EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista52208[chr6:47382599-47382792]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista52208[chr6:47382599-47382792]
Back to top
Tissue distribution of vista52208
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista52208[chr6:47382599-47382792]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 47382475 47383100 STAT1 UCSC Txn Factor no Conserved 108540574
chr6 47382512 47382809 STAT2 UCSC Txn Factor no Conserved 108540575
chr6 47382518 47382784 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108540576
chr6 47382544 47382800 SPI1 UCSC Txn Factor no Conserved 108540577
chr6 47382598 47382610 GRHL1 JASPAR yes 70376376
chr6 47382598 47382610 GRHL1 JASPAR yes 102027443
chr6 47382599 47382609 TFCP2 JASPAR yes 70376377
chr6 47382599 47382609 TFCP2 JASPAR yes 102027444
chr6 47382605 47382616 CDX2 JASPAR yes 70376378
chr6 47382605 47382616 CDX2 JASPAR yes 102027445
chr6 47382613 47382624 STAT3 JASPAR yes 70376379
chr6 47382613 47382624 STAT3 JASPAR yes 102027446
chr6 47382623 47382643 RREB1 JASPAR yes 70376380
chr6 47382623 47382643 RREB1 JASPAR yes 102027447
chr6 47382632 47382645 DUXA JASPAR yes 70376381
chr6 47382632 47382645 DUXA JASPAR yes 102027448
chr6 47382633 47382644 DUX4 JASPAR yes 70376382
chr6 47382633 47382644 DUX4 JASPAR yes 102027449
chr6 47382633 47382648 IRF9 JASPAR yes 70376383
chr6 47382633 47382648 IRF9 JASPAR yes 102027450
chr6 47382634 47382652 IRF2 JASPAR yes 70376384
chr6 47382634 47382652 IRF2 JASPAR yes 102027451
chr6 47382635 47382656 IRF1 JASPAR yes 70376385
chr6 47382635 47382656 IRF1 JASPAR yes 102027452
chr6 47382637 47382652 STAT2 JASPAR yes 70376386
chr6 47382637 47382652 STAT2 JASPAR yes 102027453
chr6 47382638 47382652 STAT1 JASPAR yes 70376387
chr6 47382638 47382652 STAT1 JASPAR yes 102027454
chr6 47382639 47382653 IRF7 JASPAR yes 70376388
chr6 47382639 47382653 IRF8 JASPAR yes 70376389
chr6 47382639 47382653 IRF7 JASPAR yes 102027455
chr6 47382639 47382653 IRF8 JASPAR yes 102027456
chr6 47382639 47382654 IRF9 JASPAR yes 70376390
chr6 47382639 47382654 IRF9 JASPAR yes 102027457
chr6 47382662 47382683 IRF1 JASPAR yes 70376391
chr6 47382662 47382683 IRF1 JASPAR yes 102027458
chr6 47382665 47382679 IRF8 JASPAR yes 70376392
chr6 47382665 47382679 IRF8 JASPAR yes 102027459
chr6 47382666 47382680 SPI1 JASPAR yes 70376393
chr6 47382666 47382680 SPIC JASPAR yes 70376394
chr6 47382666 47382680 SPI1 JASPAR yes 102027460
chr6 47382666 47382680 SPIC JASPAR yes 102027461
chr6 47382666 47382681 STAT2 JASPAR yes 70376395
chr6 47382666 47382681 STAT2 JASPAR yes 102027462
chr6 47382667 47382680 ELF1 JASPAR yes 70376396
chr6 47382667 47382680 ELF1 JASPAR yes 102027463
chr6 47382667 47382688 ZNF263 JASPAR yes 70376397
chr6 47382667 47382688 ZNF263 JASPAR yes 102027464
chr6 47382668 47382680 EHF JASPAR yes 70376398
chr6 47382668 47382680 ELF1 JASPAR yes 70376399
