EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista52720[chr6:89577904-89578284]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista52720[chr6:89577904-89578284]
Back to top
Tissue distribution of vista52720
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista52720[chr6:89577904-89578284]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 89577767 89578087 MAFK UCSC Txn Factor no Conserved 108540969
chr6 89577892 89577905 TFAP2B JASPAR yes 70398611
chr6 89577892 89577905 TFAP2B JASPAR yes 103380907
chr6 89577912 89577915 MYB TRANSFAC yes 70398612
chr6 89577912 89577915 MYB TRANSFAC yes 103380908
chr6 89577913 89577934 MAFG JASPAR yes 70398613
chr6 89577913 89577934 MAFG JASPAR yes 103380909
chr6 89577914 89577928 JUN JASPAR yes 70398614
chr6 89577914 89577928 JUN JASPAR yes 103380910
chr6 89577916 89577927 BATF JASPAR yes 70398615
chr6 89577916 89577927 BATF JASPAR yes 103380911
chr6 89577917 89577928 JUNB JASPAR yes 70398616
chr6 89577917 89577928 JUNB JASPAR yes 103380912
chr6 89577918 89577929 FOS JASPAR yes 70398617
chr6 89577918 89577929 FOSL1 JASPAR yes 70398618
chr6 89577918 89577929 JUND JASPAR yes 70398619
chr6 89577918 89577929 FOS JASPAR yes 103380913
chr6 89577918 89577929 FOSL1 JASPAR yes 103380914
chr6 89577918 89577929 JUND JASPAR yes 103380915
chr6 89577918 89577936 MAFF JASPAR yes 70398620
chr6 89577918 89577936 MAFF JASPAR yes 103380916
chr6 89577919 89577930 JUNB JASPAR yes 70398621
chr6 89577919 89577930 NFE2L2 JASPAR yes 70398622
chr6 89577919 89577930 JUNB JASPAR yes 103380917
chr6 89577919 89577930 NFE2L2 JASPAR yes 103380918
chr6 89577919 89577933 JUN JASPAR yes 70398623
chr6 89577919 89577933 JUN JASPAR yes 103380919
chr6 89577919 89577934 MAFK JASPAR yes 70398624
chr6 89577919 89577934 MAFK JASPAR yes 103380920
chr6 89577920 89577931 BATF JASPAR yes 70398625
chr6 89577920 89577931 BATF JASPAR yes 103380921
chr6 89577923 89577934 NRL JASPAR yes 70398626
chr6 89577923 89577934 NRL JASPAR yes 103380922
chr6 89577923 89577939 NFYA JASPAR yes 70398627
chr6 89577923 89577939 NFYA JASPAR yes 103380923
chr6 89577931 89577941 FIGLA JASPAR yes 70398628
chr6 89577931 89577941 SREBF2 JASPAR yes 70398629
chr6 89577931 89577941 FIGLA JASPAR yes 103380924
chr6 89577931 89577941 SREBF2 JASPAR yes 103380925
chr6 89577938 89577942 H4TF2 TRANSFAC yes 70398630
chr6 89577938 89577942 H4TF2 TRANSFAC yes 103380926
chr6 89577961 89577969 GATA3 JASPAR yes 70398631
chr6 89577961 89577969 GATA3 JASPAR yes 103380927
chr6 89577976 89577980 YY1 TRANSFAC yes 70398632
chr6 89577976 89577980 YY1 TRANSFAC yes 103380928
chr6 89578014 89578028 BATF3 JASPAR yes 70398633
chr6 89578014 89578028 BATF3 JASPAR yes 103380929
chr6 89578016 89578029 JUN JASPAR yes 70398634
chr6 89578016 89578029 JUN JASPAR yes 103380930
chr6 89578017 89578024 JUN TRANSFAC yes 70398635
