 TEAD4 TFAP2A TFAP2C
8688797
chr5 169578478 rs79314466 G A
CCNT2 EP300 ESR1 FOSL1 GABPA GATA2 JUNB JUND NR2F2 PML POLR2A RCOR1 SP1 STAT5A TAL1 TCF12 TCF7L2 TEAD4 TFAP2C
8688798
Genes possibly regulated by vista50064[chr5:169578231-169578535]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr5 169532901 169536727 + FOXI1 ENSG00000168269.7 169532901 1.0 1.0 5966 54670
chr5 169659451 169679579 + C5orf58 ENSG00000234511.4 169659451 0.96 0.96 5967 19084
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista50064[chr5:169578231-169578535]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results