EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista50358[chr5:178598679-178598882]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista50358[chr5:178598679-178598882]
Back to top
Tissue distribution of vista50358
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista50358[chr5:178598679-178598882]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr5 178598670 178598685 HSF1 JASPAR yes 68156156
chr5 178598670 178598685 HSF1 JASPAR yes 70772464
chr5 178598681 178598687 PEA3 TRANSFAC yes 68156157
chr5 178598681 178598687 PEA3 TRANSFAC yes 70772465
chr5 178598681 178598702 ZNF263 JASPAR yes 68156158
chr5 178598681 178598702 ZNF263 JASPAR yes 70772466
chr5 178598682 178598690 EHF JASPAR yes 68156159
chr5 178598682 178598690 EHF JASPAR yes 70772467
chr5 178598685 178598695 SP1 JASPAR yes 68156160
chr5 178598685 178598695 SP1 JASPAR yes 70772468
chr5 178598686 178598696 SP1 JASPAR yes 68156161
chr5 178598686 178598696 SP1 JASPAR yes 70772469
chr5 178598687 178598692 SP1 TRANSFAC yes 68156162
chr5 178598687 178598692 SP1 TRANSFAC yes 70772470
chr5 178598688 178598693 SP1 TRANSFAC yes 68156163
chr5 178598688 178598693 SP1 TRANSFAC yes 70772471
chr5 178598688 178598694 SP1 TRANSFAC yes 68156164
chr5 178598688 178598694 SP1 TRANSFAC yes 70772472
chr5 178598713 178598718 SP1 TRANSFAC yes 68156165
chr5 178598713 178598718 SP1 TRANSFAC yes 70772473
chr5 178598716 178598720 LFA1 TRANSFAC yes 68156166
chr5 178598716 178598720 LFA1 TRANSFAC yes 70772474
chr5 178598725 178598735 SREBF1 JASPAR yes 68156167
chr5 178598725 178598735 SREBF2 JASPAR yes 68156168
chr5 178598725 178598735 SREBF1 JASPAR yes 70772475
chr5 178598725 178598735 SREBF2 JASPAR yes 70772476
chr5 178598735 178598741 TCF4 TRANSFAC yes 68156169
chr5 178598735 178598741 TCF4 TRANSFAC yes 70772477
chr5 178598751 178598760 THAP1 JASPAR yes 68156170
chr5 178598751 178598760 THAP1 JASPAR yes 70772478
chr5 178598754 178598758 LFA1 TRANSFAC yes 68156171
chr5 178598754 178598758 LFA1 TRANSFAC yes 70772479
chr5 178598792 178598807 HSF1 JASPAR yes 68156172
chr5 178598792 178598807 HSF1 JASPAR yes 70772480
chr5 178598793 178598806 HSF1 JASPAR yes 68156173
chr5 178598793 178598806 HSF2 JASPAR yes 68156174
chr5 178598793 178598806 HSF4 JASPAR yes 68156175
chr5 178598793 178598806 HSF1 JASPAR yes 70772481
chr5 178598793 178598806 HSF2 JASPAR yes 70772482
chr5 178598793 178598806 HSF4 JASPAR yes 70772483
chr5 178598795 178598805 TEAD1 JASPAR yes 68156176
chr5 178598795 178598805 TEAD4 JASPAR yes 68156177
chr5 178598795 178598805 TEAD1 JASPAR yes 70772484
chr5 178598795 178598805 TEAD4 JASPAR yes 70772485
chr5 178598796 178598804 TEAD3 JASPAR yes 68156178
chr5 178598796 178598804 TEAD3 JASPAR yes 70772486
chr5 178598797 178598812 HSF1 JASPAR yes 68156179
chr5 178598797 178598812 HSF1 JASPAR yes 70772487
chr5 178598798 178598811 HSF1 JASPAR yes 68156180
chr5 178598798 178598811 HSF2 JASPAR yes 68156181
chr5 178598798 178598811 HSF4 JASPAR yes 68156182
chr5 178598798 178598811 HSF1 JASPAR yes 70772488
chr5 178598798 178598811 HSF2 JASPAR yes 70772489
chr5 178598798 178598811 HSF4 JASPAR yes 70772490
chr5 178598802 178598817 HSF1 JASPAR yes 68156183
chr5 178598802 178598817 HSF1 JASPAR yes 70772491
chr5 178598803 178598816 HSF1 JASPAR yes 68156184
chr5 178598803 178598816 HSF2 JASPAR yes 68156185
chr5 178598803 178598816 HSF4 JASPAR yes 68156186
chr5 178598803 178598816 HSF1 JASPAR yes 70772492
chr5 178598803 178598816 HSF2 JASPAR yes 70772493
chr5 178598803 178598816 HSF4 JASPAR yes 70772494
chr5 178598807 178598822 HSF1 JASPAR yes 68156187
chr5 178598807 178598822 HSF1 JASPAR yes 70772495
chr5 178598808 178598821 HSF1 JASPAR yes 68156188
chr5 178598808 178598821 HSF2 JASPAR yes 68156189
chr5 178598808 178598821 HSF4 JASPAR yes 68156190
chr5 178598808 178598821 HSF1 JASPAR yes 70772496
chr5 178598808 178598821 HSF2 JASPAR yes 70772497
chr5 178598808 178598821 HSF4 JASPAR yes 70772498
chr5 178598809 178598819 TEAD1 JASPAR yes 68156191
chr5 178598809 178598819 TEAD4 JASPAR yes 68156192
chr5 178598809 178598819 TEAD1 JASPAR yes 70772499
chr5 178598809 178598819 TEAD4 JASPAR yes 70772500
chr5 178598810 178598818 TEAD3 JASPAR yes 68156193
chr5 178598810 178598818 TEAD3 JASPAR yes 70772501
chr5 178598823 178598827 H1TF2 TRANSFAC yes 68156194
chr5 178598823 178598827 NFE TRANSFAC yes 68156195
chr5 178598823 178598827 SRF TRANSFAC yes 68156196
chr5 178598823 178598827 H1TF2 TRANSFAC yes 70772502
chr5 178598823 178598827 NFE TRANSFAC yes 70772503
chr5 178598823 178598827 SRF TRANSFAC yes 70772504
chr5 178598824 178598838 PAX6 JASPAR yes 68156197
chr5 178598824 178598838 PAX6 JASPAR yes 70772505
SNP sites on vista50358[chr5:178598679-178598882]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr5 178598691 rs13184510 C T
SP1 ZNF263
8741351
chr5 178598743 rs75917504 G T no 8741352
chr5 178598769 rs545906756 TAGG T no 8741353
chr5 178598778 rs4700786 A G no 8741354
chr5 178598844 rs150200370 G A,C no 8741355
chr5 178598862 rs10079445 C T no 8741356
Genes possibly regulated by vista50358[chr5:178598679-178598882]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
Expression level of Genes
Back to top
No results
miRNAs possibly regulated by vista50358[chr5:178598679-178598882]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results