EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista52732[chr6:89796215-89796534]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista52732[chr6:89796215-89796534]
Back to top
Tissue distribution of vista52732
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista52732[chr6:89796215-89796534]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 89796212 89796227 MEF2C JASPAR yes 70399263
chr6 89796212 89796227 MEF2C JASPAR yes 103395118
chr6 89796215 89796230 FOXP1 JASPAR yes 70399264
chr6 89796215 89796230 FOXP1 JASPAR yes 103395119
chr6 89796216 89796231 FOXP1 JASPAR yes 70399265
chr6 89796216 89796231 FOXP1 JASPAR yes 103395120
chr6 89796216 89796237 IRF1 JASPAR yes 70399266
chr6 89796216 89796237 IRF1 JASPAR yes 103395121
chr6 89796217 89796232 FOXP1 JASPAR yes 70399267
chr6 89796217 89796232 FOXP1 JASPAR yes 103395122
chr6 89796217 89796238 IRF1 JASPAR yes 70399268
chr6 89796217 89796238 IRF1 JASPAR yes 103395123
chr6 89796218 89796233 FOXP1 JASPAR yes 70399269
chr6 89796218 89796233 FOXP1 JASPAR yes 103395124
chr6 89796218 89796239 IRF1 JASPAR yes 70399270
chr6 89796218 89796239 IRF1 JASPAR yes 103395125
chr6 89796219 89796234 FOXP1 JASPAR yes 70399271
chr6 89796219 89796234 FOXP1 JASPAR yes 103395126
chr6 89796219 89796240 IRF1 JASPAR yes 70399272
chr6 89796219 89796240 IRF1 JASPAR yes 103395127
chr6 89796220 89796235 FOXP1 JASPAR yes 70399273
chr6 89796220 89796235 FOXP1 JASPAR yes 103395128
chr6 89796220 89796241 IRF1 JASPAR yes 70399274
chr6 89796220 89796241 IRF1 JASPAR yes 103395129
chr6 89796221 89796236 FOXP1 JASPAR yes 70399275
chr6 89796221 89796236 FOXP1 JASPAR yes 103395130
chr6 89796221 89796242 IRF1 JASPAR yes 70399276
chr6 89796221 89796242 IRF1 JASPAR yes 103395131
chr6 89796222 89796237 FOXP1 JASPAR yes 70399277
chr6 89796222 89796237 FOXP1 JASPAR yes 103395132
chr6 89796222 89796243 IRF1 JASPAR yes 70399278
chr6 89796222 89796243 IRF1 JASPAR yes 103395133
chr6 89796223 89796238 FOXP1 JASPAR yes 70399279
chr6 89796223 89796238 FOXP1 JASPAR yes 103395134
chr6 89796223 89796244 IRF1 JASPAR yes 70399280
chr6 89796223 89796244 IRF1 JASPAR yes 103395135
chr6 89796224 89796239 FOXP1 JASPAR yes 70399281
chr6 89796224 89796239 FOXP1 JASPAR yes 103395136
chr6 89796224 89796245 IRF1 JASPAR yes 70399282
chr6 89796224 89796245 IRF1 JASPAR yes 103395137
chr6 89796225 89796240 FOXP1 JASPAR yes 70399283
chr6 89796225 89796240 FOXP1 JASPAR yes 103395138
chr6 89796225 89796246 IRF1 JASPAR yes 70399284
chr6 89796225 89796246 IRF1 JASPAR yes 103395139
chr6 89796226 89796241 FOXP1 JASPAR yes 70399285
chr6 89796226 89796241 FOXP1 JASPAR yes 103395140
chr6 89796226 89796247 IRF1 JASPAR yes 70399286
chr6 89796226 89796247 IRF1 JASPAR yes 103395141
chr6 89796227 89796242 FOXP1 JASPAR yes 70399287
chr6 89796227 89796242 FOXP1 JASPAR yes 103395142
chr6 89796227 89796248 IRF1 JASPAR yes 70399288
