EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista53075[chr6:109780095-109780443]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista53075[chr6:109780095-109780443]
Back to top
Tissue distribution of vista53075
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista53075[chr6:109780095-109780443]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 109780058 109780345 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108541265
chr6 109780117 109780125 E2F1 JASPAR yes 70415320
chr6 109780117 109780125 E2F1 JASPAR yes 104249769
chr6 109780117 109780130 SCRT2 JASPAR yes 70415321
chr6 109780117 109780130 SCRT2 JASPAR yes 104249770
chr6 109780144 109780151 PEA3 TRANSFAC yes 70415322
chr6 109780144 109780151 PEA3 TRANSFAC yes 104249771
chr6 109780162 109780174 PBX1 JASPAR yes 70415323
chr6 109780162 109780174 PBX1 JASPAR yes 104249772
chr6 109780165 109780176 RUNX1 JASPAR yes 70415324
chr6 109780165 109780176 RUNX1 JASPAR yes 104249773
chr6 109780169 109780183 RXRB JASPAR yes 70415325
chr6 109780169 109780183 RXRG JASPAR yes 70415326
chr6 109780169 109780183 RXRB JASPAR yes 104249774
chr6 109780169 109780183 RXRG JASPAR yes 104249775
chr6 109780193 109780204 FOS JASPAR yes 70415327
chr6 109780193 109780204 JUND JASPAR yes 70415328
chr6 109780193 109780204 FOS JASPAR yes 104249776
chr6 109780193 109780204 JUND JASPAR yes 104249777
chr6 109780195 109780201 JUN TRANSFAC yes 70415329
chr6 109780195 109780201 JUN TRANSFAC yes 104249778
chr6 109780208 109780212 LFA1 TRANSFAC yes 70415330
chr6 109780208 109780212 LFA1 TRANSFAC yes 104249779
chr6 109780234 109780244 FIGLA JASPAR yes 70415331
chr6 109780234 109780244 TCF3 JASPAR yes 70415332
chr6 109780234 109780244 FIGLA JASPAR yes 104249780
chr6 109780234 109780244 TCF3 JASPAR yes 104249781
chr6 109780235 109780244 SNAI2 JASPAR yes 70415333
chr6 109780235 109780244 SNAI2 JASPAR yes 104249782
chr6 109780236 109780241 USF2 TRANSFAC yes 70415334
chr6 109780236 109780241 USF2 TRANSFAC yes 104249783
chr6 109780244 109780250 SOX10 JASPAR yes 70415335
chr6 109780244 109780250 SOX10 JASPAR yes 104249784
chr6 109780248 109780260 TFAP2A JASPAR yes 70415336
chr6 109780248 109780260 TFAP2B JASPAR yes 70415337
chr6 109780248 109780260 TFAP2C JASPAR yes 70415338
chr6 109780248 109780260 TFAP2A JASPAR yes 104249785
chr6 109780248 109780260 TFAP2B JASPAR yes 104249786
chr6 109780248 109780260 TFAP2C JASPAR yes 104249787
chr6 109780248 109780263 TFAP2A JASPAR yes 70415339
chr6 109780248 109780263 TFAP2A JASPAR yes 104249788
chr6 109780268 109780288 TP53 JASPAR yes 70415340
chr6 109780268 109780288 TP53 JASPAR yes 104249789
chr6 109780279 109780284 TFAP2A TRANSFAC yes 70415341
chr6 109780279 109780284 TFAP2A TRANSFAC yes 104249790
chr6 109780279 109780285 MZF1 JASPAR yes 70415342
chr6 109780279 109780285 MZF1 JASPAR yes 104249791
chr6 109780290 109780295 ETS2 TRANSFAC yes 70415343
chr6 109780290 109780295 ETS2 TRANSFAC yes 104249792
chr6 109780294 109780304 MAX JASPAR yes 70415344
chr6 109780294 109780304 MAX JASPAR yes 104249793
chr6 109780294 109780305 USF2 JASPAR yes 70415345
chr6 109780294 109780305 USF2 JASPAR yes 104249794
chr6 109780295 109780305 BHLHE40 JASPAR yes 70415346
chr6 109780295 109780305 BHLHE41 JASPAR yes 70415347
chr6 109780295 109780305 MAX JASPAR yes 70415348
chr6 109780295 109780305 MLXIPL JASPAR yes 70415349
chr6 109780295 109780305 MLX JASPAR yes 70415350
chr6 109780295 109780305 MNT JASPAR yes 70415351
chr6 109780295 109780305 SREBF2 JASPAR yes 70415352
chr6 109780295 109780305 TFE3 JASPAR yes 70415353