chr6 47382668 47382680 ELF4 JASPAR yes 70376400
chr6 47382668 47382680 EHF JASPAR yes 102027465
chr6 47382668 47382680 ELF1 JASPAR yes 102027466
chr6 47382668 47382680 ELF4 JASPAR yes 102027467
chr6 47382668 47382681 ELF3 JASPAR yes 70376401
chr6 47382668 47382681 ELF3 JASPAR yes 102027468
chr6 47382669 47382680 ELF5 JASPAR yes 70376402
chr6 47382669 47382680 ETV2 JASPAR yes 70376403
chr6 47382669 47382680 SPDEF JASPAR yes 70376404
chr6 47382669 47382680 ELF5 JASPAR yes 102027469
chr6 47382669 47382680 ETV2 JASPAR yes 102027470
chr6 47382669 47382680 SPDEF JASPAR yes 102027471
chr6 47382670 47382680 ELK1 JASPAR yes 70376405
chr6 47382670 47382680 ELK3 JASPAR yes 70376406
chr6 47382670 47382680 ERF JASPAR yes 70376407
chr6 47382670 47382680 ERG JASPAR yes 70376408
chr6 47382670 47382680 ETS1 JASPAR yes 70376409
chr6 47382670 47382680 ETV1 JASPAR yes 70376410
chr6 47382670 47382680 ETV3 JASPAR yes 70376411
chr6 47382670 47382680 ETV4 JASPAR yes 70376412
chr6 47382670 47382680 ETV6 JASPAR yes 70376413
chr6 47382670 47382680 FEV JASPAR yes 70376414
chr6 47382670 47382680 FLI1 JASPAR yes 70376415
chr6 47382670 47382680 GABPA JASPAR yes 70376416
chr6 47382670 47382680 ELK1 JASPAR yes 102027472
chr6 47382670 47382680 ELK3 JASPAR yes 102027473
chr6 47382670 47382680 ERF JASPAR yes 102027474
chr6 47382670 47382680 ERG JASPAR yes 102027475
chr6 47382670 47382680 ETS1 JASPAR yes 102027476
chr6 47382670 47382680 ETV1 JASPAR yes 102027477
chr6 47382670 47382680 ETV3 JASPAR yes 102027478
chr6 47382670 47382680 ETV4 JASPAR yes 102027479
chr6 47382670 47382680 ETV6 JASPAR yes 102027480
chr6 47382670 47382680 FEV JASPAR yes 102027481
chr6 47382670 47382680 FLI1 JASPAR yes 102027482
chr6 47382670 47382680 GABPA JASPAR yes 102027483
chr6 47382670 47382681 ELK4 JASPAR yes 70376417
chr6 47382670 47382681 FLI1 JASPAR yes 70376418
chr6 47382670 47382681 ELK4 JASPAR yes 102027484
chr6 47382670 47382681 FLI1 JASPAR yes 102027485
chr6 47382671 47382679 EHF JASPAR yes 70376419
chr6 47382671 47382679 FEV JASPAR yes 70376420
chr6 47382671 47382679 EHF JASPAR yes 102027486
chr6 47382671 47382679 FEV JASPAR yes 102027487
chr6 47382672 47382679 SPI1 JASPAR yes 70376421
chr6 47382672 47382679 SPI1 JASPAR yes 102027488
chr6 47382685 47382700 LEF1 JASPAR yes 70376422
chr6 47382685 47382700 LEF1 JASPAR yes 102027489
chr6 47382686 47382707 IRF1 JASPAR yes 70376423
chr6 47382686 47382707 IRF1 JASPAR yes 102027490
chr6 47382688 47382703 IRF9 JASPAR yes 70376424
chr6 47382688 47382703 IRF9 JASPAR yes 102027491
chr6 47382689 47382703 IRF7 JASPAR yes 70376425
chr6 47382689 47382703 IRF7 JASPAR yes 102027492
chr6 47382690 47382704 SPIC JASPAR yes 70376426
chr6 47382690 47382704 SPIC JASPAR yes 102027493
chr6 47382690 47382705 PRDM1 JASPAR yes 70376427
chr6 47382690 47382705 PRDM1 JASPAR yes 102027494
chr6 47382700 47382714 NR2F1 JASPAR yes 70376428