chr6 89796227 89796248 IRF1 JASPAR yes 103395143
chr6 89796228 89796243 FOXP1 JASPAR yes 70399289
chr6 89796228 89796243 FOXP1 JASPAR yes 103395144
chr6 89796228 89796249 IRF1 JASPAR yes 70399290
chr6 89796228 89796249 IRF1 JASPAR yes 103395145
chr6 89796229 89796244 FOXP1 JASPAR yes 70399291
chr6 89796229 89796244 FOXP1 JASPAR yes 103395146
chr6 89796229 89796250 IRF1 JASPAR yes 70399292
chr6 89796229 89796250 IRF1 JASPAR yes 103395147
chr6 89796230 89796245 FOXP1 JASPAR yes 70399293
chr6 89796230 89796245 FOXP1 JASPAR yes 103395148
chr6 89796230 89796251 IRF1 JASPAR yes 70399294
chr6 89796230 89796251 IRF1 JASPAR yes 103395149
chr6 89796231 89796246 FOXP1 JASPAR yes 70399295
chr6 89796231 89796246 FOXP1 JASPAR yes 103395150
chr6 89796231 89796252 IRF1 JASPAR yes 70399296
chr6 89796231 89796252 IRF1 JASPAR yes 103395151
chr6 89796232 89796247 FOXP1 JASPAR yes 70399297
chr6 89796232 89796247 FOXP1 JASPAR yes 103395152
chr6 89796232 89796253 IRF1 JASPAR yes 70399298
chr6 89796232 89796253 IRF1 JASPAR yes 103395153
chr6 89796233 89796248 FOXP1 JASPAR yes 70399299
chr6 89796233 89796248 FOXP1 JASPAR yes 103395154
chr6 89796234 89796249 FOXP1 JASPAR yes 70399300
chr6 89796234 89796249 FOXP1 JASPAR yes 103395155
chr6 89796234 89796255 IRF1 JASPAR yes 70399301
chr6 89796234 89796255 IRF1 JASPAR yes 103395156
chr6 89796235 89796250 FOXP1 JASPAR yes 70399302
chr6 89796235 89796250 FOXP1 JASPAR yes 103395157
chr6 89796236 89796251 FOXP1 JASPAR yes 70399303
chr6 89796236 89796251 FOXP1 JASPAR yes 103395158
chr6 89796236 89796257 IRF1 JASPAR yes 70399304
chr6 89796236 89796257 IRF1 JASPAR yes 103395159
chr6 89796237 89796252 FOXP1 JASPAR yes 70399305
chr6 89796237 89796252 FOXP1 JASPAR yes 103395160
chr6 89796240 89796258 NR3C1 JASPAR yes 70399306
chr6 89796240 89796258 NR3C1 JASPAR yes 103395161
chr6 89796245 89796261 SOX8 JASPAR yes 70399307
chr6 89796245 89796261 SOX8 JASPAR yes 103395162
chr6 89796252 89796268 SOX8 JASPAR yes 70399308
chr6 89796252 89796268 SOX8 JASPAR yes 103395163
chr6 89796273 89796279 HiNF-A TRANSFAC yes 70399309
chr6 89796273 89796279 HiNF-A TRANSFAC yes 103395164
chr6 89796276 89796297 ZNF263 JASPAR yes 70399310
chr6 89796276 89796297 ZNF263 JASPAR yes 103395165
chr6 89796285 89796290 ETS2 TRANSFAC yes 70399311
chr6 89796285 89796290 ETS2 TRANSFAC yes 103395166
chr6 89796285 89796293 EHF JASPAR yes 70399312
chr6 89796285 89796293 EHF JASPAR yes 103395167
chr6 89796291 89796296 ETS2 TRANSFAC yes 70399313
chr6 89796291 89796296 ETS2 TRANSFAC yes 103395168
chr6 89796319 89796334 AR JASPAR yes 70399314
chr6 89796319 89796334 AR JASPAR yes 103395169
chr6 89796343 89796355 EHF JASPAR yes 70399315
chr6 89796343 89796355 EHF JASPAR yes 103395170
chr6 89796343 89796356 ELF3 JASPAR yes 70399316
chr6 89796343 89796356 ELF3 JASPAR yes 103395171
chr6 89796344 89796355 ELF5 JASPAR yes 70399317
chr6 89796344 89796355 ELF5 JASPAR yes 103395172