chr6 89578017 89578024 JUN TRANSFAC yes 103380931
chr6 89578024 89578038 NR2F1 JASPAR yes 70398636
chr6 89578024 89578038 NR2F1 JASPAR yes 103380932
chr6 89578056 89578071 HNF1A JASPAR yes 70398637
chr6 89578056 89578071 HNF1A JASPAR yes 103380933
chr6 89578057 89578070 HNF1B JASPAR yes 70398638
chr6 89578057 89578070 HNF1B JASPAR yes 103380934
chr6 89578060 89578071 HOXC11 JASPAR yes 70398639
chr6 89578060 89578071 HOXD12 JASPAR yes 70398640
chr6 89578060 89578071 HOXC11 JASPAR yes 103380935
chr6 89578060 89578071 HOXD12 JASPAR yes 103380936
chr6 89578061 89578071 HOXC10 JASPAR yes 70398641
chr6 89578061 89578071 HOXD11 JASPAR yes 70398642
chr6 89578061 89578071 HOXC10 JASPAR yes 103380937
chr6 89578061 89578071 HOXD11 JASPAR yes 103380938
chr6 89578063 89578067 YY1 TRANSFAC yes 70398643
chr6 89578063 89578067 YY1 TRANSFAC yes 103380939
chr6 89578074 89578086 TGIF1 JASPAR yes 70398644
chr6 89578074 89578086 TGIF1 JASPAR yes 103380940
chr6 89578085 89578100 FOXP1 JASPAR yes 70398645
chr6 89578085 89578100 FOXP1 JASPAR yes 103380941
chr6 89578086 89578097 FOXA1 JASPAR yes 70398646
chr6 89578086 89578097 FOXA1 JASPAR yes 103380942
chr6 89578086 89578101 FOXA1 JASPAR yes 70398647
chr6 89578086 89578101 FOXA1 JASPAR yes 103380943
chr6 89578087 89578098 FOXB1 JASPAR yes 70398648
chr6 89578087 89578098 FOXC1 JASPAR yes 70398649
chr6 89578087 89578098 FOXB1 JASPAR yes 103380944
chr6 89578087 89578098 FOXC1 JASPAR yes 103380945
chr6 89578087 89578099 FOXC2 JASPAR yes 70398650
chr6 89578087 89578099 FOXC2 JASPAR yes 103380946
chr6 89578088 89578099 FOXP2 JASPAR yes 70398651
chr6 89578088 89578099 FOXP2 JASPAR yes 103380947
chr6 89578089 89578093 TEAD2 TRANSFAC yes 70398652
chr6 89578089 89578093 TEAD2 TRANSFAC yes 103380948
chr6 89578089 89578094 TBP TRANSFAC yes 70398653
chr6 89578089 89578094 TBP TRANSFAC yes 103380949
chr6 89578090 89578098 FOXG1 JASPAR yes 70398654
chr6 89578090 89578098 FOXO3 JASPAR yes 70398655
chr6 89578090 89578098 FOXG1 JASPAR yes 103380950
chr6 89578090 89578098 FOXO3 JASPAR yes 103380951
chr6 89578094 89578100 SOX10 JASPAR yes 70398656
chr6 89578094 89578100 SOX10 JASPAR yes 103380952
chr6 89578116 89578127 DMRT3 JASPAR yes 70398657
chr6 89578116 89578127 DMRT3 JASPAR yes 103380953
chr6 89578120 89578123 MYB TRANSFAC yes 70398658
chr6 89578120 89578123 MYB TRANSFAC yes 103380954
chr6 89578142 89578145 MYB TRANSFAC yes 70398659
chr6 89578142 89578145 MYB TRANSFAC yes 103380955
chr6 89578151 89578154 MYB TRANSFAC yes 70398660
chr6 89578151 89578154 MYB TRANSFAC yes 103380956
chr6 89578166 89578172 SOX10 JASPAR yes 70398661
chr6 89578166 89578172 SOX10 JASPAR yes 103380957
chr6 89578174 89578185 FOXH1 JASPAR yes 70398662
chr6 89578174 89578185 FOXH1 JASPAR yes 103380958
chr6 89578175 89578181 ZNF354C JASPAR yes 70398663