chr6 109780295 109780305 TFEB JASPAR yes 70415354
chr6 109780295 109780305 TFEC JASPAR yes 70415355
chr6 109780295 109780305 BHLHE40 JASPAR yes 104249795
chr6 109780295 109780305 BHLHE41 JASPAR yes 104249796
chr6 109780295 109780305 MAX JASPAR yes 104249797
chr6 109780295 109780305 MLXIPL JASPAR yes 104249798
chr6 109780295 109780305 MLX JASPAR yes 104249799
chr6 109780295 109780305 MNT JASPAR yes 104249800
chr6 109780295 109780305 SREBF2 JASPAR yes 104249801
chr6 109780295 109780305 TFE3 JASPAR yes 104249802
chr6 109780295 109780305 TFEB JASPAR yes 104249803
chr6 109780295 109780305 TFEC JASPAR yes 104249804
chr6 109780295 109780306 USF1 JASPAR yes 70415356
chr6 109780295 109780306 USF2 JASPAR yes 70415357
chr6 109780295 109780306 USF1 JASPAR yes 104249805
chr6 109780295 109780306 USF2 JASPAR yes 104249806
chr6 109780296 109780303 USF1 JASPAR yes 70415358
chr6 109780296 109780303 USF1 JASPAR yes 104249807
chr6 109780297 109780302 MYC TRANSFAC yes 70415359
chr6 109780297 109780302 USF1 TRANSFAC yes 70415360
chr6 109780297 109780302 USF2 TRANSFAC yes 70415361
chr6 109780297 109780302 MYC TRANSFAC yes 104249808
chr6 109780297 109780302 USF1 TRANSFAC yes 104249809
chr6 109780297 109780302 USF2 TRANSFAC yes 104249810
chr6 109780306 109780327 ZNF263 JASPAR yes 70415362
chr6 109780306 109780327 ZNF263 JASPAR yes 104249811
chr6 109780311 109780325 SPI1 JASPAR yes 70415363
chr6 109780311 109780325 SPIC JASPAR yes 70415364
chr6 109780311 109780325 SPI1 JASPAR yes 104249812
chr6 109780311 109780325 SPIC JASPAR yes 104249813
chr6 109780312 109780322 MZF1 JASPAR yes 70415365
chr6 109780312 109780322 MZF1 JASPAR yes 104249814
chr6 109780315 109780320 TFAP2A TRANSFAC yes 70415366
chr6 109780315 109780320 TFAP2A TRANSFAC yes 104249815
chr6 109780315 109780321 MZF1 JASPAR yes 70415367
chr6 109780315 109780321 MZF1 JASPAR yes 104249816
chr6 109780317 109780322 ETS2 TRANSFAC yes 70415368
chr6 109780317 109780322 ETS2 TRANSFAC yes 104249817
chr6 109780324 109780338 PLAG1 JASPAR yes 70415369
chr6 109780324 109780338 PLAG1 JASPAR yes 104249818
chr6 109780325 109780329 H4TF2 TRANSFAC yes 70415370
chr6 109780325 109780329 H4TF2 TRANSFAC yes 104249819
chr6 109780326 109780337 EBF1 JASPAR yes 70415371
chr6 109780326 109780337 EBF1 JASPAR yes 104249820
chr6 109780328 109780342 SPI1 JASPAR yes 70415372
chr6 109780328 109780342 SPIC JASPAR yes 70415373
chr6 109780328 109780342 SPI1 JASPAR yes 104249821
chr6 109780328 109780342 SPIC JASPAR yes 104249822
chr6 109780331 109780342 ELF5 JASPAR yes 70415374
chr6 109780331 109780342 ELF5 JASPAR yes 104249823
chr6 109780332 109780339 SPIB JASPAR yes 70415375
chr6 109780332 109780339 SPIB JASPAR yes 104249824
chr6 109780332 109780342 ETV6 JASPAR yes 70415376
chr6 109780332 109780342 ETV6 JASPAR yes 104249825
chr6 109780332 109780343 FLI1 JASPAR yes 70415377
chr6 109780332 109780343 FLI1 JASPAR yes 104249826
chr6 109780333 109780341 EHF JASPAR yes 70415378
chr6 109780333 109780341 EHF JASPAR yes 104249827
chr6 109780334 109780341 SPI1 JASPAR yes 70415379
chr6 109780334 109780341 SPI1 JASPAR yes 104249828
chr6 109780357 109780375 NFYA JASPAR yes 70415380
chr6 109780357 109780375 NFYA JASPAR yes 104249829
chr6 109780361 109780365 H1TF2 TRANSFAC yes 70415381
chr6 109780361 109780365 NFE TRANSFAC yes 70415382
chr6 109780361 109780365 SRF TRANSFAC yes 70415383
chr6 109780361 109780365 H1TF2 TRANSFAC yes 104249830
chr6 109780361 109780365 NFE TRANSFAC yes 104249831
chr6 109780361 109780365 SRF TRANSFAC yes 104249832
chr6 109780363 109780373 NFATC3 JASPAR yes 70415384