chr6 89796345 89796355 GABPA JASPAR yes 70399318
chr6 89796345 89796355 GABPA JASPAR yes 103395173
chr6 89796347 89796353 ETS1 JASPAR yes 70399319
chr6 89796347 89796353 SPI1 JASPAR yes 70399320
chr6 89796347 89796353 ETS1 JASPAR yes 103395174
chr6 89796347 89796353 SPI1 JASPAR yes 103395175
chr6 89796364 89796368 YY1 TRANSFAC yes 70399321
chr6 89796364 89796368 YY1 TRANSFAC yes 103395176
chr6 89796391 89796402 HOXC13 JASPAR yes 70399322
chr6 89796391 89796402 HOXD12 JASPAR yes 70399323
chr6 89796391 89796402 HOXC13 JASPAR yes 103395177
chr6 89796391 89796402 HOXD12 JASPAR yes 103395178
chr6 89796393 89796404 BATF JASPAR yes 70399324
chr6 89796393 89796404 BATF JASPAR yes 103395179
chr6 89796397 89796403 JUN TRANSFAC yes 70399325
chr6 89796397 89796403 JUN TRANSFAC yes 103395180
chr6 89796424 89796442 NR3C1 JASPAR yes 70399326
chr6 89796424 89796442 NR3C1 JASPAR yes 103395181
chr6 89796456 89796462 GATA1 TRANSFAC yes 70399327
chr6 89796456 89796462 GATA1 TRANSFAC yes 103395182
chr6 89796456 89796464 GATA5 JASPAR yes 70399328
chr6 89796456 89796464 GATA5 JASPAR yes 103395183
chr6 89796457 89796472 PRDM1 JASPAR yes 70399329
chr6 89796457 89796472 PRDM1 JASPAR yes 103395184
chr6 89796480 89796487 NKX3-1 JASPAR yes 70399330
chr6 89796480 89796487 NKX3-1 JASPAR yes 103395185
chr6 89796492 89796497 GATA2 JASPAR yes 70399331
chr6 89796492 89796497 GATA2 JASPAR yes 103395186
chr6 89796495 89796499 YY1 TRANSFAC yes 70399332
chr6 89796495 89796499 YY1 TRANSFAC yes 103395187
chr6 89796508 89796523 PRDM1 JASPAR yes 70399333
chr6 89796508 89796523 PRDM1 JASPAR yes 103395188
chr6 89796521 89796534 TFAP2A JASPAR yes 70399334
chr6 89796521 89796534 TFAP2B JASPAR yes 70399335
chr6 89796521 89796534 TFAP2C JASPAR yes 70399336
chr6 89796521 89796534 TFAP2A JASPAR yes 103395189
chr6 89796521 89796534 TFAP2B JASPAR yes 103395190
chr6 89796521 89796534 TFAP2C JASPAR yes 103395191
chr6 89796529 89796533 LFA1 TRANSFAC yes 70399337
chr6 89796529 89796533 LFA1 TRANSFAC yes 103395192
chr6 89796532 89796536 YY1 TRANSFAC yes 70399338
chr6 89796532 89796536 YY1 TRANSFAC yes 103395193
SNP sites on vista52732[chr6:89796215-89796534]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 89796217 rs572319154 CAAAAAAAAAAAA C
FOXP1 IRF1 MEF2C
9182390
chr6 89796343 rs372211947 T G
EHF ELF3
9182391
chr6 89796481 rs79411904 T G
NKX3-1
9182392
Genes possibly regulated by vista52732[chr6:89796215-89796534]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 89790470 89794879 + PNRC1 ENSG00000146278.10 89790470 0.71 1.0 6798 94255
chr6 89805678 89827800 - SRSF12 ENSG00000154548.8 89827800 0.94 0.87 6799 68734
chr6 89855769 89875284 + PM20D2 ENSG00000146281.5 89855769 0.69 0.99 6800 40765
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista52732[chr6:89796215-89796534]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results