chr6 89578175 89578181 ZNF354C JASPAR yes 103380959
chr6 89578182 89578198 POU4F2 JASPAR yes 70398664
chr6 89578182 89578198 POU4F3 JASPAR yes 70398665
chr6 89578182 89578198 POU4F2 JASPAR yes 103380960
chr6 89578182 89578198 POU4F3 JASPAR yes 103380961
chr6 89578184 89578198 POU4F1 JASPAR yes 70398666
chr6 89578184 89578198 POU4F1 JASPAR yes 103380962
chr6 89578184 89578199 HNF1A JASPAR yes 70398667
chr6 89578184 89578199 HNF1A JASPAR yes 103380963
chr6 89578185 89578197 HNF1B JASPAR yes 70398668
chr6 89578185 89578197 HNF1B JASPAR yes 103380964
chr6 89578185 89578198 HNF1B JASPAR yes 70398669
chr6 89578185 89578198 HNF1B JASPAR yes 103380965
chr6 89578185 89578199 POU4F1 JASPAR yes 70398670
chr6 89578185 89578199 POU4F1 JASPAR yes 103380966
chr6 89578185 89578201 POU4F2 JASPAR yes 70398671
chr6 89578185 89578201 POU4F3 JASPAR yes 70398672
chr6 89578185 89578201 POU4F2 JASPAR yes 103380967
chr6 89578185 89578201 POU4F3 JASPAR yes 103380968
chr6 89578204 89578208 H4TF2 TRANSFAC yes 70398673
chr6 89578204 89578208 H4TF2 TRANSFAC yes 103380969
chr6 89578234 89578255 ZNF263 JASPAR yes 70398674
chr6 89578234 89578255 ZNF263 JASPAR yes 103380970
chr6 89578250 89578260 SP1 JASPAR yes 70398675
chr6 89578250 89578260 SP1 JASPAR yes 103380971
chr6 89578252 89578273 ZNF263 JASPAR yes 70398676
chr6 89578252 89578273 ZNF263 JASPAR yes 103380972
chr6 89578255 89578276 ZNF263 JASPAR yes 70398677
chr6 89578255 89578276 ZNF263 JASPAR yes 103380973
chr6 89578261 89578272 FOS JASPAR yes 70398678
chr6 89578261 89578272 FOS JASPAR yes 103380974
chr6 89578262 89578273 FOSL2 JASPAR yes 70398679
chr6 89578262 89578273 JUNB JASPAR yes 70398680
chr6 89578262 89578273 FOSL2 JASPAR yes 103380975
chr6 89578262 89578273 JUNB JASPAR yes 103380976
chr6 89578262 89578276 JUN JASPAR yes 70398681
chr6 89578262 89578276 JUN JASPAR yes 103380977
chr6 89578263 89578274 BATF JASPAR yes 70398682
chr6 89578263 89578274 BATF JASPAR yes 103380978
chr6 89578266 89578287 ZNF263 JASPAR yes 70398683
chr6 89578266 89578287 ZNF263 JASPAR yes 103380979
chr6 89578269 89578290 ZNF263 JASPAR yes 70398684
chr6 89578269 89578290 ZNF263 JASPAR yes 103380980
chr6 89578274 89578285 BATF JASPAR yes 70398685
chr6 89578274 89578285 BATF JASPAR yes 103380981
SNP sites on vista52720[chr6:89577904-89578284]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 89578146 rs117904079 C T no 9181151
Genes possibly regulated by vista52720[chr6:89577904-89578284]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 89319985 89673348 - RNGTT ENSG00000111880.11 89673348 0.63 0.99 6796 4936
chr6 89674246 89676685 + AL079342.1 ENSG00000203863.1 89674246 0.92 0.85 6797 4038
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista52720[chr6:89577904-89578284]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results