chr6 47382700 47382714 NR2F1 JASPAR yes 102027495
chr6 47382703 47382709 TCF4 TRANSFAC yes 70376429
chr6 47382703 47382709 TCF4 TRANSFAC yes 102027496
chr6 47382722 47382736 FOXF2 JASPAR yes 70376430
chr6 47382722 47382736 FOXF2 JASPAR yes 102027497
chr6 47382723 47382738 MEF2A JASPAR yes 70376431
chr6 47382723 47382738 MEF2A JASPAR yes 102027498
chr6 47382724 47382736 MEF2A JASPAR yes 70376432
chr6 47382724 47382736 MEF2B JASPAR yes 70376433
chr6 47382724 47382736 MEF2D JASPAR yes 70376434
chr6 47382724 47382736 MEF2A JASPAR yes 102027499
chr6 47382724 47382736 MEF2B JASPAR yes 102027500
chr6 47382724 47382736 MEF2D JASPAR yes 102027501
chr6 47382725 47382735 MEF2A JASPAR yes 70376435
chr6 47382725 47382735 MEF2A JASPAR yes 102027502
chr6 47382758 47382763 H4TF1 TRANSFAC yes 70376436
chr6 47382758 47382763 H4TF1 TRANSFAC yes 102027503
chr6 47382763 47382775 TEAD1 JASPAR yes 70376437
chr6 47382763 47382775 TEAD1 JASPAR yes 102027504
chr6 47382765 47382775 TEAD1 JASPAR yes 70376438
chr6 47382765 47382775 TEAD4 JASPAR yes 70376439
chr6 47382765 47382775 TEAD1 JASPAR yes 102027505
chr6 47382765 47382775 TEAD4 JASPAR yes 102027506
chr6 47382766 47382774 TEAD3 JASPAR yes 70376440
chr6 47382766 47382774 TEAD3 JASPAR yes 102027507
chr6 47382767 47382782 FOXP1 JASPAR yes 70376441
chr6 47382767 47382782 FOXP1 JASPAR yes 102027508
chr6 47382768 47382779 FOXA1 JASPAR yes 70376442
chr6 47382768 47382779 FOXA1 JASPAR yes 102027509
chr6 47382768 47382780 POU3F1 JASPAR yes 70376443
chr6 47382768 47382780 POU3F1 JASPAR yes 102027510
chr6 47382768 47382781 POU2F2 JASPAR yes 70376444
chr6 47382768 47382781 POU2F2 JASPAR yes 102027511
chr6 47382768 47382783 FOXA1 JASPAR yes 70376445
chr6 47382768 47382783 FOXA1 JASPAR yes 102027512
chr6 47382769 47382778 POU3F4 JASPAR yes 70376446
chr6 47382769 47382778 POU5F1B JASPAR yes 70376447
chr6 47382769 47382778 POU3F4 JASPAR yes 102027513
chr6 47382769 47382778 POU5F1B JASPAR yes 102027514
chr6 47382769 47382780 FOXB1 JASPAR yes 70376448
chr6 47382769 47382780 FOXC1 JASPAR yes 70376449
chr6 47382769 47382780 FOXB1 JASPAR yes 102027515
chr6 47382769 47382780 FOXC1 JASPAR yes 102027516
chr6 47382769 47382781 FOXC2 JASPAR yes 70376450
chr6 47382769 47382781 FOXC2 JASPAR yes 102027517
chr6 47382779 47382794 LEF1 JASPAR yes 70376451
chr6 47382779 47382794 LEF1 JASPAR yes 102027518
SNP sites on vista52208[chr6:47382599-47382792]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 47382646 rs189153662 G A
IRF1 IRF2 IRF7 IRF8 IRF9 RUNX3 SPI1 STAT1 STAT2
9062153
Genes possibly regulated by vista52208[chr6:47382599-47382792]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 47445525 47594999 + CD2AP ENSG00000198087.7 47445525 0.82 0.97 6656 37267
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista52208[chr6:47382599-47382792]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results