chr6 109780363 109780373 NFATC3 JASPAR yes 104249833
chr6 109780403 109780420 ESR1 JASPAR yes 70415385
chr6 109780403 109780420 ESR1 JASPAR yes 104249834
chr6 109780405 109780409 ESR1 TRANSFAC yes 70415386
chr6 109780405 109780409 ESR1 TRANSFAC yes 104249835
chr6 109780407 109780419 FOXI1 JASPAR yes 70415387
chr6 109780407 109780419 FOXI1 JASPAR yes 104249836
chr6 109780408 109780422 FOXF2 JASPAR yes 70415388
chr6 109780408 109780422 FOXF2 JASPAR yes 104249837
chr6 109780409 109780420 FOXB1 JASPAR yes 70415389
chr6 109780409 109780420 FOXC1 JASPAR yes 70415390
chr6 109780409 109780420 FOXB1 JASPAR yes 104249838
chr6 109780409 109780420 FOXC1 JASPAR yes 104249839
chr6 109780410 109780414 YY1 TRANSFAC yes 70415391
chr6 109780410 109780414 YY1 TRANSFAC yes 104249840
chr6 109780417 109780430 HNF1B JASPAR yes 70415392
chr6 109780417 109780430 HNF1B JASPAR yes 104249841
chr6 109780417 109780431 POU4F1 JASPAR yes 70415393
chr6 109780417 109780431 POU4F1 JASPAR yes 104249842
chr6 109780417 109780433 POU4F2 JASPAR yes 70415394
chr6 109780417 109780433 POU4F3 JASPAR yes 70415395
chr6 109780417 109780433 POU4F2 JASPAR yes 104249843
chr6 109780417 109780433 POU4F3 JASPAR yes 104249844
chr6 109780418 109780434 POU4F2 JASPAR yes 70415396
chr6 109780418 109780434 POU4F3 JASPAR yes 70415397
chr6 109780418 109780434 POU4F2 JASPAR yes 104249845
chr6 109780418 109780434 POU4F3 JASPAR yes 104249846
chr6 109780420 109780434 POU4F1 JASPAR yes 70415398
chr6 109780420 109780434 POU4F1 JASPAR yes 104249847
chr6 109780422 109780425 MYB TRANSFAC yes 70415399
chr6 109780422 109780425 MYB TRANSFAC yes 104249848
chr6 109780425 109780437 POU2F1 JASPAR yes 70415400
chr6 109780425 109780437 POU2F1 JASPAR yes 104249849
chr6 109780426 109780438 POU3F1 JASPAR yes 70415401
chr6 109780426 109780438 POU3F2 JASPAR yes 70415402
chr6 109780426 109780438 POU3F1 JASPAR yes 104249850
chr6 109780426 109780438 POU3F2 JASPAR yes 104249851
chr6 109780426 109780439 POU2F2 JASPAR yes 70415403
chr6 109780426 109780439 POU2F2 JASPAR yes 104249852
chr6 109780427 109780436 POU3F4 JASPAR yes 70415404
chr6 109780427 109780436 POU5F1B JASPAR yes 70415405
chr6 109780427 109780436 POU3F4 JASPAR yes 104249853
chr6 109780427 109780436 POU5F1B JASPAR yes 104249854
chr6 109780428 109780435 POU2F1 TRANSFAC yes 70415406
chr6 109780428 109780435 POU2F2 TRANSFAC yes 70415407
chr6 109780428 109780435 POU2F1 TRANSFAC yes 104249855
chr6 109780428 109780435 POU2F2 TRANSFAC yes 104249856
SNP sites on vista53075[chr6:109780095-109780443]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 109780136 rs144319631 G C
RUNX3
9253590
chr6 109780140 rs12208204 C T
RUNX3
9253591
chr6 109780174 rs9487113 T C
PBX1 RUNX1 RUNX3 RXRB RXRG
9253592
chr6 109780192 rs9398202 C G
RUNX3
9253593
chr6 109780219 rs9480962 C T
RUNX3
9253594
chr6 109780316 rs188536751 T C
MZF1 RUNX3 SPI1 SPIC TFAP2A ZNF263
9253595
Genes possibly regulated by vista53075[chr6:109780095-109780443]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 109687717 109703762 - CD164 ENSG00000135535.10 109703762 0.76 0.99 6856 23667
chr6 109711418 109762374 - PPIL6 ENSG00000185250.11 109762374 0.88 1.0 6857 82279
chr6 109761966 109765122 + SMPD2 ENSG00000135587.4 109761966 0.65 1.0 6858 81871
chr6 109765265 109787171 - MICAL1 ENSG00000135596.13 109787171 0.81 1.0 6859 93272
chr6 109783797 109804440 - ZBTB24 ENSG00000112365.4 109804440 0.65 0.99 6860 76003
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista53075[chr6:109780095-109780443]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results